Доступны 8433 древних образца, из которых 4471 образец являются новыми, но пока без конкретики.
Большинство образцов женские и позднее будут опубликованы в профильных работах, а пока можно посмотреть свои древние мито-матчи.
Всеобъемлющие исследования направленного отбора с помощью древней ДНК проливают свет на человеческую адаптациюАннотация Али Акбари , Элисон Р. Бартон , Стивен Газал , Чжэн Ли , Мохаммадреза Кариминежад , Аннабель Перри , Ятинг Цзэн ,,Алисса Миттник , Ник Паттерсон , Мэтью Мах , Сян Чжоу , Элкес Л. Прайс , Эрик С. Ландер , Рон Пинхаси , Надин Роланд , Свапан Маллик , Дэвид Райх
Мы представляем метод обнаружения доказательств естественного отбора в данных временных рядов древней ДНК, который использует возможность, не использованную в предыдущих сканированиях: тестирование на наличие последовательной тенденции в изменении частоты аллелей с течением времени. Применив это к 8433 жителям Западной Евразии, которые жили в течение последних 14000 лет, и 6510 современным людям, мы обнаруживаем на порядок больше значимых сигналов по всему геному, чем в предыдущих исследованиях: 347 независимых локусов с вероятностью отбора >99%. Предыдущие работы показали, что классические жесткие зачистки, приводящие к фиксации выгодных мутаций, были редки на протяжении широкого периода эволюции человека, но за последние десять тысячелетий сильный направленный отбор затронул многие сотни аллелей. Открытия включают увеличение с ~0% до ~20% за 4000 лет для основного фактора риска целиакии в HLA-DQB1; рост с ~0% до ~8% за 6000 лет для группы крови B; и флуктуирующий отбор на аллеле риска туберкулеза TYK2, который вырос с ~2% до ~9% с ~5500 до ~3000 лет назад, прежде чем упал до ~3%. Мы выявляем случаи скоординированного отбора на аллелях, влияющих на один и тот же признак, при этом полигенная оценка сегодня предсказывает снижение процента жира в организме примерно на стандартное отклонение за десять тысячелетий, что согласуется с гипотезой бережливого гена о том, что генетическая предрасположенность к накоплению энергии во время нехватки пищи стала невыгодной после земледелия. Мы также выявляем отбор для комбинаций аллелей, которые сегодня связаны с более светлым цветом кожи, более низким риском шизофрении и биполярного расстройства, более медленным ухудшением здоровья и повышенными показателями, связанными с когнитивными показателями (баллы по тестам на интеллект, доход домохозяйства и годы обучения). Эти признаки измеряются в современных индустриальных обществах, поэтому неясно, какие фенотипы были адаптивными в прошлом. Мы оцениваем коэффициенты отбора в 9,9 миллионов вариантов, что позволяет изучать, как дарвиновские силы сочетаются с аллельными эффектами и формируют генетическую архитектуру сложных признаков.
16.09.2024 обновление релиза обобщённой базы дднк Райха AADR v62.0_1240k_public.xlsx Ресурс древней ДНК Аллена (AADR): тщательно подобранный сборник древних геномов человекаV54.1.p1 (Dataverse 8.0) 6 марта 2023 г.
V54.1 (Dataverse 7.0) 16 ноября 2022 г.
V52.2 (Dataverse 6.0) 22 августа 2022 г.
V50.0.p1 (Dataverse 5.0) 1 августа 2022 г.
V50.0 (Dataverse 4.0) 10 окт. 2021 г.
V44.3 (Dataverse 3.0) 20 января 2021 г.
V42.4 (Dataverse 2.0) 25 марта 2020 г.
V37.2 (Dataverse 1.0) 22 февраля 2019 г.
Тема: Data on 7997 ancient individuals / 4801 unpublished ancient individuals (Прочитано 15975 раз)