YFULL.com - Интерпретация вашего полного сиквенса mtDNA

[Древ]

Согласно YFULL митоГГ V1a1 formed 1150 ybp, TMRCA 700 ybp
А на википедии пишут вот так:
V1a1 определили у образца из Сербии I15533 из Сербии (Serbia_ViminaciumPecine, 246-365 годы, Y-ДНК: R1a1a1b2a2b-Z2122)[11]
V1a1 определили у раннего аварского военного лидера (Early Avar military leader, 620—660 гг.)[12][13]

Вот ссылки:
https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(23)01135-2
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.01.19.476915v1
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1WD0u5XXwa-7jeinxLLYDPf5tYMcb8ke0R8sm7Le6IZc/edit?pli=1&gid=0#gid=0

Почему так?

[Yaroslav]

Согласно YFULL митоГГ V1a1 formed 1150 ybp, TMRCA 700 ybp
А на википедии пишут вот так:
V1a1 определили у образца из Сербии I15533 из Сербии (Serbia_ViminaciumPecine, 246-365 годы, Y-ДНК: R1a1a1b2a2b-Z2122)[11]
V1a1 определили у раннего аварского военного лидера (Early Avar military leader, 620—660 гг.)[12][13]

Вот ссылки:
https://www.cell.com/cell/abstract/S0092-8674(23)01135-2
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2022.01.19.476915v1
https://docs.google.com/spreadsheets/d/1WD0u5XXwa-7jeinxLLYDPf5tYMcb8ke0R8sm7Le6IZc/edit?pli=1&gid=0#gid=0

Почему так?

Как-то года 1,5 назад был у нас разговор на эту тему:

Вот есть у меня совпадение близкое с научным образцом.
Как узнать ФИО и другие сведения этого научного образца?

https://www.yfull.com/mtree/H11a2a2b/

Ничего себе! Возраст ближайшего общего предка в генеалогических пределах ~75-225 лет!

Это какие результаты нужно иметь, чтобы получить такой возраст в mt-ДНК!

Если подняться на уровень выше - H11a2a2, то возраст в пределах ~225-425 лет, т.е. исторического периода, получился у британца, поляков, русских, финнов, чешского немца и даже одного армянина!

Das is fantastisch!)))

Спасибо, что заметили Причина банальная - мито заливается в автоматическом режиме с сервера NCBI. В генбанке отсутствует информация древний это образец или нет. Даже один древний образец может экстремально "омолодить" всю ветку, если мы не знаем о том, что это aDNA. У нас стараются отслеживать такие случаи, но при потоке тысяч образцов за раз не всегда это удается.
В данном случае взял на вскидку армянский образец из Карабаха. Оказался aDNA из статьи Маргаряна:
Eight Millennia of Matrilineal Genetic Continuity in the South Caucasus
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982217306954
Передам. Должны будут отметить их как aDNA с указанием возраста. Возраст ветви должен будет пересчитаться.

[AleksG]

Передам. Должны будут отметить их как aDNA с указанием возраста. Возраст ветви должен будет пересчитаться.

Вот это явно больше не работает, выше в топике несколько примеров есть - и отмечены как аДНК и возраст есть, а все равно рисует результаты будто для современных

[Древ]

Вот это явно больше не работает, выше в топике несколько примеров есть - и отмечены как аДНК и возраст есть, а все равно рисует результаты будто для современных

Надеюсь, Семаргл прояснит вопрос. Просто, если это не более чем недосмотр, пусть обозначит коридор, как где и в какой форме про такие ситуации писать. Мы же поможем!

[Tora_sama]

Татьяне писал уже, но обратной связи не было, на всякий случай продублирую ещё и здесь.
1)Просьба добавить данные мито образцы дДНК из статьи "Early medieval genetic data from Ural region evaluated in the light of archaeological evidence of ancient Hungarians" на древо.
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB39054
2)И ещё дДНК мито из статьи The arrival of Siberian ancestry connecting the Eastern Baltic to Uralic speakers further east
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB31893
Интересует только мито, судя по файлам его без проблем можно будет добавить на мито древо)

[Semargl]

Татьяне писал уже, но обратной связи не было, на всякий случай продублирую ещё и здесь.
1)Просьба добавить данные мито образцы дДНК из статьи "Early medieval genetic data from Ural region evaluated in the light of archaeological evidence of ancient Hungarians" на древо.
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB39054
2)И ещё дДНК мито из статьи The arrival of Siberian ancestry connecting the Eastern Baltic to Uralic speakers further east
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/PRJEB31893
Интересует только мито, судя по файлам его без проблем можно будет добавить на мито древо)

В последнее время вы часто обращались в службу поддержки с запросами по древней ДНК. Мы не можем быстро всё обработать, особенно когда нужно проверять исходные данные и искать информацию по образцам в статьях.

В последнем запросе вы попросили добавить сразу 101 древний образец. Это потому, что среди них есть несколько интересных для вас.

Мы решаем вопросы по очереди и с учётом приоритетов. Древняя мтДНК не в приоритете. Так что подождите ответа.

Мы могли бы быстрее всё сделать, если бы вы выбрали несколько интересных образцов и прислали ссылки на них в табличном формате. И всю информацию из статьи: датировку, культуру, географию и всё такое. И чтобы ссылки были именно на статью, а не на что-то из интернета.

[Tora_sama]

Спасибо за ответ, вот то, что там не одна страница с образцами я и не заметил....Я то думал и там и там 10 образцов всего...
Интересуют следующие образцы:
Образцы из статьи Early medieval genetic data from Ural region evaluated in the light of archaeological evidence of ancient Hungarians, Россия Удмуртия, 6-8 века нашей эры.
Sukhoy1   Szuhoj Log86   1987/86   Late Nevolino Culture   Sukhoy Log   Cis-Ural, Russia   57.1319   51.52164   7-8th   652-765 cal AD, 1326±23, DeA16587   female                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 
Sukhoy5   Szuhoj Log111   111   Late Nevolino Culture   Sukhoy Log   Cis-Ural, Russia   57.1319   51.52164   7-8th   668-770calAD, 1286±24, DeA16586   female               
1) https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SAMEA7016582  Sukhoy1
2) https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SAMEA7016586  Sukhoy5
Обрезцы из статьи The arrival of Siberian ancestry connecting the Eastern Baltic to Uralic speakers further east,  Россия Ленинградская область, 1-3 века,
3) https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SAMEA5538281 VII16
4) https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SAMEA5538252 V16 (нужный образец называется V16, но в базе их 2 штуки, скорее всего именно этот с H1b2)
Выделил нужные образцы.