АвторТема: Компания Nebula Genomics  (Прочитано 38933 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 409
  • Страна: kz
  • Рейтинг +230/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #30 : 10 Июнь 2020, 12:46:55 »
А вот и ответка Nebula Genomics :P Цена выросла до 499$.

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +547/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #31 : 10 Июнь 2020, 14:13:13 »
Я приношу извинения. Детская ошибка, в спам все уходило  :-\
Они отправили еще 20 мая. 20 дней в пути, сейчас в Германии. DHL до Германии оттуда уже обычной почтой. Так же как и у FTDNA.

AY67ZBFJ9
Этот купон дает 100$ скидку.
« Последнее редактирование: 10 Июнь 2020, 14:21:16 от Val_Metov »

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5625
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3511/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #32 : 14 Июнь 2020, 16:53:57 »
Цена у них сейчас на скидках $299.00 +$19.99(подписка на первый месяц)
$499 (299+200) это при заказе "безлимитного доступа к данным".
Как понимаю, делают в Китае, в BGI.
Файлы выдают в формате CRAM. Выравнивание по hg38 без альт контигов.

В YFull уже поступил первый образец от WGS небулы.

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 409
  • Страна: kz
  • Рейтинг +230/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #33 : 15 Июнь 2020, 20:40:54 »
Цена у них сейчас на скидках $299.00 +$19.99(подписка на первый месяц)
$499 (299+200) это при заказе "безлимитного доступа к данным".
Как понимаю, делают в Китае, в BGI.
Файлы выдают в формате CRAM. Выравнивание по hg38 без альт контигов.

В YFull уже поступил первый образец от WGS небулы.
Вы правы, цена вернулась на 299$. Касательно первого образца в YFull, а какое качество данных по Y хромосоме выдает BAM от Небулы?

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5625
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3511/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #34 : 17 Июнь 2020, 12:16:34 »
Цена у них сейчас на скидках $299.00 +$19.99(подписка на первый месяц)
$499 (299+200) это при заказе "безлимитного доступа к данным".
Как понимаю, делают в Китае, в BGI.
Файлы выдают в формате CRAM. Выравнивание по hg38 без альт контигов.

В YFull уже поступил первый образец от WGS небулы.
Вы правы, цена вернулась на 299$. Касательно первого образца в YFull, а какое качество данных по Y хромосоме выдает BAM от Небулы?
Полная статистика должна быть опубликована сегодня в группе YFull на FB

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 409
  • Страна: kz
  • Рейтинг +230/-0
  • YFull: YF79031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #35 : 17 Июнь 2020, 12:25:51 »
Цена у них сейчас на скидках $299.00 +$19.99(подписка на первый месяц)
$499 (299+200) это при заказе "безлимитного доступа к данным".
Как понимаю, делают в Китае, в BGI.
Файлы выдают в формате CRAM. Выравнивание по hg38 без альт контигов.

В YFull уже поступил первый образец от WGS небулы.
Вы правы, цена вернулась на 299$. Касательно первого образца в YFull, а какое качество данных по Y хромосоме выдает BAM от Небулы?
Полная статистика должна быть опубликована сегодня в группе YFull на FB
Зашел на Facebook, в тот же момент появился новый пост про Небулы WGS ;)


Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +547/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #36 : 17 Июнь 2020, 15:18:51 »
Он еще ответил на мой вопрос, что важнее Width and depth, which of them more important?

Width. 15x depth is enough for genealogy, 10x depth is acceptable.

По этим цифрам Nebula интереснее BigY.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5625
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3511/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #37 : 17 Июнь 2020, 16:07:32 »
Он еще ответил на мой вопрос, что важнее Width and depth, which of them more important?

Width. 15x depth is enough for genealogy, 10x depth is acceptable.

По этим цифрам Nebula интереснее BigY.
Скажем так, Big Y - это таргетное секвенирование. Все остальные, включая Nebula - это полногеномное секвенирование (WGS).
Эти продукты несравнимы и в дальнейшем стоит ожидать апгрейды BigY1000, BigY2000, BigALL и тп )))
WGS это уже конечный продукт. То есть FTDNA со своим BigY живет в прошлом веке, и их цены неоправданно завышены.

Оффлайн Viktor97

  • Сообщений: 113
  • Страна: ua
  • Рейтинг +29/-0
  • Y-ДНК: М:R1a-YP1137(Y-190380); ЖМ:I2a-L621(CTS10228); ЖЖМ:R1a-YP1337A1*
  • мтДНК: H9a
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #38 : 19 Июнь 2020, 20:12:00 »
Пришло письмо от Небулы - WGS за 300 баксов с доступом к Y и mt базам FTDNA:
"In partnership with FamilyTreeDNA, we give you access to the world’s largest Y-DNA and mtDNA databases."
Я так понимаю они будут показывать только совпаденцев и терминальный снип, но не будут создавать аккаунт в FTDNA?

