Ссылка: http://генофонд.рф/?page_id=35185
Источник:
Mark Lipson, Elizabeth A Sawchuk, Jessica C Thompsonet al. Ancient DNA and deep population structure in sub-Saharan African foragers // Nature. 2022 Mar;603(7900):290-296. doi: 10.1038/s41586-022-04430-9. Epub 2022 Feb 23.
https://www.nature.com/articles/s41586-022-04430-9Анализ ДНК шести древних индивидов из Восточной и Центральной Африки вдвое увеличил древность изученных палеогеномов и позволил понять источники генетического разнообразия африканских охотников-собирателей. По полученным данным, оно является результатом смешения от 80 до 20 тысяч лет назад популяций из трех источников: Восточной, Центральной и Южной Африки. После этого времени сформировавшаяся популяционная структура оставалась довольно стабильной и отразилась в генетическом разнообразии современных охотников-собирателей дождевых лесов Центральной Африки.
аселение Африки отличается наибольшим генетическим разнообразием среди всех регионов планеты, в то же время истоки этого разнообразия недостаточно изучены. Причины этого в нехватке данных как по современным, так и, в особенности, по древним геномам, так как ДНК в африканском климате плохо сохраняется. Поэтому любое добавление к исследованным древним геномам из Африки особенно ценно.
Судя по археологическим данным, около 50 тыс. лет назад по Африке южнее Сахары распространяются технологические инновации и символическое поведение (орнаменты, каменные орудия, микролиты); это считают переходом от среднего к позднему каменному веку. К 20 тыс. лет назад эти компоненты материальной культуры уже были повсюду, но имели региональные различия. Палеогенетики попытались выяснить, какими демографическими событиями сопровождались эти периоды.
В работе, опубликованной в журнале Nature (один из ведущих авторов статьи авторитетный палеогенетик Дэвид Райх из Гарвардского университета) представлены новые геномные данные шести древних индивидов из Восточной и юга Центральной Африки возрастом от 18 до 5 тысяч лет назад. До сих пор все исследованные африканские геномы были моложе 9 тысяч лет, так что древность образцов увеличилась вдвое. Кроме того, авторы улучшили качество данных для 15 ранее опубликованных древних африканских геномов.
Были изучены геномы трех древних индивидов позднего плейстоцена и трех – раннего-среднего голоцена, с датировками от 18 до 5 тыс. лет назад, ассоциированными с технологиями позднего каменного века. Места их находок – пять археологических сайтов: в Танзании (пещеры Кисесе II и Мламбалази); в Малави (пещеры Фингира и Хора 1) и в Замбии (пещера Калемба). Эти данные проанализированы вместе с 28 ранее изученными африканскими геномами. На панели на 1,2 млн SNP получены данные секвенирования с покрытием таргетных SNP от 0,001х до 3,2х (в среднем 0,06х); 15 геномов секвенированы с высоким покрытием.
Результаты показали, что модель смешения из двух источников предковых компонентов (Восточная и Южная Африка) недостаточна для объяснения генетической изменчивости древних охотников-собирателей Африки южнее Сахары. Данные говорят, что нужно добавить третий источник – в Центральной Африке (близкий к современным мбути). Эти три источника смешаны в разных пропорциях в древних геномах Кении, Замбии, Танзании и Малави.
Обнаруженное смешение в популяциях африканских охотников-собирателей трех генетических источников, вероятно, отражает межпопуляционные взаимодействия в плейстоцене, от 80 до 20 тыс. лет назад, включая глубоко генетически различные популяции Восточной и Южной Африки. Эта структура до сих пор остается довольно стабильной, что говорит об ограничении генетических потоков после 20 тыс. лет назад. Следовательно, в конце плейстоцена происходит региональное разделение генофондов, и эти древние генетические компоненты вносят существенный вклад в генетическое разнообразие современных охотников-собирателей дождевых лесов Центральной Африки.