Создание региональных выборок для русских.

[Roaring]

В виду малого количества региональных выборок для русских решил сам начать потихоньку собирать базу данных.

Целью данного проекта является создание региональных выборок русских по всем областям европейской части РФ.

Прошу предоставлять результаты калькуляторов Eurogenes K13, K15, K36, и, если имеются G25 для людей имеющих всех четырех бабушек и дедушек из одной области/региона.

[Valery]

Вы покушаетесь на наш хлеб, оплаченный государственными деньгами )) Среди жителей крупных городов 4/4 - реально редкие птички. за такими анкетами (4/4) надо самим ездить по деревням и все это оплачивать. Еще, как вариант - мелкие "депрессивные" города, подальше от агломераций, там может быть до половины жителей из окрестных районов.

[redisik]

Вы покушаетесь на наш хлеб, оплаченный государственными деньгами )) Среди жителей крупных городов 4/4 - реально редкие птички. за такими анкетами (4/4) надо самим ездить по деревням и все это оплачивать. Еще, как вариант - мелкие "депрессивные" города, подальше от агломераций, там может быть до половины жителей из окрестных районов.

главная проблема в каком направление они пошлют данного исследователя и на каком говоре))) хотя за бутылку водки? но проблема в том что те которые за бутылку это как правило генетика нескольких поколений и такие люди едва ли хранят семейные предания, в точности готовы их подтвердить (ну либо придумают и подтвердят все что угодно за вознаграждение)
насколько я понимаю из за специфичности дохристианской формы погребения самыми перспективными являются болота, вот наверное и там надо искать, но наверное это жутко дорого и не всегда с пользой

[valera27]

Интересуют номера на Гедматч супергомогенных (по региону) русских с хорошопроработанной родословной? Их есть у меня.

M084421 - исследовано чудовищное количество (около сотни) линий до конца 16 века. Все - бесфамильные частновладельческие крепостные с небольшой территории частично Мышкинского, частично Мологского уезда (до второй половины 18 века это Верховский стан Ярославского уезда). Лишь одна небольшая ветка уходит в Пошехонский уезд (что тоже в общем-то рядом). Ни сицкарей, ни карелов, ни каких-либо ещё инородцев не было.

M576228 - потомок однодворцев Ливенского уезда. Почти все из нескольких десятков известных линий - с небольшой территории севернее Ливен, редкие исключения тоже жили в том же уезде. На момент правления Петра все были детьми боярскими. В 17 веке одна линия поверсталась из казаков, пара линий взялась непонятно откуда, а все остальные были в числе первых помещиков Ливенского уезда (упоминаются в писцовой книге 1615 года); люди с такими же фамилиями служат и в 16 веке по разным уездам. Утилита определения родства родителей находит 1.21% идентичных генов от мамы и от папы (forth cousins)

Если интересует гомогенность с региональной точки зрения, без привязки к сословиям - продолжаю:

M558811 - отец предыдущий человек, а мать - потомок крепостных одного и того же владельца (по крайней мере до первой половины 18 века), все его деревни были в Малоархангельском уезде возле границы с Ливенским (в 17-18 веках это был тоже Ливенский уезд). Но в 18 веке среди предков попалась и однодворческая дочь, продавшаяся в крепость, тоже из ливенских детей боярских.

M060515 - (это я))) Мать - уже описал в предыдущем абзаце. Отец - примерно из того же материала, что и дед по маме (на момент Петра все дети боярские, в 17 веке пара линий из казаков, пара - видимо из других уездов, все остальные - первые помещики уезда), только жили по большей части в югу и западу от Ливен. По поводу прапрапрабабушки (т.е. 1/32) есть подозрения, что она не из русских (цыганка или ещё кто), но скорее всего это только подозрения...

[valera27]

Кстати интересно про M084421 ("эталон" русских Ярославщины)

K13:

#   Population   Percent
1   Baltic   45.59
2   North_Atlantic   30.83
3   West_Med   8.07
4   Siberian   4.08
5   West_Asian   3.51
6   East_Med   3.33
7   South_Asian   1.95
8   Amerindian   1.68
9   Northeast_African   0.75
10   Oceanian   0.22

Single Population Sharing:

#   Population (source)   Distance
1   Polish   5.09
2   Estonian_Polish   5.28
3   Belorussian

K15:

#   Population   Percent
1   Baltic   29.64
2   North_Sea   23.21
3   Eastern_Euro   17.77
4   Atlantic   17.25
5   West_Med   3.76
6   Siberian   3.22
7   West_Asian   1.7
8   South_Asian   1.47
9   Amerindian   1.32
10   Northeast_African   0.62
11   Oceanian   0.06

Single Population Sharing:

