Предиктор этногеографического происхождения от лаборатории Балановских

[Petosiris]

Месяц назад, участник нашего форума Валерий Бибиков записал интервью у Олега Балановского  в своем стриме на Youtube https://www.youtube.com/watch?v=JSkXehWkOVU&t=4381s.
Очень интересно, всем рекомендую! Самое запоминающееся для меня, была информация, что популяционные генетики разработали, по заказу МВД карту происхождения по аутосомным маркерам.

Так, что похоже скоро у полиции будет новый метод поиска людей.

[Petosiris]

Кстати Балановский был очень удивлен, что не обнаружили отдельной беларусской группы.

[Petosiris]

Теперь рассмотрим украинцев и русских. Если с украинцами, зная их историю и, то что от Сяна и до Дона один, средне-украинский антропологический тип все понятно, то русские центральной России, по мнению антропологов, см. Алексеева "АНТРОПОЛОГИЧЕСКИЙ ОБЛИК РУССКОГО НАРОДА" https://www.booksite.ru/ancient/reader/human_1_04.htm
имеют большое разнообразие типов, но почему-то аутосомно одинаковы?

Географические зоны антропологических типов русских:

1 – ильменско-белоозерская, II – валдайсхо-соротская, III – западная верхневолжская,
IV – восточная верхневолжская, V – вологдо-вятская, VI – вятско-каискан, VII – клязьминская,
VIII – центральная, IX – док-сурехая, X – степная, XI – средневолжская, ХII – верхнео

[Yaroslav]

Самое запоминающееся для меня, была информация, что популяционные генетики разработали, по заказу МВД карту происхождения по аутосомным маркерам.

Интересно, как к этому отнесётся наш постоянный читатель, биохимик из Бостона Анатолий К.? МВД заказывает карту, основанную на попгенетическом аутосомном мракобесии...)))

Хотя, самому любопытно, что будет в ситуациях, когда дело касается таких метисов указанных на карте 21-го и 22-го регионов, как я?

[maxmalk]

почему-то аутосомно одинаковы?

Странно. В статье Балановских 2020 года по Тверской области они выделяли аутосомные ареалы русских даже внутри одного региона.
Т.е. говорили, что население запада Тверской области тяготеет к их западным соседям (экс-кривичи), а востока и севера - к новгородцам (экс-словене). И всё это - безотносительно их связей с карелами.
https://vestnik.rsmu.press/archive/2020/6/4/abstract?lang=ru

Думаю, что и по другим областям можно найти такие различия. Толи не успели плотно обработать другие регионы также как Тверскую, то ли политзаказ (что странно, зачем это Балановским, которые вроде не замечены, и зачем это МВД, которому нужны в данном случае различия, а не монолитное единство).

[Petosiris]

почему-то аутосомно одинаковы?

Странно. В статье Балановских 2020 года по Тверской области они выделяли аутосомные ареалы русских даже внутри одного региона.
Т.е. говорили, что население запада Тверской области тяготеет к их западным соседям (экс-кривичи), а востока и севера - к новгородцам (экс-словене). И всё это - безотносительно их связей с карелами.
https://vestnik.rsmu.press/archive/2020/6/4/abstract?lang=ru

Думаю, что и по другим областям можно найти такие различия. Толи не успели плотно обработать другие регионы также как Тверскую, то ли политзаказ (что странно, зачем это Балановским, которые вроде не замечены, и зачем это МВД, которому нужны в данном случае различия, а не монолитное единство).

Единственное объяснение, различия в Центральной России не столь значительные, по сравнению с соседними регионами...?

[R1a-Stolin]

Кстати Балановский был очень удивлен, что не обнаружили отдельной беларусской группы.

Чему он удивлён, если сам выкладывал карты, как полеские беларусы неотличимы от украинцев? Скорее странно, что молдаване в той же группе, хотя дистанция между ними и большинством украинцев значительная.

[Petosiris]

Кстати Балановский был очень удивлен, что не обнаружили отдельной беларусской группы.

Чему он удивлён, если сам выкладывал карты, как полеские беларусы неотличимы от украинцев? Скорее странно, что молдаване в той же группе, хотя дистанция между ними и большинством украинцев значительная.

Я тоже заметил!

[Kambic]

Кто скрывается за номером 29? На выше приведённой карте Крым и центральный Кавказ отмечен одной цифрой 29. Это греки или армяне? У разработчиков вроде есть детальные исследования  по племенам Крыма.

Так самый большой процент "европейских" гаплогрупп оказался у тюркоязычных урумов, проживавших на месте, где когда-то существовала Крымская Готия, окончательно уничтоженная в 1475 году турками(падение княжества Феодоро).
https://forum.molgen.org/index.php/topic,7471.msg275377.html#msg275377
Видимо, некоторая часть готского населения после разгрома турками крымского княжества Феодоро 1475 году ушла к ногайцам. Далее в составе ногайцев дошли до Башкирии, где уже вошли в состав башкир как племя Айле.

