АвторТема: YFULL.com - Интерпретация вашего полного сиквенса mtDNA  (Прочитано 36887 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1322
  • Страна: ru
  • Рейтинг +93/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Подскажите, а известны ли имена доноров референсных игреков для: Hg38 и CP086569.2? Вроде бы для Hg38 донором является представитель R1b (но известно ли точное имя?). А на уровне глубже, чем R1b - кто был донором референсного игрека, с кем идёт сравнение?

ОКАЗЫВАЕТСЯ:

Ту ДНК, в которой сейчас прочитали центромеры, теломеры и пр., взяли даже не из человека, а из клеток хориоаденомы, или, как её неблагозвучно называют по-русски, пузырного заноса. Это странное клеточное образование, возникающее в результате слияния нормального сперматозоида с яйцеклеткой, у которой вообще нет хромосом. То есть при созревании яйцеклеток такое случается, что образуется яйцеклетка без своего генетического материала, и если она встретится со сперматозоидом, все хромосомы в ней будут отцовские. Зародыша здесь никак не получится, хориоаденому удаляют хирургически, но зато потом она может послужить науке в виде клеточной культуры. Для секвенирования (чтения) ДНК такие клетки очень кстати — именно потому, что в них есть только отцовские варианты хромосом. И когда исследователи будут читать последовательность фрагментов, им не придётся разбирать, относится ли прочитанный кусок, к примеру, к материнской 18-й хромосоме или к отцовской 18-й хромосоме.

То есть сейчас белые пятна человеческого генома закрыли с помощью ДНК, взятой из продукта неудавшейся беременности, а белые пятна в Y-хромосоме закрыли с помощью одного профессора из Гарварда, который любезно предоставил свой генетический материал для исследований. На самом деле, частично новые последовательности сверяли с данными, полученными при более продвинутом секвенировании человеческой ДНК в рамках других геномных проектов. Пока что таким образом удалось установить, в каких участках прежних белых пятен следует ожидать наиболее сильные индивидуальные вариации. Когда придёт время собирать новый референсный геном человека — что, по-видимому, дело ближайшего будущего, — именно на эти особо вариативные участки будут обращать особое внимание.

https://www.nkj.ru/news/43650/

P.S. ВЫХОДИТ, ЧТО В ЭТОЙ ХОРИОАДЕНОМЕ ОКАЗАЛСЯ ОТЦОВСКИЙ НАБОР ХРОМОСОМ С Х-ХРОМОСОМОЙ...

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1322
  • Страна: ru
  • Рейтинг +93/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Подскажите, а известны ли имена доноров референсных игреков для: Hg38 и CP086569.2? Вроде бы для Hg38 донором является представитель R1b (но известно ли точное имя?). А на уровне глубже, чем R1b - кто был донором референсного игрека, с кем идёт сравнение?

ОКАЗЫВАЕТСЯ:

Ту ДНК, в которой сейчас прочитали центромеры, теломеры и пр., взяли даже не из человека, а из клеток хориоаденомы, или, как её неблагозвучно называют по-русски, пузырного заноса. Это странное клеточное образование, возникающее в результате слияния нормального сперматозоида с яйцеклеткой, у которой вообще нет хромосом. То есть при созревании яйцеклеток такое случается, что образуется яйцеклетка без своего генетического материала, и если она встретится со сперматозоидом, все хромосомы в ней будут отцовские. Зародыша здесь никак не получится, хориоаденому удаляют хирургически, но зато потом она может послужить науке в виде клеточной культуры. Для секвенирования (чтения) ДНК такие клетки очень кстати — именно потому, что в них есть только отцовские варианты хромосом. И когда исследователи будут читать последовательность фрагментов, им не придётся разбирать, относится ли прочитанный кусок, к примеру, к материнской 18-й хромосоме или к отцовской 18-й хромосоме.

То есть сейчас белые пятна человеческого генома закрыли с помощью ДНК, взятой из продукта неудавшейся беременности, а белые пятна в Y-хромосоме закрыли с помощью одного профессора из Гарварда, который любезно предоставил свой генетический материал для исследований. На самом деле, частично новые последовательности сверяли с данными, полученными при более продвинутом секвенировании человеческой ДНК в рамках других геномных проектов. Пока что таким образом удалось установить, в каких участках прежних белых пятен следует ожидать наиболее сильные индивидуальные вариации. Когда придёт время собирать новый референсный геном человека — что, по-видимому, дело ближайшего будущего, — именно на эти особо вариативные участки будут обращать особое внимание.

https://www.nkj.ru/news/43650/

P.S. ВЫХОДИТ, ЧТО В ЭТОЙ ХОРИОАДЕНОМЕ ОКАЗАЛСЯ ОТЦОВСКИЙ НАБОР ХРОМОСОМ С Х-ХРОМОСОМОЙ... Какая-то генетическая матрёшка получилась: женщина как донор пузырного заноса, в котором оказались хромосомы её недооплодотворителя, у которого был гаплоидный набор для потенциальной девочки...