#   Population (source)   Distance
1   Estonian   4.51
2   Polish   5.32
3   South_Polish

Оракулы этих двух калькуляторов зарекомендовали себя как достаточно адекватные, в то же время данному образцу в качестве первых выборов подсовывает поляков. Вспоминается книга о самых первых славянских диалектах (Дыбо со товарищи), на основе которой уважаемый форумчанин Daemon2017 составил карту (где-то здесь):

http://forum.molgen.org/index.php/topic,7326.2175.html

На карте это красный цвет ("ляшско-мерянский" диалект)

[kardes]

Есть возможность бесплатно исследоваться за счёт науки, но нужны добровольцы поморы:
"о предстоящей экспедиции генетиков в Архангельскую область зав. лаб. геномной географии ИОГен РАН, профессор РАН Олег Балановский рассказал об экспедиции, которая будет работать в Архангельской области во второй половине июля.  Основные цели экспедиции – создание генетического портрета коренного русского населения трех северных районов области – Онежского, Приморского и Мезенского, и сбор важной для медицины геномной информации, в лабораториях геномной географии ИОГен РАН и популяционной генетики человека МГНЦ исследуют 60 генов, связанных с индивидуальной чувствительностью к действию различных лекарств; эти данные позволят врачу выбрать лекарство и точнее подобрать дозировку. После анализа результатов ту информацию, за которую в коммерческих компаниях по генетическому тестированию люди платят большие деньги, участники обследования смогут получить бесплатно.
 Основные маршруты экспедиции будут проходить по территории Национального парка «Онежское Поморье». Чтобы человека могли включить в обследование, его предки в трех поколениях (включая бабушек и дедушек) должны происходить из данного региона. Олег Балановский пригласил всех жителей прибрежных деревень, включенных в обследование, принять в нем участие и подчеркнул, что успех экспедиции будет зависеть от личного интереса жителей к своей генетической истории и своим медико-генетических особенностям."
Всего 60 респондентов или полногеномных только 60 образцов будет?

[Roaring]

Есть возможность бесплатно исследоваться за счёт науки, но нужны добровольцы поморы:
"о предстоящей экспедиции генетиков в Архангельскую область зав. лаб. геномной географии ИОГен РАН, профессор РАН Олег Балановский рассказал об экспедиции, которая будет работать в Архангельской области во второй половине июля.  Основные цели экспедиции – создание генетического портрета коренного русского населения трех северных районов области – Онежского, Приморского и Мезенского, и сбор важной для медицины геномной информации, в лабораториях геномной географии ИОГен РАН и популяционной генетики человека МГНЦ исследуют 60 генов, связанных с индивидуальной чувствительностью к действию различных лекарств; эти данные позволят врачу выбрать лекарство и точнее подобрать дозировку. После анализа результатов ту информацию, за которую в коммерческих компаниях по генетическому тестированию люди платят большие деньги, участники обследования смогут получить бесплатно.
 Основные маршруты экспедиции будут проходить по территории Национального парка «Онежское Поморье». Чтобы человека могли включить в обследование, его предки в трех поколениях (включая бабушек и дедушек) должны происходить из данного региона. Олег Балановский пригласил всех жителей прибрежных деревень, включенных в обследование, принять в нем участие и подчеркнул, что успех экспедиции будет зависеть от личного интереса жителей к своей генетической истории и своим медико-генетических особенностям."
Всего 60 респондентов или полногеномных только 60 образцов будет?

Олег недавно погиб к сожалению.

[kardes]

Результаты поморов -
https://forum.molgen.org/index.php/topic,14474.msg553606.html#msg553606
https://forum.molgen.org/index.php/topic,14475.msg553661.html#msg553661
https://forum.molgen.org/index.php/topic,14361.msg550460.html#msg550460

[kardes]

 Этническое разнообразие в выборке из 4145 россиян- жителей мегаполисов: С.Петербург, Самара, Оренбург.
Complex trait susceptibilities and population diversity in a sample of 4,145 Russians
Аннотация
Население России состоит из более чем 150 местных этнических групп. Этническое разнообразие и географическое происхождение, которые простираются от Восточной Европы до Азии, делают популяцию уникальной для исследования общих свойств рисков наследственных заболеваний между европейскими и азиатскими предками. Мы представляем анализ генетических и фенотипических данных выборки из 4145 человек, собранных в трех городских районах на западе России. Мы показываем наличие множественных смешанных генетических кластеров предков, охватывающих в первую очередь европейцев и азиатов, и высокую степень идентичности по происхождению с финской популяцией. В результате в России наблюдалось заметное обогащение специфичных для финнов вариантов. Мы иллюстрируем полезность когорт русского происхождения для открытия новых специфичных для популяции генетических ассоциаций, а также репликации ранее выявленных ассоциаций, которые считались специфичными для популяции в других когортах. Наконец, мы предоставляем доступ к базе данных частот аллелей и результатам GWAS для 464 фенотипов.