Из обсуждения в Телеграмме.
https://www.nature.com/articles/s41586-024-08418-5Этот палео образец - « one of the Avar samples from Mödling An Der Goldenen Stiege (MGS330)», с бронзовым кольцом на пальце.
Один Авар из Медлинга относится к Ос-Багатаровской ветви? т.к. Z16575 эквивалентен GG330.
ID
Lab ID
SeqID
Reads
Reads_Mapped
Post-DeDup_Mapped_Reads
ClusterFactor
Endogenous_DNA_Post-DeDup(%)
Endogenous_DNA_OffTarget_Post-Dedup(%)
Damage at 5' end (1st position)
Damage at 5' end (2nd position)
Mean_read_length
Median_read_length
%GC
RateX
RateY
Sex
Auto
chrX
chrY
chrMT
nSNP
nFlank
rSNP
rFlank
Method
MoM
SE(MoM)
ML
SE(ML)
nr.MT.only
mn.cov.MT.only
contamix contamination est.(cont.nolen)
contamix lower bound (cont.nolen.lb)
contamix upper bound(cont.nolen.ub)
n1240K
percentage 1240K
nHO (Human Origin panel positions)
percentage HO
yhap
mtDNA_Hap
MGS330.A0101
MGS330
MGS330.A0101.TF1
30554386
1859223
127647
1.93
6.08
1.18
0.23
0.01
50.17
48.00
42.71
0.48
0.55
M
0.04
0.02
0.02
2.35
9
81
0.000
0.000
Method1:new_ll1
NA
NA
NA
NA
2155
5.63
0.02
0.01
0.03
28477
0.02
14024
0.02
G2a1a1a1a1a1b1(G-Z16575,G-Z7947)
H4a1a1