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1322
  • Страна: ru
  • Рейтинг +93/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Подскажите, как часто обновляется live версия YFull дерева? Интересует ветка: https://www.yfull.com/tree/G-Y36006/
Обновляется достаточно быстро, за исключением редких случаев, зависящих от стадии обновления публичного дерева с возрастами.
Что конкретно интересует в указанной ветке?
Можете сказать, когда планируется обновление древа в целом?
Через пару дней.
Вышла новая версия.

А вот данные по митоДНК перестали отображаться...

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5657
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3567/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Подскажите, как часто обновляется live версия YFull дерева? Интересует ветка: https://www.yfull.com/tree/G-Y36006/
Обновляется достаточно быстро, за исключением редких случаев, зависящих от стадии обновления публичного дерева с возрастами.
Что конкретно интересует в указанной ветке?
Можете сказать, когда планируется обновление древа в целом?
Через пару дней.
Вышла новая версия.

А вот данные по митоДНК перестали отображаться...
Уважаемый Нилогов, Вы удивляете умением писать оффтоп. Перенес последнее сообщение в профильную тему. В дальнейшем буду просто удалять. Что касается мито, то вопрос опять не по теме топика. И без уточнения деталей... Экстрасенсов к сожалению нет.

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 17565
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4195/-13
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Очередная просьба от пропившего глобус геногеографа 80-го уровня.)))

Можно у образца древней ДНК id:MG773623.1 из Италии, гаплогруппа V18*, указать провинцию Бари?

Здесь подробнее о данном образце.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1322
  • Страна: ru
  • Рейтинг +93/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Новые данные по митогаплогруппам денисовцев и неандертальцев добавили в древо, осталось дождаться добавления в YTree, хотя бы до уровня ISOGG
« Последнее редактирование: 13 Август 2022, 10:32:30 от Lesla »

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5657
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3567/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Очередная просьба от пропившего глобус геногеографа 80-го уровня.)))

Можно у образца древней ДНК id:MG773623.1 из Италии, гаплогруппа V18*, указать провинцию Бари?

Здесь подробнее о данном образце.
Готово.

Оффлайн Daniil

  • Сообщений: 30
  • Страна: ru
  • Рейтинг +17/-0
  • Yfull: YF097436 GEDmatch: NL2024446
  • Y-ДНК: T-FTB28475
  • мтДНК: X2e2a3b2
Доброе утро! Подскажите, пожалуйста, где можно посмотреть приватные мутации мтднк древних образцов? Интересует данный образец (VK327).
https://www.yfull.com/mtree/H6a1a5/

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5657
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3567/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Доброе утро! Подскажите, пожалуйста, где можно посмотреть приватные мутации мтднк древних образцов? Интересует данный образец (VK327).
https://www.yfull.com/mtree/H6a1a5/
Для клиентов YFull в гаплогруппных проектах.
Или в исходниках:
https://www.ebi.ac.uk/ena/browser/view/SAMEA6800073?show=reads

Если вопрос связан с aDNA радимича, то пишите в саппорт YFull.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1322
  • Страна: ru
  • Рейтинг +93/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Подскажите, будет ли добавлена хронология для новой ветви R-Y38374* с учётом нового образца id:YF110536? Или данная ветвь пока под вопросом?

Оффлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R1a-L365
  • Сообщений: 397
  • Страна: 00
  • Рейтинг +143/-0
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1
Не пойму отдает ли Nebula в Yfull mtDNA или там только игрек ? Если не отдает - то почему бы и нет, м ?

Оффлайн Oleg V.

  • YFull: YF088859
  • Сообщений: 75
  • Страна: ru
  • Рейтинг +230/-0
  • GEDmatch: T159830
  • Y-ДНК: R1a-YP682
  • мтДНК: U5b2a1b1a
Не пойму отдает ли Nebula в Yfull mtDNA или там только игрек ? Если не отдает - то почему бы и нет, м ?
Конечно отдаёт. Но для этого нужно нажать кнопку "Transfer" на сайте Небулы. Анализ Мито в YFull бесплатный для клиентов Небулы.
« Последнее редактирование: 22 Ноябрь 2022, 09:28:58 от Oleg V. »

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 33
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
  • Y-ДНК: I1a1b1 (Y132166)
  • мтДНК: T1a1 и H5b9 дети
Не пойму отдает ли Nebula в Yfull mtDNA или там только игрек ? Если не отдает - то почему бы и нет, м ?
последнее время они больше недели тупили, вырезая Y и мито - вкладка deep ancestry была неактивная.
yfull сказали весь bam они не передают им

Онлайн raia

  • Сообщений: 126
  • Страна: ru
  • Рейтинг +230/-3
  • Y-ДНК: e
  • мтДНК: Т2b4
Вновь появившиеся на митодреве образцы  JQ-числовые знаки.1 это клоны уже имеющихся участников или всё таки какие то новые научные образцы?

Оффлайн Valery

  • Сообщений: 7641
  • Страна: 00
  • Рейтинг +937/-6
  • Ultimate Matriarchy
поищите эти аксешны тут

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.