АвторТема: Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean  (Прочитано 548 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15387
  • Страна: az
  • Рейтинг +4693/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean

Древняя ДНК раскрывает историю смешений и эндогамии в доисторическом Эгейском регионе.

Неолит и бронзовый век были периодами значительных преобразований в генетической истории Европы, но для Эгейского моря — региона, лежащего в основе предыстории Европы, — биологические аспекты культурных переходов пока выяснены лишь в ограниченной степени. Мы проанализировали недавно сгенерированные полногеномные данные 102 древних людей с Крита, материковой Греции и островов Эгейского моря, начиная с неолита и заканчивая железным веком. Мы обнаружили, что ранние земледельцы с Крита имели ту же родословную, что и другие жители Эгейского моря эпохи неолита того же времени. Напротив, конец неолита и последующий ранний бронзовый век были отмечены «восточным» потоком генов, который на Крите имел преимущественно анатолийское происхождение. Подтверждая предыдущие выводы о дополнительных центрально-восточноевропейских предках на материковой части Греции к среднему бронзовому веку, мы дополнительно показываем, что такие генетические сигнатуры постепенно появлялись на Крите с семнадцатого по двенадцатый век до н.э., в период, когда влияние материка на остров усилился. Биологическая и культурная связь в пределах Эгейского моря также подтверждается обнаружением кровнородственной эндогамии, практикуемой на высоких частотах, беспрецедентной в глобальной записи древней ДНК. Наши результаты подчеркивают потенциал археогеномных подходов в Эгейском море для раскрытия взаимодействия генетических примесей, брачных и других культурных практик.

Остальное (и самое интересное!) добавьте сами :)

Оффлайн Fire

  • 100% child of stardust
  • Сообщений: 9624
  • Страна: gr
  • Рейтинг +891/-132
  • Y-dna G2a1a1a1a1a1b1 Z7947
Re: Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean
« Ответ #1 : 20 Январь 2023, 22:40:07 »
Друг с ФБ

