J1 полку прибыло

[Karen]

Готов Биг Торникова.
YSC0000076>FGC8223>BY65>ZS1559
Снипы BY93, ZS6829 не были протестированы.

Просьба прокоментировать результаты.

Значит, Торников всё-таки FGC8223, а не FGC15940, хотя на 67 локусах подавляющее большинство его приближенцев с общей разницей от 10 до 20 мутаций - с ветвей FGC15940.

Мой комментарий остался незамеченным 

Как я и предполагал, он оказался из FGC8224 и даже из ветви Kharmandarianа

[Yaroslav]

Мой комментарий остался незамеченным 

Как я и предполагал, он оказался из FGC8224 и даже из ветви Kharmandarianа

Да, Карен, плюс Вам за прозорливость

Kazanci распределён админом проекта J1 в J-FGC15938 Cluster A1, одну из ветвей FGC15940. Теперь я думаю, что это распределение может быть ошибочным и Kazanci нужно тестировать снипы.

Ближайшие к Хармандаряну в Семаргле - тоже люди с подтверждением или предикцией на различные ветви FGC15940. Торников и Kazanci не из самых ближних к нему.

Возможно, что всему J-FGC15938 Cluster A1 нужно тестирование снипов для пересмотра их положения на дереве J1.

[AlexanderK]

Просьба сапгрейдить в Семаргле до 111 маркеров:

571843   George Hachaturov
538482   Igor Kakalov

[Yaroslav]

Просьба сапгрейдить в Семаргле до 111 маркеров:

571843   George Hachaturov
538482   Igor Kakalov

Хачатуров уже со 111, а Какалов в каком сейчас проекте, не напомнишь?

[AlexanderK]

Просьба сапгрейдить в Семаргле до 111 маркеров:

571843   George Hachaturov
538482   Igor Kakalov

Хачатуров уже со 111, а Какалов в каком сейчас проекте, не напомнишь?

А, Какалов только в моем семейном так как это мой троюродный брат. Но у него был У67, а оставшиеся  маркеры до 111 ты взял из БигУ, так что там всего 4 дырки надо заполнить:

dys716  26
dys717  19
dys452  30
dys463  22

- ожидаемо значения такие же как у меня, так что и на 111 у нас разница только один - dys576 у меня 16 а у него 15. Но раз уж ФТДНА дали хорошую скидку то решил проапгрейдить и его и Мадатова (он пока не готов).

Упд. На 111 разница не 1 а 2 маркера - еще ggaat1b07 у меня 11 а у брата 10

[AlexanderK]

Ярослав, сапгрейди пожалуйста Какалова до 111!!!

[Yaroslav]

Ярослав, сапгрейди пожалуйста Какалова до 111!!!

Извини, упустил. Готово!

[Yaroslav]

Borg J-BY69)

Не пойму, какой он снип-пакет себе заказывал. Если посмотреть в таблицу снипов, то непонятно, что у него со снипами ниже BY69. В его списке такие снипы как ZS3202, Z18471 и L1189 не указаны ни среди положительных, ни среди отрицательных, ни среди no call-ов.

[Джим]

So the J1 SNP Pack is not very useful any more.

[AlexanderK]

Ярослав, сапгрейди пожалуйста Какалова до 111!!!

Извини, упустил. Готово!

И еще два апгрейда 67-111 готовы, оба в твоей компетенции:

347635   Emil Madatov
242152   Sergey Mirzoyan

 

[Yaroslav]

И еще два апгрейда 67-111 готовы, оба в твоей компетенции:

347635   Emil Madatov
242152   Sergey Mirzoyan

Мадатова проапгрейдил. А где можно увидеть Y-111 гаплотип Мирзояна?

[AlexanderK]

И еще два апгрейда 67-111 готовы, оба в твоей компетенции:

347635   Emil Madatov
242152   Sergey Mirzoyan

Мадатова проапгрейдил. А где можно увидеть Y-111 гаплотип Мирзояна?

А черт, его же Ован тестировал и запретил мне его добавлять куда-либо... Но в моем семейном он есть, так как родом тоже из Гандзака и у нас много пересечений по FF. Кину вечером!

[Александр 1977]

Готов Биг Торникова.
YSC0000076>FGC8223>BY65>ZS1559
Снипы BY93, ZS6829 не были протестированы.

Просьба прокоментировать результаты.

Значит, Торников всё-таки FGC8223, а не FGC15940, хотя на 67 локусах подавляющее большинство его приближенцев с общей разницей от 10 до 20 мутаций - с ветвей FGC15940.

