АвторТема: Научные и любительские публикации о J1  (Прочитано 1712 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17566
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Публикации, отдельно исследующие гаплогруппу J1 и/или какие-либо из её субкладов, а также публикации, в заглавиях которых помимо других гаплогрупп присутствует также и J1:

Sergio Tofanelli et al., 2009 J1-M267 Y lineage marks climate-driven pre-historical human displacements (комментарий Dienekes Pontikos)

Jacques Chiaroni et al., 2010 The emergence of Y-chromosome haplogroup J1e among Arabic-speaking populations (комментарий Dienekes Pontikos)
« Последнее редактирование: 21 Май 2020, 03:21:57 от Yaroslav »

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17566
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #1 : 15 Май 2020, 09:43:05 »
Публикации, уделяющие J1 особое внимание:

Cengiz Cinnioğlu et al. 2004 Excavating Y-chromosome haplotype strata in Anatolia (текст в pdf) - именно в этом исследовании была найдена мутация M267, определяющая гаплогруппу J1.

Ornella Semino et al., 2004 Origin, Diffusion, and Differentiation of Y-Chromosome Haplogroups E and J: Inferences on the Neolithization of Europe and Later Migratory Events in the Mediterranean Area

Alicia M Cadenas et al., March 2008 Y-chromosome diversity characterizes the Gulf of Oman - авторы считают, что распространение и анализ STR представителей гаплогруппы J1-M267 говорит о её появлении в Аравии с севера, скорее всего в период неолита.

Jacques Chiaroni et al., June 2008 Correlation of annual precipitation with human Y-chromosome diversity and the emergence of Neolithic agricultural and pastoral economies in the Fertile Crescent (текст в pdf) (комментарий Dienekes Pontikos)

Khaled K Abu-Amero et al., 2009 Saudi Arabian Y-Chromosome diversity and its relationship with nearby regions

Oleg Balanovsky et al., 2011 Parallel Evolution of Genes and Languages in the Caucasus Region (комментарий Dienekes Pontikos)
« Последнее редактирование: 21 Май 2020, 08:24:21 от Yaroslav »

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17566
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #2 : 15 Май 2020, 09:43:53 »
Место для сбора информации о частотах J1 в популяциях.

Оффлайн Джим

  • Сообщений: 207
  • Страна: gb
  • Рейтинг +45/-0
  • Y-ДНК: J1
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #3 : 15 Май 2020, 10:41:05 »
A list of J1 ancient DNA, with sources: https://indo-european.eu/all-ancient-dna.pdf

Maybe you already have this in another place.  If so, delete this from your thread.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17566
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #4 : 15 Май 2020, 10:56:57 »
Спасибо, Джим!

Да, есть отдельная тема о найденных J1 среди древней ДНК. Но, там не все данные. В этом сообщении позже составлю список для наглядности.

Оффлайн Сергей Ивановский

  • Сообщений: 174
  • Страна: ru
  • Рейтинг +31/-0
  • Y-ДНК: J-FT308514
  • мтДНК: H16-T152C!
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #5 : 16 Май 2020, 18:59:02 »
https://www.eupedia.com/europe/Haplogroup_J1_Y-DNA.shtml
Наиболее полное описание J1, которое я нашел в интернете. Как раз для таких начинающих, как я.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17566
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #6 : 16 Май 2020, 19:58:40 »
https://www.eupedia.com/europe/Haplogroup_J1_Y-DNA.shtml
Наиболее полное описание J1, которое я нашел в интернете. Как раз для таких начинающих, как я.

Да, спасибо! Хотел эту статью в Eupedia позже включить в списке любительских публикаций.

Правда, так и не понял, почему в ней со ссылкой на упомянутую мной в стартовом сообщении публикацию Chiaroni et al., 2010 говорится о наибольшем разнообразии всей J1 в Тавре и Загросе, когда Кьярони говорил о наибольшем разнообразии только J1e, то есть субклада P58.

Оффлайн Джим

  • Сообщений: 207
  • Страна: gb
  • Рейтинг +45/-0
  • Y-ДНК: J1
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #7 : 28 Май 2020, 18:42:25 »
Maybe there will be some J1 in this academic paper:

Genomic History of Neolithic to Bronze Age Anatolia, Northern Levant, and Southern Caucasus
Eirini Skourtanioti et al.

Highlights
• Genome-wide analysis of 110 ancient individuals from the Near East
• Gene pools of Anatolia and Caucasus were biologically connected ∼6500 BCE
• Gene flow from neighboring populations in Northern Levant during 3 rd millennium BCE
• One individual of likely Central Asian origin in 2 nd millennium BCE Northern Levant

Video abstract here:
https://www.cell.com/cell/pdf/S0092-8674(20)30509-2.pdf?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS0092867420305092%3Fshowall%3Dtrue

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17566
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #8 : 28 Май 2020, 18:51:18 »
Thanks Jim! Very interesting! I think it deserves a separate thread in tne aDNA section.

Оффлайн Джим

  • Сообщений: 207
  • Страна: gb
  • Рейтинг +45/-0
  • Y-ДНК: J1
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #9 : 28 Май 2020, 19:48:06 »
I don't know where the aDNA section is.

