Компания Nebula Genomics

[nilogov]

Может я с темой фтдна перепутал. )
Вроде бы читал, что кто-то так массово посылает щетки.

2 месяца к ним шел материал и вот теперь, спустя 2 месяца написали, что не годный. (
С ноября все на самом начальном этапе.

Yseq понимает все что угодно. Nebula отказываются. Может и можно уломать но с ними тяжко общаться, долго отвечают.
Выслали нам 3 набора через 3ю страну. Взамен проваленных тестов. Вопрос с доставкой решаем.

Интересно, какая у них складывается статистика по проваленным тестам? И такой вопрос: а вы из России пробовали отсылать им образцы - наша почта доставляет?

[Val_Metov]

Свежая версия WGSExtract https://disk.yandex.ru/d/FEm33Nz8S9mXXA

[nilogov]

Свежая версия WGSExtract https://disk.yandex.ru/d/FEm33Nz8S9mXXA

А что делается этими программами?

[Val_Metov]

Свежая версия WGSExtract https://disk.yandex.ru/d/FEm33Nz8S9mXXA

А что делается этими программами?

Посмотрите инструкцию, в интернете есть. Работает в windows, Linux и Mac OS. Самое часто применение - выделение аутосом. Можно перевести cram/bam обратно в fastq и оттуда пересобрать на T2T. И загрузить например на theytree. Хотя толку от этого пока немного.

[nilogov]

Свежая версия WGSExtract https://disk.yandex.ru/d/FEm33Nz8S9mXXA

А что делается этими программами?

Посмотрите инструкцию, в интернете есть. Работает в windows, Linux и Mac OS. Самое часто применение - выделение аутосом. Можно перевести cram/bam обратно в fastq и оттуда пересобрать на T2T. И загрузить например на theytree. Хотя толку от этого пока немного.

А практическая польза будет? Я, например, сделал пожизненную подписку в Небуле, но и там какие-то лаги, не все отображается…

[nilogov]

Свежая версия WGSExtract https://disk.yandex.ru/d/FEm33Nz8S9mXXA

А что делается этими программами?

Посмотрите инструкцию, в интернете есть. Работает в windows, Linux и Mac OS. Самое часто применение - выделение аутосом. Можно перевести cram/bam обратно в fastq и оттуда пересобрать на T2T. И загрузить например на theytree. Хотя толку от этого пока немного.

А это theytree разве полнее, чем Yfull?

[Val_Metov]

Уважаемый nilogov вы очень много вопросов задаете.

Практическая ценность у каждая своя, это магический инструмент которые реализует все фантазии.

theYtree ничем не лучше Yfull, только о них есть загрузка T2T.

В WGSE есть опция debug. Если ее включить в папку temp будут сохраняться команды которые используются при нажатия на те или иные кнопки. Можно без GUI пользоваться всеми "фишками". Например я пользуюсь удаленной машиной с Linux, соединение через ssh. Все что мне нужно это выделить аутосомы. Сформировать VCF. Пересобрать на новый рефернс и опять VCF. Потом итоговый Bam фаил перевести в Cram. Можно все это делать через программу, нажимая на кнопки, а можно подсмотреть команды и просто менять переменные.

[nilogov]

Уважаемый nilogov вы очень много вопросов задаете.

Практическая ценность у каждая своя, это магический инструмент которые реализует все фантазии.

theYtree ничем не лучше Yfull, только о них есть загрузка T2T.

В WGSE есть опция debug. Если ее включить в папку temp будут сохраняться команды которые используются при нажатия на те или иные кнопки. Можно без GUI пользоваться всеми "фишками". Например я пользуюсь удаленной машиной с Linux, соединение через ssh. Все что мне нужно это выделить аутосомы. Сформировать VCF. Пересобрать на новый рефернс и опять VCF. Потом итоговый Bam фаил перевести в Cram. Можно все это делать через программу, нажимая на кнопки, а можно подсмотреть команды и просто менять переменные.

YFull тоже дают информацию по Т2Т. Это больше биоинформативная работа с программами… Мне бы с глюками браузера в Небуле разобраться)

[nilogov]

У кого-нибудь в браузере Небулы на Игреке встречались проблемы с отображением данных? У меня и отца, например, для SNP Y38374 (позиция 2827785) выдаётся ошибка...

[inetstar]

Посоветуйте, пожалуйста, как оплатить nebula.org.
Белорусскими карточками Альфа-банка (Visa, MasterCard) через нидерландский прокси не получается.

И сколько денег должно быть на карточке?
Я положил 25 баксов, но это не помогло.

[NathanS]

Посоветуйте, пожалуйста, как оплатить nebula.org.
Белорусскими карточками Альфа-банка (Visa, MasterCard) через нидерландский прокси не получается.

И сколько денег должно быть на карточке?
Я положил 25 баксов, но это не помогло.

Про белорусские карты не знаю, но сейчас Nebula берет сразу за квартал - 3*25$, т.е. 75$.

[inetstar]

Моя эпопея с оплатой Nebula закончилась так. В итоге прошла белорусская виртуальная карточка Приорбанка через нидерландский прокси. Сумма списалась $19.99 (на чёрную пятницу брал). Visa и Mastercard от белорусской дочки Альфабанка не прошли.

[nilogov]

Моя эпопея с оплатой Nebula закончилась так. В итоге прошла белорусская виртуальная карточка Приорбанка через нидерландский прокси. Сумма списалась $19.99 (на чёрную пятницу брал). Visa и Mastercard от белорусской дочки Альфабанка не прошли.

А как такую карту получить?

[forbid]

Ура!!!  Nebula: Your sequencing data has been generated!   
Год с оплаты , можно выдохнуть.

[Farroukh]

Можно ли на практике загрузить в FTDNA результаты по Y и Mt от Nebula для сравнения?