R2 - T13500C

[Aseke]

Кто-нибудь встречал Мито R2 - T13500C

[Francois]

Гаплогруппа характерна для северной Индии.

[TK]

Да, встречал и изучал. Могу написать больше, но уточните вопрос - что именно интересует.
А география снипа - от Ирана-Пакистана до Швеции

[Aseke]

Да всё интересует об этой гаплогруппе

Результат такой

R2-T13500C   

HRV1 Mutations C16071T, A16129G, T16187C, C16189T, T16223C, G16230A, T16278C, C16311T, T16362C

HRV2 Mutations C146T, C195T, A247G, 522.1A, 522.2C, 309.1C, 309.2C, 315.1C


Я так понимаю, что предковая мать матери отца откуда-то из Индии. Но хотелось бы узнать побольше. За ранее спасибо.

Заказал недавно на скидках аутосомный анализ FF.

[TK]

А Вы делали только mtDNA Plus или mtFull?
Если mtFull, то должны быть ещё данные CR.
В любом случае, посмотреть смогу только в понедельник-вторник, как доберусь до компа.
На первый взгляд - интересная ветка, и похоже, что может быть новой.

[Aseke]

MtFull Sequnce. Надо посмотреть, что за CR. Первый мой кит мито на ФТДНА, раньше на 23ия заказывал.

[Aseke]

HVR1 DIFFERENCES FROM RSRS
C16071T A16129G T16187C C16189T T16223C G16230A T16278C C16311T T16362C

HVR2 DIFFERENCES FROM RSRS
C146T C195T A247G 309.1C 309.2C 315.1C 522.1A 522.2C

CODING REGION DIFFERENCES FROM RSRS
A769G A825t A1018G A2758G C2885T T3594C G4104A T4216C T4312C G4769A T5964C G7146A T7256C A7521G T7657C T8143C G8251A T8468C T8473C T8655C G8701A C9540T G9932A G10398A T10664C G10685A A10688G C10810T C10873T C10915T A11914G A12654G T12705C G13105A G13276A T13500C T13506C T13650C G14305A

Extra Mutations   309.1C309.2C315.1C522.1A522.2C T5964C T8143C G8251A T16362C

HVR1 DIFFERENCES FROM rCRS 16071T 16362C 16519C

HVR2 DIFFERENCES FROM rCRS 73G 152C 263G 309.1C 309.2C 315.1C

CODING REGION DIFFERENCES FROM rCRS
750G 1438G 2706G 4216C 5964C
7028T 7657C 8143C 8251A 8473C
8860G 9932A 10685A 11719A 12654G
13500C 14305A 14766T 15326G

[TK]

Спасибо за полные данные!
Итак, добрался до компьютера и сравнил с помощью Mega (https://www.megasoftware.net/) Ваш образец с известными полными mtDNA гаплогруппы R2 из базы NCBI nucleotide (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore ) и еще парой других.
Получилось дерево, представленное ниже (Ваш образец обозначен просто как test).
Разумеется, это автоматическая обработка и данное дерево может содержать некоторые ошибки, но для данной цели, полагаю, его достаточно.

Видно, что ближе всего к Вашему образцу находятся образцы из Памира, полученные и обсуждаемые в статье:
Peng, Min-Sheng; Xu, Weifang; Song, Jiao-Jiao; Chen, Xing; Sulaiman, Xierzhatijiang; Cai, Liuhong et al. (2018): Mitochondrial genomes uncover the maternal history of the Pamir populations. In European Journal of Human Genetics 26 (1), pp. 124–136. DOI: 10.1038/s41431-017-0028-8 https://www.nature.com/articles/s41431-017-0028-8

Более того, за исключением малозначимого отличия в 309.2C, Ваш образец идентичен образцу MF522994 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MF522994)
Если не секрет - каково географическое происхождение Вашего образца? Далеко ли оно от Памира?

[Aseke]

Большое спасибо за развернутый ответ. Я с Казахстана из Алматы. В нашем роду брали девушек из разных народов, это были казашки, узбечки, татарки, башкортки, ногайки, уйгурки. По фотографии у моей бабушки чисто казахское лицо, а вот откуда была ее Мама я Вам сказать не смогу. Папа мой говорил, что она тоже была казашка.