Субклад ZS1559 возрастом где-то ~4000 лет (плюс-минус чего-то там).

В BY93 находятся европейцы. В ZS6829 - арабы. Торников может быть ZS1559*, то есть, представлять собой третью ветвь ZS1559, ещё не определённую. Возможно, что он разбивает узел BY93 или узел ZS6829.

Все точки над "ё" расставит BAM-файл, отправленный в YFull, правда, ветвь BY65>ZS1559 там ещё не исследована. Пока что там исследованы другие ветви FGC8223 (там этот снип называется также Y3441).

Если есть возможность, скиньте мне VCF Торникова, я посмотрю, можно ли из него что-то выловить помоложе ZS1559.

Только так, ВАМ-файл не доступен.

A5013+, BY18729+, BY3070+, BY65+, CTS10640+, CTS1068+, CTS10858+, CTS1138+, CTS11501+, CTS11571+, CTS11741+, CTS11765+, CTS11787+, CTS12047+, CTS1983+, CTS2453+, CTS2769+, CTS3068+, CTS3101+, CTS3210+, CTS3401+, CTS3492+, CTS3654+, CTS3936+, CTS4025+, CTS4133+, CTS426+, CTS4274+, CTS4294+, CTS4368+, CTS4437+, CTS5269+, CTS5280+, CTS5285+, CTS5394+, CTS5628+, CTS5884+, CTS6932+, CTS712+, CTS7412+, CTS7598+, CTS7738+, CTS7997+, CTS8183+, CTS8340+, CTS8437+, CTS852+, CTS8938+, CTS9240+, F1209+, F1329+, F1704+, F1714+, F1744+, F1753+, F1767+, F2048+, F2142+, F2155+, F2402+, F2587+, F2688+, F2746+, F2817+, F2837+, F2839+, F2985+, F3111+, F3119+, F3136+, F3335+, F3368+, F3402+, F3556+, F3692+, F4188+, F4200+, F4287+, F719+, FGC8182+, FGC8184+, FGC8223+, L1090+, L132+, L134+, L136+, L15+, L16+, L255+, L321+, L350+, L403+, L468+, L470+, L498+, L60+, L748+, L765+, L778+, L858+, L862+, M168+, M213+, M235+, M267+, M294+, M299+, M304+, M42+, M497+, M89+, M94+, P123+, P124+, P125+, P126+, P127+, P129+, P130+, P133+, P134+, P135+, P136+, P138+, P139+, P14+, P140+, P141+, P143+, P145+, P146+, P148+, P149+, P151+, P157+, P158+, P159+, P160+, P161+, P163+, P166+, P187+, P209+, P316+, P58+, PAGES00026+, PAGES00081+, PF2591+, PF2608+, PF2611+, PF2615+, PF2643+, PF2745+, PF2747+, PF2748+, PF2749+, PF2770+, PF3562+, PF4513+, PF4521+, PF4572+, PF4591+, PF4595+, PF4598+, PF4622+, PF4653+, PF4654+, PF4656+, PF4659+, PF4661+, PF4662+, PF4663+, PF4664+, PF4666+, PF4668+, PF4669+, PF4670+, PF4672+, PF4676+, PF4685+, PF4695+, PF4738+, PF4758+, PF4759+, PF4761+, PF4762+, PF4764+, PF4768+, PF4769+, PF4774+, PF4780+, PF4788+, PF4798+, PF4799+, PF4800+, PF4812+, PF4830+, PF4832+, PF4833+, PF4835+, PF4838+, PF4843+, S2617+, V168+, V186+, V189+, V205+, V221+, V241+, V250+, V52+, V9+, Y4922+, YSC0000071+, YSC0000073+, YSC0000076+, YSC0000080+, YSC0000141+, YSC0000164+, YSC0000171+, YSC0000173+, YSC0000181+, YSC0000218+, YSC0000227+, YSC0000234+, YSC0000235+, Z1850+, Z1853+, Z1854+, Z1855+, Z1856+, Z1871+, Z1885+, Z1886+, Z1887+, Z1889+, Z1890+, Z2065+, Z2317+, Z2326+, ZS1559+

Нисходящие снипы BY93, ZS6829 не были протестированы, только отдельно заказывать.

Субклад ZS1559 на дереве Виктара Маса:



Субклад ZS1559 в таблице проекта J1:

[Александр 1977]

Готов Биг Торникова.
YSC0000076>FGC8223>BY65>ZS1559
Снипы BY93, ZS6829 не были протестированы.

Просьба прокоментировать результаты.

