Кавказский зигзаг

[Valery]

Поскольку 408A - птичка редкая, то матч железный

[Valery]

Вы бы могли и сами, не дожидаясь покуда я почешусь, их найти. Ирвиновская выборка - судебная, значит, наверняка есть у Парсона на EMPOP. Эмпоп орг - серчибельная онлайн база.

[Valery]

С кавказскими длинными ГВС2 - плохо, если среди ГВС1=16311 такое и есть, то не в базах. Мы например в основном ставили только начальные огрызки кавказских ГВС2 в одной реакции с ГВС1, на одном праймере.

[Valery]

может ли кыргыз иметь уйгурскую бабушку - даже не знаю )) но не суть важно: понятно, что в ЦА эта штука скорее всего одного происхождения

[Valery]

По моей статистике (правда много лет не обновляемой) 15334 - уникальная мутация на дереве

[Valery]

Со всеми нашими с ней тремя, 8598С, 408А и 15334Т, никого в эмпопе и neighbours нет.  Но и так сюрприз.  Это их неправильно классифицировали, или нас?

На эмпопе пожалуй следует искать только по ГВС, тк там не густо с полными сиквенсами. Вам в даннннном случае нужны полные совпаденцы, или хотя бы все у кого есть и 408 и 16311. Прочие будут чересчур далекой родней. Вообще любая новая хрень в ГВС - это тысячелетия до предка. Что-то вроде 16090-16365 40-408 152C 263G 408A 16311C, и может даже поз. 152 затемнить: 152N.

[Valery]

Если sources не врут, то 15334 это филогенетическая мутация для брахминов Утар-Прадеша с группой R31a.     И мы две такие с ней сидим.  Феоктиста Евграфовна с Сарой Исаковной.

у меня старое дерево, не обновляемое с 2013

[Valery]

Так, у моей совпаденки с кавказской ашкенази-бабушкой в ГВС1 дополнительно (к 16311) есть еще 16362C
Значит мы с ней разлетелись, несмотря на общие H2b и редкие  408А и 15334Т?

Я что-то туплю. А не очень ли вас затруднит еще раз перечислить все ГВСы о которых речь? Ну, всех действующих лиц.

[Oxon]

Вот эти, что я дала выше, это мои были ГВС-мутации
16311C
152C 263G 309.1C 309.2C 315.1C 408A

Она от меня дистанция-1, у неё ещё в гвс1 дополнительно 16362C.   

Все остальные совладенцы от нас отличаются в CR на мутацию 15334 

[Valery]

Все остальные совладенцы от нас отличаются в CR на мутацию 15334

а в чем они с вами совпадают?

[Oxon]

408А ещё у 4 человек есть.  Но у них нет 15334 в CR.  Но от неё они ещё на шаг дальше из-за этой её дополнительной индивидуальной 16362C в HVR1

[Valery]

408А ещё у 4 человек есть.  Но у них нет 15334 в CR.  Но от неё они ещё на шаг дальше из-за этой её дополнительной индивидуальной 16362C в HVR1

и 16311 они имеют все?

[Oxon]

Все.  Полные совпаденцы у меня по HVR1 и 2.  Но она их не видит на этом уровне из-за её 16362, но она их же видит в mtfull как совпаденцев с дистанцией 2.    Фтдна мне в уровне "HVR1, HVR2, CR" ставит её самой близкой совпаденкой.  А их всех дальше. 

[Valery]

Все.  Полные совпаденцы у меня по HVR1 и 2.  Но она их не видит на этом уровне из-за её 16362, но она их же видит в mtfull как совпаденцев с дистанцией 2.    Фтдна мне в уровне "HVR1, HVR2, CR" ставит её самой близкой совпаденкой.  А их всех дальше.

Если четверо др с другом идентичны, то Ро-возраст по полной молекуле всей клады будет 3 мутации на 6 персон (15334 считаем дважды, 16362 один раз) = (3/6) * 3500 лет = 1750 лет, но там плюс-минус более чем на половину этой штуки точно. Но это еще относительно малый возраст. Будь в наличии только европейские матчи - все ок (а перечисленные совпаденцы - откуда?).

Труднее с киргизами. ГВС1-клада на 8 человек с одной мутацией (добавил вас, девушку, четверых матчей ft и киргизов, мутация лишь у сабжевой девушки) - это (1/8) * 20000 лет, то есть 2500. Почти то же, что по полным. И мы не знаем полного сиквенса киргизов, кстати. потому и считаю по ГВС1. Если учесть, что ГВС2 идентичны, то возраст можно понизить в 2 раза. Ну не верится мне в такие дальние путешествия относительно недавних бабушек. Аэроп Манас таки еще не работал.

[Valery]

ГВС2 идентичны, то возраст можно понизить в 2 раза

Пардон, по памяти не скажу точно - должно в полтора уменьшиться. Камбинированный икспектейшн по ГВС1+2 будет где-то 1 мут в 15000 лет. И получится совсем то же что по полным сиквенсам. Пока расчеты феерически сходятся (ну, игнорируя доверительный), а историческая картинка - хренотень какая-то.