[Aseke]

Спасибо за полные данные!
Итак, добрался до компьютера и сравнил с помощью Mega (https://www.megasoftware.net/) Ваш образец с известными полными mtDNA гаплогруппы R2 из базы NCBI nucleotide (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore ) и еще парой других.
Получилось дерево, представленное ниже (Ваш образец обозначен просто как test).
Разумеется, это автоматическая обработка и данное дерево может содержать некоторые ошибки, но для данной цели, полагаю, его достаточно.

Видно, что ближе всего к Вашему образцу находятся образцы из Памира, полученные и обсуждаемые в статье:
Peng, Min-Sheng; Xu, Weifang; Song, Jiao-Jiao; Chen, Xing; Sulaiman, Xierzhatijiang; Cai, Liuhong et al. (2018): Mitochondrial genomes uncover the maternal history of the Pamir populations. In European Journal of Human Genetics 26 (1), pp. 124–136. DOI: 10.1038/s41431-017-0028-8 https://www.nature.com/articles/s41431-017-0028-8

Более того, за исключением малозначимого отличия в 309.2C, Ваш образец идентичен образцу MF522994 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/MF522994)
Если не секрет - каково географическое происхождение Вашего образца? Далеко ли оно от Памира?

Вы знаете, я как-то наткнулся на одну научную статью, в ней были выборки Мито из Памира, один из авторов был по фамилии Деренко М.В.. Вы случайно, не со-автор той статьи?

[TK]

Спасибо и Вам за информацию!
Но вот что прямо сейчас еще нашел - хотя у меня и нет доступа к той статье, но в её описании есть дополнительные электронные материалы.
А из них удается получить ещё немного информации о проанализированных образцах, а именно - принадлежность к народу.
Получается, что совпадающий образец MF522994 был получен от уйгуров низменности (lowland - это вроде как низменность - в отличие от высокогорных областей).


Разумеется, далеко не факт, что Ваши предки принадлежали к уйгурам, например.
Даже при полном совпадении речь может идти о столетиях и тысячелетиях.
Так, в той же статье есть попытка оценки временных интервалов разделения субкладов.
Согласно им (я сейчас уже оцениваю по картинке "на глазок") для этой маленькой картинки выше - самое раннее разделение (MF522980 и MF522994/и Ваш образец) произошло примерно 2,5-4 тыс. лет назад.

[TK]

Вы знаете, я как-то наткнулся на одну научную статью, в ней были выборки Мито из Памира, один из авторов был по фамилии Деренко М.В.. Вы случайно, не со-автор той статьи?

Не, увы - я наукой занимаюсь вообще в качестве хобби

[Aseke]

Вы знаете, я как-то наткнулся на одну научную статью, в ней были выборки Мито из Памира, один из авторов был по фамилии Деренко М.В.. Вы случайно, не со-автор той статьи?

Не, увы - я наукой занимаюсь вообще в качестве хобби

Похоже, что все здесь занимаются хобби Начинают изучать себя и двигаются дальше и дальше.  ))) В любом случае, спасибо большое.

[TK]

Большое спасибо за развернутый ответ. Я с Казахстана из Алматы. В нашем роду брали девушек из разных народов, это были казашки, узбечки, татарки, башкортки, ногайки, уйгурки. По фотографии у моей бабушки чисто казахское лицо, а вот откуда была ее Мама я Вам сказать не смогу. Папа мой говорил, что она тоже была казашка.

Спасибо за информацию. Конечно же, mtDNA никак определяет национальность!
Интересно скорее в историческом плане - благодаря этому есть стимул изучать историю своего и соседних народов!

[Aseke]

Большое спасибо за развернутый ответ. Я с Казахстана из Алматы. В нашем роду брали девушек из разных народов, это были казашки, узбечки, татарки, башкортки, ногайки, уйгурки. По фотографии у моей бабушки чисто казахское лицо, а вот откуда была ее Мама я Вам сказать не смогу. Папа мой говорил, что она тоже была казашка.

Спасибо за информацию. Конечно же, mtDNA никак определяет национальность!
Интересно скорее в историческом плане - благодаря этому есть стимул изучать историю своего и соседних народов!

Family Finder прояснит этногенез, надеюсь. 
Приятного Вам вечера.