Тема: Полногеномный сиквенс (WGS), где и как использовать результаты? (Прочитано 9442 раз)

MikSa · « **Ответ #45 :** 03 Май 2023, 17:37:22 »

Понятно, спасибо!

MikSa · « **Ответ #46 :** 04 Май 2023, 01:05:17 »

Насколько я понял, достаточно хранить CRAM у себя, необязательно FastQ?
Пока не понятно про небольшие индексные файлы для CRAM и для VCF.

MikSa · « **Ответ #47 :** 04 Май 2023, 11:58:18 »

Установил WGSExtractv4, выбираю свой CRAM файл в поле "Выбрать BAM/CRAM" и программа выдает ошибку "Error processing the BAM File Header" - что-то с заголовком моего файла.

Georg · « **Ответ #48 :** 04 Май 2023, 12:12:28 »

Попробуйте перекачать. И все мелкие файлы подложите в ту папку.
Лучше со скрином.

MikSa · « **Ответ #49 :** 04 Май 2023, 13:55:46 »

Еще есть два файла FastQ - из них как-то можно получить правильный BAM/CRAM?

Georg · « **Ответ #50 :** 04 Май 2023, 14:06:33 »

Цитата: MikSa от 04 Май 2023, 13:55:46

Еще есть два файла FastQ - из них как-то можно получить правильный BAM/CRAM?

Написано, что можно. Но я тут не подскажу. Или подождите тут ответ или в теме Nebula

MikSa · « **Ответ #51 :** 04 Май 2023, 15:44:54 »

Оказалось сам экстрактор криво стал - после удаления его папок и новой установки вроде все пошло.
Спасибо за помощь!
Если не рановато пишу )))

АвторТема: Полногеномный сиквенс (WGS), где и как использовать результаты? (Прочитано 9442 раз)

MikSa

Re: Полногеномный сиквенс (WGS), где и как использовать результаты?

MikSa

Re: Полногеномный сиквенс (WGS), где и как использовать результаты?

MikSa

Re: Полногеномный сиквенс (WGS), где и как использовать результаты?

Georg

Re: Полногеномный сиквенс (WGS), где и как использовать результаты?

MikSa

Re: Полногеномный сиквенс (WGS), где и как использовать результаты?

Georg

Re: Полногеномный сиквенс (WGS), где и как использовать результаты?

MikSa

Re: Полногеномный сиквенс (WGS), где и как использовать результаты?