АвторТема: Интерпретация данных из genotek  (Прочитано 4323 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн ChАвтор темы

  • Сообщений: 15
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: N1a1-(N-VL29)
  • мтДНК: U
Интерпретация данных из genotek
« : 08 Декабря 2020, 14:56:54 »
Привет,
парни, подскажите, насколько корректно прошла интерпретация и определение гаплогруппы?
Данные получены путем перевода vcf(genotek)->23andme-> Morley SNPs
Достаточно ли данных? Где еще по таким данным можно провести оценку?
Первый день в генеалогии, поэтому прошу не судить строго.

Снипы здесь
https://whosts.ru/fF1Y3gy3Rk

Еще картинка по ссылке (здесь почему-то не загрузилась)
https://ibb.co/kX0zgxb




Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 6494
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4885/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #1 : 08 Декабря 2020, 15:18:48 »
Привет,
парни, подскажите, насколько корректно прошла интерпретация и определение гаплогруппы?
Данные получены путем перевода vcf(genotek)->23andme-> Morley SNPs
Достаточно ли данных? Где еще по таким данным можно провести оценку?
Первый день в генеалогии, поэтому прошу не судить строго.

Снипы здесь
https://whosts.ru/fF1Y3gy3Rk

Еще картинка по ссылке (здесь почему-то не загрузилась)
https://ibb.co/kX0zgxb

Тут явная ошибка в структуре используемого дерева... Обратите внимание, что определенный терминальным M46 встречается в двух местах на указанном дереве. На самом деле в одном, том что выше. Так что если других данных по снипам нет, то субклад будет N-VL29 (xL550)

Оффлайн ChАвтор темы

  • Сообщений: 15
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: N1a1-(N-VL29)
  • мтДНК: U
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #2 : 08 Декабря 2020, 15:41:24 »
Тут явная ошибка в структуре используемого дерева... Обратите внимание, что определенный терминальным M46 встречается в двух местах на указанном дереве. На самом деле в одном, том что выше. Так что если других данных по снипам нет, то субклад будет N-VL29 (xL550)
Спасибо за ответ
Сделал интерпретацию другим сервисом ( https://cladefinder.yseq.net/index.php ) - результат такой же
Может дело в исходных данных?



Цитировать
L550
Как я понял по графику - у меня этого нет

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 1279
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1215/-2
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #3 : 08 Декабря 2020, 16:11:06 »
Тут явная ошибка в структуре используемого дерева... Обратите внимание, что определенный терминальным M46 встречается в двух местах на указанном дереве. На самом деле в одном, том что выше. Так что если других данных по снипам нет, то субклад будет N-VL29 (xL550)
Спасибо за ответ
Сделал интерпретацию другим сервисом ( https://cladefinder.yseq.net/index.php ) - результат такой же
Может дело в исходных данных?
Как я понял по графику - у меня этого нет
Yseq кажется должен принять VCF от Генотека, без всяких конвертаций. Вы его прогнали через этот сервис?

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 6494
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4885/-5
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #4 : 08 Декабря 2020, 16:11:12 »
Тут явная ошибка в структуре используемого дерева... Обратите внимание, что определенный терминальным M46 встречается в двух местах на указанном дереве. На самом деле в одном, том что выше. Так что если других данных по снипам нет, то субклад будет N-VL29 (xL550)
Спасибо за ответ
Сделал интерпретацию другим сервисом ( https://cladefinder.yseq.net/index.php ) - результат такой же
Может дело в исходных данных?

Цитировать
L550
Как я понял по графику - у меня этого нет
Указанный сервис использует дерево YFull, так что все верно.
(xL550) - это значит что у вас L550 признан отрицательным.

Оффлайн ChАвтор темы

  • Сообщений: 15
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: N1a1-(N-VL29)
  • мтДНК: U
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #5 : 08 Декабря 2020, 16:17:43 »
Yseq кажется должен принять VCF от Генотека, без всяких конвертаций. Вы его проглани через этот сервис?
Да, тот же результат

Указанный сервис использует дерево YFull, так что все верно.
(xL550) - это значит что у вас L550 признан отрицательным.
Принял, спасибо.
Если ли смысл делать какие-то дополнительные исследования, или мои данные достаточно исчерпывающие?
Просто, как мне кажется, N-VL29 дает не там много информации.
Если я не смог войти в другие группы - можно ли выделить свой отдельный субсклад (если я правильно понимаю о чем говорю)?
« Последнее редактирование: 08 Декабря 2020, 16:28:58 от Ch »

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 19114
  • Страна: az
  • Рейтинг +7213/-18
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #6 : 08 Декабря 2020, 16:37:40 »
Ответ один: для более детального результата вам надо пройти тест в другой лаборатории - FTDNA или Nebula.
Всё зависит от ваших конкретных целей.

Оффлайн Александр Ловягин

  • Сообщений: 7
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
  • Y-ДНК: T-Y641354
  • мтДНК: U4d1a1
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #7 : 15 Августа 2024, 18:14:14 »
Добрый день!
Коллеге Генотек нашёл гаплогруппы N1c1a1a1a и N1c1a1a1a2. Подскажите, пожалуйста, какие это обозначения в ISOGG?

Оффлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R-L365->R-Y596405
  • Сообщений: 1585
  • Страна: 00
  • Рейтинг +683/-6
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1a5
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #8 : 21 Августа 2024, 17:50:52 »
Добрый день!
Коллеге Генотек нашёл гаплогруппы N1c1a1a1a и N1c1a1a1a2. Подскажите, пожалуйста, какие это обозначения в ISOGG?

Посмотрите там же в Генотеке, они пишут нормальный снип в разделе «Миграции»

Онлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 19114
  • Страна: az
  • Рейтинг +7213/-18
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Интерпретация данных из genotek
« Ответ #9 : 21 Августа 2024, 20:04:31 »
Цитировать
N1c1a1a1a и N1c1a1a1a2
N-VL29 и N-CTS9976 соответственно

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.