АвторТема: FTDNA  (Прочитано 1317760 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17317
  • Страна: az
  • Рейтинг +6041/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: FTDNA
« Ответ #13455 : 17 Апрель 2024, 21:53:33 »
Спрос однозначно есть. (Практически каждый новый пользователь приходит именно с таким вопросом - куда и как можно импортировать всё это хозяйство). Будет веб-морда - запиним темку с кратким описанием превращения сырого генотековского материала в FF.
« Последнее редактирование: 18 Апрель 2024, 05:47:36 от Farroukh »

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2230
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1095/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: FTDNA
« Ответ #13456 : 17 Апрель 2024, 23:15:53 »
Спрос однозначно есть. (Практически каждый новый пользователь приходит именно с таким вопросом - куда и как можно импортировать всё это хозяйство). Будет веб-морда - запирим темку с кратким описанием превращения сырого генотековского материала в FF.

А, добро, значит на следующей неделе засяду  ;)

Оффлайн ETOBOG

  • Сообщений: 84
  • Страна: ru
  • Рейтинг +35/-2
  • Индия + РФ
  • Y-ДНК: R1a-Y1 (Индия)
  • мтДНК: J1c2c2a (РФ)
Re: FTDNA
« Ответ #13457 : 18 Апрель 2024, 02:07:26 »
Но есть ли спрос? Может уже существуют программы, которые делают конвертацию CSV из Генотека в ФТДНА? Не хотелось бы делать то, что уже сделано и используется.

есть чудесный сайт https://tendna.com/ru/dna-converter, он бесплатно всё кодирует, и даже результаты медицинские даёт. Но вот проблема, почему-то перестали нормально кодироваться любые Ancestry тесты, они никуда не грузятся, а также не грузятся тесты других компаний в формате 23andMe на Генотек, в том числе тот-же ancestry. И всё это не грузится на FTDNA так как они принимают только Ancestry а он какой-то вдруг глючный стал. В общем, не понятно что делать, я так и не смог разобраться до конца как именно кодировать чтобы ничего не пропало, потому что в EXCEL я могу переделывать основные записи, но многое приходится удалять из-за несовместимости.

Возможно, вы сможете каким-то образом понять, что Ancestry такого нового сделали, что теперь их файлы не могут нормально перекодироваться даже в Dna Kit Studio

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17317
  • Страна: az
  • Рейтинг +6041/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: FTDNA
« Ответ #13458 : 18 Апрель 2024, 05:59:41 »
Для тех, кто заказывал первые BigY тесты (более 10 лет назад) bam-файл предоставлялся бесплатно и вдобавок содержал полный митосеквенс.

Направил им запрос, чтобы залили полный митогеном в мой профиль. (Из мито-тестов я заказывал себе лишь HVR1, полный мито-результат был извлечён из bam-файла и висит на мито-древе Yfull.)

О результате сообщу.
Прокомментирую чуть подробнее ответ от FTDNA:

- Результаты мтДНК, которые ранее включались в BAM-файлы являлись неполными и не проверялись контролем качества, поэтому не использовались в качестве окончательных  результатов.
Единственный способ — заказать апгрейд.
Как Legacy-клиенту, мы предлагаем скидку 50 % на mtFullSequence, что снижает стоимость до 59$ (вместо 119$).

Не знаю, насколько верно их утверждение насчёт куцого мито-секвенса из старого BAM-файла: у меня вроде как Yfull всё извлекли и на митодреве разместили.
« Последнее редактирование: 18 Апрель 2024, 08:52:03 от Farroukh »

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2230
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1095/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: FTDNA
« Ответ #13459 : 18 Апрель 2024, 09:48:51 »
есть чудесный сайт https://tendna.com/ru/dna-converter, он бесплатно всё кодирует, и даже результаты медицинские даёт. Но вот проблема, почему-то перестали нормально кодироваться любые Ancestry тесты, они никуда не грузятся, а также не грузятся тесты других компаний в формате 23andMe на Генотек, в том числе тот-же ancestry. И всё это не грузится на FTDNA так как они принимают только Ancestry а он какой-то вдруг глючный стал. В общем, не понятно что делать, я так и не смог разобраться до конца как именно кодировать чтобы ничего не пропало, потому что в EXCEL я могу переделывать основные записи, но многое приходится удалять из-за несовместимости.

