АвторТема: T1a1y (YFull, MtDNA)  (Прочитано 3577 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
T1a1y (YFull, MtDNA)
« : 19 Декабрь 2021, 20:14:57 »
Просто создам тут отдельную тему по своему мито-субкладу, чтобы удобнее было систематизировать информацию :)

https://www.yfull.com/mtree/T1a1y/

(для новичков: пожалуйста, не заполняйте эту тему сообщениями о своих результатах, если Вы не относитесь к этому субкладу 8))


Подмосковный вариант (Солнечногорский район - в прошлом Дмитровский уезд, Берендеев стан):

HVR1: T16126C A16129G A16163G C16186T T16187C C16188T T16223C G16230A T16278C C16294T C16311T
HVR2: C146T C195T A247G 309.1C 315.1C 522.1A 522.2C 522.3A 522.4C

CR: G709A A769G A825t A1018G G1888A A2758G C2885T T3594C G4104A T4216C T4312C G4596A G4820A A4917G G7146A T7256C A7521G T8468C T8655C G8697A G8701A C9540T T9899C G10398A T10463C T10664C A10688G C10810T C10873T C10915T A11251G A11914G C12633a T12705C G13105A G13276A G13368A T13506C T13650C G14905A C15452a A15607G G15928A

(подробнее о линии: https://forum.molgen.org/index.php/topic,14202.0.html )

Украинский вариант (Херсонская область (в прошлом - Бериславский уезд, село Великая Александровка) , предположительно переселенцы с Черниговщины, Полтавщины или Киевщины) - идентичный:

HVR1: T16126C A16129G A16163G C16186T T16187C C16188T T16223C G16230A T16278C C16294T C16311T

HVR2: C146T C195T A247G 309.1C 309.2C 315.1C 522.1A 522.2C 522.3A 522.4C

CR: G709A A769G A825t A1018G G1888A A2758G C2885T T3594C G4104A T4216C T4312C G4596A G4820A A4917G G7146A T7256C A7521G T8468C T8655C G8697A G8701A C9540T T9899C G10398A T10463C T10664C A10688G C10810T C10873T C10915T A11251G A11914G C12633a T12705C G13105A G13276A G13368A T13506C T13650C G14905A C15452a A15607G G15928A


УайФулл выделил на древе мутацию G4596A как филогенетически важную, вследствие чего в этот же субклад можно поместить и ирландский гаплотип из графства Литрим, но у которого набежали и другие мутации (его нет на древе):

HVR1: 16126C, 16163G, 16186T, 16188T, 16189C, 16294T, 16519C

HVR2: 73G, 152C, 195C, 263G, 309.1C, 315.1C

CR: 709A, 750G, 1438G, 1888A, 2706G, 4216C, 4596A, 4769G, 4820A, 4917G, 7028T, 8697A, 8860G, 9575T, 9899C, 10463C, 11251G, 11719A, 12633A, 13368A, 14766T, 14905A, 15326G, 15452A, 15607G, 15928A


В ГВС2 у нее 195С и нет 523. 1С и 523. 2А, которые есть у нас с украинцем
А в кодирующем регионе у нее 9575T, которых также у нас нет.



В 2013 году на ГВР1 был еще один ирландский гаплотип с вышеуказанным (общий предок в 19 веке из того же графства, но из-за какой-то незначительной мутации ФТДНА его убрало)

Владелец ирландского сэмпла с 2014 года не выходит на связь (я даже не знаю жив ли он, т.к. на момент переписки был в преклонных годах) :'(

Не так давно я пробежался по ирландским проектам на ФТДНА и заметил, что линий T1a1 у них не так уж и много (в основном ирландские линиджи - это Н и К). В целом, ирландские мито имеют весьма высокое генетическое разнообразие.
Сами ирландские Т1а1, судя по всему, - это преимущественно потомки миграций бронзового и железного веков (если судить по обилию Т1а1 из двух новых статей по генетике культуры колоколовидных кубков и кельтов железного века).

