An Ancient Harappan Genome Lacks Ancestry from Steppe Pastoralists or Iranian Farmers

[Аббат Бузони]

Спасибо за ответы

[G-Man]

Semargl, можете проверить древнейших R1a из долины Сват?

I12457   Loebanr_IA  1044-922 calBCE

I12450   Butkara_IA  824-792 calBCE

Они вроде Z95+, Z2121-, а вот ниже ничего "нащупать" не удалось.

[Semargl]

Semargl, можете проверить древнейших R1a из долины Сват?

I12457   Loebanr_IA  1044-922 calBCE

I12450   Butkara_IA  824-792 calBCE

Они вроде Z95+, Z2121-, а вот ниже ничего "нащупать" не удалось.

I12457   Loebanr_IA  1044-922 calBCE

Код: [Выделить]

R-Z94: Z95/F3568+
R-BY170828: BY207052- A15393- BY206349- BY156430- BY207885-
R-Y61616: FGC86665-
R-YP294: Z675/CTS11926-
R-Z676: Z655-
R-Z96: Z669/CTS9557/S444- Z654-
R-BY32033: BY32046/Y107300- BY32033/Y88217-
R-BY32496: BY32495- BY32497-
R-Y151416: Y151418/BY155072-
R-Y6: Y6/M787-
R-Y5: Y5/M699-
R-Y28659: Y28667-
R-Y883: Y890- Y905- Y914- Y916- Y919-
R-BY113766: Y23344- FGC44611- BY99278- BY120555-
R-BY123407: BY123407- BY168177-
R-M157.1: M157.1/M157.2/M157-
R-Y1: Y1-
R-Y924: Y27971- Z29138-
R-Y34260: Y34261-
R-Y2351: Y2351/FGC7398-
R-Y66189: Y66189-
R-Y45385: Y51790- Y168776- Y168775- FT20693-
R-Y34241: Y34246-
R-Y35112: Y36428-
R-YP6238: YP6250-
R-Y34214: Y34214- Y34225-
R-Y34215: Y34215-
R-YP5544: YP5546/FGC39547- YP5557- YP5558- Y28956- YP5556- Y28957- Y75065/FGC72668-
R-Y45946: Y51683/FGC73292-
R-Y133381: Y133381/FGC72660-
R-Y2414: Y2429- Y2441- Y2453- Y2454-
R-Z2124: Z2121/S3410-
R-Z2122: Z2122/S4576-
R-Y57: Y58/S20663- Y50-
R-YP639: YP634/ZS2886- YP630- YP643- YP645-
R-V164: V164-
R-Y52: Y55/ZP111- Y52- Y2167/FGC4547- Y60-
R-YP5644: ZS8666- YP5656- Y28679-
R-BY27616: BY27618-
R-F1345: Z2472/F1345/FGC99-
R-YP5484: YP5484/FGC111- YP5485/FGC113- YP5487/FGC115- YP5491/FGC123- YP5499- FGC110-
R-FGC107: FGC107-
R-Y37903: BY16213/V4262- Y37905- Y37913- FGC70864-
R-CTS6: Z2469/CTS6/S3403- Z2471-
R-Y37891: Y37891- Y38021-
R-Y37892: Y37893-
R-CTS10041: Y37899- Y37900-
R-Y2619: YP267/FGC10633-
R-YP1366: Y6720.2/Y6720/FGC23322/Z20978-
R-YP5480: YP5480-
R-BY24987: BY24988-
R-YP4487: YP4487-
R-YP1429: YP1429-
R-YP4807: YP4808-
R-M12280: M12291-
R-Y23079: Y61750- Y64019-
R-YP1123: YP1128-
R-S23592: S23592-
R-YP5844: M4367-
R-Y95687: BY74121- Y105635-
R-BY102185: Y170411/FT41626- BY119500- BY92576- BY65872- A20162- Y3984-
R-YP1359: Y12480- YP1359- Y12886-
R-YP1360: YP1360-
R-YP1352: YP1355- YP1358-
R-FGC56440: FGC56440-
R-YP1456: YP1456-
R-YP1542: Y29560- YP1549- YP1542- YP1560-
R-F21381: F21381-
R-Z2123: Z2123-
R-YP1532: YP1536-
R-FGC17209: FGC17218-
R-Y20746: Y20746/SUR86-
R-Y875: F998-
R-YP4907: YP4922-
R-Y67224: Y67224-
R-YP5716: YP5716-
R-BY30764: Y65989/BY30764-
R-Y136333: Y136357- Y136366- Y136348- Y136363-
R-YP4974: YP4976-
R-Y19762: Y19831- Y19828-
R-Y151833: SK729- Y151897/ACT4622-
R-YP523: YP526-
R-FGC51149: Y36355-
R-Y155229: BY101880-
R-Y5992: FGC10203- FGC10211- FGC10226-
R-Y5977: Y5978/FGC10207-
R-YP451: YP452/FGC22471- FGC22465-
R-YP450: Y4130/FGC22482-
R-Y137329: Y125613-
R-YP6291: Z16267- FGC59412- FGC59402- ZS7878/FGC34849-
I12450   Butkara_IA  824-792 calBCE

