Разбор случая sanych_85

[Farroukh]

Серж, возможно, Александр относится не к русинской ветви, а к греко-понтийской? Есть какие-нибудь гаплотипы греков советского Причерноморья?

[sanych_85]

Попробовал убрать 4 маркера, которые дают наибольшее отклонение (389-2, 392, 439,389-1). На 12 маркерах оказалось совпадение с поляком Гвоздем и немцем Видманом,   1 мутация на тех же 12 маркерах еще с десятком человек, в основном ирландцы и немцы.

[Sergey Lutak]

Попробовал убрать 4 маркера, которые дают наибольшее отклонение (389-2, 392, 439,389-1). На 12 маркерах оказалось совпадение с поляком Гвоздем и немцем Видманом,   1 мутация на тех же 12 маркерах еще с десятком человек, в основном ирландцы и немцы.

Ну это вы, Саша, поторопились.  Зачем же сразу убирать значения четырёх маркеров из Ysearch.org?
Тем более 439, 389-1 чем вам "помешали"? 

[Sergey Lutak]

Серж, возможно, Александр относится не к русинской ветви, а к греко-понтийской?

Из "ближайших" (общий предок - в середине II-го тыс. до н.э.) к Александру: Widmann (160666, Германия), Rose (S10129, ?), Fichter (S10087, вероятно, Германия), Famas (S10087, Греция) и Hansard (6334, Англия).
Как видишь, Фарра, Сашу "тянет" больше к Западу. Впрочем, и один грек то же есть.

Серб (Pavlovich), русин (Burock) и Nozdrin - на расстоянии 9 мутаций (в той же компании ещё француз, мексиканец, итальянец, уругваец, ашкеназ и немец.

[Nozdrin]

Ну всё, пора идти на Пасхальную службу. До завтра.

Всех православных и католиков поздравляю с Светлым Христовым Воскресением!

...Кончен пост, прибавим в весе.
Добрый день!
Христос воскресе!

От перемены мест слагаемых... 

может возникать сумятица и неразбериха 
Заходим на страницу Генофонда, смотрим данные участников проекта "Однофамильцы ..", наблюдаем картину, когда маркеры выстроены в порядке DYS 389I DYS 389II DYS 390 DYS 456 DYS 19 DYS 385 DYS 385-2 DYS 458 DYS 437 DYS 438 DYS 448 GATA _H4 DYS 391 DYS 392 DYS 393 DYS 439 DYS 635
В такой же последовательности рисует Гентис.
Наши с Санычем гаплотипы в такой последовательности:
13 30 24 15 13 16 18 15 14 10 19 12 10 12 13 12 21
12 25 25 15 13 16 18 15 14 10 20 12 10 13 13 11 21
Я встречал в Сети (была какая-то статья, где не помню, рыться, искать ссылку лень):

Данные от Балановских:
сэмпл\DYS 19 385a 385b 389i 389ii 390 391 392 393 437 438 439 448 456 458 635 H4

Такую строку я встречал ещё на форуме Генофонда
В Сети можно также увидеть варианты:

DYS19, DYS389i, DYS389ii, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS385a/b, DYS437, DYS438, DYS439, DYS448,DYS456, DYS458, DYS635, Y-GATA-H4

и

DYS19     DYS389I  DYS389II  DYS390  DYS391  DYS392  DYS393  DYS385   DYS438  DYS439  DYS437  DYS448  DYS456  DYS458  DYS635  YGATAH4

Сергей отобразил гаплотипы в формате yFiler без комментария по порядку следования маркеров.

Мой гаплотип в 17-ти маркерном формате Yfiler (FBI/National Standards):
13 – 14 – 31 – 24 – 10 – 11 – 13 – 16,16 – 11 – 12 – 14 – 20 – 16 – 15 – 21 – 12
Гаплотип Александра Шатохина:
13 – 12 – 25 – 25 – 10 – 13 – 13 – 16,18 – 10 – 11 – 14 – 20 – 15 – 15 – 21 – 12

Все из новопротестированных (или просто читающих эту тему людей) помнят (знают) порядок следования маркеров в yfiler?

[Farroukh]

Серж, разные последовательности - это ещё полбеды. У разных лабораторий ещё и сами аллели надо пересчитывать (та самая ГАТА4, 389-1 389-2 и 389a 389 b)

Надо бы какой-нибудь конвертер сваять. Загоняешь туда свои маркёры, указываешь лабораторию и на выходе получаешь человеческий фтдна-формат.

[Nozdrin]

Abstract In the past 5 years, there has been a substantial increase in the use of Y-short tandem repeat loci (Y-STRs) in forensic laboratories, especially in cases where typing autosomal STRs has met with limited success. The AmpFlSTR Yfiler PCR amplification kit simultaneously amplifies 17 Y-STR loci including the loci in the "European minimal haplotype" (DYS19, DYS385a/b, DYS389I, DYS389II, DYS390, DYS391, DYS392, and DYS393), the Scientific Working Group on DNA Analysis Methods (SWGDAM) recommended Y-STR loci (DYS438 and DYS439), and the highly polymorphic loci DYS437, DYS448, DYS456, DYS458, Y GATA H4, and DYS635 (formerly known as Y GATA C4). The Yfiler kit was validated according to the FBI/National Standards and SWGDAM guidelines. Our results showed that full profiles are attainable with low levels of male DNA (below 125 pg) and that under optimized conditions, no detectable cross-reactive products were obtained on human female DNA, bacteria, and commonly encountered animal species. Additionally, we demonstrated the ability to detect male specific profiles in admixed male and female blood samples at a ratio of 1:1000.

