Генетическое происхождение гуннов, аваров и венгров (Maroti 2022)

[Павлов Сергей]

Его ближайший "дядя"  BOU11 (Corconne), Регион Окситания (Франция), 5140 л.н. - FGC750 - Z7958 - FGC701;
A181025, сармат, (Венгрия), FGC1053* - FGC1053 - FGC701.
Разошлись, как раз, 5100 л.н.

[Tora_sama]

Поскорей бы уже в открытый доступ басы выложили,а то мои Ешки скучают на ифулле((

[Fire]

Из достоверного сарматского некрополя  A181025 pre-G-FGC1053*         1600   375-425 CA   Sarmatian  Hajdúnánás-Fürj-halom-dűlő 2. site, M3/40A, Transtisza region  Hungary   Feature 27/Str. 46   47.857447   21.357433   Mт   T2b      3.659   1109443   Petrous   Gnecchi-Ruscone2022
 https://sun9-79.userapi.com/impf/AE5iOKZ1CtFoNHagcKNGHAQpSY5S6c8skgn_dQ/i8oN3ptjhtY.jpg?size=502x437&quality=96&sign=1c62e93ea9dd994846f064f461c3ad12&type=album
 

Митоветвь сармата A181025 уже определена  T2b80

Кстати Сарматы там Лимигантае=Дружиники и Ардарагантае=Рукодержатели.
Окончание суфикс множественного числа "антае" Дигорского типа и отсутствует в Иронском.

[G-Man]

На FTP уже доступны БАМы образцов из препринта   http://ftp.ebi.ac.uk//vol1/run/ERR805/

Проверил файл знатного мадьяра SEO-4 из гаплогруппы G2a1

FTB14662+   (4 прочтения)


Скорее всего, увидим на дереве — БАМ увесистый у него

[Val_Metov]

Ссылка на таблицу со всем перечнем размещенных на этом ftp образцов https://docs.google.com/spreadsheets/d/1fxhtiBtjNz7LYLZe6zx-ViLwKyOYG-cnvuJ1aqrZTE0/edit?usp=sharing

[Таусо]

Ссылка на таблицу со всем перечнем размещенных на этом ftp образцов https://docs.google.com/spreadsheets/d/1fxhtiBtjNz7LYLZe6zx-ViLwKyOYG-cnvuJ1aqrZTE0/edit?usp=sharing

Неплохо было бы проанализированные по БАМу субклады тоже вписать.

[Val_Metov]

Давайте поделим образцы и прогоним.
Есть скрипт который смотрит по не самым глубоким снипам, дальше можно вручную, загрузив в геномный браузер а там подключить список снипов с адресами по нужной Гг.
Ещё можно через wgsextract тоже определить субклады. Или vcf изготовить и на yseq clafe finder.

[Tora_sama]

Для Ешников уже сделали на антроподженике.
SZOD1-829 is CTS9320*, no positives below. https://www.yfull.com/tree/E-CTS9320/
SZK-102 is BY28615 https://www.yfull.com/tree/E-Y84931/
KK1-251 is BY193951* (negative for Z21366) https://www.yfull.com/tree/E-L241/
SZKT-311 is Y145455* https://www.yfull.com/tree/E-Y145455/
SZKT-265 is FGC11451*, he breaks this segment, probably being negative for FGC11448. https://www.yfull.com/tree/E-FGC11451/
ALT-369 is PH283* (negative for FT1812) https://www.yfull.com/tree/E-Z17293/
PV-12 is BY4523* (negative for both subgroups) https://www.yfull.com/tree/E-Y20805/
SZK-130 is BY6170 https://www.yfull.com/tree/E-BY6162/
HH-10 is BY6375* (negative for both subgroups) https://www.yfull.com/tree/E-BY6375/
SZKT-70 is BY5617* (negative for both subgroups) https://www.yfull.com/tree/E-BY5617/
ALT-224 is BY72004 https://www.yfull.com/tree/E-BY6375/
IBE-90 is a badly covered sample, maybe BY4684* (and possibly BY159225* or FGC71968* which have no coverage). https://www.yfull.com/tree/E-Y18556/
PLE-23 is FGC11444* https://www.yfull.com/tree/E-ZS1176/
SH-182 is FT153688 https://www.yfull.com/tree/E-FT30969/
SZOD-376 is FT264135 https://www.yfull.com/tree/E-Z5017/
SZK-83 is FT226363 https://www.yfull.com/tree/E-PH1173/
TMH-199 is FTA67460 https://www.yfull.com/tree/E-Z16988/

Итого:
Z5017 > CTS9320: SZOD1-829, PV-12, SH-182
Z5017 > BY4684: IBE-90
Z5017 >FT264135: SZOD-376
S7461: SSD-144
Z5018 > S2979 basal: TCS-18
Z5018 > S2979 > FGC33614: SZM-259, SZK-130
Z5018 > S2979 > L241: KK1-251, SZKT-70 В моём субукладе двое, но соседние ветки(((
Z5018 > S2979 >FGC11457: SZKT-265, PLE-23
Z5018 > Y145455: SZKT-311, ALT-369, HH-10, ALT-442
PH1246: SZK-102

[Tora_sama]

Анализ от Trojet
I was able to analyze the BAM files for the three J2b-L283's from this paper. The coverage is pretty good, so hopefully they are eventually uploaded to YFull.
They are more specifically as follows:

ALT-77, ~648 CE, Hungary_Avar_EarlyMiddle: J2b-L283>>Z597>Z638>Z1297>Z1295>Y21878>Y32373>FT33245: https://www.yfull.com/tree/J-Y32373/
FT33245 is not on YFull, but on FTDNA is a J-FT35302 equivalent and he is positive. Since he is negative for FT33542, he should split J-FT35302 that's shared by the Scottish and Spanish sample.