Хитмэп субклада G4596A T->T1a1y:


хранение рисунков

https://phylogeographer.com/scripts/mt_heatmap.php

« Последнее редактирование: 07 Январь 2023, 21:02:03 от grimsvotn »

Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #1 : 05 Февраль 2022, 17:13:46 »
Оставлю тут, чтобы потом не искать.

Специфика ветки (всех трех указанных выше сэмплов):

G4596A
G4820A
T9899C - уже не актуально, т.к. это мутация, маркирующая всю T1a1

« Последнее редактирование: 07 Январь 2023, 20:55:50 от grimsvotn »

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1380/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #2 : 05 Февраль 2022, 17:43:38 »
данных пока увы мало ((

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1380/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #3 : 05 Февраль 2022, 17:44:50 »
Надо выпросить белорусский образец из-под Гомеля, отсеквенировать, сравнить со мной. Руки не доходят.

Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #4 : 05 Февраль 2022, 17:45:39 »
Ещё мутации такие редкие, в древней ДНК упорно не хотят находиться))
« Последнее редактирование: 05 Февраль 2022, 21:48:14 от grimsvotn »

Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #5 : 25 Ноябрь 2022, 16:17:20 »
В T1a1y появился новый образец (американец из научной работы), из-за чего мы с Бондарем образовали ветку под этот субклад - T1a1y1



У американца есть G4820A, но нет G4596A

Интересно было бы узнать: откуда у него линидж, но...
Можно предположить, что из Ирландии, однако местные Т1а1y c G4596A (да еще 9575T). Соответственно, если бы ирландцы G4596A (кузены по ФМС из ФТДНА) закачали свои БАМы на древо, они образовали свою подветвь к Т1а1у

Источник:
Platinum-Quality Mitogenome Haplotypes from United States Populations
https://www.mdpi.com/2073-4425/11/11/1290
Профайл сэмпла:
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MZ387733
« Последнее редактирование: 27 Ноябрь 2022, 17:37:10 от grimsvotn »

Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #6 : 27 Ноябрь 2022, 18:01:00 »
Поискал еще раз meticulously данный гаплотип в сапплиментари. Нет и все тут)) Ни по 4820, ни по 16188. И потом понял, что, Yfull поместил его в один субклад не на основании 16188 и 4820, а просто с 4820 (я уже даже не знаю - важна ли в наших реалиях 16188 или нет, хотя, ранее данная мутация считалась "тяжеловесной")



Получается, что ирландцы из Литрима филогетенически ближе: они и 16188, и 4820, и еще и 4596 (а этот товарищ до конца не ясно с какого боку припеку) ;)

UPD: в любом случае - я написал с левого мэйла паре авторов статьи, может дадут какую дополнительную инфу

Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #7 : 27 Ноябрь 2022, 22:26:48 »
Собственно, как я и думал: это гаплотип T1a1 без 16188 (ID TT51328, source NTHS - National Institute of Standards and Technology (Gaithersburg, MD))

73G 152C 195C 263G 309.1C 315.1C 709A 750G 1438G 1888A 2706G 4216C 4769G 4820A 4917G 7028T 8697A 8860G 9554A 9899C 10463C 11251G 11719A 12633A 13368A 14766T 14905A 15326G 15452A 15607G 15928A 16126C 16163G 16186T 16189C 16294T 16519C

Больше особо ничего общего не вижу)

Заявлен как Hispanic :) Собственно говоря, кто это такие: https://en.wikipedia.org/wiki/Hispanic#Definitions_in_the_United_States

То есть, в теории, линия может уходить на Иберийский п-ов (кельты?)