Ind ID   Sex   Y-chr hg   mt hg   Group
AID001   F      U5a1d2b   Aidonia LBA
AID002   M   C1a2   R0a1a   Aidonia LBA - rel.of.AID001
AID007   M   J2a   N1b1a2   Aidonia LBA
AID008   M   J2a2~   N1b1a2   Aidonia LBA - rel.of.AID007
AID009   M   R1b1a1b      Aidonia LBA
AID010   F         Aidonia LBA
AID012   F      K1a2c   Aidonia LBA - rel.of.AID014-017 lc
AID014   F         Aidonia LBA - rel.of.AID012-017
AID017   F         Aidonia LBA
APO004   F         Aposelemis N
APO022   F      H5'36   Aposelemis LBA
APO023   M   J2a   K2b1   Aposelemis LBA
APO025   M   J2a   T2b   Aposelemis LBA
APO028   F         Aposelemis N
APO029   M   G/G2      Aposelemis N
APO037   M   G      Aposelemis N
APO038   F         Aposelemis N (lc_conam.)
APO043   F         Aposelemis N
APO044   M   G/G2      Aposelemis N
GLI002   M   R1b1a1b      GlykaNera LBA
GLI003   M   J2a1a   U3c   GlykaNera LBA
HGC001   M   J1a2a1a2~   H   Hg. Charalambos EMBA
HGC002   M   J1   T2+16189   Hg. Charalambos EMBA - rel.of.HGC026andI0074
HGC003   F      H   Hg. Charalambos EMBA
HGC005   M   J1   H4a1   Hg. Charalambos EMBA
HGC006   M   J2a1a1a2   H13a1a   Hg. Charalambos EMBA
HGC008   F      T2b25   Hg. Charalambos EMBA
HGC009   M   J2a1a1a2   H   Hg. Charalambos EMBA
HGC010   M   CT   U1a1a+16129   Hg. Charalambos EMBA
HGC011   F      HV+16311   Hg. Charalambos EMBA
HGC013   M   J1a2a1a2~   HV1a'b'c   Hg. Charalambos EMBA - rel.of.HGC024-036-063
HGC015   M   J   X2   Hg. Charalambos EMBA
HGC017   M   J2a1a1a2   H5   Hg. Charalambos EMBA
HGC018   M   J2a1a1a2   HV+16311   Hg. Charalambos EMBA
HGC020   F      T2c1d   Hg. Charalambos EMBA
HGC024   M   J2a1a   I5a   Hg. Charalambos EMBA
HGC025   M   G2a   H+195   Hg. Charalambos EMBA
HGC027   M   J2a1a1a2   K1a4   Hg. Charalambos EMBA
HGC031   M   J2a1a1a2      Hg. Charalambos EMBA
HGC032   M   J2a1a1a2   H   Hg. Charalambos EMBA
HGC033   F      H5   Hg. Charalambos EMBA - rel.of.HGC033
HGC036   M   J2a1a   HV+16311   Hg. Charalambos EMBA (contam.)
HGC037   M   J2a   H   Hg. Charalambos EMBA
HGC040   F      I1   Hg. Charalambos EMBA
HGC041   M   J2   H102   Hg. Charalambos EMBA
HGC045   F      H   Hg. Charalambos EMBA - rel.of.HGC015
HGC053   M   J/J2a   U7b   Hg. Charalambos EMBA
HGC055   M   IJK   HV+16311   Hg. Charalambos EMBA
HGC063   M   J1a2a1a2~   I5a   Hg. Charalambos EMBA - rel.of.HGC024-020-013
KRO008   F         Krousonas LBA
KRO009   F         Krousonas LBA
KUK001   F      H5a2   Koukounaries LBA
KUK002   M   J1/J1b   U1a1a   Koukounaries LBA
KUK005   F      J2b1b1   Koukounaries LBA
KUK006   F      H+16291   Koukounaries LBA
LAZ017   M   C1a2b   T2b8   Lazarides EBA
LAZ018   M   G2a   H   Lazarides LBA
LAZ019   F         Lazarides LBA
LAZ020   F      K2a2a   Lazarides LBA
LAZ021   F      T1a5   Lazarides LBA
MYG001   M   J2b2a1   K1a   Mygdalia LBA - related
MYG002   F      H26b   Mygdalia LBA - related
MYG003   F      U3c   Mygdalia LBA
MYG004   M   G2a2a1   U8b1a2b   Mygdalia LBA
MYG005   M   J2b2a1   U8b1a2b   Mygdalia LBA - related
MYG006   M   J2b2a1   T1a4   Mygdalia LBA - related
MYG008   M   J2b2a1   K1a   Mygdalia LBA - related
NST001   M   J1a2a1a~   U3a1   NeaStyra EBA
NST004   M   I2a2   W   NeaStyra EBA
NST005   M   G2a2b2b1a1a   H   NeaStyra EBA
NST010   M   L      NeaStyra EBA
NST012   M   J1      NeaStyra EBA
TIR001   M   J2a   H13a2a   Tiryns LBA
TIR002   F      V   Tiryns LBA
TIR008   M   R1b1a1b      Tiryns IA
TIR010   M   J2a1a1a2   W1h1   Tiryns LBA
XAN003   F      W1h1   Chania LBA
XAN007   M   CT      Chania LBA
XAN013   F      H7c   Chania LBA
XAN014   M   E1b1b1a1b   H4a1   Chania LBA
XAN015   F      H1bm   Chania LBA
XAN016   M   G2a2b2a   H1   Chania LBA (rel.of.XAN017)
XAN017   F      H1e   Chania LBA
XAN018   F      H1   Chania LBA
XAN021   F      H1az   Chania LBA
XAN022   F      W6   Chania LBA
XAN023   F      HV4a1+16291   Chania LBA
XAN024   M   J2a   X2   Chania LBA
XAN025   F      H1m   Chania LBA
XAN026   F         Chania LBA
XAN027   M   G2a   J2b1   Chania LBA
XAN028   F      HV1a'b'c   Chania LBA
XAN029   M   J2a/J2a1a~   H   Chania LBA
XAN030   M   R1b1a1b   J2b1   Chania LBA
XAN031   M   J2a1a1a2   K1a4b1   Chania LBA
XAN034   F      N1'5   Chania LBA
XAN035   M   CT   T2b   Chania LBA
XAN036   F      HV1   Chania LBA
XAN040   F      H41a   Chania LBA
XAN041   M   J2a1a1a2   K1a+195   Chania LBA
XAN042   F      N1a1b   Chania LBA
XAN051   M   G2      Chania LBA
XAN053   F      H4a1   Chania LBA

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15387
  • Страна: az
  • Рейтинг +4693/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean
« Ответ #2 : 21 Январь 2023, 05:42:30 »
Некоторые образцы уже на TheYtree:

XAN014- Chania LBA  E-BY6578, на древе указан как XAN016 (?)
GLI002- Glyka Nera LBA cal  BC 1416-1312 E-S9621
(в статье ошибочно указан как R1b, но bam однозначно указал на E-S9621)

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1320
  • Страна: ua
  • Рейтинг +768/-6
    • ΑΡΧΑΙΑ ΓΛΩΣΣΑ
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
  • мтДНК: K1c1e
Re: Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean
« Ответ #3 : 21 Январь 2023, 10:24:55 »
Некоторые образцы уже на TheYtree:

