Таблица значений ВБОП для пары гаплотипов

[Farroukh]

В данном сообщении представлены оценки генеалогически значимых величин ВБОП (т. е. в пределах 50 поколений), рассчитанных для двух гаплотипов при помощи КлАд-калькулятора. [Необходимо отметить, что в ряде нетривиальных случаев выявлялось большее число мутаций при близком родстве (2 шага на 67 маркёрах между родными братьями)]:

17-маркёрные гаплотипы Yfiler
1 шаг на 17 маркёрах - не менее 12 поколений
2 шага на 17 маркёрах - не менее 24 поколений
3 шага на 17 маркёрах - не менее 37 поколений
4 шага на 17 маркёрах - не менее 52 поколений

При разнице более 4 шагов между двумя 17-маркёрными гаплотипами оценочная величина ВБОП превышает генеалогически значимые величины

25-маркёрные гаплотипы
1 шаг на 25 маркёрах - не менее 11 поколений
2 шага на 25 маркёрах - не менее 23 поколений
3 шага на 25 маркёрах - не менее 35 поколений
4 шага на 25 маркёрах - не менее 47 поколений

При разнице более 4 шагов между двумя 25-маркёрными гаплотипами оценочная величина ВБОП превышает генеалогически значимые величины - требуется продление длины гаплотипа как минимум до 37 маркёров

37-маркёрные гаплотипы
1 шаг на 37 маркёрах - не менее 6 поколений
2 шага на 37 маркёрах - не менее 11 поколений
3 шага на 37 маркёрах - не менее 17 поколений
4 шага на 37 маркёрах - не менее 24 поколений
5 шагов на 37 маркёрах - не менее 30 поколений
6 шагов на 37 маркёрах - не менее 36 поколений
7 шагов на 37 маркёрах - не менее 43 поколений
8 шагов на 37 маркёрах - не менее 50 поколений

При разнице более 8 шагов между двумя 37-маркёрными гаплотипами оценочная величина ВБОП превышает генеалогически значимые величины - требуется продление длины гаплотипа как минимум до 67 маркёров

67-маркёрные гаплотипы
1 шаг на 67 маркёрах - не менее 3 поколений
2 шага на 67 маркёрах - не менее 7 поколений
3 шага на 67 маркёрах - не менее 11 поколений
4 шага на 67 маркёрах - не менее 14 поколений
5 шагов на 67 маркёрах - не менее 18 поколений
6 шагов на 67 маркёрах - не менее 22 поколений
7 шагов на 67 маркёрах - не менее 26 поколений
8 шагов на 67 маркёрах - не менее 29 поколений
9 шагов на 67 маркёрах - не менее 33 поколений
10 шагов на 67 маркёрах - не менее 37 поколений
11 шагов на 67 маркёрах - не менее 41 поколения
12 шагов на 67 маркёрах - не менее 46 поколений
13 шагов на 67 маркёрах - не менее 50 поколений

При разнице более 13 шагов между двумя 67-маркёрными гаплотипами оценочная величина ВБОП превышает генеалогически значимые величины - требуется продление длины гаплотипа до 111 маркёров.

111-маркёрные гаплотипы
1 шаг на 111 маркёрах - не менее 2 поколений
2 шага на 111 маркёрах - не менее 4 поколений
3 шага на 111 маркёрах - не менее 7 поколений
4 шага на 111 маркёрах - не менее 9 поколений
5 шагов на 111 маркёрах - не менее 11 поколений
6 шагов на 111 маркёрах - не менее 13 поколений
7 шагов на 111 маркёрах - не менее 16 поколений
8 шагов на 111 маркёрах - не менее 18 поколений
9 шагов на 111 маркёрах - не менее 21 поколения
10 шагов на 111 маркёрах - не менее 23 поколений
11 шагов на 111 маркёрах - не менее 25 поколений
12 шагов на 111 маркёрах - не менее 28 поколений
13 шагов на 111 маркёрах - не менее 30 поколений
14 шагов на 111 маркёрах - не менее 33 поколений
15 шагов на 111 маркёрах - не менее 35 поколений
16 шагов на 111 маркёрах - не менее 38 поколений
17 шагов на 111 маркёрах - не менее 40 поколений
18 шагов на 111 маркёрах - не менее 43 поколений
19 шагов на 111 маркёрах - не менее 45 поколений
20 шагов на 111 маркёрах - не менее 48 поколений

[Farroukh]

В своё время Дмитрий Адамов разработал весьма востребованный метод расчёт возраста ближайшего общего предка (ВБОП) для двух гаплотипов.

