АвторТема: Филогенетическая история Y-ДНК линий, редких в Северной и Восточной Европе  (Прочитано 250 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн rozenblattАвтор темы

  • Сообщений: 1493
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1934/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
https://www.nature.com/articles/s41431-021-00897-8

Phylogenetic history of patrilineages rare in northern and eastern Europe from large-scale re-sequencing of human Y-chromosomes

    Anne-Mai Ilumäe, Helen Post, Rodrigo Flores, Monika Karmin, Hovhannes Sahakyan, Mayukh Mondal, Francesco Montinaro, Lauri Saag, Concetta Bormans, Luisa Fernanda Sanchez, Adam Ameur, Ulf Gyllensten, Mart Kals, Reedik Mägi, Luca Pagani, Doron M. Behar, Siiri Rootsi & Richard Villems

European Journal of Human Genetics (2021)

Abstract

The most frequent Y-chromosomal (chrY) haplogroups in northern and eastern Europe (NEE) are well-known and thoroughly characterised. Yet a considerable number of men in every population carry rare paternal lineages with estimated frequencies around 5%. So far, limited sample-sizes and insufficient resolution of genotyping have obstructed a truly comprehensive look into the variety of rare paternal lineages segregating within populations and potential signals of population history that such lineages might convey. Here we harness the power of massive re-sequencing of human Y chromosomes to identify previously unknown population-specific clusters among rare paternal lineages in NEE. We construct dated phylogenies for haplogroups E2-M215, J2-M172, G-M201 and Q-M242 on the basis of 421 (of them 282 novel) high-coverage chrY sequences collected from large-scale databases focusing on populations of NEE. Within these otherwise rare haplogroups we disclose lineages that began to radiate ~1–3 thousand years ago in Estonia and Sweden and reveal male phylogenetic patterns testifying of comparatively recent local demographic expansions. Conversely, haplogroup Q lineages bear evidence of ancient Siberian influence lingering in the modern paternal gene pool of northern Europe. We assess the possible direction of influx of ancestral carriers for some of these male lineages. In addition, we demonstrate the congruency of paternal haplogroup composition of our dataset with two independent population-based cohorts from Estonia and Sweden.

Наиболее часто встречающиеся Y-хромосомные (chrY) гаплогруппы в Северной и Восточной Европе (СВЕ) хорошо известны и подробно описаны. Тем не менее, значительное число мужчин в каждой популяции являются носителями редких отцовских линий с частотой около 5%. До сих пор ограниченные размеры выборки и недостаточное разрешение генотипирования препятствовали действительно всестороннему изучению разнообразия редких отцовских линий, сегрегации в популяциях и потенциальных сигналов истории популяций, которые могут передавать такие линии. Здесь мы используем возможности массового повторного секвенирования Y-хромосомы человека для выявления ранее неизвестных популяционных кластеров среди редких отцовских линий в СВЕ. Мы построили датированные филогении для гаплогрупп E2-M215, J2-M172, G-M201 и Q-M242 на основе 421 (из них 282 новых) высокопокрытых хромосомных последовательностей, собранных из крупномасштабных баз данных, сосредоточенных на популяциях СВЕ. В рамках этих редких гаплогрупп мы обнаружили линии, которые начали распространяться ~1-3 тысячи лет назад в Эстонии и Швеции, и выявили филогенетические модели мужчин, свидетельствующие о сравнительно недавних местных демографических экспансиях. И наоборот, линии гаплогруппы Q свидетельствуют о древнем сибирском влиянии, сохраняющемся в современном отцовском генофонде Северной Европы. Мы оцениваем возможное направление притока предков-носителей для некоторых из этих мужских линий. Кроме того, мы демонстрируем соответствие состава отцовских гаплогрупп в нашем наборе данных с двумя независимыми популяционными когортами из Эстонии и Швеции.

Переведено с помощью www.DeepL.com/Translator (бесплатная версия)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.