АвторТема: FTDNA  (Прочитано 1131825 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Tora_sama

  • Сообщений: 656
  • Страна: ru
  • Рейтинг +289/-0
  • Y-ДНК: E-Y184711
  • мтДНК: H1b2g
Re: FTDNA
« Ответ #12795 : 25 Июль 2022, 01:14:06 »
https://discover.familytreedna.com/y-dna/E-L241/story
Обновили интерфейс в новом сервисе, может ещё чего нового добавили.

Оффлайн voyt

  • Сообщений: 30
  • Страна: ru
  • Рейтинг +5/-0
  • Y-ДНК: I-M253 (предположительно Y6340) Maternal Y-DNA: FT42838 (на YFull: I-Y45587)
Re: FTDNA
« Ответ #12796 : 25 Июль 2022, 14:51:25 »
Здравствуйте, скажите, можно ли из Nebula (Deep Whole Genome Sequencing) выгрузить данные в FTDNA и какие данные?
Аутосомный (FF)? Y (Y-700)? mtDNA?

Берет ли FTDNA за это деньги (если загрузка данных возможна)?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15432
  • Страна: az
  • Рейтинг +4714/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: FTDNA
« Ответ #12797 : 25 Июль 2022, 18:12:31 »
Можно, но только аутосомы в таких форматах:
https://www.familytreedna.com/autosomal-transfer

Оффлайн voyt

  • Сообщений: 30
  • Страна: ru
  • Рейтинг +5/-0
  • Y-ДНК: I-M253 (предположительно Y6340) Maternal Y-DNA: FT42838 (на YFull: I-Y45587)
Re: FTDNA
« Ответ #12798 : 28 Июль 2022, 15:12:39 »
Как вы полагаете, какова вероятность в обозримом будущем, что FDNA начнет выполнять WGS-тесты? Понятно, что это вопрос чисто умозрительный, но судя по логике развития технологий (да и самих продуктов, которые предлагает FTDNA), к этому все идет.
В этой связи еще вопрос: смогут ли они выполнять WGS тесты c образцов материала, по которым уже выполнялись тесты на чипе? Правильно ли я понимаю, что потребуется "с нуля" работать с имеющимся био-материалом? Где-то я встречал информацию, что они хранят биоматериал 25 лет, это так?

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 924
  • Страна: ru
  • Рейтинг +622/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: FTDNA
« Ответ #12799 : 28 Июль 2022, 22:31:28 »
Аппараты на которых делают BigY пригодны и для WGS. У них illumina novaseq 6000 если не ошибаюсь. Вопрос в цене. BigY явно более маржинальный.
Однако в дополнение они делают y111 тест э. Это тоже затраты. Вряд ли они откажутся от такого теста, ведь база маркеров их самая рекламируемая фишка.
Хотя можно выделять маркеры из bam и по не прочитанным отдельно проходится. В теории это возможно.
Пол года назад выкладывали информацию, что в 22 году ftdna могут запустить WGS тесты, но оказалось это были чьи то пожелания.

Оффлайн voyt

  • Сообщений: 30
  • Страна: ru
  • Рейтинг +5/-0
  • Y-ДНК: I-M253 (предположительно Y6340) Maternal Y-DNA: FT42838 (на YFull: I-Y45587)
Re: FTDNA
« Ответ #12800 : 28 Июль 2022, 22:51:40 »
Аппараты на которых делают BigY пригодны и для WGS. У них illumina novaseq 6000 если не ошибаюсь. Вопрос в цене. BigY явно более маржинальный.
Однако в дополнение они делают y111 тест э. Это тоже затраты. Вряд ли они откажутся от такого теста, ведь база маркеров их самая рекламируемая фишка.
Хотя можно выделять маркеры из bam и по не прочитанным отдельно проходится. В теории это возможно.
Пол года назад выкладывали информацию, что в 22 году ftdna могут запустить WGS тесты, но оказалось это были чьи то пожелания.

У меня сложилось похожее впечатление (если говорить об их бизнес-модели). Конечно, маржинальность будет играть значительную роль в ответе на поставленный вопрос. До тех пор пока рынок не начнет капитально "поджимать" (хотя бы та же Небула с ее условными 200 долларами), то никакого WGS не будет. Я единственное не понимал технические возможности обновления данных до уровня WGS - нужно ли заново работать с био-материалом или нет и, если работать, то как.

