G25 от Давидски (Eurogenes)

[Roaring]

Target: PMorozova_scaled
Distance: 1.5858% / 0.01585786 | ADC: 0.25x RC
39.0   Cossack_Ukrainian
21.4   Russian_Orel
18.6   Slovakian
8.4   Dutch
6.4   Estonian
4.8   Cossack_Kuban
1.4   Uttar_Pradesh
Вот для при мера я скопировал табл. Global25 pop averages modern scaled получились такие данные. Может что не так делаю? И вообще он(Веселовски),скинул  мне координаты разные: PMorozova_scaled,0.133173,0.118817,0.065996,0.06137,0.033545,0.02259,0.012691,0.01823,0.002045,-0.015126,-0.000325,-0.00045,0.014271,0.019405,-0.009772,0.006762,0.001043,-0.005068,0.001257,0.004002,-0.008485,-0.001607,-0.000616,0.001687,-0.001557

PMorozova,0.0117,0.0117,0.0175,0.019,0.0109,0.0081,0.0054,0.0079,0.001,-0.0083,-0.0002,-0.0003,0.0096,0.0141,-0.0072,0.0051,0.0008,-0.004,0.001,0.0032,-0.0068,-0.0013,-0.0005,0.0014,-0.0013
я использую первые PMorozova_scaled, потому что вторые дают какие то неадекватные данные.Для чего они вообще? Объясните!

Да нет, всё правильно делаете, в чём разница между скейлед и анскейлед я к своему стыду так пока и не разобрался, знаю только, что там разные математические подходы используются.

[Roaring]

Добавил в стартовый пост сайт с подборками калькуляторов на основе G25.

[pliers]

В 2018 году заказывал у него интерпритацию теста, сейчас использовав vahaduo.github.io получил такие результаты:
Distance to:   Deniss
0.04957539   Russian_Kostroma
0.05156678   Russian_Tver
0.05393030   Russian_Kursk
0.05559034   Russian_Orel
0.06027146   Russian_Voronez
0.06746367   Russian_Smolensk
0.06993469   Russian_Pinega
0.07017530   German_East
0.07220684   German
0.07436765   Dutch
0.08168528   Scottish
0.08387014   English
0.08707288   English_Cornwall

Target: Deniss_scaled
Distance: 4.3177% / 0.04317739
70.4   Russian_Kostroma
29.6   German

[Roaring]

В 2018 году заказывал у него интерпритацию теста, сейчас использовав vahaduo.github.io получил такие результаты:


Target: Deniss_scaled
Distance: 4.3177% / 0.04317739
70.4   Russian_Kostroma
29.6   German

Большая дистаниция получилась, вы все популяции использовали?

[pliers]

Большая дистаниция получилась, вы все популяции использовали?
[/quote]

Нужно наверно попробовать данные, которые опубликованы в данный момент у него на сайте. Я использовал данные, которые были направлены в 2018 году электронной почтой от G25 от Давидски (Eurogenes).

[andronn]

прикольный калькулятор World War I calculator G25

Distance to:   PMorozova_scaled
0.02168024   Russian_Empire:Ukrainian
0.02846457   Austro-Hungarian_Empire:Slovakian
0.02969686   Russian_Empire:Belarusian
0.02982417   Russian_Empire:Russian_Smolensk
0.03129300   Austro-Hungarian_Empire:Polish32
0.03286367   Austro-Hungarian_Empire:Czech
0.03504594   German_Empire:Polish29
0.03604023   Russian_Empire:Polish40
0.04087562   Russian_Empire:Estonian
0.04127199   German_Empire:German_East
0.04128724   Austro-Hungarian_Empire:Hungarian
0.04407786   Austro-Hungarian_Empire:Slovenian
0.04510364   Austro-Hungarian_Empire:Croatian
0.04998295   Russian_Empire:Finnish
0.05088926   Austro-Hungarian_Empire:Austrian
0.05237702   Russian_Empire:Lithuanian_PZ
0.05279350   Russian_Empire:Latvian
0.05410807   Austro-Hungarian_Empire:Bosnian
0.05522102   German_Empire:German
0.06062701   British_Empire:English:HG01790
0.06345158   British_Colonial_Empire:Afrikaner
0.06634502   Russian_Empire:Finnish_East
0.06781935   Kingdom_Of_Montenegro:Montenegrin
0.07024463   Kingdom_Of_Serbia:Serbian
0.07330492   Kingdom_Of_Belgium:Belgian


Target: PMorozova_scaled
Distance: 1.7820% / 0.01781994 | ADC: 0.25x
72.0   Russian_Empire
23.8   Austro-Hungarian_Empire
2.4   British_Empire
1.8   British_Colonial_Empire

[Andvari]

Что-то не пойму, что не так делаю. Загнал в target по этой ссылке
http://g25vahaduo.genetics.ovh/G25modern&ancient-scaled-averages.htm
результаты К13, написал в начале test и результаты через запятую без пробелов (и с пробелами тоже пробовал) в таком формате:
test,24.13,46.80,7.28,8.33,5.44,0.31,2.75,0.22,2.52,1.89,0,0,0.33

