Вопросы Артему Лобову

[Аббат Бузони]

Лобов Артем Сергеевич, к.б.н., недавно защитил работу «Структура генофонда субпопуляций башкир» http://www.anrb.ru/molgen/Lobov_AS.PDF



Институт биохимии и генетики Уфимского научного центра РАН

Институт создан в 1962 г. как Отдел биохимии и цитохимии Башкирского филиала АН СССР академиком Российской академии сельскохозяйственных наук В.Г. Конаревым, в 1999 г. переименован в Институт биохимии и генетики УНЦ РАН. Огромная роль в его организации, а также формировании и становлении основных научных направлений принадлежит академикам А.Н. Белозерскому, А.Л. Курсанову, Г.П. Георгиеву, чл.-корреспондентами РАН Р.Г. Бутенко и А.Г. Рыскову, профессорам О.Н. Кулаевой, А.С. Антонову и другим ведущим ученым России. В разное время Институт возглавляли профессор Р.Р. Ахметов, к.б.н. Ш.Я. Гилязетдиинов. С 1991 г директором Института является В.А. Вахитов, д.б.н., профессор, действительный член Академии наук Республики Башкортостан, заслуженный деятель науки Российской Федерации и Башкортостана.

Основные научные направления:

    Организация и экспрессия генов высших и низших организмов
    Молекулярная и популяционная генетика человека
    Физиология и биохимия растений и животных
    Технология живых систем

Исследования, проводимые сотрудниками Института, поддержаны многочисленными грантами - РФФИ, ФЦП, Государственная поддержка интеграции высшего образования и фундаментальной науки, ГНТП Геном человека, Приоритетные направления генетики, Новейшие методы биоинженерии, Национальные приоритеты в медицине и здравоохранении, Программой Государственной поддержки ведущих научных школ России (проф. В.А. Вахитов), ГНТП АН РБ. Проблемы физико-химической биологии в области медицины, сельского хозяйства и технологии живых систем Республики Башкортостан, а также программой международного сотрудничества INTAS.

    Россия
    Башкортостан
    450054 г.Уфа, пр. Октября, 71
    тел.  +7 (347) 2356088
    факс +7 (347) 2356088
    molgen@anrb.ru

http://www.anrb.ru/molgen/index.html

[Аббат Бузони]

Выслал приглашение, надеюсь скоро увидим Артема Сергеевича у нас на форуме.

[Grigoriev]

Александр, что ж.. это здорово!
Я тоже очень надеюсь, что А.С. Лобов к нам присоединится, и будет хотя бы изредка принимать участие в дискуссиях.

[Аббат Бузони]

Александр, что ж.. это здорово!
Я тоже очень надеюсь, что А.С. Лобов к нам присоединится, и будет хотя бы изредка принимать участие в дискуссиях.

Обещал заглядывать, но из-за личных проблем частое общение гарантировать не может.

[Mich Glitch]

Артём, у меня к Вам не вопрос, а скорее просьба.
Мы с коллегами затеяли издание журнала, Russian Journal of Genetic Genealogy, который поможет донести до широкой публики наработки российских авторов по ДНК-генеалогии.

Если у Вас имеются уже издававшиеся работы, авторские права на которые принадлежат исключительно Вам; или же осталось что-то неопубликованное, но до сих пор сохранившее актуальность, очень просим поделиться.
 

[asan-kaygy]

Вопрос: Уважаемый Артем, когда производился сбор образцов по У-хромосоме велся ли учет башкирских родов или разделение было только по районам?

[Аббат Бузони]

Артем из-за личных проблем не может ответить на вопросы, но я с ним переписывался и то что он мне ответил я позже выложу.

[Grigoriev]

Ждём ответов!

[Аббат Бузони]

Вопросы:
1) В работе Lobov et al. 2009 отмечено, что "медианные сети
построены на основе десятилокусных STR-гаплотипов (DYS19,DYS390, DYS391,
DYS392, DYS393, DYS389I, DYS389II, DYS439, DYS461, DYS388)."

 Существуют ли эти гаплотипы в виде приложения к работе, если да, то
где можно их найти, если нет, то можно ли их получить от Вас?

2) Отслежены ли генеалогии тестирумых?

3) Из 8 изученных групп - 4 - юго-восточные, 3 - юго-западные и 1
северная. Нет центральных, северо-восточных, северо-западных. Почему
такой выбор?

Ответы:
По поводу вопроса по YSTR. На данный момент я не могу Вам выслать эти
результаты, по причине того, что они пока не опубликованы. Мы уже давно
ждем статью в "European Jornal", в которой будут все основные данные и
данные по YSTR в том числе. (мое примечание - как же выгодно посылать статьи к нам)

Что означает Ваш вопрос поповоду генеалогии? Если Вы имеете в виду
прослежена ли связь доноров между собой, то нет. При анкетировании мы
лишь устанавливали ФИО и место жительства близких родственников до 2-го
поколения (бабушки, дедушки) и их национальность. Это проводилось с
целью определения национальности.

По поводу выбора субпопуляций. Выбор именно этих субпопуляций башкир был
сделан с целью: охватить максимальные территории проживания башкир, а
также связан с некоторыми особенностями субпопуляций. Мы изучили самых
западных башкир Самарской и Саратовской областей на которых, безусловно,
оказали сильное влияние западно-евразийские популяции, также были
изучены самые северные башкиры Пермской области, которые являются
лесными изолятами. Башкиры Баймакского района Республики Башкортостан
тоже длительное время находились в изоляции от других популяции в горной
местности. Оренбургские башкиры, являясь самыми южными, проживают в
непосредственной близости с народами Средней Азии. Башкиры
Стерлибашевского района Республики Башкортостан являются центральными
башкирами в нашей выборке.

[Denis B.]

из работы:
При анализе Y хромосомы использовано 26 диаллельных и 18 микросателлитных локусов.

Т.е. гаплотипы у Лобова - 18-маркерные.

asan-kaygy
О родовой принадлежности при сборе материала не спрашивали. У них стандартная попгеновская анкета, где нужно указать имена и национальность, место рождения родителей и бабушек-дедушек.

[Каржавин]

Лобов Артем Сергеевич, к.б.н., недавно защитил работу «Структура генофонда субпопуляций башкир» http://www.anrb.ru/molgen/Lobov_AS.PDF
http://www.anrb.ru/molgen/index.html

Что-то ссылки не работают 

[Аббат Бузони]

Лобов Артем Сергеевич, к.б.н., недавно защитил работу «Структура генофонда субпопуляций башкир» http://www.anrb.ru/molgen/Lobov_AS.PDF
http://www.anrb.ru/molgen/index.html

Что-то ссылки не работают 

Да, ссылки крякнули не так давно.

[Denis B.]

Да, сайт АН РБ недавно переделали