Значит, Торников всё-таки FGC8223, а не FGC15940, хотя на 67 локусах подавляющее большинство его приближенцев с общей разницей от 10 до 20 мутаций - с ветвей FGC15940.

Субклад ZS1559 возрастом где-то ~4000 лет (плюс-минус чего-то там).

В BY93 находятся европейцы. В ZS6829 - арабы. Торников может быть ZS1559*, то есть, представлять собой третью ветвь ZS1559, ещё не определённую. Возможно, что он разбивает узел BY93 или узел ZS6829.

Все точки над "ё" расставит BAM-файл, отправленный в YFull, правда, ветвь BY65>ZS1559 там ещё не исследована. Пока что там исследованы другие ветви FGC8223 (там этот снип называется также Y3441).

Если есть возможность, скиньте мне VCF Торникова, я посмотрю, можно ли из него что-то выловить помоложе ZS1559.

Только так, ВАМ-файл не доступен.

A5013+, BY18729+, BY3070+, BY65+, CTS10640+, CTS1068+, CTS10858+, CTS1138+, CTS11501+, CTS11571+, CTS11741+, CTS11765+, CTS11787+, CTS12047+, CTS1983+, CTS2453+, CTS2769+, CTS3068+, CTS3101+, CTS3210+, CTS3401+, CTS3492+, CTS3654+, CTS3936+, CTS4025+, CTS4133+, CTS426+, CTS4274+, CTS4294+, CTS4368+, CTS4437+, CTS5269+, CTS5280+, CTS5285+, CTS5394+, CTS5628+, CTS5884+, CTS6932+, CTS712+, CTS7412+, CTS7598+, CTS7738+, CTS7997+, CTS8183+, CTS8340+, CTS8437+, CTS852+, CTS8938+, CTS9240+, F1209+, F1329+, F1704+, F1714+, F1744+, F1753+, F1767+, F2048+, F2142+, F2155+, F2402+, F2587+, F2688+, F2746+, F2817+, F2837+, F2839+, F2985+, F3111+, F3119+, F3136+, F3335+, F3368+, F3402+, F3556+, F3692+, F4188+, F4200+, F4287+, F719+, FGC8182+, FGC8184+, FGC8223+, L1090+, L132+, L134+, L136+, L15+, L16+, L255+, L321+, L350+, L403+, L468+, L470+, L498+, L60+, L748+, L765+, L778+, L858+, L862+, M168+, M213+, M235+, M267+, M294+, M299+, M304+, M42+, M497+, M89+, M94+, P123+, P124+, P125+, P126+, P127+, P129+, P130+, P133+, P134+, P135+, P136+, P138+, P139+, P14+, P140+, P141+, P143+, P145+, P146+, P148+, P149+, P151+, P157+, P158+, P159+, P160+, P161+, P163+, P166+, P187+, P209+, P316+, P58+, PAGES00026+, PAGES00081+, PF2591+, PF2608+, PF2611+, PF2615+, PF2643+, PF2745+, PF2747+, PF2748+, PF2749+, PF2770+, PF3562+, PF4513+, PF4521+, PF4572+, PF4591+, PF4595+, PF4598+, PF4622+, PF4653+, PF4654+, PF4656+, PF4659+, PF4661+, PF4662+, PF4663+, PF4664+, PF4666+, PF4668+, PF4669+, PF4670+, PF4672+, PF4676+, PF4685+, PF4695+, PF4738+, PF4758+, PF4759+, PF4761+, PF4762+, PF4764+, PF4768+, PF4769+, PF4774+, PF4780+, PF4788+, PF4798+, PF4799+, PF4800+, PF4812+, PF4830+, PF4832+, PF4833+, PF4835+, PF4838+, PF4843+, S2617+, V168+, V186+, V189+, V205+, V221+, V241+, V250+, V52+, V9+, Y4922+, YSC0000071+, YSC0000073+, YSC0000076+, YSC0000080+, YSC0000141+, YSC0000164+, YSC0000171+, YSC0000173+, YSC0000181+, YSC0000218+, YSC0000227+, YSC0000234+, YSC0000235+, Z1850+, Z1853+, Z1854+, Z1855+, Z1856+, Z1871+, Z1885+, Z1886+, Z1887+, Z1889+, Z1890+, Z2065+, Z2317+, Z2326+, ZS1559+

Нисходящие снипы BY93, ZS6829 не были протестированы, только отдельно заказывать.

Субклад ZS1559 на дереве Виктара Маса:



Субклад ZS1559 в таблице проекта J1:

олько так, ВАМ-файл не доступен.