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 924
  • Страна: ru
  • Рейтинг +622/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: FTDNA
« Ответ #12801 : 29 Июль 2022, 06:35:34 »
Аппараты на которых делают BigY пригодны и для WGS. У них illumina novaseq 6000 если не ошибаюсь. Вопрос в цене. BigY явно более маржинальный.
Однако в дополнение они делают y111 тест э. Это тоже затраты. Вряд ли они откажутся от такого теста, ведь база маркеров их самая рекламируемая фишка.
Хотя можно выделять маркеры из bam и по не прочитанным отдельно проходится. В теории это возможно.
Пол года назад выкладывали информацию, что в 22 году ftdna могут запустить WGS тесты, но оказалось это были чьи то пожелания.

У меня сложилось похожее впечатление (если говорить об их бизнес-модели). Конечно, маржинальность будет играть значительную роль в ответе на поставленный вопрос. До тех пор пока рынок не начнет капитально "поджимать" (хотя бы та же Небула с ее условными 200 долларами), то никакого WGS не будет. Я единственное не понимал технические возможности обновления данных до уровня WGS - нужно ли заново работать с био-материалом или нет и, если работать, то как.
Новое секвенирование делать конечно придется и тут встанет вопрос количества и качества биоматериала. Для WGS теста требования намного более жесткие, соответственно даже если они и введут такой продукт, придется заново отправлять материал.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15432
  • Страна: az
  • Рейтинг +4714/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: FTDNA
« Ответ #12802 : 29 Июль 2022, 08:23:29 »
Веду несколько китов, у которых после FF стал невозможен BigY, так что материал многим придётся пересдать.
« Последнее редактирование: 31 Июль 2022, 17:45:23 от Farroukh »

Оффлайн voyt

  • Сообщений: 30
  • Страна: ru
  • Рейтинг +5/-0
  • Y-ДНК: I-M253 (предположительно Y6340) Maternal Y-DNA: FT42838 (на YFull: I-Y45587)
Re: FTDNA
« Ответ #12803 : 31 Июль 2022, 16:59:01 »
Веду несколько китов, у которых после FF стал невозможен BigY, так что материал мнооим придётся пересдать.
И при этом они не успели сделать никакой анализ по Y (например, Y-12) одновременно с FF?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15432
  • Страна: az
  • Рейтинг +4714/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: FTDNA
« Ответ #12804 : 31 Июль 2022, 17:47:33 »
Успели. Я всегда начинаю с Y12, потом FF и в конце уже BigY. Поступать более рационально, начав сразу с бига, увы, не получалось по финансовым соображениям.
« Последнее редактирование: 01 Август 2022, 04:49:23 от Farroukh »

Оффлайн Tora_sama

  • Сообщений: 656
  • Страна: ru
  • Рейтинг +289/-0
  • Y-ДНК: E-Y184711
  • мтДНК: H1b2g
Re: FTDNA
« Ответ #12805 : 01 Август 2022, 01:54:48 »
Интересно а мне хватит, 37+фф, потом апгрейд до 111 и ещё одиночный снип....

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 924
  • Страна: ru
  • Рейтинг +622/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: FTDNA
« Ответ #12806 : 01 Август 2022, 07:49:38 »
Интересно а мне хватит, 37+фф, потом апгрейд до 111 и ещё одиночный снип....
Это все индивидуально. Есть примеры и в ту и в другую сторону. По запросу в техподдержку можно предварительно выяснить, хватит или нет.

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 924
  • Страна: ru
  • Рейтинг +622/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: FTDNA
« Ответ #12807 : 01 Август 2022, 09:21:05 »
Лучше накопить средств и сразу сделать всё один раз.
С первого раза бывает не проходит.
Техподдержка никогда не скажет хватит или не хватит материала.
Я тоже так думал, но некоторые люди утверждают, что предварительно уточняли у поддержки, до апгрейда

Оффлайн voyt

  • Сообщений: 30
  • Страна: ru
  • Рейтинг +5/-0
  • Y-ДНК: I-M253 (предположительно Y6340) Maternal Y-DNA: FT42838 (на YFull: I-Y45587)
Re: FTDNA
« Ответ #12808 : 05 Август 2022, 18:11:44 »
Летние скидки начались
FF-49$ mtdna-139$
У них бывают скидки на Big Y Raw Data файл (BAM)?

Оффлайн mefo

  • Сообщений: 1321
  • Страна: ru
  • Рейтинг +248/-0
  • Y-ДНК: N-BY4144
  • мтДНК: J2b1a6a
Re: FTDNA
« Ответ #12809 : 06 Август 2022, 11:23:16 »
Летние скидки начались
FF-49$ mtdna-139$
У них бывают скидки на Big Y Raw Data файл (BAM)?
Иногда некоторые купоны на 10$ применимы и к заказу BAM.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.