АвторТема: FTDNA Y-STR genetic distance  (Прочитано 2620 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #15 : 13 Июль 2020, 17:20:58 »
Ещё немного истории. Тоже, относяееся где-то к 2007-2010 году.
Тогда уже была формула (о формулах позже), которую хочет вытащить Фаррух, но господин Клёсов, который тоже чужд математики (иными словами, по складу ума, - чистый гуманитарий; хоть и химик в прошлой жизни) возвестил, что и так несложное (относительно) выражение можно заменить на ещё более простую формулу "кинетики второго порядка".

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #16 : 13 Июль 2020, 17:21:38 »
Сознательно разбиваю нить повествования на короткие смысловые чанки.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #17 : 13 Июль 2020, 17:28:16 »
Тот же Клёсов в своём Катехизисе так же голословно заявил, что попарных сравнений быть не можно.

То есть, сначала из пальца взяли высосали подходы. А потом стали обильно блевать академической мудростью.

Можно согласиться с кучей оговорок с предлагаемой филогенией на уровне топологии.

Оговорки следующие:

1. Используемый Клёсовым пакет PHYLIP - вещь признанная и себя зарекомендовавшая. Консенсусно. На уровне аксиоматики. То есть, предполагается, что она как бы верная.

2. На каждый клёсовский гребешок - стоит добавлять. Что это гипотеза. Одна из многих. И уточнять, что гипотеза - не суть доказательства. Наоборот, гипотеза сама в доказательствах нуждается.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #18 : 13 Июль 2020, 17:33:36 »
Немного забегу вперёд. Начну как бы с конца. Поясню, к чему вся эта моя болтовня?

Для меня очевидно, что составление табличек и поиск очередной описательной формулы (что такое описательная формула, расскажу позже) - это ерунда. Чушь собачья. Траты времени.

Хочу эту очевидность донести и до других. Со всей приязнью к собеседнику. И убедительно мотивировкой.

:)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #19 : 13 Июль 2020, 17:40:25 »
Прежде всего спросим себя зачем?
Зачем таблички?
Зачем формулы?
Что мы хотим получить? Каким образом?

Ответ вроде бы очевиден - нам нужны ВБОПы.

Да. Нужны.

Но вот теперь главная ложка дёгтя.
ВБОПы с кумулятивным доверительным интервалом в единицы процентов методом попарных сравнений можно оценить (оценить! не вычислить! вдумайтесь в эту семантическую разницу) для ГД 0.1. Максимум, где-то 0.15.

Собственно, это то, что Клёсов имел в виду.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #20 : 13 Июль 2020, 17:44:06 »
Памятуя о том, что иной раз собеседник может не знать вещи, казалось бы, банальные и очевидные, напомню, что такое ГД 0.1.

Это генетическая дистанция в 10%.

То есть, если у нас есть 111 маркерный гаплотип, то 11 маркеров двух сравниваемых персон отличаются. На сколько одношаговых мутаций отличаются - не важно.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #21 : 13 Июль 2020, 17:46:45 »
То есть, мы имеем зону применения попарного определения ВБОПов по СТРам где-то на глубину 25-30 поколений.

ФТДНА идёт от обратного. Не от генетических разниц. А от ВБОПов.
И закладывает наиболее дальний интервал в 24 поколения.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #22 : 13 Июль 2020, 17:49:06 »
Опять спросим зачем?

Область практического применения - очень узка.

Для кроссплатформенного сравнения. То есть для сравнения результатов двух разных лабораторий.

Случай достаточно редкий. Львиная доля игрек СТР коммерческих гаплотипов - родом из ФТДНА.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #23 : 13 Июль 2020, 17:50:12 »
Теперь главный тезис. (Его ещё обосную ниже.)

Если оба результата от ФТДНА - то самое разумное, использовать временные оценки от ФТДНА же.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #24 : 13 Июль 2020, 17:52:54 »
Не забываем про опцию трансфера данных в базу ФТДНА. Увы, сейчас она платная.

Если имеем какие-нибудь коротенькие эрзац гаплотипы из местечковых компаний,то надо понимать, что результаты по ним будут никакие.

Для никаких результатов - прекрасно сгодятся никакие формулы и никакие таблички.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #25 : 13 Июль 2020, 17:55:44 »
Если нас интересуют дальние интервалы, то про СТРы вообще лучше забыть.

Переходим к снипам и к скудному выбору инструментов.
Либо блок-схема от ФТДНА на глубину до 30 поколений (вроде работают над её углублением и повышением точности).
Либо ИгрекФулл.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #26 : 13 Июль 2020, 18:06:27 »
Соображение общего плана.

Мы все тут с высшим образованием. То есть, мы все тут люди образованные.

Многие из нас брали курсы математического анализа и крепко завязанных на математику дисциплин.

Это преамбула. Для того, чтобы объяснить, что такое конформистский подход. Что такое профессиональное - профессионалам.

Допустим, у вас был курс сопромата. Это не значит, что вы возьмёте и с ходу просчитаете балку.
Или поползаете в интернете и потом просчитаете балку.
А ведь учились.    :-X

Или же были курсы по приводам. А сейчас, бац! и матричные расчёты с ходу сделаете.

Или гироскопы, там, изучали. Опля, немножечко почитали и выдали цепочку выкладок.

Свёртка Фурье. Или z-преобразования 8 порядка. Или числовой анализ (отсюда, кстати, описательные формулы, т.е. пртблизительная формула, которая лучше всего описывает конкретную функцию).

За исключением сопромата, перечислил только то, что учил, зубрил, сдавал и... напрочь забыл.    :-\

Гну к тому, что ВБОПы - это не просто, как таблица умножения. Нужны специальные знания, математические инструменты и опыт.
За неимением других узкопрофильных специалистов, будем полагаться на ФТДНА.

Ну, а сами займёмся чем-то более лёгким и приятным.


::)

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #27 : 13 Июль 2020, 18:33:19 »
К слову сказать, кого интересуют расчёты на коленке по формуле Уолша, могу подарить готовую утилитку.
Это день вчерашний. Это отброшено. Но если душа просит...    :)

Будет вам такое вот счастье (создал пример для ГД 10 на 111-маркерных гаплотипах):


Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #28 : 13 Июль 2020, 18:33:59 »

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 36936
  • Страна: ca
  • Рейтинг +3759/-48
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: FTDNA Y-STR genetic distance
« Ответ #29 : 13 Июль 2020, 18:35:34 »
Вышестоящая картинка, в переводе на русский, говорит:

Наиболее вероятный ВБОП расположен на глубине где-то 37 переходных событий.
Правда эта наибольшая вероятность составляет всего около 3%.   :(

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.