Код: [Выделить]

R-Z94: Z95/F3568+
R-BY170828: BY207885-
R-Y61616: FGC86665-
R-Y41: Y42-
R-Z676: Z655-
R-Z96: Z670- Z669/CTS9557/S444- Z654-
R-YP4866: Y152491- Y38296- YP4867/FGC30901-
R-Y3: Y26/M780x
R-Y2: Y27/M634/V1981-
R-F1417: BY32043/Y106817-
R-Y147630: Y148914- F2421- BY153444-
R-BY32033: BY32035/Y89141- BY32031/Y84653-
R-BY32496: BY32495- BY32497-
R-Y151416: Y151418/BY155072- Y151416/BY153823-
R-Y4: Y8/M648-
R-Y5: Y927-
R-Y28659: Y28655- Y28666- Y28667-
R-Y920: Y920/V3122-
R-Y883: Y905- Y911- Y914- Y916-
R-BY113766: BY99278- BY133069-
R-BY123407: BY123407- BY168177-
R-YP6192: Y33209- Y32864-
R-Y34178: Y34180-
R-Y924: Z29135- Z29138-
R-Y34260: Y34260-
R-Y66189: Y66189-
R-Y45385: Y51790- Y168776- Y57700- Y59567- FT20693-
R-Y51106: Y51106-
R-Y2568: Y2568/M12369/V1838-
R-Y34241: A195/Z16253- Y34246-
R-Y878: Y880-
R-Y35112: Y36428-
R-YP6238: Y32878- Y32877-
R-Y28652: Y28652-
R-Y34214: BY19269- Y34214- Y34225-
R-BY3873: BY3873- Y35107-
R-Y34215: Y34215-
R-YP5544: YP5546/FGC39547- YP5547- YP5549- YP5551- YP5558- YP5573- Y75065/FGC72668-
R-Y45946: Y51683/FGC73292-
R-Y133381: Y133381/FGC72660-
R-Y2414: Y2429- Y2434- Y2437- Y2441- Y2447- Y2453-
R-Y16494: Y16494-
R-Z2124: Z2121/S3410-
R-Z2122: Z2122/S4576-
R-Y57: Y50-
R-YP639: YP669-
R-Y52: Y55/ZP111- Y52- Y59-
R-BY32052: BY32052- BY32058-
R-YP5644: YP5650- YP5656-
R-Y2631: Y2631-
R-BY27616: BY27618-
R-F1345: Z2472/F1345/FGC99-
R-YP5484: YP5484/FGC111- YP5485/FGC113- YP5487/FGC115- YP5491/FGC123- YP5495/FGC131-
R-F1019: YP5938-
R-Y37903: BY16213/V4262- Y37905-
R-Y37891: Y37891- Y38016- Y38018-
R-Y37892: Y37893-
R-CTS10041: CTS7114-
R-Y2619: Y2743/FGC10618-
R-BY29826: BY29826/FGC74782+
R-YP1366: Y6720.2/Y6720/FGC23322/Z20978-
