АвторТема: YFULL.com - Интерпретация вашего полного сиквенса mtDNA  (Прочитано 39779 раз)

Farroukh и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 1890
  • Страна: gb
  • Рейтинг +468/-4
У нас с совпаденкой редчайшая общая мутация C15334T - пока вижу мы обе в H2b3 со звездой, но наверно нас в отдельный выделят?

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5707
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3640/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
У нас с совпаденкой редчайшая общая мутация C15334T - пока вижу мы обе в H2b3 со звездой, но наверно нас в отдельный выделят?
Перенаправил ваш вопрос специалисту. Она посмотрит, и если необходимо - сделает.

Оффлайн Oxon

  • Сообщений: 1890
  • Страна: gb
  • Рейтинг +468/-4
Спасибо, совпаденку отправили в отдельный субклад H2b3b, а про меня, я YF090338, забыли - у меня тоже в фаста файле есть эта 15334T, и в yfull раньше она была в novelties, а сегодня пропала, и я так и осталась под звездой H2b3, хотя мы обе с одинаковой 15334T в фтдна.

Оффлайн zea78

  • SevskGen.ru
  • Сообщений: 1542
  • Страна: ru
  • Рейтинг +750/-3
  • будем искать
  • Y-ДНК: R1a-YP418*
  • мтДНК: U8a1a1b1*
Здравствуйте, уважаемые форумчане.
Может этот вопрос уже задавался и если не секрет - на каком ПО или библиотеках строится древо на подобие YFULL? Это собственная разработка команды или есть нечто подобное доступное по лицензии (или еще как то)? Хочу на свой сайт подобное сделать, но только не гаплогруппы и снипы, а люди, фамилии :)

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6239
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2483/-13
  • мтДНК: H1b
Здравствуйте, уважаемые форумчане.
Может этот вопрос уже задавался и если не секрет - на каком ПО или библиотеках строится древо на подобие YFULL? Это собственная разработка команды или есть нечто подобное доступное по лицензии (или еще как то)? Хочу на свой сайт подобное сделать, но только не гаплогруппы и снипы, а люди, фамилии :)
собственные разработки, насколько знаю. Отцы-основатели - программисты.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1361
  • Страна: ru
  • Рейтинг +94/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Интересно, а есть ли статистика по семейным ветвям на MTree, где протестированы близкие родственники по прямой женской линии с выделением отдельных ветвей и временем жизни предка на период документальной родословной?

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1361
  • Страна: ru
  • Рейтинг +94/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
А кому известны случаи атрибуции/идентификации конкретного человека и узлового или терминального снипа на уровне документальной родословной?

Оффлайн SemarglАвтор темы

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Сообщений: 5707
  • Страна: cn
  • Рейтинг +3640/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
25-26.06.2022
Сайт глючит ?
Раньше обработка результатов занимала максимум минут 15, сейчас висит в ожидании уже несколько часов.
Файлы Y быстро обрабатываются (около получаса)
Есть ли сейчас ошибка? Если есть, то напишите мне в личку подробности.

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1361
  • Страна: ru
  • Рейтинг +94/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Встретил помимо однонуклеотидных полиморфизмов информацию о а что такое несколько-нуклеотидных снипах? А есть примеры последних?

Оффлайн Yurgan

  • Кто везёт, тому везёт
  • ...
  • Сообщений: 8269
  • Страна: gt
  • Рейтинг +832/-7
  • Потомок кузнеца Ильмаринена
    • Сибирский родословец
Я предлагаю заменить определение - язык, которое высвечивается на древе,  на другой термин -  этнос предка.

У многих стала возникать путаница.
Потомки поляков, чулымцев или башкир указывают для своего профиля русский язык, а потомки русских - английский

А это дает повод для неверной интерпретации

« Последнее редактирование: 29 Июнь 2022, 11:42:03 от Yurgan »

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1361
  • Страна: ru
  • Рейтинг +94/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
« Последнее редактирование: 30 Июнь 2022, 06:48:06 от nilogov »

Оффлайн ochkas

  • Сообщений: 518
  • Страна: ru
  • Рейтинг +214/-0
  • FTDNA: 634321
    • Ochkas DNA
  • Y-ДНК: R1a-L1029-Y128293 (UKR)
  • мтДНК: U3a3a1a1 (BLR)
Подскажите.
В ветке H54a:
https://www.yfull.com/mtree/H54a/
пользователь id:<T85MSN> это не научный образец?

Я привык, что написать можно только тем у кого Id:YF... , а тут какой-то странный номер, похож на научный образец, но при этом горит символ конверта - то есть человеку можно написать. Ошибка?

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1361
  • Страна: ru
  • Рейтинг +94/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Подскажите, а известны ли имена доноров референсных игреков для: Hg38 и CP086569.2? Вроде бы для Hg38 донором является представитель R1b (но известно ли точное имя?). А на уровне глубже, чем R1b - кто был донором референсного игрека, с кем идёт сравнение?

