Туберкулез повлиял на генофонд популяций в Европе

[pashka_1604]

Туберкулез повлиял на генофонд популяций в Европе (http://xn--c1acc6aafa1c.xn--p1ai/?page_id=33665)

По древней ДНК ученые проследили за изменением частоты генетического варианта, повышающего риск заболевания туберкулезом. Они показали, что около 2000 лет назад в европейских популяциях этот вариант попадает под сильное давление отрицательного отбора. По времени это совпадает с распространением в Европе туберкулеза.

Палеогенетики с помощью анализа древней ДНК исследовали историю взаимоотношений человека и бактерии — возбудителя туберкулеза (Mycobacterium tuberculosis). Они показали, как микобактерия повлияла на генетическую изменчивость в популяциях. Статья с результатами этой работы опубликована в журнале Cell. В ней использован открытый в 2018 году генетический маркер высокого риска туберкулеза. Было показано, что гомозиготы по определенному варианту гена тирозинкиназы 2 (TYK2) – обладатели аллеля P1104A, имеют высокий риск заболевания из-за нарушения интерлейкиновой (IL-23) иммунной защиты от микобактерий.

Специалисты считают, что возбудители летальных заболеваний (а туберкулез имеет высокую летальность) в эволюции человека сыграли значительную роль как фактор отбора, поскольку генетические варианты устойчивости к ним давали большое преимущество в выживании. Чтобы проследить это на примере туберкулеза, авторы реконструировали эволюцию рискового генетического варианта TYK2 P1104A. Они предполагали, что, как всякий аллель, повышающий риск инфекционного заболевания, он должен был находиться под сильным отрицательным отбором.

Частоту аллеля TYK2 P1104A изучили в геномах древних европейцев, проанализировав 1 013 геномов, которые охватывали период 10 тысяч лет, от мезолита до средних веков. Геномные данные были взяты из опубликованных статей по древней ДНК на территории разных стран Европы.

Источник:

Gaspard Kerne, Guillaume Laval, Etienne Patin et al. Human ancient DNA analyses reveal the high burden of tuberculosis in Europeans over the last 2,000 years //  Cell, Volume 108, ISSUE 3, P517-524, March 04, 2021 DOI:https://doi.org/10.1016/j.ajhg.2021.02.009

Статья в открытом доступе https://www.cell.com/ajhg/fulltext/S0002-9297(21)00051-3