FTDNA

[Mc-simov]

Не уточнил, что  о безнаборном тесте спрашиваю.

Я использую бумажные пакеты для стерилизации. К пакету прикладываю форму о согласии передачи персональных данных. Затем всё вместе запечатываю в зиплок и отправляю.

[ETOBOG]

Если у кого-то как у меня не грузятся данные из Генотека (формат vcf или 23andMe) в FamilyTreeDna из-за каких-то их новых ограничений, то вот что мне помогло после двух недель мучений:

1) Открываю файл Генотека (оригинальный VCF) в Excel, указываю что разделитель табуляция, импортирую все столбцы
2) Удаляю лишние первые строки, оставляя только результаты
3) сортирую так, как требует ftdna:
rsid chromosome position allele1 allele2

4) заменяю имя хромосом, где написано "chr1" удаляя заменой "chr", тем самым остаются только цифры хромосом.
5) дальше работа с фильтрами: удаляю все значения где указано больше одного ACTG, все значения должны быть только по 1 букве
6) удаляю все пустые или непонятные значения отовсюду строчками прямо, включая 0-0 и --
7) удаляю те rsid в которых присутствует несколько значений разделённых знаком ";"
8) исправляю название хромосом:
генотековские значения для Y хромосомы исправляю "Y" на "23"
генотековские значения для X хромосомы исправляю "X" на "24"
генотековские значения для Mt хромосомы исправляю "Mt" на "26"
9) экспортирую всё в txt файл разделённый пробелами, предварительно отсортировав строки по столбцу хромосом
10) открываю блокнотом и добавляю в начало файла:

#AncestryDNA raw data download
#This file was generated by AncestryDNA at: 09/26/2023 23:47:04 UTC
#Data was collected using AncestryDNA array version: V2.0
#Data is formatted using AncestryDNA converter version: V1.0
#Below is a text version of your DNA file from Ancestry.com DNA, LLC. THIS
#INFORMATION IS FOR YOUR PERSONAL USE AND IS INTENDED FOR GENEALOGICAL RESEARCH
#ONLY. IT IS NOT INTENDED FOR MEDICAL, DIAGNOSTIC, OR HEALTH PURPOSES. THE EXPORTED DATA IS
#SUBJECT TO THE ANCESTRY TERMS AND CONDITIONS, BUT PLEASE BE AWARE THAT THE
#DOWNLOADED DATA WILL NO LONGER BE PROTECTED BY OUR SECURITY MEASURES.
#WHEN YOU DOWNLOAD YOUR RAW DNA DATA, YOU ASSUME ALL RISK OF STORING,
#SECURING AND PROTECTING YOUR DATA. FOR MORE INFORMATION, SEE ANCESTRYDNA FAQS.
#
#Genetic data is provided below as five TAB delimited columns. Each line
#corresponds to a SNP. Column one provides the SNP identifier (rsID where
#possible). Columns two and three contain the chromosome and basepair position
#of the SNP using human reference build 37.1 coordinates. Columns four and five
#contain the two alleles observed at this SNP (genotype). The genotype is reported
#on the forward (+) strand with respect to the human reference.
rsid chromosome position allele1 allele2

------ в последней строчке между rsid и chromosome и далее не пробелы а табуляция

11) сохраняю, архивирую в zip, загружаю.
12) если не принимает файл всё равно, то открываю в DnaStudio 2.9 и конвертирую используя шаблон Ancestry v2, после чего снова в блокноте открываю и добавляю указанную выше шапку, снова в архив - так сработало.

[Farroukh]

Интересный способ. Возможно, уважаемый Daemon2017 сумеет изваять соответствующий конвертер по автоматизации?

[Semargl]

Если у кого-то как у меня не грузятся данные из Генотека (формат vcf или 23andMe) в FamilyTreeDna из-за каких-то их новых ограничений, то вот что мне помогло после двух недель мучений:

Плюс!
Единственно, не уверен на 100%, но могут слететь результаты MT из-за возможных разных референсов. Но это не важно, так как FTDNA и так не интерпретирует данные Y и mtDNA из загруженного VCF.

[Farroukh]

Для тех, кто заказывал первые BigY тесты (более 10 лет назад) bam-файл предоставлялся бесплатно и вдобавок содержал полный митосеквенс.