R-YP5480: YP5480-
R-BY24987: BY24988-
R-YP4487: YP4487-
R-YP1429: YP1429-
R-M12280: M12291-
R-Y23079: Y69721-
R-YP1127: YP1127-
R-S23592: S23592-
R-Y95687: Y104491- Y105635-
R-BY102185: BY92576- BY61819-
R-YP1359: YP1345- YP1359- Y12886-
R-YP1360: YP1360-
R-YP1352: YP1358-
R-YP5505: FGC56429-
R-FGC56440: FGC56440-
R-YP1455: YP1460/FGC31687-
R-YP1542: Y29561- Y27973- YP1546- YP1542- YP1561- YP1559- YP1560-
R-F21381: F21381-
R-Y147594: Y148921-
R-YP4926: YP4926-
R-Y615: Y603/BY17625- Y940-
R-Y875: PF4879- Y877-
R-YP4907: Y20653- YP4912- YP4922- YP4919-
R-YP5716: YP5717-
R-BY30764: Y65989/BY30764-
R-Y136333: Y136357- Y136366- Y136363- FT69355-
R-Y19762: Y19828- Y19765-
R-YP523: SK2032- SK2031-
R-YP520: YP520-
R-FGC51149: FGC4016/Y8852- Y36346- FGC51149- Y36348- Y141974-
R-YP6325: Y37346-
R-Y155229: BY101880-
R-Y5992: FGC10203- FGC10211- FGC10225/Y13525- FGC10226-
R-Y5977: Y5986/FGC10231-
R-YP450: Y4130/FGC22482-
R-Y137329: Y125613- BY63726-
R-YP6291: FGC59412- YP6300/FGC59417- YP6298/FGC59415- ZS7878/FGC34849-
Первый получается Z94 [Z95+ Z2121- Z2122- Z2123- Y40? Y3? Y26? Y2?]
Второй  Z94 [Z95+ Z2121- Z2122- Y40? Y3? Y2?] но вот снип Y26, одноуровневый с Y3 у него имеет 4 рида со значениями 3C и 1T. При внимательном рассмотрении мы видим что риды с "C"  имеют одинаковую стартовую и конечную позиции. Чаще это говорит о ридах-дублях. То есть можно говорить о равноценном варианте 1C или 1T. По опыту, снипы, не имеющие гомологии с X или другими хромосомами, чаще могут иметь ложное отрицательное значение, чем ложное положительное. Я бы склонился в этом случае что I12450 Y26+
Что на самом деле не удивительно, так как субклад R-Y3 как раз ожидаем для тех мест.

