АвторТема: Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)  (Прочитано 702044 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн пенелопа

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6550
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2777/-13
  • мтДНК: H1b
Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #3225 : 04 Июль 2024, 07:55:48 »
30 древних людей из Малой Азии. https://nplus1.ru/news/2024/07/01/neolithic-expansion-in-the-aegean
Препринт https://doi.org/10.1101/2024.06.23.599747

Оффлайн Kambic

  • Сообщений: 1506
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1575/-34
  • Y-ДНК: r1b
  • мтДНК: H
Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #3226 : 04 Июль 2024, 20:20:18 »
30 древних людей из Малой Азии. https://nplus1.ru/news/2024/07/01/neolithic-expansion-in-the-aegean
Препринт https://doi.org/10.1101/2024.06.23.599747

Получается по своим генетическим профилям донеолитические популяции в западной Анатолии(Гирмелер, Пинарбаши и Актопраклик) были обычными левантийцами охотниками? А что там у них по физике однородительским линиям было?

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1202
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1803/-11
  • Y-ДНК: G2a1
История жизни и происхождение младенца позднего верхнего палеолита из Гротта делле Мура (южная Италия, 17 тыс. лет назад)
Университет Флоренции 2024-06-26 Аннотация
В конце последнего ледникового максимума (ПЛМ) общее улучшение климата определило период великой трансформации с новой экспансией человека и изменениями в материальной культуре по всей Европе. Несмотря на недавние работы по социальной и популяционной динамике, роль южных рефугиумов и биологические аспекты, связанные с ранней историей жизни людей позднего верхнего палеолита, все еще недостаточно изучены. В этом исследовании представлено междисциплинарное исследование с высоким временным разрешением младенца верхнего палеолита из Гротта делле Мура (Апулия, Италия), объединяющее палеогеномику, дентальную палеогистологию, пространственно-разрешенный геохимический анализ и прямое радиоуглеродное датирование AMS. Останки скелета младенца — Le Mura 1 — были напрямую датированы 17 079–16 990 кал. BP. Результаты отображают биологическую историю развития, ранней жизни, здоровья и смерти младенца. Они раскрывают модели мобильности во время беременности, идентифицируют несколько фенотипических признаков и потенциальное врожденное заболевание, а также указывают на высокий уровень эндогамии. Кроме того, они отмечают раннее распространение компонентов, подобных Виллабруне, вдоль итальянского полуострова, подтверждая смену населения около времени LGM, и подчеркивают общее снижение генетической изменчивости от северной до южной Италии. В целом, Le Mura 1 способствует нашему лучшему пониманию ранних стадий жизни и генетической загадки на итальянском полуострове в конце LGM.
Согласно  BAM- файлу был  I2a1a1 I-CTS595*(xCTS2879,S19554) и должен встать в изголовье ветви. Качество образца вроде позволяет загрузить его на дерево YFull YTree, у него была примерно половина положительных SNP I2a1a1a , а другая половина - отрицательных.

Согласно анализу FTDNA Y-DNA Time Tree образец младенца Grotta delle Mura1 размещён даже под I-M26
Материнская ДНК-митолиния https://www.yfull.com/mtree/U2'3'4'7'8'9*/  как у образцов охотников из сибирской стоянки Яна
 Result ( 77.8% 46 -2 +8):  U2'3'4'7'8'9a  Extra: C150T T310C T5999C C6498A A14152G G15466A G16274A T16297C
Top Hit U2'3'4'7'8'9 (87%) Expected Mutations  73G 263G 750G 1438G 1811G 2706G 4769G 7028T 8860G 11467G 11719A 12308G 12372A 14766T 15326G
« Последнее редактирование: 09 Июль 2024, 23:31:41 от kardes »