Направил им запрос, чтобы залили полный митогеном в мой профиль. (Из мито-тестов я заказывал себе лишь HVR1, полный мито-результат был извлечён из bam-файла и висит на мито-древе Yfull.)

О результате сообщу.

[grazie]

Обнаружил аутосомный матч, который сегодня или на днях появился молча без уведомлений (он 162сМ), хотя в match date указана дата, когда мой тест FF был готов (в моем случае в конце февраля).
Это всё потому, что пользователь сначала скрыл себя для возможных матчей, а потом снова открылся (opt-in to matching)?

[AleksG]

Обнаружил аутосомный матч, который сегодня или на днях появился молча без уведомлений (он 162сМ), хотя в match date указана дата, когда мой тест FF был готов (в моем случае в конце февраля).
Это всё потому, что пользователь сначала скрыл себя для возможных матчей, а потом снова открылся (opt-in to matching)?

McRae Sidney Smith ?)

[grazie]

Обнаружил аутосомный матч, который сегодня или на днях появился молча без уведомлений (он 162сМ), хотя в match date указана дата, когда мой тест FF был готов (в моем случае в конце февраля).
Это всё потому, что пользователь сначала скрыл себя для возможных матчей, а потом снова открылся (opt-in to matching)?

McRae Sidney Smith ?)

Он 

[shink]

Подскажите, есть ли сейчас возможность загрузить аутосомальный результат из WGS+ Yseq в FTDNA? Если да, то какой из файлов результата нужно использовать?

[Daemon2017]

Подскажите, есть ли сейчас возможность загрузить аутосомальный результат из WGS+ Yseq в FTDNA? Если да, то какой из файлов результата нужно использовать?

Ancestry точно можно и, кажется, MyHeritage.
https://www.familytreedna.com/autosomal-transfer

[AleksG]

Обнаружил аутосомный матч, который сегодня или на днях появился молча без уведомлений (он 162сМ), хотя в match date указана дата, когда мой тест FF был готов (в моем случае в конце февраля).
Это всё потому, что пользователь сначала скрыл себя для возможных матчей, а потом снова открылся (opt-in to matching)?

McRae Sidney Smith ?)

Он 

Третьим будете
Ну или трехсоттысячным у кого этот товарищ вылез.

Полагаю сбой в ftdna при трансфере у него.

[Древ]

Подскажите, есть ли сейчас возможность загрузить аутосомальный результат из WGS+ Yseq в FTDNA? Если да, то какой из файлов результата нужно использовать?

такая возможность просто обязана быть. Поиграйте с WGS extract - расскажите потом.

[Farroukh]

Для тех, кто заказывал первые BigY тесты (более 10 лет назад) bam-файл предоставлялся бесплатно и вдобавок содержал полный митосеквенс.

Направил им запрос, чтобы залили полный митогеном в мой профиль. (Из мито-тестов я заказывал себе лишь HVR1, полный мито-результат был извлечён из bam-файла и висит на мито-древе Yfull.)

О результате сообщу.

Докладываю по ситуации. Эти результаты отображаться не будут. Контора не любит шибко грамотных, для полного митосеквенса будь добр заказать MtFull

[mefo]

Подскажите. Есть ли продвижение по определению гапрогрупп в тестах Family Finder старше 2023 года? Такое впечатление, что работа остановилась.

Какой-то у них вялотекущий прогресс. По старым наборам Prediction выкладывали 08.12.23 и 31.01.24 - 01.02.24.
Если тенденция сохранится, то следующая порция появится в начале апреля.

Похоже дождались новой порции! Хоть уже середина апреля. Мне на почту пришли уведомления  "A new report is ready for you!" по двум наборам с очень похожими номерами, но в списке сделанных тестов Prediction по ним нет.

[Lesla]

Похоже дождались новой порции! Хоть уже середина апреля. Мне на почту пришли уведомления  "A new report is ready for you!" по двум наборам с очень похожими номерами, но в списке сделанных тестов Prediction по ним нет.

Я по проекту вижу ежедневные обновления. Причем о большинстве не уведомляют в админке. Приходится вручную искать изменения в таблице гаплотипов проекта.