Урумы - потомки гото-аланов (православные, поэтому они себя считают греками) из окрестностей Бахчисарая, страны Татов...
Ногайцы там появились значительно позже!

На востоке Крыма проживали румеи, а не урумы. Урумы это, всё таки, в основном греки южнобережные. Крымские татары по своей природе в основном отюреченные местные автохтоны со средиземноморской и кавказской генетикой. Попыток отфильтровать как то готов и алан от греков вроде пока не было.

Предки карачаевцев  жили в Крыму рядом  с татами(горные татары ) ,которые  являются потомками готов ,принявших Ислам и перешедших на татарский язык  и они по всей видимости вступали в брачные отношения .После прихода на Кавказ карачаевцы поселились высоко в горах , кроме сванов мало с кем смешивались

Откуда информация? Интересно, то что ведущее племя Крымского царства было ширин и похоже - это потомки алан.

Ширин не племя, а  отдельный правящий нечингизидский золотоордынский род, у протестированного из этого рода(несмотря на тюркскую легенду) определили монгольскую Y- гг С. Ширинские практически не смешивались с местными, а только с Гераями, тоже монгольский род. Другое дело территория, которую они контролировали- восточный Крым(румеи), где нет генетического следа средневековых степных кочевников.
 
Есть же хорошая работа Агджоян А.Т. (около 500 респондентов) и другие   мелкие  выборки. Все крымские племена генетически преимущественно средиземноморцы, но у восточных  и горных есть связь с центральными северокавказцами, в этих регионах и упоминались аланы, да и сами аланы считали себя тоже понтийцами.
 При этом, восточные(румеи) практически не получили азиатских ген, даже в сравнении с южнобережными урумами.

[Srkz]

http://генофонд.рф/?page_id=35416

Российские исследователи разработали систему, позволяющую по ДНК определить этногеографическое происхождение индивида. Система основана на анализе около 5000 SNP, ассоциированных с происхождением в популяциях Северной Евразии. Она была создана в результате исследования 1883 образцов ДНК из 266 популяций, которые были объединены в 29 этногеографических групп (ЭГГ). После отбора 5229 SNP, отличающих каждую ЭЭГ от других, была создана модель для предсказания происхождения индивида из какой-либо ЭЭГ. В среднем точность предикции для 29 ЭЭГ составила 71%, при этом абсолютную точность модель продемонстрировала для Южной и Центральной Сибири, Дальнего Востока и Камчатки. Предложенный метод может быть использован с целью определения происхождения индивида для популяций России и сопредельных стран, области его применения – криминалистическая наука и генетическая генеалогия.

Доля правильных предикций (совпадений между реальной ЭГГ и предсказанной ЭГГ) в среднем составляла 71%. На карте доля правильных предикций (совпадений между реальным и предсказанным регионом) составляла 61% для наиболее вероятных регионов происхождения (вероятность более 0,4) и 81% для объединения наиболее вероятных и менее вероятных регионов происхождения (вероятность более 0,2). Объединение ЭГГ в большие кластеры или расширение географического ареала происхождения увеличивает точность модели (долю правильных предикций), но снижает информативную ценность метода (географическую точность).  Отсюда возникает необходимость поиска правильного баланса между точностью и информационной ценностью. Абсолютная точность предикции была достигнута для большинства ЭГГ Сибири, Дальнего Востока и Камчатки.  Хорошая точность была достигнута для популяций Восточной Европы, Урала, Западной Сибири, Кавказа и Центральной Азии, небольшие отклонения можно, вероятно, объяснить высокой генетической гетерогенностью этих регионов. Повысить точность, как предполагают авторы, можно будет при увеличении размера выборки.

Авторы полагают, что разработанный ими метод в его текущем состоянии может быть применим для предсказания происхождения индивида для популяций России и сопредельных стран. В этом качестве он может использоваться в криминалистике и в генетической генеалогии. Его ограничением они считают два фактора: первый — высокая стоимость генотипирования, второй – то что метод пока не был испытан на индивидах смешанного происхождения.

Что лично мне показалось интересным - если на графиках ничего не напутано, они там нашли какие-то специфичные для группы "русские и белорусы" снипы, отличающие их от украинцев и других. Впрочем, прибалтов и поляков в анализе нет, так что снипы могут оказаться не такими уж специфичными в итоге.

upd По усмотрению модераторов можно объединить с предыдущей темой: https://forum.molgen.org/index.php/topic,13438.0.html

[kapustin]

http://генофонд.рф/?page_id=35416

Российские исследователи разработали систему, позволяющую по ДНК определить этногеографическое происхождение индивида. Система основана на анализе около 5000 SNP, ассоциированных с происхождением в популяциях Северной Евразии. Она была создана в результате исследования 1883 образцов ДНК из 266 популяций, которые были объединены в 29 этногеографических групп (ЭГГ). После отбора 5229 SNP, отличающих каждую ЭЭГ от других, была создана модель для предсказания происхождения индивида из какой-либо ЭЭГ. В среднем точность предикции для 29 ЭЭГ составила 71%, при этом абсолютную точность модель продемонстрировала для Южной и Центральной Сибири, Дальнего Востока и Камчатки. Предложенный метод может быть использован с целью определения происхождения индивида для популяций России и сопредельных стран, области его применения – криминалистическая наука и генетическая генеалогия.