[Fire]

https://1.bp.blogspot.com/-gGCc7wOoeE0/XXFSMrotZuI/AAAAAAAAIMQ/JCU0ObJ25v0ZOwq15MC45eSChN8Pu6_-ACLcBGAs/s1600/Harappan_genome_graphical_abstract.jpg

Дравидийский микс похож на Харапский микс , Загрос + Андаманские О.
Дравидийцы самые ранне отделившиеся Ностраты

Отделение пра-Дравидийского примерно 15000 лет назад от других Ностратов, а здесь на графике отделение Загроской части Харапцев от других разновидных Загрозцев более чем 12000 лет назад.
И ветвь Загроского Охотника собирателя позже встречается у Монголоидного южного Алтайца ранней железы, и позже у современных Тюрков

[mikhail a.]

I4157 Bustan_BA Iran / Turan 1600-1300 BCE J2a

Любопытный оказался образец: ни разу не J2a, а J2b. Причем J2b, который делает сплит корневого для этой гаплогруппы узла J2-M102.
Наряду с порцией положительных значений SNP этого уровня, у I4157 также выявились: Z557-, Z8226-, Z8246-, Z8238- и Y7895/BY1954-. Ну и подкрепляется это всё Z2486/CTS2582- с нижерасположенного уровня
J2-Z534.
Напомню, что уровень J2-Z534 отпочковался от большого узла М102 совсем недавно, и причиной его появления на свет стал результат теста BigY нашего форумчанина Аrdian.
Тут обсуждение этого кейса. Сразу вспомнилось, что он был родом из Узбекистана, так же как и рассматриваемый бронзовик I4157.
А поскольку разделние уровней M102 и Z534 основывается только на одном образце, то точное распределение снипов между ними весьма затруднительно (каких-то снипов в резульатах ув. Аrdian точно не было или было не ясное прочтение).
Это я все к тому, что очень даже может быть, что I4157 и ув. Аrdian сформируют свою очень старую узбекскую поветку от самого корня J2b, а Аrdian получит подтверждение, что его прямая мужская линия понаехала в Узбекистан ну очень давно)
Дело осталось за малым: каким-то образом добраться до приватных снипов ув. Аrdian'а. и сравнить их с I4157.

[G-Man]

Интересный результат с Западного Казахстана (типировали на Антрогенике):

I11735; 2462-2299 BC; Mereke; Kazakhstan; N2-Y6503>pre-P189.2 (17 derived, 3 ancestral)

I11737; 2195-2032 BC; Mereke; Kazakhstan; N2-Y6503>pre-P189.2 (15 derived, 4 ancestral)

Mereke is а mound burial located in the Taskala district (Zapadno-Kazahstanskaya Oblast, Kazakshtan). Within Kurgan 1 there are 17 burials in all, most dating to the Bronze Age. The mound itself measures 1.75m high with a diameter of 34m. More intact burials in Kurgan 1 contained skeletons positioned on their left side in a flexed position, head to the north and facing eastward. A notable feature of the kurgan was a ritually interred horse head placed at the southeastern sector of the mound.
On the basis of the material inventory from burials 14 and 17, and details of the cemetery as a whole, the authors attribute Mereke 1 to the “Poltavka culture”. Given the practice of large mound burials, sometimes as large as 300 cubic meters and the material assessment of the traits and artifacts recovered, Mereke 1 was dated stylistically to the second half of the 3rd millennium BCE.

[Eugene]

Интересный результат с Западного Казахстана (типировали на Антрогенике):

I11735; 2462-2299 BC; Mereke; Kazakhstan; N2-Y6503>pre-P189.2 (17 derived, 3 ancestral)

I11737; 2195-2032 BC; Mereke; Kazakhstan; N2-Y6503>pre-P189.2 (15 derived, 4 ancestral)

Mereke is а mound burial located in the Taskala district (Zapadno-Kazahstanskaya Oblast, Kazakshtan). Within Kurgan 1 there are 17 burials in all, most dating to the Bronze Age. The mound itself measures 1.75m high with a diameter of 34m. More intact burials in Kurgan 1 contained skeletons positioned on their left side in a flexed position, head to the north and facing eastward. A notable feature of the kurgan was a ritually interred horse head placed at the southeastern sector of the mound.
On the basis of the material inventory from burials 14 and 17, and details of the cemetery as a whole, the authors attribute Mereke 1 to the “Poltavka culture”. Given the practice of large mound burials, sometimes as large as 300 cubic meters and the material assessment of the traits and artifacts recovered, Mereke 1 was dated stylistically to the second half of the 3rd millennium BCE.

Неожиданный результат. Получается примерно 2000-2500 лет до н.э.
Постямники.

[mikhail a.]

... у I4157 также выявились: Z557-, Z8226-, Z8246-, Z8238- и Y7895/BY1954-.

У Аrdian'а  Z557, Z8246, Y7895 не определены, а вот Z8238+. Но это может волне может быть и ошибка прочтения у I4157.

[Arame]

Ярослав

Я ожидал впервую очередь эту ветвь. Там где пакистанцы.
https://www.yfull.com/tree/J-Y29696/

----------
@all
Кстати этот афанасьевец довольно глубоко типирован. Получается Z2108+.