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +547/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #39 : 21 Июнь 2020, 20:38:57 »
Пришло письмо от Небулы - WGS за 300 баксов с доступом к Y и mt базам FTDNA:
"In partnership with FamilyTreeDNA, we give you access to the world’s largest Y-DNA and mtDNA databases."
Я так понимаю они будут показывать только совпаденцев и терминальный снип, но не будут создавать аккаунт в FTDNA?
С самого запуска проекта была эта информация, про сотрудничество. Мой кит уже почти дополз, 1,5 месяца, не так страшно.

Оффлайн Storgt2

  • Сообщений: 1
  • Страна: ru
  • Рейтинг +0/-0
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #40 : 26 Июль 2020, 13:35:25 »
Кто уже отправлял? Подскажите пожалуйста через какую компанию отправляли и как подписывали. Просто переживаю как бы на границе не остановили мою посылку.

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +547/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #41 : 29 Июль 2020, 10:15:01 »
Кто уже отправлял? Подскажите пожалуйста через какую компанию отправляли и как подписывали. Просто переживаю как бы на границе не остановили мою посылку.
Числа 10 мая +- заказывал. Примерно 25 Июня получил. Сразу отправил. С 7 июля был статус Подготовлено к отправке из России.  24 июля Прошло регистрацию в Соединенных Штатах Америки. 27 вручение.

Кстати, с купоном MYTRUEANCESTRY10  Nebula выходит в 269$.

Вопрос с интеграцией с базой FTDNA похоже не в лучшую сторону будет решен. Придется доплачивать. И суммы которые писали в Facebook не очень радужные. Но нужна ли эта интеграция? Данные FTDNA (большую часть) можно сами собрать. STR маркеры получим у Yfull. Да там не все будут, но для сравнений можно использовать. Плюс снипы будут. На мой взгляд даже без базы FTDNA Nebula куда перспективнее BigY.

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +547/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #42 : 24 Сентябрь 2020, 11:16:55 »
Наконец готов результат.
29 Июля получил сообщение, что кит получен. Обещали до 10 недель. Справились почти ровно за 2 месяца.
Утром сразу сняли 20$ за месяц абон плата. Сразу отключу, ничего интересного там нет.
Дают возможность скачать:
CRAM (+CRAI)  - 50 gb
FASTQ - 50gb x2
VCF(+TBI)  - 300 mb
Никакой интеграции с FTDNA у них пока нет.
Deep Ancestry (Coming Soon) есть надпись.

Есть:
genome browser
Gene Analysis
Nebula Library. Можно в PDF скачать их данные по предрасположенностям.
traits
Чуть позже со скриншотами сделаю обзор.

Оффлайн ETOBOG

  • МЖ: R5a2. ММЖ: H6a1b2
  • Сообщений: 63
  • Страна: ru
  • Рейтинг +18/-1
  • Папа: R-Y1 (R1a1a1b2a1a1a1f1), Мама: J1c2c2a
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #43 : 25 Сентябрь 2020, 23:53:19 »
Есть:
genome browser
Gene Analysis
Nebula Library. Можно в PDF скачать их данные по предрасположенностям.
traits
Чуть позже со скриншотами сделаю обзор.

Очень жду обзор, спасибо за то, что делитесь.
Тоже намереваюсь заказать, но пока не понял для чего :)

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 835
  • Страна: ru
  • Рейтинг +547/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Nebula Genomics
« Ответ #44 : 26 Сентябрь 2020, 15:55:31 »
Есть:
genome browser
Gene Analysis
Nebula Library. Можно в PDF скачать их данные по предрасположенностям.
traits
Чуть позже со скриншотами сделаю обзор.

Очень жду обзор, спасибо за то, что делитесь.
Тоже намереваюсь заказать, но пока не понял для чего :)
За 300$ можно получить все что можно. Аналогичные продукты (не совсем тоже самое, продукт FTDNA основан на технологиях прошлого) обойдутся примерно в 770$.
Вы получаете cram фаил. Его можно загрузить напрямую в Yfull. Cram легко перевести в обычный Bam. Его уже можно скормить WGSExtract и выделить из Bam аутосомные файлы, получить группу Y и Mtdna. Аутосомные файлы создаются во всех форматах, можно загрузить в gedmatch, myheritage, ftdna. + файлы для медицинских исследований итд.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.