Чтобы ещё более упростить насущную для любого новичка задачу, автор этих строк сваял нехитрый экселевский файлик, назвав его KLAD CALCULATOR, где в соответствующую ячейку столбца B надо ввести количество мутаций между двумя гаплотипами.
Результат - ВБОП, выраженный в поколениях.

Последний вариант калькулятора (12, 17, 25, 37, 67 и 111, а также 400...500 маркёров Yfull.com)

Количество маркёров для двух гаплотипов формата Yfull взято равным 400. При необходимости его можно корректировать, подставив конкретное значение из диапазона 400...500. Константа скорости (0,0016) остаётся примерно одинаковой для всех значений данного диапазона

[Farroukh]

Согласно исследованиям Феннера, в среднем на 1 поколение принимают 31,5 год

[Farroukh]

Небольшая статистика из личного опыта на примере нескольких разных случаев
Для двух гаплотипов при совпадениях типа
1 шаг на 12 маркёрах > ... > 2 шага на 25 маркёрах >...> 4 шага на 37 маркёрах >...> на 67 и 111 маркёрах нет близких совпадений, то расчётный ВБОП после BigY составляет 9-12 снипов/1650 лет (цифры Yfull)

UPD:
Ещё пример:
Полное совпадение на 12 маркёрах > ... > 2 шага на 25 маркёрах >...> 3 шага на 37 маркёрах >...> 6 шагов на 67 маркёрах >...> на 111 маркёрах уже без совпадений, расчётный ВБОП после BigY составляет 2500 лет (цифры Yfull)

[RomanS]

Дорогой Фарух!

Что-то не скачивается твой калькулятор.    Мог бы ты мне его на е-мейл переслать?

С уважением,

РоманС

[Farroukh]

Что-то не скачивается

Калькулятор перезалит, ссылка в основном сообщении также исправлена

[RomanS]

Что-то не скачивается

Калькулятор перезалит, ссылка в основном сообщении также исправлена

Большое спасибо, уважаемый Акпер!

Всё работает! 

[Farroukh]

Из практического опыта. Доверительный интервал оценки ВБОП для 111-маркёрных гаплотипов может достигать +/- 8 поколений.
Это, конечно же, оптимизма не внушает и лишний раз подтверждает необходимость тестов типа  BigY.

[Tora_sama]

Из практического опыта. Доверительный интервал оценки ВБОП для 111-маркёрных гаплотипов может достигать +/- 8 поколений.
Это, конечно же, оптимизма не внушает и лишний раз подтверждает необходимость тестов типа  BigY.

Было бы ещё бабло на это( Особенно в лихие времена.

[Farroukh]

Из практического опыта-2.
После изрядных самоиздевательств с ~700 маркёрными гаплотипами E-V13, E-M84 и E-Y37518.
Для расчётной оценки ВБОП по Y-STR мутациям 111-маркёрные гаплотипы вполне достаточны, доверительный интервал в пределах +/- 8 поколений. Увеличение количества маркёров (вплоть до Y700) лишь увеличивает вероятность межсубкладной гомоплазии и доверительный интервал никак не сокращает.

Вывод: для оценочных расчётов ВБОП по Y-STR мутациям 111-маркёрные гаплотипы необходимы и достаточны

[Farroukh]

FTDNA разродились новой фишкой - таблица с возрастами по Y-STR мутациям (кликабельно):



По сравнению с данными по методу КлАд, возрастные планки ощутимо удревнены. По FTDNA, 0 мутаций на 111 - это 1750...1950 гг. (1...8 поколений)

[Tora_sama]

FTDNA разродились новой фишкой - таблица с возрастами по Y-STR мутациям (кликабельно):



По сравнению с данными по методу КлАд, возрастные планки ощутимо удревнены. По FTDNA, 0 мутаций на 111 - это 1750...1950 гг. (1...8 поколений)

9 шагов на 111 маркерах 1350, в два раза и выходит. Интересно однако)

[Farroukh]

Для 9/111 у них диапазон 950...1650 гг. (40...12 поколений, в среднем 26). Согласно КлАд - от 9 поколений. То есть ФТДНА ощутимо завышают возраст по сравнению с КлАд.

[Tora_sama]

Для 9/111 у них диапазон 950...1650 гг. (40...12 поколений, в среднем 26). Согласно КлАд - от 9 поколений. То есть ФТДНА ощутимо завышают возраст по сравнению с КлАд.

Без бига точно не узнаешь в общем.