I3952   I3952   StPet51, collection 6612, individual 5   petrous   separate nuclear and mtDNA target enrichment   2866-2579 calBCE (4120±30 BP, PSUAMS-1957)   This study   Vyacheslav Moiseyev   4673   2866-2579 calBCE (4120±30 BP, PSUAMS-1957)   EMBA   Afanasievo   Afanasievo   Yes   Altai Mountains, Yenisey River, left bank of Karasuk tributary, Karasuk III   Russia   Forest / Steppe   48.832683   83.909744   M   U5a1a1   R1b1a1a2a2c1   manual   7.81   917159   0.004759   5.937994066   S3952.E1.L1,S3953.E1.L1   half,half   0.072,0.073   0.987,0.997   PASS (Xcontam=0.005)                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                

[zastrug]

Удивительно как быстро все меняется. Мощная статья с более, чем 500 новыми образцами дДНК, (большинство из которых, кстати, с территории бывшего Союза). Еще совсем недавно было бы уже десятки страниц обсуждения. А сейчас - никто особо и внимания не обратил)

Да а что особо говорить? Споры раньше были, пока непонятно, сейчас "чувство глубокого удовлетворения" что думалось в правильную сторону.

[Arame]

Все Е из Свата из этой ветки.
К этой ветке принадлежал сак из Алтая. Однозначно ветка БМАКовского происхождение впрочем как и практически все другие ближневосточные гаплотипы среди саков и скифов.

https://www.yfull.com/tree/E-Y31991/

I've merged the calls for all 7 E1b1b1b2 samples from Udegram_SPGT to get a better coverage, and they have 20 SNPs covered out of total 56 at Y31991 level, 6 of them being derived and 14 being ancestral. So I6900, I1799, I1985, I6194, I6197, I6899 and I3262 all belong to E1b1b1b2-M123>pre-Y31991

[Fire]

В Хараппе нет смешанного  Иранско-Анатолийского компонента Иранских земледельцев,
Но в эпоху железа в Индии/Пакистане есть и Анатолийская часть, и без Адмикса от Вост.Европейских охотников который есть у Степняков.

[FenriR]

Удивительно как быстро все меняется. Мощная статья с более, чем 500 новыми образцами дДНК, (большинство из которых, кстати, с территории бывшего Союза). Еще совсем недавно было бы уже десятки страниц обсуждения. А сейчас - никто особо и внимания не обратил)

Да а что особо говорить? Споры раньше были, пока непонятно, сейчас "чувство глубокого удовлетворения" что думалось в правильную сторону.

Справедливости ради,
PreSlav, под ником Archi, храбо сражается с супостатами (и гугл-переводчиком) в комментариях eurogenes
И он таки уже подорвал несколько "брахманов"=)

Молгеновский десант strong!))

[Farroukh]

Все Е из Свата из этой ветки.
К этой ветке принадлежал сак из Алтая. Однозначно ветка БМАКовского происхождение впрочем как и практически все другие ближневосточные гаплотипы среди саков и скифов.

https://www.yfull.com/tree/E-Y31991/

Результаты из захоронений Гонур-тепе (БМАК) и долины Сват, относящиеся к субкладу E-Y31991 можно рассматривать в рамках гипотезы Гамкрелизде - Иванова, с оговоркой, что мигранты из Западной Азии были носителями неиндоевропейского языка, чей субстрат сохранился в арийских языках

Что же до гаплогруппы E-Y31991, то она (пока) не выявлена у современных жителей юга Средней Азии и исторической Северной Индии и представлена лишь на Ближнем Востоке и средиземноморской Европе:



Скорее всего, древнее население E-Y31991 Южной Азии в итоге было полностью замещено арийскими кочевниками из степи.

[Farroukh]

Полученные данные о субкладе E-Y31991 позволяют по-новому трактовать гипотезы Ренфрю и Гамкрелидзе - Иванова, как неолитические миграции носителей алародийских языков (условно сближаемых с современным бурушаски) в Европу и Южную Азию.