Anyway, here's another academic paper, open access, with lots of J1a2b:

The Genomic History of the Bronze Age Southern Levant
Lily Agranat-Tamir et al.

https://www.cell.com/cell/fulltext/S0092-8674(20)30487-6?fbclid=IwAR3Dw1cdG1RB01zHKsqCFeEudJ17HtxpIMlXo8HHPeh01zy2lNgFChsi5Yg

Click on Table S1 for the DNA results.

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17566
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #10 : 28 Май 2020, 19:55:10 »
I don't know where the aDNA section is.

It's not a problem, the thread has already been started here.

Anyway, here's another academic paper, open access, with lots of J1a2b:

Great! Thank you!

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1501
  • Страна: kg
  • Рейтинг +1947/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #11 : 23 Март 2021, 20:24:45 »
https://www.nature.com/articles/s41598-021-85883-2

    Article
    Open Access
    Published: 23 March 2021

Origin and diffusion of human Y chromosome haplogroup J1-M267


    Hovhannes Sahakyan, Ashot Margaryan, Lauri Saag, Monika Karmin, Rodrigo Flores, Marc Haber, Alena Kushniarevich, Zaruhi Khachatryan, Ardeshir Bahmanimehr, Jüri Parik, Tatiana Karafet, Bayazit Yunusbayev, Tuuli Reisberg, Anu Solnik, Ene Metspalu, Anahit Hovhannisyan, Elza K. Khusnutdinova, Doron M. Behar, Mait Metspalu, Levon Yepiskoposyan, Siiri Rootsi & Richard Villems

Scientific Reports volume 11, Article number: 6659 (2021)

Abstract

Human Y chromosome haplogroup J1-M267 is a common male lineage in West Asia. One high-frequency region—encompassing the Arabian Peninsula, southern Mesopotamia, and the southern Levant—resides ~ 2000 km away from the other one found in the Caucasus. The region between them, although has a lower frequency, nevertheless demonstrates high genetic diversity. Studies associate this haplogroup with the spread of farming from the Fertile Crescent to Europe, the spread of mobile pastoralism in the desert regions of the Arabian Peninsula, the history of the Jews, and the spread of Islam. Here, we study past human male demography in West Asia with 172 high-coverage whole Y chromosome sequences and 889 genotyped samples of haplogroup J1-M267. We show that this haplogroup evolved ~ 20,000 years ago somewhere in northwestern Iran, the Caucasus, the Armenian Highland, and northern Mesopotamia. The major branch—J1a1a1-P58—evolved during the early Holocene ~ 9500 years ago somewhere in the Arabian Peninsula, the Levant, and southern Mesopotamia. Haplogroup J1-M267 expanded during the Chalcolithic, the Bronze Age, and the Iron Age. Most probably, the spread of Afro-Asiatic languages, the spread of mobile pastoralism in the arid zones, or both of these events together explain the distribution of haplogroup J1-M267 we see today in the southern regions of West Asia.

Человеческая Y-хромосома гаплогруппы J1-M267 - обычная мужская линия в Западной Азии. Один высокочастотный регион - охватывающий Аравийский полуостров, южную Месопотамию и южный Левант - находится на расстоянии ~ 2000 км от другого, обнаруженного на Кавказе. Регион между ними, хотя и имеет более низкую частоту, тем не менее, демонстрирует высокое генетическое разнообразие. Исследования связывают эту гаплогруппу с распространением земледелия с Плодородного полумесяца в Европу, распространением мобильного скотоводства в пустынных районах Аравийского полуострова, историей евреев, распространением ислама. Здесь мы изучаем прошлую мужскую демографию человека в Западной Азии с 172 высокоохватными целыми Y-хромосомами и 889 генотипированными образцами гаплогруппы J1-M267. Мы показываем, что эта гаплогруппа эволюционировала ~ 20 000 лет назад где-то на северо-западе Ирана, Кавказе, Армянском нагорье и северной Месопотамии. Главная ветвь J1a1a1-P58 появилась в раннем голоцене ~ 9500 лет назад где-то на Аравийском полуострове, в Леванте и южной Месопотамии. Гаплогруппа J1-M267 расширилась в период энеолита, бронзового и железного веков. Скорее всего, распространение афро-азиатских языков, распространение мобильного пастбищного скотоводства в засушливых зонах, или оба эти события вместе объясняют распространение гаплогруппы J1-M267, которое мы наблюдаем сегодня в южных регионах Западной Азии.

Переведено с помощью www.DeepL.com/Translator (бесплатная версия)

Оффлайн YaroslavАвтор темы

  • Сообщений: 17566
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Научные и любительские публикации о J1
« Ответ #12 : 23 Март 2021, 20:38:04 »
https://www.nature.com/articles/s41598-021-85883-2

    Article
    Open Access
    Published: 23 March 2021

Origin and diffusion of human Y chromosome haplogroup J1-M267

Спасибо! По-моему с 2009 года не было публикаций, целиком посвящённых гаплогруппе J1.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.