(а в теории и не может ;D)
« Последнее редактирование: 28 Ноябрь 2022, 16:02:32 от grimsvotn »

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1380/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #8 : 27 Ноябрь 2022, 22:34:39 »
мы видим что 16188 таки может как вскакивать так и исчезать снова
короче, чел в корне линии, не считая обратной замены 16188
или наоборот он еще недомутил недомутировал

Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #9 : 27 Ноябрь 2022, 22:37:50 »
мы видим что 16188 таки может как вскакивать так и исчезать снова
короче, чел в корне линии, не считая обратной замены 16188
или наоборот он еще недомутил недомутировал

А когда-то на 16188 возлагали большие надежды ;)

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 10107
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1380/-7
  • Ultimate Matriarchy
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #10 : 27 Ноябрь 2022, 23:14:23 »
А когда-то на 16188 возлагали большие надежды ;)

да
но они рассыпались после нахождения северорусской ветви которая даже не T1a1 а T1a

Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #11 : 29 Ноябрь 2022, 17:55:58 »
Оставлю тут.

Специфика T1a1y:
подмосковная/украинская линия: 4820, 4596, 16188 (если еще актуально брать в расчёт эту мутацию). Без 195
Ирландская линия: 4820, 4596, дополнительная 9575, 16188, имеются 195 и 152
Hispanic: 4820, нет 16188 и нет 4596, есть 9554, плюс есть 195 и 152
« Последнее редактирование: 29 Ноябрь 2022, 21:00:43 от grimsvotn »

Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #12 : 30 Ноябрь 2022, 13:18:49 »
Комментарий ув. Валерия:

тут явный перебор получается
вручную имеем
2 отличия на московско-укр * 2 индив
4 ирл
3 исп

и поделить на число индив = 4

около 3

это ро, его надо умножить на 3.5 тыс лет
слишком много
мы в ситуации когда требуется какая то коррекция
но хз какая
например коррекция сверху - по возрасту родительского клады
она приведет к тому что время разделения станет практически как у родителя - T1a1
« Последнее редактирование: 30 Ноябрь 2022, 21:17:21 от grimsvotn »

Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #13 : 30 Ноябрь 2022, 21:15:48 »
Conclusion тут заключается в том, что от одной 4820 толкну нет. Как минимум (!) в связке с 4596


Оффлайн grimsvotnАвтор темы

  • Some things in life are too complicated to explain in any language © Murakami
  • Сообщений: 6390
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1771/-1
  • Потомок Морры
    • R-L1280 haplogroup project
  • Y-ДНК: R-Y220521 (RU-BY), Russian-Belorussian borderline cluster
  • мтДНК: T1a1y1 G4820A (RU-UA), Russian-Ukrainian lineage
Re: T1a1y (YFull, MtDNA)
« Ответ #14 : 02 Январь 2023, 00:31:56 »
В Geni.com уже давно висит кузен с полным FMS секвенсом. Гаплотип, вестимо, не посмотреть, но есть интересные детали. Я так понимаю, что у него:

1) либо есть 16188, либо нет (что уже филогенетически не важно - выяснили в посте выше)
2) вероятно, ГД-1 на Т152С!
3) как минимум имеет образующие субклад T1a1y мутации на 4820 и 4596
4) имеет всё то же, что и T1a1y, но ещё что-то дополнительное

Возможны и другие варианты (мутации, не имеющие филогенетической значимости в ГВС2 и пр)

Как выудить гаплотип он не знает, но  хотя бы написал, что предки из неких Бережан в Галиции:
I just know my Grandmother was born in Galicia Poland I believe in a place called Berzezny and I have seen it spelled differently. I think it eventually became or was part of western Ukrain.

 Думаю, те, который в Тернопольской области: https://ru.wikipedia.org/wiki/Округ_Бережаны

Полагаю, что линия не ашкеназская (их вообще в T1a1 почти нет), а либо польская, либо западноукраинская

В любом случае, сравнить было бы интересно, т.к. я люблю всякого рода научный scrutinizing ;D




« Последнее редактирование: 04 Январь 2023, 00:25:08 от grimsvotn »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.