Ещё один предположительный E1b1b1a2 или E1b1b1*-C

[Centurion]

Да чо вы спорите. Просто GATA H4 - 1. вот вам и фтдна, или наоборот, формат фтдна не правильный, т.е. к нему на +1 делать чтобы был НОРМАЛЬНЫЙ формат 17 локусов.

[Nozdrin]

Да мы не спорим. С переводом из формата в формат, я думаю, уже всё ясно.
А вот почему существует различие? Используются различные праймеры, или различие в "математике", или ещё что? Почему "Балановские", Гентис (вернее, когда используется формат Y-filer) нам выдают GATA_H4 = 12, а FTDNA - 11? Из-за чего приходится конвертировать форматы?
Какими "линейками" GATA_H4 меряют и какими "гирями" взвешивают?
Или у GATA_H4 есть какой-то "хвостик", который одни видят, а другие нет?
Или я ни фига не понял про аллели?

GATA H4

Repeat Motif:   [TAGA]n
Variable Region:   [TAGA]n

GATA_H4 = 12 - это 12 раз TAGA
GATA_H4 = 11 - это 11 (раз TAGA)
 

[Овод]

Да, такой "хвостик" есть. И он действительно зависит от пары праймеров, которые должны "сесть" до и после региона повтора, но не обязательно - вплотную к нему.
 
Положение пика на гель-электрофорезе таким образом не строго кратно количеству повторов, а включает некоторый сдвиг, зависящий также от суммарной массы обоих праймеров и величины двух "хвостиков". Величина этих "хвостиков неизвестна", к тому же и сам "мотив" может включать кроме полных, также и неполные повторы.
 
Поэтому многие исследователи описывают иногда аллели как "дробные", скажем 11.2, что означает одиннадцать полных повторов с двумя неполными. Однако при такой записи реально нельзя судить о числе мутаций (которое должно быть целым). Поэтому фирмы округляют. Одни в плюс, другие - в минус. Отсюда и разночтения.
 
Никто не знает "правильной" величины.

[Centurion]

Нет, Овод, это вы объяснили о дробных аллелях, а тут вопрос о конкретном H4, а там другая причина.

[Sergey Lutak]

Фарра, можешь передать своему знакомому - уважаемому А...ву, что он - E1b1b1*-Cluster C (Jewish Cluster) (см. сайт Гаплотип).

Дима, поздравляю! В твоём кластере  прибыло!

[Farroukh]

Получается, что это еврейский кластер? И как же быть?

P. S. Идём в синагогу?

[Alesh]

С прибытием новых людей, кластер вполне может измениться из еврейского в не еврейский.
 


Так мы и до Алёши Поповича дойдём, эх жалко АК с Шварёвым, придётся им менять арийскую гапплогруппу
 

[Farroukh]

Как принято говорить в нашей гапле:

Добро пожаловать в Адъ тёплую компанию гаплогруппы E1b1b1! 

[dima75]

Добро пожаловать!
А он не тестировал маркеры DYS426, DYS388?

[Farroukh]

Вроде в 17-маркерных гаплотипах это не предусмотрено.

[Farroukh]

Серж, тебе вопрос как к зубру. По какому принципу проводится кластеризация?
Если я правильно понимаю, участники кластера – это потомки одного обособившегося предка и давшего свою ветвь, отчего его потомки имеют свои характерные значения аллелей.

Поясню на этом примере. У Алексея из 17 маркеров 15 совпадают с человеком из субклада E1b1b1a2. Но гаплозона почему-то причислила его к E1b1b1*-C. И то через какое-то определённое время.

В чём причина? Почему он не E1b1b1a2 или E1b1b1c1, а именно E1b1b1*-C?

[Centurion]

Фарух, закажите Ал. SNP-тест в Гентисе. Можно будет его поставить на V13 и M123, и M35.

Если он будет полож. на M35, но отриц. на V13, значит это E1b1b1*(xE1b1b1a2)

[Sergey Lutak]

Брат Фарра, я не совсем понимаю, в чём твои сомнения.

У А...ва есть два полных совпаденца - оба они E1b1b1*-Cluster C.
На дистанции в одну мутацию - 6 человек: 5 - E1b1b1*-Cluster C и 1 - E1b1b1a2.

Сам видишь, что вероятность E1b1b1*-Cluster C несравнимо выше, чем E1b1b1a2.

Если конечно говорить о вероятности 99,99..., то могу лишь посоветовать последовать совету уважаемого Центуриона.

[Farroukh]

У А...ва есть два полных совпаденца - оба они E1b1b1*-Cluster C.

Ааа, теперь ясно. Я-то думал что совпаденец только тот человек с E1b1b1a2.