Возможно, вы сможете каким-то образом понять, что Ancestry такого нового сделали, что теперь их файлы не могут нормально перекодироваться даже в Dna Kit Studio

Ааа, решение уже есть, просто перестало работать после каких-то изменений формата... Понять бы еще, кто и что поменял  ;D
т.е. сломаны:
23иЯ -> Генотек
Ancestry -> Генотек
Генотек -> Ancestry -> FTDNA
Буду думать.

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 646
  • Страна: ru
  • Рейтинг +176/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: FTDNA
« Ответ #13460 : 18 Апрель 2024, 10:28:58 »
Как Legacy-клиенту
А что это означает, извините?)

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2230
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1095/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: FTDNA
« Ответ #13461 : 18 Апрель 2024, 10:50:26 »
А что это означает, извините?)

Это значит, что для него делался продукт/услуга, которая более не доступна в том же виде, или даже не доступна вовсе. Например, в районе 2017 года FTDNA перешла с чипа v1 на v2 и все, кто делал тест во времена v1, считаются легаси-клиентами. Фаррух делал BigY500, когда в него был включен мито, так что он считается легаси-клиентом.

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1175
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1734/-11
  • Y-ДНК: G2a1
Re: FTDNA
« Ответ #13462 : 24 Апрель 2024, 14:21:25 »
Абсолютное большинство вновь появляющихся FF матчей на FTDNA  это новые аутосомные трансферы. Это те кто бегут из 23andme? img1  img2  img3  img4

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 646
  • Страна: ru
  • Рейтинг +176/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: FTDNA
« Ответ #13463 : 24 Апрель 2024, 15:28:54 »
Абсолютное большинство вновь появляющихся FF матчей на FTDNA  это новые аутосомные трансферы.
фтДНА долгое время не давали вообще загружать аутосомы других лабораторий. А это миллионы тестов. Так что, новые совпаденцы через аутосомный трансфер будут и будут накапливаться вне зависимости от того, как там дела у 23иЯ.
« Последнее редактирование: 24 Апрель 2024, 19:22:10 от Lesla »

Оффлайн kita

  • Сообщений: 27
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: R1a1-L1029
  • мтДНК: J1c4b
Re: FTDNA
« Ответ #13464 : 25 Апрель 2024, 23:06:44 »
У кого есть свежая информация по срокам подготовки лаборарией тестов Y37? С 20 марта изучают мой материал... До этого результат получал за пару недель  ???
« Последнее редактирование: 26 Апрель 2024, 16:49:16 от kita »

Оффлайн Mc-simov

  • GuslitsaDNA
  • Сообщений: 81
  • Страна: ru
  • Рейтинг +50/-0
  • Y-ДНК: R1a-CTS3402-BY32477
  • мтДНК: H6a1a4
Re: FTDNA
« Ответ #13465 : 26 Апрель 2024, 06:39:22 »
У кого есть свежая информация по срокам подготовки лаборарией тестов Y37. С 20 марта изучают мой материал... До этого результат получал за пару недель  ???
Две недели - это самые оптимистичные сроки. Я меньше, чем на два месяца не рассчитываю. Особенно учитывая то обстоятельство, что в течении месяца было два скидочных периода, а значит очередь на тестирование заметно увеличилась.
К тому же, многое зависит от качества материала на самих щёточках - если лаборатория не сможет уверенно определить один маркер, тест отправят на повторное исследование.

Оффлайн guenther

  • Сообщений: 67
  • Страна: de
  • Рейтинг +34/-0
  • Y-ДНК: I-Z63 > I-FT30287
Re: FTDNA
« Ответ #13466 : 26 Апрель 2024, 12:15:48 »
Уважаемые коллеги, кто-нибудь может помочь с конвертацией Генотека в формат, который сейчас принимается FTDNA? У меня не получается в Экселе сконвертировать по ранее опубликованной инструкции.