XAN014- Chania LBA  E-BY6578, на древе указан как XAN016 (?)
GLI002- Glyka Nera LBA cal  BC 1416-1312 E-S9621
(в статье ошибочно указан как R1b, но bam однозначно указал на E-S9621)

Проверил GLI002, у меня он всё же больше похож на R1b, чем на E-S9621 :)

https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SAMEA112227745
GLI002.YC_rmdup.bam

S9621****        G>A
chrY:6 931 109
Total count: 1
A : 1 (100%, 0+, 1- )
C : 0
G : 0
T : 0
N : 0

В статье он указан как R1b1a1b, то есть M269.

На уровне M269 положительные прочтения я нашёл тут:

CTS11422*       T>C
chrY:23 104 079
Total count: 2
A : 0
C : 2 (100%, 2+, 0- )
G : 0
T : 0
N : 0

На древе YFull уже есть XAN030:
https://www.yfull.com/tree/R-PF7562/
« Последнее редактирование: 21 Январь 2023, 16:29:37 от Arthwr »

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15387
  • Страна: az
  • Рейтинг +4693/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean
« Ответ #4 : 21 Январь 2023, 11:40:26 »
Цитировать
Проверил GLI002, у меня он всё же больше похож на R1b, чем на E-S9621 :)
Значит, TheYtree что-то не так делают :)

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1320
  • Страна: ua
  • Рейтинг +768/-6
    • ΑΡΧΑΙΑ ΓΛΩΣΣΑ
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
  • мтДНК: K1c1e
Re: Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean
« Ответ #5 : 21 Январь 2023, 16:57:13 »
Исправил своё предыдущее сообщение, там я взболтнул лишнего :-X

Нашёл ещё прочтения на уровне M269 у GLI002:

MF16510*    G>T
chrY:22 621 843
Total count: 2
A : 0
C : 0
G : 0
T : 2 (100%, 0+, 2- )
N : 0

Хотя на уровне M269 есть и единичные отрицательные прочтения.
 
Но это не PF7562, на этом уровне отрицательные прочтения:

BY1713****   A>G
chrY:21 110 969
Total count: 3
A : 3 (100%, 2+, 1- )
C : 0
G : 0
T : 0
N : 0

Y19696****   C>T
chrY:8 885 774
Total count: 2
A : 0
C : 2 (100%, 1+, 1- )
G : 0
T : 0
N : 0

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 17887
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4302/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean
« Ответ #6 : 21 Январь 2023, 17:07:53 »
Ну, вот и первые невосточноевропейские J1, начиная с ранней бронзы.

Прежние гипотезы о том, что современные европейские J1 неолитического происхождения пока что не получают подтверждения. Но, и ранее это уже было видно по дистанциям.

Оффлайн Arthwr

  • Сообщений: 1320
  • Страна: ua
  • Рейтинг +768/-6
    • ΑΡΧΑΙΑ ΓΛΩΣΣΑ
  • Y-ДНК: R1b-PF7563
  • мтДНК: K1c1e
Re: Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean
« Ответ #7 : 21 Январь 2023, 18:40:05 »
Повозился ещё с разбором GLI002 - да, сложный случай.

Есть как положительные, так и отрицательные единичные прочтения на уровне M269.

Вот ещё два случая за (двойные прочтения):

Y429*     C>T
chrY:22 530 830
Total count: 2
A : 0
C : 0
G : 0
T : 2 (100%, 0+, 2- )
N : 0

PF6412*    G>A
chrY:5 224 862
Total count: 2
A : 2 (100%, 0+, 2- )
C : 0
G : 0
T : 0
N : 0

А это три случая против:

YSC0000072****    T>C
chrY:7 766 712
Total count: 3
A : 0
C : 0
G : 0
T : 3 (100%, 2+, 1- )
N : 0

YSC0000238****    G>C
chrY:23 242 935
Total count: 2
A : 0
C : 0
G : 2 (100%, 0+, 2- )
T : 0
N : 0

CTS10834***     T>C
chrY:22 796 697
Total count: 2
A : 0
C : 0
G : 0
T : 2 (100%, 1+, 1- )
N : 0

Так что пусть спецы посмотрят по гаплогруппе E. Может, там более однозначно.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 15387
  • Страна: az
  • Рейтинг +4693/-16
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Ancient DNA reveals admixture history and endogamy in the prehistoric Aegean
« Ответ #8 : 25 Январь 2023, 13:11:14 »
 Вердикт от Yfull: GLI002 - однозначный E-M84.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.