Все равно ничего не показывает.
Может кто-то прогнать по древним компонентам? Или сказать, что я неправильно делаю. Вроде все по инструкции
Population   
North_Atlantic   24.13 Pct
Baltic   46.80 Pct
West_Med   7.28 Pct
West_Asian   8.33 Pct
East_Med   5.44 Pct
Red_Sea   0.31 Pct
South_Asian   2.75 Pct
East_Asian   0.22 Pct
Siberian   2.52 Pct
Amerindian   1.89 Pct
Oceanian   -   
Northeast_African   -   
Sub-Saharan   0.33 Pct

[Ankor]

Что-то не пойму, что не так делаю. Загнал в target по этой ссылке
http://g25vahaduo.genetics.ovh/G25modern&ancient-scaled-averages.htm
результаты К13, написал в начале test и результаты через запятую без пробелов (и с пробелами тоже пробовал) в таком формате:
test,24.13,46.80,7.28,8.33,5.44,0.31,2.75,0.22,2.52,1.89,0,0,0.33

Это не те координаты, для G25 надо отправлять запрос Давидски, как указано в первом сообщении темы

[Ankor]

Базовые компоненты отца:

Distance: 7.7953% / 0.07795334
52.2   Yamnaya_Samara
23.8   Barcin_N
14.8   WHG
7.8   Nganassan
1.4   Han

G25 Modern Averages scaled

Distance: 1.8430% / 0.01842996
47.8   Lithuanian_PZ
24.6   Russian_Smolensk
7.2   Ket
7.2   Mari
5.0   Lithuanian_VZ
4.2   Yakut
2.4   Azeri_Turkey
1.2   Samaritan
0.2   Dolgan
0.2   Mbuti

G25 Modern Individual Samples scaled

Distance: 0.7266% / 0.00726609
33.2   Latvian
15.2   Polish
10.8   Chuvash
8.8   Belarusian
6.8   Ukrainian
5.0   Komi
4.8   Yakut
4.0   Russian_Smolensk
4.0   Selkup
3.0   Lithuanian_PZ
2.6   Russian_Kostroma
1.2   Mordovian
0.6   Saudi

[Kote]

Target: Kote_scaled
Distance: 6.4982% / 0.06498191
53.6 Yamnaya_RUS_Samara
28.2 Anatolia_Barcin_N
17.2 WHG
1.0 Han

G25 Modern Averages scaled
Target: Kote_scaled
Distance: 1.2192% / 0.01219238 | ADC: 0.25x
43.6  Ukrainian
36.0  Polish
6.2    Karelian
4.4    Latvian
3.4    Russian_Tver
2.0    Estonian
1.8    Vepsian
1.4    Russian_Kostroma
1.0    Czech
0.2    Ju_hoan_North

G25 modern individual samples
Target: Kote_scaled
Distance: 1.9028% / 0.01902810 | ADC: 0.25x
40.0   Cossack_Kuban
24.8   Slovakian
15.2   Latvian
11.0   Lithuanian_PA
5.0     Lithuanian_RA
3.8     Cossack_Ukrainian
0.2     Ju_hoan_North

World War I calculator G25
Target: Kote_scaled
Distance: 2.1471% / 0.02147087 | ADC: 0.25x
55.2  Austro-Hungarian_Empire
43.0  Russian_Empire
1.2    French_Colonial_Empire
0.6    German_Empire

[Ankor]

Оказывается помимо 2D PCA Plot, ссылку на который Давид дает в письме с координатами, есть еще и 3D версия https://vahaduo.github.io/3d/

[andronn]

Кто знает, кого Веселовски выделяет как  Cossack_Ukrainian, с какого региона , и вообще что за категория населения Украины скрывается под этим названием . Может, это население Днепропетр. Кировоград. и Полтавской областей?

[R1a-Stolin]

Козаки должны быть из Запорожской области, там были образцы, если не ошибаюсь.

[Eozaka]

Target: Oksana_scaled
Distance: 7.1827% / 0.07182675
51.4 Yamnaya_RUS_Samara
30.0 Anatolia_Barcin_N
18.6 WHG

G25 Modern Averages scaled

48.2   Lithuanian_VZ
18.8   Lithuanian_PZ
8.2   Lithuanian_PA
6.6   Cossack_Ukrainian
4.6   Basque_French
4.6   Russian_Voronez
4.0   Italian_Lombardy
2.0   Sardinian
1.0   BedouinB
1.0   Sakha
0.6   Koinanbe
0.4   Ju_hoan_North

G25 modern individual samples

34.0   Lithuanian_VZ
16.0   Polish
14.6   Ukrainian
8.4   Lithuanian_PZ
4.4   Lithuanian_RA
4.4   Lithuanian_VA
3.6   Russian_Voronez
3.2   Sardinian
3.0   Lithuanian_PA
2.6   Estonian
2.0   French_Alsace
1.2   Mordovian
0.8   Lithuanian_SZ
0.8   Yakut
0.6   Koinanbe
0.4   Ju_hoan_North

[Eozaka]

А какая разница здесь имеется в виду между литовцами? Что означают сокращения?

Lithuanian_VZ
 Lithuanian_PZ
Lithuanian_PA
Lithuanian_RA
Lithuanian_VA