АвторТема: V18  (Прочитано 616 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
V18
« : 25 Март 2022, 21:59:17 »
Пришли результаты жены.

FTDNA выдал гаплогруппу V. Я уже думал, что это какой-то реликт из V*, но YFull сказал, что это V18a2a (образец id:YF102132).

В FTDNA совпаденцы в Full Mitochondrial Sequence отсутствуют как класс, есть только совпаденцы в HVR1 и совпаденцы в HVR1 + HVR2.

FTDNA перечислили следующие полиморфизмы в качестве приватных (RSRS):

309.1C, 315.1C, 522.1A, 522.2C, 522.3A, 522.4C, A2775G, G5460A, G8839A, G9145R, T14034C, A14914c, C16519T.

Сравнив с результатами в YFull, понял, что:

1) снипы 309.1C, 315.1C, 522.1A, 522.2C, 522.3A, 522.4C и G9145R — в YFull отсутствуют, то есть скорее всего трешак;

2) снипы G5460A и C16519T — это уровень L3'4;

3) снип A14914c — это уровень V18a;

4) снип A2775G — это уровень V18a2a;

5) снипы G8839A и T14034C — в YFull также указаны приватными.
« Последнее редактирование: 25 Март 2022, 22:55:49 от Yaroslav »

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: V18
« Ответ #1 : 25 Март 2022, 21:59:53 »
Снип A508G уровня V18 у супруги отсутствует. Я так понял, произошла обратная мутация, потому что у неё на данном участке стоит A.

Поэтому, учитывая отсутствие снипа A508G (уровень V18), а также то, что снипы A14914c (уровень V18a) и A2775G (уровень V18a2a) указаны приватными (видимо в FTDNA нет ещё других носителей A14914c и A2775G), поэтому FTDNA и поставили ей просто V.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: V18
« Ответ #2 : 25 Март 2022, 22:00:21 »
В V18a2a на сегодняшний день 11 образцов. Из них у 7 указано происхождение:

2 из США,

2 из Польши,

1 из Чехии,

1 из Швеции.

Ну, и теперь появился 1 образец из Брянской области России :)

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: V18
« Ответ #3 : 25 Март 2022, 22:35:05 »
В V18a* есть образец id:I11713 древней ДНК из захоронения поздней Латенской культуры (190-1 гг. до н.э.) на территории современного Братиславского града в Словакии.

Это публикация Patterson et al. 2022, Large-scale migration into Britain during the Middle to Late Bronze Age.

Цитировать
Individual 8/14 (c. 50–59 years), who yielded sample I11713 (male), lay in a crouched position near wall Nr. XV in layer SJ2317.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: V18
« Ответ #4 : 26 Март 2022, 10:13:00 »
Пришли результаты жены.

Найденные полиморфизмы от FTDNA (RSRS - Reconstructed Sapiens Reference Sequence):

HVR1: A16129G, T16187C, C16189T, T16223C, G16230A, T16278C, T16298C, C16311T, C16519T

HVR2: T72C, G73A, C146T, C152T, C195T, A247G, 309.1C, 315.1C, 522.1A, 522.2C, 522.3A, 522.4C

CR: A769G, A825t, A1018G, A2758G, A2775G, C2885T, T3594C, G4104A, T4312C, G4580A, G5460A, G7146A, T7256C, A7521G, T8468C, T8655C, G8701A, G8839A, G9145R, C9540T, G10398A, T10664C, A10688G, C10810T, C10873T, C10915T, A11719G, A11914G, T12705C, G13105A, G13276A, T13506C, T13650C, T14034C, T14766C, A14914c, C15904T

Extra Mutations (приватные мутации): 309.1C, 315.1C, 522.1A, 522.2C, 522.3A, 522.4C, A2775G, G5460A, G8839A, G9145R, T14034C, A14914c, C16519T

Найденные полиморфизмы от FTDNA (rCRS - revised Cambridge Reference Sequence):

HVR1: 16298C

HVR2: 72C, 263G, 309.1C, 315.1C, 523.1C, 523.2A

CR: 750G, 1438G, 2706G, 2775G, 4580A, 4769G, 5460A, 7028T, 8839A, 8860G, 9145R, 14034C, 14914C, 15326G, 15904T
« Последнее редактирование: 26 Март 2022, 10:27:02 от Yaroslav »

