АвторТема: Конвертация файла .vcf  (Прочитано 8045 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Veprya

  • Сообщений: 61
  • Страна: kz
  • Рейтинг +7/-0
  • R-M198, gedmatch: H730833
  • Y-ДНК: R-M198
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #30 : 26 Декабрь 2022, 09:00:35 »
Подскажите, скачала файл из генотека и хотела конвертировать его в V5, но не пойму куда загружать и куда нажимать, подскажите, пожалуйста.

Может по видео понятно будет https://youtu.be/6Hs1hmcjnUE
« Последнее редактирование: 26 Декабрь 2022, 10:19:30 от Veprya »

Оффлайн Pedder

  • Сообщений: 2
  • Страна: ru
  • Рейтинг +0/-0
  • Y-ДНК: I1a1b1
  • мтДНК: H13a2b2
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #31 : 08 Май 2023, 02:27:39 »
После конвертации из vcf в txt (23andme_v5) файл из 25.3 МБ в txt занимает 16 МБ, это норма? хотя возможно сокращено ко-во пробелов из исходника, но не уверен.

Оффлайн poofeg

  • Сообщений: 3
  • Рейтинг +0/-0
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #32 : 24 Май 2023, 11:25:27 »
Не получилось. Скачал VCF из ЛК Генотека, сконвертировал с помощью DNA Kit Studio в 23andme, а при загрузке на MyHeritage вот так:

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 730
  • Страна: ru
  • Рейтинг +224/-5
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a, дети T1a1ct и H5b*
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #33 : 24 Май 2023, 11:47:54 »
Маппинг в нужный формат надо выставлять
Смотрите https://forum.molgen.org/index.php/topic,9248.msg569729.html#msg569729

Оффлайн poofeg

  • Сообщений: 3
  • Рейтинг +0/-0
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #34 : 24 Май 2023, 18:31:27 »
Маппинг в нужный формат надо выставлять
Смотрите https://forum.molgen.org/index.php/topic,9248.msg569729.html#msg569729
Если это был ответ мне, и если вы про шаблон, то конечно я выставил нужный. И перепробовал еще кучу других, чтобы уж точно.

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 730
  • Страна: ru
  • Рейтинг +224/-5
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a, дети T1a1ct и H5b*
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #35 : 24 Май 2023, 18:46:21 »
Маппинг в нужный формат надо выставлять
Смотрите https://forum.molgen.org/index.php/topic,9248.msg569729.html#msg569729
Если это был ответ мне, и если вы про шаблон, то конечно я выставил нужный. И перепробовал еще кучу других, чтобы уж точно.
У меня тоже сперва была проблема из Генотек в myheritage
Выбрал тот маппинг и всё получилось. И в ftdna и ещё в 5 сервисов

Оффлайн poofeg

  • Сообщений: 3
  • Рейтинг +0/-0
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #36 : 24 Май 2023, 19:06:58 »
Маппинг в нужный формат надо выставлять
Смотрите https://forum.molgen.org/index.php/topic,9248.msg569729.html#msg569729
Если это был ответ мне, и если вы про шаблон, то конечно я выставил нужный. И перепробовал еще кучу других, чтобы уж точно.
У меня тоже сперва была проблема из Генотек в myheritage
Выбрал тот маппинг и всё получилось. И в ftdna и ещё в 5 сервисов
У меня Family Tree DNA приняли файл, а MyHeritage никак.

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 667
  • Страна: ru
  • Рейтинг +179/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #37 : 18 Май 2024, 22:41:41 »
Господа! С прискорбием узнал, что в программе DNA kit studio 2.9 нет конвертатора VCF!!! В версии 2.8 он был. Подскажите, как быть? Старой версии программы нигде не сыскать.

Оффлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R-L365->YP940>R-FT439430
  • Сообщений: 956
  • Страна: 00
  • Рейтинг +420/-4
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1a
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #38 : 18 Май 2024, 23:59:06 »
Господа! С прискорбием узнал, что в программе DNA kit studio 2.9 нет конвертатора VCF!!! В версии 2.8 он был. Подскажите, как быть? Старой версии программы нигде не сыскать.

Да мой возьмите
https://disk.yandex.ru/d/jW1BqX48dKReRA
« Последнее редактирование: 19 Май 2024, 15:15:36 от AleksG »

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 667
  • Страна: ru
  • Рейтинг +179/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #39 : 19 Май 2024, 00:18:51 »

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 667
  • Страна: ru
  • Рейтинг +179/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #40 : 24 Май 2024, 22:41:01 »
Не получается у меня правильно сконвертировать. В чём-то у меня, видимо, ошибка.
Рассказываю по порядку.
С Генотека качаю бесплатный VCF. Через DNA kit studio переделываю его в 23&me в формате txt. Дальше из этого txt конвертирую в формат МХ (тоже в txt). Гружу на МХ. Он даёт загрузить, но если зайти в управление наборами пишет "неверный комплект".
Пробовал по-разному конвертировать (скрины прилагаю).
Подскажите, в чём моя ошибка?





Оффлайн Древ

  • Сообщений: 667
  • Страна: ru
  • Рейтинг +179/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #41 : 24 Май 2024, 23:28:31 »
Я разобрался в чём была ошибка.
Мне в этом помогла вот эта инструкция:

Итак. Генотек в личном кабинете позволяет нам бесплатно загрузить результаты ДНК-теста в виде файла .vcf. Его, к сожалению, нельзя загрузить в крупнейшие базы данных (например, GEDmatch). Всё равно, давайте загрузим его на свой ПК.
Далее, загружаем DNA Kit Studio с официального сайта. Распаковываем архив в какую-нибудь папку и открываем файл DNAKitStudio.exe. Перед нами открывается окно программы.
По умолчанию открыта вкладка RAW Tools, которая нам не нужна. Нажимаем на вкладку справа, VCF Tools, где по умолчанию будет открыта подвкладка VCF Converter. Это то, что нам нужно.
Настраиваем параметры. VCF File Input – выбираем тот файл, который мы загрузили из личного кабинета Генотека. Output Format оставляем без изменений, 23andme. Ставим флажок напротив Use Raw Data Template. В выпадающем списке нужно выбрать Template_23andme_v5.txt. Далее, в Raw Data Output указываем, куда сохранить новый файл, и нажимаем Convert.
После завершения работы программы у вас будет файл с генетическими данными, которые вы можете загрузить в крупнейшие базы данных, и найти, таким образом, ещё больше своих родственников.

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1250
  • Страна: ru
  • Рейтинг +929/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #42 : 25 Май 2024, 12:14:56 »
Древ
По сути вы просто написали тоже самое что и в конце предыдущей страницы.

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 667
  • Страна: ru
  • Рейтинг +179/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Конвертация файла .vcf
« Ответ #43 : 25 Май 2024, 13:51:38 »
Древ
По сути вы просто написали тоже самое что и в конце предыдущей страницы.
Да, наверное. Но там я непонял. Может быть, этот текст кому-нибудь когда-нибудь поможет.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.