дДНК из Японии от эпохи Дзёмон до эпохи Кофун

[rozenblatt]

https://www.science.org/doi/10.1126/sciadv.abh2419

Ancient genomics reveals tripartite origins of Japanese populations

Niall P. Cooke, Valeria Mattiangeli, Lara M. Cassidy, Kenji Okazaki, Caroline A. Stokes, Shin Onbe, Satoshi Hatakeyama, Kenichi Machida, Kenji Kasai, Naoto Tomioka, Akihiko Matsumoto, Masafumi Ito, Yoshitaka Kojima, Daniel G. Bradley, Takashi Gakuhari, and Shigeki Nakagome

Abstract

Prehistoric Japan underwent rapid transformations in the past 3000 years, first from foraging to wet rice farming and then to state formation. A long-standing hypothesis posits that mainland Japanese populations derive dual ancestry from indigenous Jomon hunter-gatherer-fishers and succeeding Yayoi farmers. However, the genomic impact of agricultural migration and subsequent sociocultural changes remains unclear. We report 12 ancient Japanese genomes from pre- and postfarming periods. Our analysis finds that the Jomon maintained a small effective population size of ~1000 over several millennia, with a deep divergence from continental populations dated to 20,000 to 15,000 years ago, a period that saw the insularization of Japan through rising sea levels. Rice cultivation was introduced by people with Northeast Asian ancestry. Unexpectedly, we identify a later influx of East Asian ancestry during the imperial Kofun period. These three ancestral components continue to characterize present-day populations, supporting a tripartite model of Japanese genomic origins.

За последние 3000 лет доисторическая Япония претерпела быстрые трансформации, сначала от собирательства к влажному рисоводству, а затем к образованию государства. Давняя гипотеза гласит, что население материковой Японии имеет двойное происхождение от коренных охотников-собирателей-рыболовов Дзёмон и сменивших их земледельцев Яёй. Однако геномное воздействие сельскохозяйственной миграции и последующих социокультурных изменений остается неясным. Мы представляем 12 древних японских геномов, относящихся к периодам до и после земледелия. Наш анализ показывает, что в течение нескольких тысячелетий Дзёмон поддерживали небольшую эффективную численность населения ~1000 человек, при этом глубокая дивергенция с континентальными популяциями произошла 20 000-15 000 лет назад, в период, когда произошла изоляция Японии в результате повышения уровня моря. Культивирование риса было введено людьми с северо-восточными азиатскими корнями. Неожиданно мы обнаружили более поздний приток предков из Восточной Азии во время имперского периода Кофун. Эти три предковых компонента продолжают характеризовать современные популяции, поддерживая трехстороннюю модель геномного происхождения Японии.

Переведено с помощью www.DeepL.com/Translator (бесплатная версия)

Код: [Выделить]

Associated culture Sample ID Date range and median(cal B.P.) Coverage mtDNA contamination rate(%) Molecular sex mtDNA haplogroup Y chromosome haplogroup Ref. Newly sequenced in this study
Jomon JpKa6904 8646–8991; 8819 7.51 1.46 XX N9b3 – –
JpOd274 6119–6289; 6204 1.56 1.13 XY M7a D1b1d1 –
JpOd6 5934–6179; 6057 1.18 1.55 XX N9b3 – –
JpOd181 5751–5917; 5834 1.83 0.91 XY N9b1 D1b1d1 –
JpOd282 5737–5902; 5820 0.96 1.38 XY M7a1 D1b1d1 –
JpFu1 5478–5590; 5534 1.13 2.15 XX M7a1 – –
JpKo2 4294–4514; 4404 2.47 1.44 XX N9b – –
JpKo13 3847–3978; 3913 1.81 1.50 XX N9b1 – –
JpHi01 3685–3850; 3768 0.88 1.45 XX M7a1a – –
Kofun JpIw32 1347–1409; 1378 4.80 0.41 XY B5a2a1b O3a2c –
JpIw31 1303–1377; 1340 1.44 0.63 XX D5c1a – –
JpIw33 1295–1355; 1325 1.54 0.75 XX M7b1a1a1 – –
Previously published
Jomon F23 3550–3960; 3755 34.82 1.20 XX N9b1 - (14)