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: V18
« Ответ #5 : 26 Март 2022, 10:17:00 »
Найденные полиморфизмы от YFull (RSRS - Reconstructed Sapiens Reference Sequence):

HVR1:   A16129G, T16187C, C16189T, T16223C, G16230A, T16278C, T16298C, C16311T, C16519T

HVR2:   T72C, G73A, C146T, C152T, C195T, A247G, A302AC, T310TC, G513GCA, C522CAC

CR:   A769G, A825T, A1018G, A2758G, A2775G, C2885T, T3594C, G4104A, T4312C, G4580A, G5460A, G7146A, T7256C, A7521G, T8468C, T8655C, G8701A, G8839A, C9540T, G10398A, T10664C, A10688G, C10810T, C10873T, C10915T, A11719G, A11914G, T12705C, G13105A, G13276A, T13506C, T13650C, T14034C, T14766C, A14914C, C15904T

Найденные полиморфизмы от YFull (rCRS - revised Cambridge Reference Sequence):

HVR1:   16298C

HVR2:   72C, 263G, 302AC, 310TC, 513GCA, 522CAC, 523, 523, 523N, 524N

CR:   750G, 1438G, 2706G, 2775G, 4580A, 4769G, 5460A, 7028T, 8839A, 8860G, 14034C, 14914C, 15326G, 15904T

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: V18
« Ответ #6 : 25 Июль 2022, 00:23:52 »
FTDNA выдал гаплогруппу V. Я уже думал, что это какой-то реликт из V*, но YFull сказал, что это V18a2a (образец id:YF102132).

Снип A508G уровня V18 у супруги отсутствует. Я так понял, произошла обратная мутация, потому что у неё на данном участке стоит A.

Поэтому, учитывая отсутствие снипа A508G (уровень V18), а также то, что снипы A14914c (уровень V18a) и A2775G (уровень V18a2a) указаны приватными (видимо в FTDNA нет ещё других носителей A14914c и A2775G), поэтому FTDNA и поставили ей просто V.

Почему возникла такая большая разница между результатами FTDNA и YFull?

FTDNA, насколько я понял, использует дерево, построенное на мутациях пересмотренной кембриджская эталонной последовательности (revised Cambridge Reference Sequence - rCRS): *Based on Build 17 from: van Oven M, Kayser M. 2009. Updated comprehensive phylogenetic tree of global human mitochondrial DNA variation. Hum Mutat 30(2):E386-E394. http://www.phylotree.org/ (Build 17).

YFull использует дерево, построенное на мутациях реконструированной эталонной последовательностью сапиенса (Reconstructed Sapiens Reference Sequence - RSRS).

1. После уровня V идёт уровень V18 с определяющей его мутацией A508G в гипервариабельном регионе 2 (hypervariable region 2 - HVR 2), но у супруги здесь предковый аденин вместо гуанина, поэтому FTDNA ей на засчитали этот уровень. Почему у жены здесь аденин вместо гуанина - я объясню ниже.

2. Далее идёт уровень V18a с определяющей его мутацией A14914C в кодирующем регионе (Coding Region - CR). Эта мутация присутствует у супруги, она есть в rCRS и представлена на дереве FTDNA, но видимо из-за аденина у жены на участке 508 уровня V18 компания не стала ей присваивать уровень V18a.

На уровне V18a дерево FTDNA, построенное на мутациях rCRS, заканчивается. Дальше этого FTDNA никакие гаплогруппы протестированным не присваивает.

3. Далее идёт уровень V18a2. Вот как раз у кого-то из предков людей, находящихся на данном уровне, включая мою супругу, произошла обратная мутация G508A! в гипервариабельном регионе 2 (hypervariable region 2 - HVR 2). Именно из-за этой обратной мутации FTDNA и остановился на уровне V.