http://www.yhrd.org/Publication;Mulero2006a
Порядок следования маркеров в формате yFiler:
DYS19, DYS389I, DYS389II, DYS390, DYS391, DYS392, DYS393, DYS385ab, DYS438, DYS439, DYS437, DYS448, DYS456, DYS458, DYS635, YGATAH4
Теперь наши гаплотипы отобразятся уже так:
13 - 13 - 30 - 24 - 10 - 12 - 13 - 16,18 - 10 - 12 - 14 - 19 - 15 - 15 - 21 - 12
13 - 12 - 25 - 25 - 10 - 13 - 13 - 16,18 - 10 - 11 - 14 - 20 - 15 - 15 - 21 - 12
10/34/0,002=147
4412 лет до общего предка, если считать одно поколение 30 лет
Совпаденцев в базе YHRD у меня тоже нет.
Среди моих 17 маркеров есть один с "нестандартным" значением
DYS392 = 12
Я привожу его к стандартному виду, меняя его значение на 1  (делаю DYS392 = 11)
База выдаёт 1 совпаденца.
Eurasian Metapopulation: Found 1 of 8974 matching haplotypes [f=1.114 ???10-4 (95% CI: 2.821???10-6 – 6.207???10-4)] in 1 of 67 populations.
Northern Greece, Greece [Greek]
Если это так, то:
1/34/0,002=(14,7)15
(441)450
2010-450=1560 г.
Наш общий предок жил во времена Ивана Грозного.
Но я особо губу не раскатываю. На 67 маркерах, с учётом моих "нестроевых" 487 и 557, мы можем разлететься капитально.
Я тут не ахинею нёс, брат Сергей?

[Nozdrin]

Серж, разные последовательности - это ещё полбеды. У разных лабораторий ещё и сами аллели надо пересчитывать (та самая ГАТА4, 389-1 389-2 и 389a 389 b)

Надо бы какой-нибудь конвертер сваять. Загоняешь туда свои маркёры, указываешь лабораторию и на выходе получаешь человеческий фтдна-формат.

Вроде бы Вадим ваяет предиктор, который сам всё понимает.

[Centurion]

Как раз у фтдна не кашерный формат 

[Farroukh]

Серж, красный квадратик на карте - это грек-совпаденец. А синие квадратики на этой карте - это тоже E1b1b1a2? Что-то их много в Японии, не к добру это. 

[Nozdrin]

Мой батя, когда ДВВИМУ (мореходка (высш.), ныне ВМУ) закончил (или на практике когда был) бывал в Японии. Потом ещё и старший мой брат там был - вторая волна, так сказать. Вот и поменялись частоты. 

[Nozdrin]

Ещё, меняя свой 392 с 12 на 11, я подвожу его к DanubianModalType
См. в усёрче QRNBX
Был как-то разговор по моему 392:

5. Интересно предположение. Мутация DYS 392 11->12 встречается всего три раза. На ветвях F1, G2 и древней A. Все в последнюю тысячу лет.
На ветви F1 она на подветви Johnson-Ferguson. На G2 безымянный гаплотип из проекта Sutton. Там их шестеро в проекте с похожими гаплотипами (группа 07). В проекте непонятно откуда эта группа, но про все группы написано "These family lines are found in Canada, Europe, New Zealand and the United States". На ветви A такая мутация у Fernandez, Испания.
Получается, что на дереве такая мутация у англичан и испанцев, но нет среди восточноевропецев... Не думаю, что Вы ее с кем-то из них разделяете. Скорее, после добавления на дерево Вашего 37-маркерного гаплотипа появится такая же мутация в еще одном месте.

Кто знает, может мои предки были и в Греции и на Дунае? Потом 392>12. Потом разбежались. Кто в Англию, кто в Испанию, а кто и ... в Черниговскую губернию. 
Я, просто, меняю одну цифорку в гаплотипе!

[wertner]

Кто знает, может мои предки были и в Греции и на Дунае? Потом 392>12. Потом разбежались. Кто в Англию, кто в Испанию, а кто и ... в Черниговскую губернию. 
Я, просто, меняю одну цифорку в гаплотипе!

Скорее в Македонии И разбежались кто в Германию-Данию-Финляндию, а кто и в Черниговскую и Кировскую губернию

[sanych_85]

А что же делать мне ,бедному и несчастному, к какому народу мне примкнуть, учитывая то, что общий предок с ближайшими товарищами у меня обнаруживается только по приблизительным подсчетам в 1200-1300г. до н.э.    То есть вероятно, мой предок наравне с большинством представителей E1b1b1a был в Египте, но вот куда он отправился потом я лично объяснить не могу, может кто-то сможет попытаться предположить приблизительный путь миграции моего предка.

[Sergey Lutak]

Саша, наличие среди ваших хоть и не очень близких кузенов грека, серба, итальянца, русина, украинца, немцев и западноевропейцев, на мой взгляд, указывает на то, что как минимум до 1500 г.г. до н.э. ваш предок жил ещё на Балканах.
А вот что было в интервале от 1500 г. до н.э. по 1800 г. н.э. можно будет предполагать лишь после 67-ми маркерного теста.