Оффлайн Daemon2017

  • Сообщений: 2230
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1095/-18
  • Y-ДНК: R1a-Y35174
  • мтДНК: V7-a2a2a2b*
Re: FTDNA
« Ответ #13467 : 30 Апрель 2024, 19:25:38 »
Цитировать
Прекращение производства продукции

Мы работаем над оптимизацией нашего каталога продуктов, чтобы можно было перераспределить ресурсы в сторону более полезных и популярных продуктов. На большинство этих продуктов за последние три года или около того поступило мало заказов, и удаление их из нашей системы управления продуктами упростит наши внутренние процессы.

Уже размещенные заказы будут выполнены; однако новые заказы будут невозможны.

Ожидается, что в период до конца июня будут удалены следующие продукты:
В настоящее время доступно только через службу поддержки клиентов
*Y-12
*Ю-67
*Трансфер Y-ДНК (Y33, Y46, Y46 с обновлением Y-37)
*Отдельные SNP
*Пакеты SNP
*Аутосомный перенос без витагена
*Аутосомальная разблокировка Vitagene
*Family Finder + пакет myDNA Wellness
*Дополнение myDNA Wellness (для клиентов, у которых уже есть Family Finder)
*Воин Джин
*Передача Geno 2+ Family Finder* (заменена на обычную Family Finder) — в настоящее время это обновление передачи вообще не может быть обработано, но оно настолько редкое, что мы все равно будем рассматривать его в индивидуальном порядке.

Мы знаем, что некоторые из вас используют Y-12 в качестве квалификационного теста, но поскольку Family Finder предоставляет подтвержденную, более точную гаплогруппу, мы рекомендуем вместо этого использовать его в качестве квалификатора, поскольку это может исключить тестеров, которые могли бы считаться хорошими вариантами. с предсказанной выше гаплогруппой. Например, предсказанная гаплогруппа R-M269 может быть столь же специфичной, как R-U198 или FCG8601.

FF, Y37, Y111, BigY700 - никогда еще линейка продуктов FTDNA не была столь скудной  :-\

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 723
  • Страна: ru
  • Рейтинг +222/-5
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a, дети T1a1ct и H5b*
Re: FTDNA
« Ответ #13468 : 04 Май 2024, 11:01:28 »
Опять не прокатило, но вдруг подумают, действительно.

Request Form:
Hi!
I have a wgs test 40x and my terminal Y is under https://discover.familytreedna.com/y-dna/I-BY74538/story subclade.
Is it possible to upload my results to your bigY database for some fee - e.g. in equivalent of Y37 test?
Please consider this possibility if you don't yet have such a transfer - I think this would be great product ( as it happened with autosomal upgrade which will give us eventually some ancient terminal SNP).

Hello,
Thank you for contacting FamilyTreeDNA, and I apologize for the delayed response. Unfortunately, we do not accept WGS transfers. I've shared your feedback with our development team to consider for future changes to the product offerings.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8554
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4900/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: FTDNA
« Ответ #13469 : 05 Май 2024, 06:22:00 »
Если у кого-то как у меня не грузятся данные из Генотека (формат vcf или 23andMe) в FamilyTreeDna из-за каких-то их новых ограничений, то вот что мне помогло после двух недель мучений:

1) Открываю файл Генотека (оригинальный VCF) в Excel, указываю что разделитель табуляция, импортирую все столбцы
2) Удаляю лишние первые строки, оставляя только результаты
3) сортирую так, как требует ftdna:
rsid chromosome position allele1 allele2
Тут надо дополнить, что сами аллели ещё необходимо сначала вывести. В vcf Генотека данные хранятся в следующем виде:

#CHROM   POS   ID   REF   ALT   QUAL   FILTER   INFO   FORMAT
chr1   752721   rs3131972   A   G   .   .   .   GT   0/1
chr1   759036   rs114525117   G   A   .   .   .   GT   0/0

Здесь A и G это не результаты тестирования, а референс и альтернативный вариант. Сам же результат закодирован в правой колонке. 0 - берём первый вариант, 1 - второй. То есть, строки из примера выше нужно преобразовать в такой вид:

rs3131972   chr1   752721   AG
rs114525117   chr1   759036   GG

Во второй строчке не GA, а GG. Думаю, можно сделать, используя формулу Excel "Если".

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.