Касательно идеи собрать ДНК Абрама Ганнибила, анализируя ДНК его потомков: в Исландии удалось сделать такое:
https://ep70.eventpilotadmin.com/web/page.php?page=IntHtml&project=ASHG15&id=150122397PgmNr 321: Computational reconstruction of a haploid genome from the 18th century.
Abstract:
Icelandic history contains an unusually tractable case study for the problem of ancestral genome reconstruction. The case is that of Hans Jonatan (HJ), born in 1784 on the Caribbean island St. Croix to an African enslaved mother and a supposed Danish father. Following a complex series of events, HJ eventually settled in Iceland in 1805 and married an Icelandic woman, with whom he had two children. In all, HJ has 636 contemporary descendants in the Icelandic population, of whom we have Illumina microarray SNP genotypes for 114. Using these data, we identified African fragments using two different methods. The first, “AdmixIBD”, was devised by us and is based on detection of identity-by-descent (IBD) sharing of long contiguous chromosome fragments with a set of reference samples from Europe and Africa. The second is a published method called Hapmix. The African fragments identified by both methods were highly consistent and were therefore combined and then further filtered based on correspondence between the parental origin of alleles in HJ descendants and the known genealogy linking them to HJ. In this way, we were able to identify and reconstruct 32% of HJ‘s maternal haploid African genome. We then attempted to determine the geographical origin of this reconstructed genome. The transatlantic slave trade resulted in mass uprootment of millions of Africans to the New World. Using reference samples from 48 different African populations, we were able to use multi-dimensional scaling analysis and a statistical test of IBD values to rule out East and Southern Africa as places of origin for HJ‘s mother. Within West Africa, we found statistical support for a closer relationship to populations from Nigeria and Benin than to other populations.
В истории Исландии есть необычайно лёгкий для обработки образец проблемы реконструкции предкового генома. А именно случай Ханса Йонатана(HJ), родившегося в 1784 году на карибском острове Сент-Круа, от матери-рабыни, африканки и вероятно отца-датчанина. После сложной серии событий, Ханс Йонатан в конце концов поселился в Исландии в 1805 году и женился на исландской женщине, от которой у него было двое детей. Всего у Ханса Йонатана 636 современных потомков в исландской популяции, из которых мы SNP-микрочипировали при помощи Illumina 114 человек. Используя эти данные, мы выявили африканские фрагменты с использованием двух различных методов. Первый, “AdmixIBD”, был разработан нами и основывается на обнаружение длинных совпадающих фрагментов хромосом, унаследованных от общего предка, с набором эталонных образцов из Европы и Африки. Второй - опубликованный ранее так называемый метод Hapmix. Африканский фрагменты выявленные обоими методами были тесно связаны между собой и поэтому были объединены и далее отфильтрованы на основании известноо генеалогической связи с Хансом Йонатаном. Таким образом, нам удалось выявить и реконструировать 32% из материнского африканского гаплоидного генома Ханса Йонатана. Затем мы попытались определить географическое происхождение этого реконструированного генома. Трансатлантическая работорговля привели к массовому перемещению миллионов африканцев в Новый Свет. С помощью эталонных образцов из 48 различных африканских популяций, мы были в состоянии использовать многомерный анализ и статистическую проверку IBD значений, чтобы исключить Восточную и Южную Африки в качестве места происхождения для матери Ханса Йонатана. В Западной Африке, мы обнаружили статистическую поддержку для близости к популяциям из Нигерии и Бенина, нежели к другим популяциям.