АвторТема: Результаты Family Finder от FTDNA  (Прочитано 434842 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10415
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1545 : 27 Январь 2016, 11:26:53 »
Какой приблизительно степени родства соответствует результат в 89.51 cM, 15 сегментов, три самых крупных: 24.04, 23.98 и 10.55?
FTDNA определяет как 2nd Cousin - 4th Cousin, но хотелось бы посмотреть и "живые" примеры.

Эти cегменты на одной хромосоме или на разных? Если такие сегменты на трех разных хромосомах, тогда - в силу менделевского закона независимого наследования - предикт скорее всего точный (т.к. вероятность родства  вычисляется независимо для каждого из сегментов). Если на одной - родство может быть более удаленным, т.к. сегменты физически сцеплены.

Оффлайн Oleg Vladimirov

  • Сообщений: 506
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1181/-0
  • Y-ДНК: R1a1 - Y28938*
  • мтДНК: Ж - H23, МЖ - H11a1, ЖМЖ - H2a2a1, ЖЖМЖ - U5a1d2b, дочь - H6a1a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1546 : 27 Январь 2016, 12:54:33 »
Какой приблизительно степени родства соответствует результат в 89.51 cM, 15 сегментов, три самых крупных: 24.04, 23.98 и 10.55?
FTDNA определяет как 2nd Cousin - 4th Cousin, но хотелось бы посмотреть и "живые" примеры.
На моем примере это соответствует уровню родства троюродного дяди и племянника.

Comparing Kit F344707 (Nikolay Kozhevnikov) and F344711 (Oleg Vladimirov)

Minimum threshold size to be included in total = 700 SNPs
Mismatch-bunching Limit = 350 SNPs
Minimum segment cM to be included in total = 7.0 cM

Largest segment = 24.0 cM
Total of segments > 7 cM = 84.9 cM
Estimated number of generations to MRCA = 3.7
« Последнее редактирование: 27 Январь 2016, 14:36:19 от Oleg Vladimirov »

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10415
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1547 : 27 Январь 2016, 16:13:31 »
Какой приблизительно степени родства соответствует результат в 89.51 cM, 15 сегментов, три самых крупных: 24.04, 23.98 и 10.55?
FTDNA определяет как 2nd Cousin - 4th Cousin, но хотелось бы посмотреть и "живые" примеры.

Эти cегменты на одной хромосоме или на разных? Если такие сегменты на трех разных хромосомах, тогда - в силу менделевского закона независимого наследования - предикт скорее всего точный. Если на одной - родство может быть более удаленным, т.к. сегменты физически сцеплены.

24.04 и 10.55 на одной, 23.98 на другой. Ну и мелочи всякой почти на каждой второй набросано.

В приципе, наличие двух больших сегментов на разных хросомах  -это надежный индикатор.
На мелочь (большое количество мелких совпадающих сегментов-блоков) можно не обращать внимание. В большинстве случае они свидетельствуют не о родстве в генеалогически обозримом интервале, а о размере эффективной популяции (т.е степени генетического однообразия генетического пула популяции). Часто они вносят помехи в определение реальной степени родства - классический пример евреи-ашкеназы с небольшим размером начальной эффективной популяции.

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10415
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1548 : 27 Январь 2016, 16:23:57 »
У меня самого немного (всего два) примера, когда благодаря IBD-анализу (т.е изучению общих по происхождению) сегментов хромосом я нашел ранее неизвестных мне людей, с которыми удалось выйти на линию общих предков.

Первый пример - канадка, бабушка которой происходит из рода Качановских, а прабабушка Агафия Васильевна из рода Вереничей. Благодаря метрическим книгам я узнал, что наше реальное родство 5 поколений до общего предка (с учетом простейшей линии родства). На Gedmatch медианное значение степени вероятного родства -  4.4.

Ниже приводятся технические детали 3 совпадающих сегментов (как видите, все три сегмента проходят пороговые требования к  минимальному размеру (7 cM) и числу снипов (700) в  сегменте), и - что наиболее важно - все три находятся на разных хромосомах. Поскольку наследование каждого сегмента, то вероятности случайного (негенеалогического) совпадения этих сегментов перемножаются.

ChrStart LocationEnd LocationCentimorgans (cM)SNPs
432,232,22442,421,62513.21,115
78,295,40513,845,9899.8885
1136,784,44545,084,8788.0881

Largest segment = 13.2 cM
Total of segments > 7 cM = 30.9 cM
Estimated number of generations to MRCA = 4.4

 

Оффлайн Ya-nina

  • Сообщений: 203
  • Страна: by
  • Рейтинг +84/-4
  • Y-ДНК: R-YP1410 (отец),
  • мтДНК: HV2 (отец); V7а (я)
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1549 : 27 Январь 2016, 17:42:56 »
На тему еврейских совпаденцев (ашкенази).
Есть, например, у меня такой совпаденец (папа - еврей, мама -- ирландка). На ФТДНА 3-5 кузен, 8 сегментов, сумма 42.69 сМ. Совсем мелкие сегменты опускаю.