4. Далее идёт уровень V18a2a с определяющей его мутацией A2775G в кодирующем регионе (Coding Region - CR). Но, этой мутации нет в rCRS, она есть в RSRS, почему FTDNA, в отличие от YFull, не использует её для своего дерева.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: V18
« Ответ #7 : 25 Июль 2022, 01:09:47 »
Ещё интересен возраст ближайшего предка гаплогруппы V18a2a, подсчитанный YFull - где-то в пределах интервала 800-300 лет. То есть, 2-е тысячелетие нашей эры, уже исторический период для наших широт.

При этом указанная география в пределах Старого Света - Польша, Чехия, Швеция и российская Брянская область.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: V18
« Ответ #8 : 28 Июль 2022, 10:19:02 »
В V18a* есть образец id:I11713 древней ДНК из захоронения поздней Латенской культуры (190-1 гг. до н.э.) на территории современного Братиславского града в Словакии.

Это публикация Patterson et al. 2022, Large-scale migration into Britain during the Middle to Late Bronze Age.

Цитировать
Individual 8/14 (c. 50–59 years), who yielded sample I11713 (male), lay in a crouched position near wall Nr. XV in layer SJ2317.

Ещё один образец древней ДНК - это древнеримский id:MG773623.1, находящийся на одной из звёздных линий V18*.

К сожалению в публикации Matthew V. Emery et al., 2018 Ancient Roman mitochondrial genomes and isotopes reveal relationships and geographic origins at the local and pan-Mediterranean scales, откуда взят данный образец, не могу найти доступ к Supplementary data, чтобы посмотреть, что это за образец.

Судя по Abstract, это захоронение в некрополе Ваньяри в Гравина-ин-Пулья провинции Бари в Апулии:

Цитировать
In this paper, we present the whole mitochondrial (mtDNA) genomes of 30 Roman period (1st–4th centuries CE) individuals buried in the Vagnari necropolis in southern Italy.

Оффлайн Allon

  • Сообщений: 153
  • Страна: ru
  • Рейтинг +105/-9
Re: V18
« Ответ #9 : 28 Июль 2022, 12:44:09 »
Ещё один образец древней ДНК - это древнеримский id:MG773623.1, находящийся на одной из звёздных линий V18*.

К сожалению в публикации Matthew V. Emery et al., 2018 Ancient Roman mitochondrial genomes and isotopes reveal relationships and geographic origins at the local and pan-Mediterranean scales, откуда взят данный образец, не могу найти доступ к Supplementary data, чтобы посмотреть, что это за образец.

Судя по Abstract, это захоронение в некрополе Ваньяри в Гравина-ин-Пулья провинции Бари в Апулии:

Цитировать
In this paper, we present the whole mitochondrial (mtDNA) genomes of 30 Roman period (1st–4th centuries CE) individuals buried in the Vagnari necropolis in southern Italy.

этот женский образец (LIAV_7) происходит из античного поселения Ботроманьо (Сильвиум)

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: V18
« Ответ #10 : 28 Июль 2022, 15:17:31 »
этот женский образец (LIAV_7) происходит из античного поселения Ботроманьо (Сильвиум)

Спасибо! Это тоже в окрестностях Гравина-ин-Пулья.

У автора публикации есть ещё одна по данному некрополю: Assessing Migration and Demographic Change in pre-Roman and Roman Period Southern Italy Using Whole-Mitochondrial DNA and Stable Isotope Analysis. В ней в том числе говорится и о япигах. Так как данный образец относится к 7-4 вв. до н.э., я так понимаю, это наверное кто-то из них.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: V18
« Ответ #11 : 09 Сентябрь 2022, 16:00:40 »
У супруги время от времени появляются по 5-6 совпаденцев в HVR1, в том числе и сегодня появились шестеро. Всего набралось уже 3680 человек! И все какие-то из V* и чуть ли не 18 разных дочерних для V гаплогрупп (согласно дереву по rCRS, которое использует FTDNA).

В HVR1+HVR2 их 20 человек тоже разных гаплогрупп.

И при этом в FMS (HVR1+HVR2+CR) - ни одного.

Наверное в FTDNA путаница из-за обратной мутации A508G! у супруги и у остальных представителей гаплогруппы V18a2 (YFull), произошедшей ещё на уровне V18.

Всё-таки дерево по RSRS выглядит более точным, чем по rCRS.
« Последнее редактирование: 09 Сентябрь 2022, 18:03:53 от Yaroslav »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.