SP-2, ~950 CE, Hungary_Conq_Elite: J2b-L283>>Z597>Z638>Z1297>Y27522>Y23097 (xY23094): https://www.yfull.com/tree/J-Y23097/
There was a Nebula WGS sample on YFull a few months ago in the same phylogeny (that apparently did not pay for the analysis). It's possible they share some SNPs there and form a parallel branch to J-Y23094.

VPB-307, ~800 CE, Hungary_Avar_Late_Elite: J2b-L283>YP91>YP61>YP29>YP181 (xFT196148): https://www.yfull.com/tree/J-YP181/
May share some SNPs with the Polish sample.

[Val_Metov]

На FTP уже доступны БАМы образцов из препринта   http://ftp.ebi.ac.uk//vol1/run/ERR805/

Проверил файл знатного мадьяра SEO-4 из гаплогруппы G2a1

FTB14662+   (4 прочтения)


Скорее всего, увидим на дереве — БАМ увесистый у него

Респект, оперативная работа)
уже на yfull

[Semargl]

Ссылка на таблицу со всем перечнем размещенных на этом ftp образцов https://docs.google.com/spreadsheets/d/1fxhtiBtjNz7LYLZe6zx-ViLwKyOYG-cnvuJ1aqrZTE0/edit?usp=sharing

Вопрос. А что в этой табличке делают геномы растений? К примеру ERR8057060 - омела белая и тд
За табличку спасибо

[Val_Metov]

Ссылка на таблицу со всем перечнем размещенных на этом ftp образцов https://docs.google.com/spreadsheets/d/1fxhtiBtjNz7LYLZe6zx-ViLwKyOYG-cnvuJ1aqrZTE0/edit?usp=sharing

Вопрос. А что в этой табличке делают геномы растений? К примеру ERR8057060 - омела белая и тд
За табличку спасибо

Все что было на ftp сервере, вдруг там что то еще. Доступ на редактирование открыт для всех. Лишнее просьба удалить

[Val_Metov]

Добавил лист с проверкой снипов.
HMSZ-50.bam
G-L1264+
G-FT9681+
G-PRX54+ этот снип есть на древе ftnda. Может быть они уже загрузили этот образец?

Наконец-то L1264 древний у нас.

И у второго L1264 (HMSZ-231) тоже этот снип в плюсе G-PRX54+

[G-Man]

Образцы из-под Анапы:

KAUK10    886‒992 AD   R1a-Y9082   https://www.yfull.com/tree/R-YP582/

KAUK11    880‒994 AD   R1a-S3358   https://www.yfull.com/tree/R-CTS3402/

Аутосомы вроде кавказские, если я правильно понял

могильник Андреевская щель
https://www.academia.edu/44582996/

Археологи отмечают поразительное сходство с материалами из Карпатского бассейна

Добрый день,

Где можно ознакомится с данными этих образцов? R1a-YP582 наш однокланник.

У KAUK 10 и KAUK 11 одинаковая mtDNA - J1c - вряд ли совпадение.

S1.9.1 Anapa–Andreyevskaya Shhel (Anapa; Krasnodar Krai, Russia) 155
Excavations were carried out by Andrej Novicsihin and Gabriella M. Lezsák near Anapa, at
Andreyevskaya Shhel in two periods, between 1991 and 1992 and in 2019. Eleven graves were
unearthed from which two graves were cremation, respectively eight of them were inhumation.
Besides, the grave No. 5 was a horse burial. However, in the graves No. 10 and 11 weapons
(arrowheads and a saber), while in graves No. 9 and 10 potteries were found, the quality and quantity
60
of the grave goods is rather poor. Additionally, the inhumation graves uncovered in 2019 did not follow
the most important burial custom of the Eurasian nomads, namely laying the dead to rest with a horse
or with parts of the horse. Nonetheless, in two graves weapon-related grave goods were found.
The evaluation and publication of the archaeological analysis is in progress. Furthermore, radiocarbon
analysis was carried out in the case of graves No. 9, 10 and 11. Based on these results the site can be
dated to the 10th (i.e., graves No. 10 and 11), and 11-12th centuries (i.e., grave No. 9) CE. We involved
three samples in our analysis.
Anapa-9: Grave No. 9:
The skeletal remains of an infant (6–9 months old) were found in the grave pit, orientated from south
to north. The burial contained 43 glass beads, 7 copper rattles and hand-made pottery. Based on
radiocarbon analysis it was dated to the 11‒12th centuries CE (with the highest probability between
1075‒1154).
Anapa-10: Grave No. 10:
The grave contained the skeletal remains of a sub-adult individual (9-12 years old) oriented along the
west-east axis. The grave goods were two copper buttons, six iron arrowheads and pottery. The burial
was dated to the 10th century CE (based on the radiocarbon analysis with the highest probability
between 886‒992).
Anapa-11: Grave No. 11:
It was the burial of a juvenile (16‒19 years old) individual oriented along from west to east. The grave
finds were two copper buttons, fragment of a copper finger ring, a saber, an iron awl, and five
arrowheads. It was dated to the 10th century CE (based on the radiocarbon analysis with the highest
probability between 880‒994).

БАМы еще не выложили, но скоро должны быть доступны.

https://www.yfull.com/tree/R-YP582/

https://www.yfull.com/mtree/J1c-a1a1/


Страну только поменять

[G-Man]

Статья официально опубликована https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982222007321


По многим образцам теперь известны радиоуглеродные датировки. К примеру, образцы c Причерноморья:

Anapa-10 (ERS9945041)   886-992

Anapa-11 (ERS9945042)   880-994