Chr.     Start Location                End Location               (cM)       SNPs
11   27451835      30151147      2.41      500
11   40345455      43471106      3.89      800
12   54388428      57269740      2.29      700
13   43809556      74903294      25.38      7600

на Гедматче
Сравнение 1:1
Largest segment = 23.9 cM
 Total of segments > 7 cM = 23.9 cM (в таблице – 41сМ)
 Estimated number of generations to MRCA = 4.6 (в общей таблице – 4,2)

В обозримом прошлом никаких пересечений пока не просматривается. Хотелось бы все-таки узнать поточнее -- учитывая специфику этноса -- насколько эта генетическая дистанция может соответствовать стандартной ситуации?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10415
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1550 : 27 Январь 2016, 18:33:18 »
На тему еврейских совпаденцев (ашкенази).
Есть, например, у меня такой совпаденец (папа - еврей, мама -- ирландка). На ФТДНА 3-5 кузен, 8 сегментов, сумма 42.69 сМ. Совсем мелкие сегменты опускаю.

Chr.     Start Location                End Location               (cM)       SNPs
11   27451835      30151147      2.41      500
11   40345455      43471106      3.89      800
12   54388428      57269740      2.29      700
13   43809556      74903294      25.38      7600

на Гедматче
Сравнение 1:1
Largest segment = 23.9 cM
 Total of segments > 7 cM = 23.9 cM (в таблице – 41сМ)
 Estimated number of generations to MRCA = 4.6 (в общей таблице – 4,2)

В обозримом прошлом никаких пересечений пока не просматривается. Хотелось бы все-таки узнать поточнее -- учитывая специфику этноса -- насколько эта генетическая дистанция может соответствовать стандартной ситуации?

Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

Оффлайн dars

  • Сообщений: 585
  • Страна: ru
  • Рейтинг +93/-0
  • Y-ДНК: N1c1-L708
  • мтДНК: U7
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1551 : 27 Январь 2016, 20:32:20 »
Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

а можно подробнее вот этот момент? как вы это видите?

Оффлайн I2a1a

  • ...
  • Сообщений: 10415
  • Страна: ee
  • Рейтинг +757/-8
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1552 : 27 Январь 2016, 22:35:38 »
Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

а можно подробнее вот этот момент? как вы это видите?

Так и вижу - подробное изучения аутосомного генофонда популяций

Оффлайн Ya-nina

  • Сообщений: 203
  • Страна: by
  • Рейтинг +84/-4
  • Y-ДНК: R-YP1410 (отец),
  • мтДНК: HV2 (отец); V7а (я)
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1553 : 27 Январь 2016, 23:29:10 »

Точно неизвестно. Но реально значимый сегмент в совпадении у вас один - на 13 хромосоме. Проблема в том, что мы ничего не знаем о характере наследования этого участка - может быть это недавний кусок генома общего предка, cохранившийся после множества кроссинговеров. А может - консервативный фрагмент генома, находящийся под давлением естественного отбора (например, в этом сегменте находятся полезные гены иммунитета от некоторых заболеваний).

Вы спрсите меня: "А кто знает?" Да наверное, никто. До тех пор пока не будет изучена этногеномика условных популяций ваших условных предков.

Этот сегмент на 13 хромосоме  я унаследовала от отца, правда, в каждом подобном случае у меня сегмент чуть-чуть, но увеличивается (?). И всех евреев, которые есть у меня в совпаденцах (а это из 34 стр. на ФТДНА -- пожалуй, половина) можно сгруппировать на расположению большого сегмента -- их 3 группы, на 3, 8 и 13 хромосоме. И на 13-й они все локализуются на одном участке в основном. Но в этнокалькуляторах  ашкеназов у меня нет.

Оффлайн Oleg Vladimirov

  • Сообщений: 506
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1181/-0
  • Y-ДНК: R1a1 - Y28938*
  • мтДНК: Ж - H23, МЖ - H11a1, ЖМЖ - H2a2a1, ЖЖМЖ - U5a1d2b, дочь - H6a1a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1554 : 28 Январь 2016, 01:47:16 »
Oleg Vladimirov,
Chr.     Start Location          End Location         (cM)       SNPs  ?

