Этот плот Asi не странный РСА-анализ адмиксча/примесей, а "вручную" рассчитанные генетические связи.
Так написано "метод РСА", "В пространстве двух главных компонент". IBD-связи в другом разделе. Просто в одной и той же области разместились как северо-западные европейцы, так и кавказцы, вот и сделали такой вывод. Видимо, идея "кто рядом на PCA, те непременно и родственники" бессмертна, несмотря на свою логическую ошибочность.
Причём Anapa-9-то совсем в другой части плота, несмотря на родство третьей степени с Anapa-10.