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1361
  • Страна: ru
  • Рейтинг +94/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Подскажите, а известны ли имена доноров референсных игреков для: Hg38 и CP086569.2? Вроде бы для Hg38 донором является представитель R1b (но известно ли точное имя?). А на уровне глубже, чем R1b - кто был донором референсного игрека, с кем идёт сравнение?

ОКАЗЫВАЕТСЯ:

Ту ДНК, в которой сейчас прочитали центромеры, теломеры и пр., взяли даже не из человека, а из клеток хориоаденомы, или, как её неблагозвучно называют по-русски, пузырного заноса. Это странное клеточное образование, возникающее в результате слияния нормального сперматозоида с яйцеклеткой, у которой вообще нет хромосом. То есть при созревании яйцеклеток такое случается, что образуется яйцеклетка без своего генетического материала, и если она встретится со сперматозоидом, все хромосомы в ней будут отцовские. Зародыша здесь никак не получится, хориоаденому удаляют хирургически, но зато потом она может послужить науке в виде клеточной культуры. Для секвенирования (чтения) ДНК такие клетки очень кстати — именно потому, что в них есть только отцовские варианты хромосом. И когда исследователи будут читать последовательность фрагментов, им не придётся разбирать, относится ли прочитанный кусок, к примеру, к материнской 18-й хромосоме или к отцовской 18-й хромосоме.

То есть сейчас белые пятна человеческого генома закрыли с помощью ДНК, взятой из продукта неудавшейся беременности, а белые пятна в Y-хромосоме закрыли с помощью одного профессора из Гарварда, который любезно предоставил свой генетический материал для исследований. На самом деле, частично новые последовательности сверяли с данными, полученными при более продвинутом секвенировании человеческой ДНК в рамках других геномных проектов. Пока что таким образом удалось установить, в каких участках прежних белых пятен следует ожидать наиболее сильные индивидуальные вариации. Когда придёт время собирать новый референсный геном человека — что, по-видимому, дело ближайшего будущего, — именно на эти особо вариативные участки будут обращать особое внимание.

https://www.nkj.ru/news/43650/

P.S. ВЫХОДИТ, ЧТО В ЭТОЙ ХОРИОАДЕНОМЕ ОКАЗАЛСЯ ОТЦОВСКИЙ НАБОР ХРОМОСОМ С Х-ХРОМОСОМОЙ...

Оффлайн nilogov

  • Сообщений: 1361
  • Страна: ru
  • Рейтинг +94/-3
  • философ антиязыка
  • Y-ДНК: R-BY55151
  • мтДНК: T2b-T152C!
Подскажите, а известны ли имена доноров референсных игреков для: Hg38 и CP086569.2? Вроде бы для Hg38 донором является представитель R1b (но известно ли точное имя?). А на уровне глубже, чем R1b - кто был донором референсного игрека, с кем идёт сравнение?

ОКАЗЫВАЕТСЯ:

Ту ДНК, в которой сейчас прочитали центромеры, теломеры и пр., взяли даже не из человека, а из клеток хориоаденомы, или, как её неблагозвучно называют по-русски, пузырного заноса. Это странное клеточное образование, возникающее в результате слияния нормального сперматозоида с яйцеклеткой, у которой вообще нет хромосом. То есть при созревании яйцеклеток такое случается, что образуется яйцеклетка без своего генетического материала, и если она встретится со сперматозоидом, все хромосомы в ней будут отцовские. Зародыша здесь никак не получится, хориоаденому удаляют хирургически, но зато потом она может послужить науке в виде клеточной культуры. Для секвенирования (чтения) ДНК такие клетки очень кстати — именно потому, что в них есть только отцовские варианты хромосом. И когда исследователи будут читать последовательность фрагментов, им не придётся разбирать, относится ли прочитанный кусок, к примеру, к материнской 18-й хромосоме или к отцовской 18-й хромосоме.

То есть сейчас белые пятна человеческого генома закрыли с помощью ДНК, взятой из продукта неудавшейся беременности, а белые пятна в Y-хромосоме закрыли с помощью одного профессора из Гарварда, который любезно предоставил свой генетический материал для исследований. На самом деле, частично новые последовательности сверяли с данными, полученными при более продвинутом секвенировании человеческой ДНК в рамках других геномных проектов. Пока что таким образом удалось установить, в каких участках прежних белых пятен следует ожидать наиболее сильные индивидуальные вариации. Когда придёт время собирать новый референсный геном человека — что, по-видимому, дело ближайшего будущего, — именно на эти особо вариативные участки будут обращать особое внимание.

https://www.nkj.ru/news/43650/

P.S. ВЫХОДИТ, ЧТО В ЭТОЙ ХОРИОАДЕНОМЕ ОКАЗАЛСЯ ОТЦОВСКИЙ НАБОР ХРОМОСОМ С Х-ХРОМОСОМОЙ... Какая-то генетическая матрёшка получилась: женщина как донор пузырного заноса, в котором оказались хромосомы её недооплодотворителя, у которого был гаплоидный набор для потенциальной девочки...

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.