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1202
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1803/-11
  • Y-ДНК: G2a1
Re: дДНК зерновой мумии из Египта
« Ответ #3228 : 09 Июль 2024, 01:34:10 »
Метагеномный взгляд на зерновую мумию  Posted July 04, 2024. ABSTRACT
Многочисленные исследования показали, что метагеномика открыла новое возможности в прочтении содержимого археологических останков - капсул времени. Зерновые мумии — ритуальные предметы, изготовленные в Древнем Египте путем формирования фигур в форме человека из зерен злаков, выращенных в смеси воды и земли. Мы провели метагеномный анализ образцов из такой мумии, датируемой второй половиной III века до н. э. Наряду с рядом явно современных загрязняющих веществ мы идентифицировали организмы, которые нельзя исключить как имеющие историческое происхождение. Помимо значительного количества бактериальных последовательностей, принадлежащих родам Bacillus, Coprococcus, Metabacillus, Niallia и Roseburia , мы также обнаружили следы растений, животных и людей. Последовательности, отнесенные к роду Triticum , показали наибольшее сходство с древними образцами T. turgidum ssp. dicoccum из Египта и южного Леванта. Последовательности, отнесенные к роду Populus, показали наибольшую идентичность с геномом P. nigra . Фрагменты, которые были идентифицированы как чешуекрылые по происхождению, показали наибольшее сходство с геномами Sphingidae. Гаплотипический анализ последовательностей Hомо. sapiens предполагает гаплогруппы L3 и E, основанные на митогеноме и Y-хромосоме соответственно, которые являются двумя распространенными линиями в Африке сегодня.


История населения и примесь народа фулани из Сахеля Опубликовано 28 июня 2024 г.
Народ фулани, одна из важнейших групп скотоводов в Африке к югу от Сахары, по-прежнему в значительной степени недостаточно представлен в исследованиях популяционной геномики. Они говорят на языке нигеро-конголезского происхождения, называемом фульфульде или пулаар, и живут в разбросанных местах по всему поясу Сахеля/Саванны, от Атлантического океана до озера Чад. Согласно историческим записям, их предки распространились от Фута-Торо в долине Среднего Сенегала до Фута-Джаллон в Гвинее, а затем на восток в пояс Сахеля за последние 1500 лет. Однако более ранняя история этой традиционно скотоводческой популяции изучена недостаточно хорошо. Чтобы раскрыть генетическую структуру и происхождение этой широко распространенной популяции, мы собрали данные о генотипах по всему геному 460 человек из 18 местных популяций фулани, а также сравнительные данные как по современным, так и по древним популяциям мира. Это представляет собой наиболее географически масштабное исследование генома фулани на сегодняшний день. Мы выявили генетический компонент, тесно связанный со всеми местными популяциями фулани, что предполагает общий предковый компонент, возможно, связанный с началом африканского скотоводства в Зеленой Сахаре. Сравнение с результатами древней ДНК также выявило наличие древнего иберомаврского компонента, связанного со всеми группами фулани, что дает новое понимание их глубокой генетической истории. Кроме того, наши генетические данные указывают на более позднюю экспансию фулани из западного в восточный Сахель, характеризующуюся клинальным паттерном и смешением с несколькими другими африканскими популяциями к северу от экватора.

Оффлайн MCB

  • Сообщений: 74
  • Страна: 00
  • Рейтинг +53/-1
Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #3229 : 09 Июль 2024, 21:33:36 »
Решена проблема с датировкой древних и архаичных Y-хромосом (раньше казалось, что "молекулярные часы" мутагенеза работают в таких игрек-хромосомах медленнее - даже в 1.66 раза медленнее на уровне неандертальских геномов, но новая статья показывает, что "ускорение" мутагенеза в современных Y-хромосомах - это просто иллюзия из-за того, что часть древних и архаичных последовательностей настолько от них отличаются, что вообще не распознаются как Y при использовании стандартной референтной последовательности). Скорее всего, этот препринт из Макс-Планка уже где-то обсуждается на форуме, но я не видел ... а из-за прямого отношения к древним ДНК, считаю не лишним упомянуть его тут.
https://www.biorxiv.org/content/10.1101/2024.07.05.602100v1

Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1202
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1803/-11
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #3230 : 14 Июль 2024, 02:00:08 »
Палеогенетики прочитали древнейший высококачественный геном человека. 11 июля 2024 г. 16:15 Автор: Энн ГИББОНС
Самый древний человеческий геном был секвенирован — и это ДНК денисовца возрастом 200 000 лет из сибирской. Хорошо сохранившуюся ДНК удалось выделить из зуба денисовца, который жил на Алтае примерно 200 тысяч лет назад. Если вести речь только о неандертальцах и денисовцах, то на сегодняшний день опубликованы всего лишь четыре подобных генома, причем все они женские. Эти последовательности ученые определили, когда исследовали неандертальские останки возрастом около 120 тысяч лет из Денисовой пещеры (Denisova-5), около 55 тысяч лет из Чагырской пещеры (Chagyrskaya-B), около 50 тысяч лет из хорватской пещеры Виндия (Vindija-33.19). Единственный качественный денисовский геном исследователи получили больше десяти лет назад, когда проанализировали образец Denisova-3 возрастом примерно 64 тысячи лет. Кроме того, еще как минимум два неандертальских генома, древнейшему из которых около 110 тысяч лет, пока не опубликованы (один, два).Древнюю ДНК хорошей сохранности ученые смогли выделить из зуба Denisova-25, обнаруженного во время раскопок в Денисовой пещере, в которой многие годы ведут работы исследователи из Института археологии и этнографии СО РАН. По данным археологов, возраст этой находки составляет около 200 тысяч лет. Тем самым полученная последовательность представляет собой древнейший человеческий геном, прочитанный с высокой точностью.Согласно анализу Пейреня и коллег, недавно секвенированный самец происходит из особой популяции ранних денисовцев, которые многократно скрещивались с группой неандертальцев, чья популяция ранее не была обнаружена в ДНК.


Оффлайн kardes

  • Сообщений: 1202
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1803/-11
  • Y-ДНК: G2a1
Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #3231 : 15 Июль 2024, 01:28:22 »
Генетическое родство  популяций хмонг-мьен из пещерных захоронений в Гуаньсу, выявленное из древних геномов.

Аннотация-Пещерные захоронения были распространены в Южном Китае на протяжении тысяч лет. История популяции и генетический вклад групп пещерных захоронений в формирование современных южных меньшинств в значительной степени неизвестны из-за отсутствия древних геномных данных. Здесь мы представляем геномные данные 4 древних людей из пещерных захоронений от поздней династии Юань до династий Мин в Гуаньсу. Мы наблюдали близкое генетическое родство между четырьмя людьми пещерных захоронений. Однако наши образцы получили потоки генов от северо-восточных азиатов по сравнению с группами пещерных захоронений около 1600-1400 лет назад. Мы выявили сильную генетическую связь между этими древними группами пещерных захоронений и современными популяциями, говорящими на языке хмонг-мьен, в частности, географически соседней популяцией байку- яо, что указывает на стабильность популяции в горном регионе Южного Китая за последние несколько столетий.

Оффлайн rozenblatt

  • Сообщений: 1608
  • Страна: kg
  • Рейтинг +2142/-0
  • Y-ДНК: C-ZQ31
  • мтДНК: M8a
Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #3232 : 15 Июль 2024, 18:35:39 »
https://nplus1.ru/news/2024/07/15/gao-bin

 Палеогенетики прочитали геном раннесредневекового крупного китайского чиновника

Его гробницу раскопали в 2007 году

https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S167385272400184X?via%3Dihub

 Gao Bin (高宾, 503-572 AD), mtDNA Z4 and Y-DNA O1a1a2b-F2444*

Оффлайн Yaroslav

  • Сообщений: 18865
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4779/-14
  • 76% East Europe + 17% Finland
  • Y-ДНК: J1a2b1a ZS3067, ЖМ: I2a1a2b1a1a1a1 FT37540, МЖМ: G2a2b1a1a1a2b2a FT159945
  • мтДНК: K1b1a1 T199C, МЖ: H13a1a1d
Re: Результаты исследований дДНК (обсуждение)
« Ответ #3233 : 15 Июль 2024, 19:17:34 »
Палеогенетики прочитали геном раннесредневекового крупного китайского чиновника...

...и не смогли найти в нём коррупционной составляющей. 8)

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.