Если кратко, то Compare List 5+ сМ выдает 5 одиночных сегментов на 1-й (17.81 сМ), 2-й (8.97 сМ), 3-й (17.64 сМ), 4-й (7.13 сМ), 10-й (23.2 сМ) и 15-й (9,99 сМ) хромосомах.

Кстати если кому интересно, вот результаты сравнения результатов по 5-6 юродным родстенникам:

1) 5-юродный дядя и племянник:

Comparing Kit F418637 (Vladimir Klimin) and F250006 (Valentin Tsyganov)

Minimum threshold size to be included in total = 700 SNPs
Mismatch-bunching Limit = 350 SNPs
Minimum segment cM to be included in total = 7.0 cM

Largest segment = 15.3 cM
Total of segments > 7 cM = 15.3 cM
Estimated number of generations to MRCA = 4.9

В FTDNA - всего 42.70 cM, Longest Block: 16.00 cM.

2) 6-юродные братья:

Comparing Kit F344702 (Roman Kozikhin) and F250006 (Valentin Tsyganov)

Minimum threshold size to be included in total = 700 SNPs
Mismatch-bunching Limit = 350 SNPs
Minimum segment cM to be included in total = 7.0 cM

Largest segment = 14.8 cM
Total of segments > 7 cM = 36.4 cM
Estimated number of generations to MRCA = 4.3

В FTDNA - всего 47.50 cM, Longest Block: 14.41 cM.

Оффлайн vnik

  • Сообщений: 242
  • Страна: de
  • Рейтинг +23/-0
  • мтДНК: H16
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1555 : 28 Январь 2016, 21:51:03 »
Кстати если кому интересно, вот результаты сравнения результатов по 5-6 юродным родстенникам:
В FTDNA - всего 42.70 cM, Longest Block: 16.00 cM.
В FTDNA - всего 47.50 cM, Longest Block: 14.41 cM.

Можете подсказать, когда были рождены общие предки по указанным выше примерам?

Оффлайн Oleg Vladimirov

  • Сообщений: 506
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1181/-0
  • Y-ДНК: R1a1 - Y28938*
  • мтДНК: Ж - H23, МЖ - H11a1, ЖМЖ - H2a2a1, ЖЖМЖ - U5a1d2b, дочь - H6a1a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1556 : 28 Январь 2016, 22:00:32 »
Можете подсказать, когда были рождены общие предки по указанным выше примерам?
1) Климентий Федоров (1773-1848) и Агафья Фокеева (1774-1843);
2) Козихин Евдоким Герасимов (1764-1833) и Татьяна Васильева (1760-1818).

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 125
  • Страна: ru
  • Рейтинг +19/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-Y4706
  • мтДНК: H24A
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1557 : 01 Февраль 2016, 20:02:14 »
Можете подсказать, когда были рождены общие предки по указанным выше примерам?
1) Климентий Федоров (1773-1848) и Агафья Фокеева (1774-1843);
2) Козихин Евдоким Герасимов (1764-1833) и Татьяна Васильева (1760-1818).
А реальное число поколений какое? Не пять же по пятьдесят лет?

Оффлайн Oleg Vladimirov

  • Сообщений: 506
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1181/-0
  • Y-ДНК: R1a1 - Y28938*
  • мтДНК: Ж - H23, МЖ - H11a1, ЖМЖ - H2a2a1, ЖЖМЖ - U5a1d2b, дочь - H6a1a
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1558 : 01 Февраль 2016, 20:41:28 »
А реальное число поколений какое? Не пять же по пятьдесят лет?
Не понял вопроса. По 1 примеру ДНК взят у шестиюродных братьев 1949 и 1961 г.р.
По 2 примеру у пятиюродного дяди 1930 г.р. и его пятиюродного племянника 1949 г.р.

Оффлайн smolinsky

  • Сообщений: 125
  • Страна: ru
  • Рейтинг +19/-0
  • u r not me
  • Y-ДНК: N-Y4706
  • мтДНК: H24A
Re: Результаты Family Finder от FTDNA
« Ответ #1559 : 01 Февраль 2016, 21:46:54 »
А реальное число поколений какое? Не пять же по пятьдесят лет?
Не понял вопроса. По 1 примеру ДНК взят у шестиюродных братьев 1949 и 1961 г.р.
По 2 примеру у пятиюродного дяди 1930 г.р. и его пятиюродного племянника 1949 г.р.
Gedmatch предсказал 4,9 и 4,3 поколения до общего предка в первом и втором случае соответственно. А в реальности какое количество поколений до общего предка в обоих случаях?
Я сморю по метрическим книгам и часто поколение  даже меньше двадцати лет, а племянники старше дядей.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.