Доля правильных предикций (совпадений между реальной ЭГГ и предсказанной ЭГГ) в среднем составляла 71%. На карте доля правильных предикций (совпадений между реальным и предсказанным регионом) составляла 61% для наиболее вероятных регионов происхождения (вероятность более 0,4) и 81% для объединения наиболее вероятных и менее вероятных регионов происхождения (вероятность более 0,2). Объединение ЭГГ в большие кластеры или расширение географического ареала происхождения увеличивает точность модели (долю правильных предикций), но снижает информативную ценность метода (географическую точность).  Отсюда возникает необходимость поиска правильного баланса между точностью и информационной ценностью. Абсолютная точность предикции была достигнута для большинства ЭГГ Сибири, Дальнего Востока и Камчатки.  Хорошая точность была достигнута для популяций Восточной Европы, Урала, Западной Сибири, Кавказа и Центральной Азии, небольшие отклонения можно, вероятно, объяснить высокой генетической гетерогенностью этих регионов. Повысить точность, как предполагают авторы, можно будет при увеличении размера выборки.

Авторы полагают, что разработанный ими метод в его текущем состоянии может быть применим для предсказания происхождения индивида для популяций России и сопредельных стран. В этом качестве он может использоваться в криминалистике и в генетической генеалогии. Его ограничением они считают два фактора: первый — высокая стоимость генотипирования, второй – то что метод пока не был испытан на индивидах смешанного происхождения.

Что лично мне показалось интересным - если на графиках ничего не напутано, они там нашли какие-то специфичные для группы "русские и белорусы" снипы, отличающие их от украинцев и других. Впрочем, прибалтов и поляков в анализе нет, так что снипы могут оказаться не такими уж специфичными в итоге.

upd По усмотрению модераторов можно объединить с предыдущей темой: https://forum.molgen.org/index.php/topic,13438.0.html

В своей книге "Генофонд Европы" они объединяли украинцев и белорусов из западного Полесья в один кластер и  русских, других белорусов и поляков, особенно из Мазовии, в другой кластер.

[Srkz]

В своей книге "Генофонд Европы" они объединяли украинцев и белорусов из западного Полесья в один кластер и  русских, других белорусов и поляков, особенно из Мазовии, в другой кластер.

Тут интересно, что все северные русские тоже туда вошли (левый верхний угол). Картинка вот эта: "График анализа главных компонент, основанный на отобранных 5000 SNP (Gorin et al., 2022)." С обычным PCA чуть выше заметно различается.

[kapustin]

В своей книге "Генофонд Европы" они объединяли украинцев и белорусов из западного Полесья в один кластер и  русских, других белорусов и поляков, особенно из Мазовии, в другой кластер.

Тут интересно, что все северные русские тоже туда вошли (левый верхний угол). Картинка вот эта: "График анализа главных компонент, основанный на отобранных 5000 SNP (Gorin et al., 2022)." С обычным PCA чуть выше заметно различается.

Вообще то по их картам - нет. Он объединял Северных русских с Прибалтикой (всей), Карелами и прочими фино-уграми Европейской части России (за исключением мордвы).

[kapustin]

В своей книге "Генофонд Европы" они объединяли украинцев и белорусов из западного Полесья в один кластер и  русских, других белорусов и поляков, особенно из Мазовии, в другой кластер.

Тут интересно, что все северные русские тоже туда вошли (левый верхний угол). Картинка вот эта: "График анализа главных компонент, основанный на отобранных 5000 SNP (Gorin et al., 2022)." С обычным PCA чуть выше заметно различается.

[kapustin]

В своей книге "Генофонд Европы" они объединяли украинцев и белорусов из западного Полесья в один кластер и  русских, других белорусов и поляков, особенно из Мазовии, в другой кластер.

Тут интересно, что все северные русские тоже туда вошли (левый верхний угол). Картинка вот эта: "График анализа главных компонент, основанный на отобранных 5000 SNP (Gorin et al., 2022)." С обычным PCA чуть выше заметно различается.

Вообще то по их картам - нет. Он объединял Северных русских с Прибалтикой (всей), Карелами и прочими фино-уграми Европейской части России (за исключением мордвы).

http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=5467