A5013+, BY18729+, BY3070+, BY65+, CTS10640+, CTS1068+, CTS10858+, CTS1138+, CTS11501+, CTS11571+, CTS11741+, CTS11765+, CTS11787+, CTS12047+, CTS1983+, CTS2453+, CTS2769+, CTS3068+, CTS3101+, CTS3210+, CTS3401+, CTS3492+, CTS3654+, CTS3936+, CTS4025+, CTS4133+, CTS426+, CTS4274+, CTS4294+, CTS4368+, CTS4437+, CTS5269+, CTS5280+, CTS5285+, CTS5394+, CTS5628+, CTS5884+, CTS6932+, CTS712+, CTS7412+, CTS7598+, CTS7738+, CTS7997+, CTS8183+, CTS8340+, CTS8437+, CTS852+, CTS8938+, CTS9240+, F1209+, F1329+, F1704+, F1714+, F1744+, F1753+, F1767+, F2048+, F2142+, F2155+, F2402+, F2587+, F2688+, F2746+, F2817+, F2837+, F2839+, F2985+, F3111+, F3119+, F3136+, F3335+, F3368+, F3402+, F3556+, F3692+, F4188+, F4200+, F4287+, F719+, FGC8182+, FGC8184+, FGC8223+, L1090+, L132+, L134+, L136+, L15+, L16+, L255+, L321+, L350+, L403+, L468+, L470+, L498+, L60+, L748+, L765+, L778+, L858+, L862+, M168+, M213+, M235+, M267+, M294+, M299+, M304+, M42+, M497+, M89+, M94+, P123+, P124+, P125+, P126+, P127+, P129+, P130+, P133+, P134+, P135+, P136+, P138+, P139+, P14+, P140+, P141+, P143+, P145+, P146+, P148+, P149+, P151+, P157+, P158+, P159+, P160+, P161+, P163+, P166+, P187+, P209+, P316+, P58+, PAGES00026+, PAGES00081+, PF2591+, PF2608+, PF2611+, PF2615+, PF2643+, PF2745+, PF2747+, PF2748+, PF2749+, PF2770+, PF3562+, PF4513+, PF4521+, PF4572+, PF4591+, PF4595+, PF4598+, PF4622+, PF4653+, PF4654+, PF4656+, PF4659+, PF4661+, PF4662+, PF4663+, PF4664+, PF4666+, PF4668+, PF4669+, PF4670+, PF4672+, PF4676+, PF4685+, PF4695+, PF4738+, PF4758+, PF4759+, PF4761+, PF4762+, PF4764+, PF4768+, PF4769+, PF4774+, PF4780+, PF4788+, PF4798+, PF4799+, PF4800+, PF4812+, PF4830+, PF4832+, PF4833+, PF4835+, PF4838+, PF4843+, S2617+, V168+, V186+, V189+, V205+, V221+, V241+, V250+, V52+, V9+, Y4922+, YSC0000071+, YSC0000073+, YSC0000076+, YSC0000080+, YSC0000141+, YSC0000164+, YSC0000171+, YSC0000173+, YSC0000181+, YSC0000218+, YSC0000227+, YSC0000234+, YSC0000235+, Z1850+, Z1853+, Z1854+, Z1855+, Z1856+, Z1871+, Z1885+, Z1886+, Z1887+, Z1889+, Z1890+, Z2065+, Z2317+, Z2326+, ZS1559+

Нисходящие снипы BY93, ZS6829 не были протестированы, только отдельно заказывать.

[Golubtsov]

У меня наконец-то появился первый совпаденец на 37 хромосомах, причем он из России, правда генетическая дистанция составляет 4. Надеюсь он зарегистрируется на сайте и отпишется, во всяком случае во время нашей переписки по электронной почте я ему советовал это сделать, а пока он это не сделал, то я хотел спросить, как мне высчитать время до БОП с ним?

Вот мои цифры (все 67):
PANEL 1 (1-12)
Value   12   23   14   11   13-18   11   16   11   13   11   29

PANEL 2 (13-25)
Value   18   8-9   11   11   25   14   20   27   12-14-16-18

PANEL 3 (26-37)
Value   11   10   22-22   15   12   18   17   31-36   12   10

PANEL 4 (38-47)
Value   11   8   15-16   8   11   10   8   11   9

PANEL 4 (48-60)
Value   13   21-22   19   10   12   12   17   8   13   28   21   15

PANEL 4 (61-67)
Value   12   11   13   12   12   12   11

А вот его 37:
12  23  14  11  13-18  11  16  11  14  11  31
18  8-9  11  11  25  14  20  27  12-14-16-18
11  10  22-22  15  12  19  17  31-35  12  10