АвторТема: LivingDNA  (Прочитано 13685 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Ankor

  • Сообщений: 399
  • Страна: ru
  • Рейтинг +199/-0
Re: LivingDNA
« Ответ #60 : 09 Февраль 2020, 00:11:41 »
Не особо понятен смысл группы West Russia - почему русские оказываются отдельно от поляков, белорусов и украинцев, которые в группе Northeast Europe?
В любом случае у русских эта группа преобладает:



Оффлайн Alexey_V.B.

  • Сообщений: 880
  • Страна: il
  • Рейтинг +223/-0
  • Y-ДНК: R1a (R-A8995*)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: LivingDNA
« Ответ #61 : 09 Февраль 2020, 00:13:26 »
Кто знает: где такие Balochistan с Kurdish? Не рядом ли с Тургистаном из "Призрачная шестёрка"?  ;)
Фильм кстати шустренький - стОит посмотреть https://www.kinopoisk.ru/film/1128272/

Оффлайн Томми

  • Сообщений: 264
  • Рейтинг +75/-1
  • Y-ДНК: I2a2b L38 S2606
  • мтДНК: H3f
Re: LivingDNA
« Ответ #62 : 10 Февраль 2020, 04:36:36 »
Вы же опытный спец и наверняка есть тесты в других компаниях. До сих пор считал, что только 23andMe выдает гаплогруппы в составе своего теста (min за $79 - по акции). 
я не видел упоминаний гаплогрупп на сайте Living DNA, действительно Living DNA дает Y- и mt-гапрогуппы (за $49)?
За 49$ имхо нет, я за емнип 69$ заказывал, там мужская и женская гаплогруппы входят

Оффлайн Sarmat

  • Сообщений: 5
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: I-A13916 (Dinaro-carpathic_N)
  • мтДНК: U4b1b1c (Volga-Ural)
Re: LivingDNA
« Ответ #63 : 30 Май 2020, 08:58:09 »
Не особо понятен смысл группы West Russia - почему русские оказываются отдельно от поляков, белорусов и украинцев, которые в группе Northeast Europe?
В любом случае у русских эта группа преобладает:



Раньше этот кластер назывался "Finland and West Russia". Смею предположить, что под этим кластером подразумевается северо-запад России. За основу скорее всего взяли Каргопольских русских, по стандарту.

Оффлайн R1a-Stolin

  • Сообщений: 907
  • Страна: us
  • Рейтинг +505/-1
  • Y-ДНК: R1a
  • мтДНК: H
Re: LivingDNA
« Ответ #64 : 27 Август 2021, 20:47:43 »
Новый апдейт.

У меня больше нет Балтии (было 16% в прошлый раз) и это большой плюс...







« Последнее редактирование: 29 Август 2021, 08:32:13 от R1a-Stolin »

Оффлайн Sly

  • East Slavic 74% Baltic 14% Central Europe 9% Ireland 3%
  • Сообщений: 506
  • Страна: nf
  • Рейтинг +464/-6
  • Y-ДНК: Печенкины R1a-Y2915 (Южно-русский) Мишины N-L1027 (Литва) Микуровы R-CTS4648 (Польша)
  • мтДНК: K1b2b1 Кельты
Re: LivingDNA
« Ответ #65 : 20 Сентябрь 2021, 14:06:26 »

Сейчас  Западная Россия  :)

Europe 100%
Europe (East) 95.9%
West Russia 95.9 %
Europe (North and West) 4.1%


Оффлайн Sly

  • East Slavic 74% Baltic 14% Central Europe 9% Ireland 3%
  • Сообщений: 506
  • Страна: nf
  • Рейтинг +464/-6
  • Y-ДНК: Печенкины R1a-Y2915 (Южно-русский) Мишины N-L1027 (Литва) Микуровы R-CTS4648 (Польша)
  • мтДНК: K1b2b1 Кельты
Re: LivingDNA
« Ответ #66 : 29 Апрель 2022, 10:21:20 »
Новая фишка

С помощью нашего анализа ДНК викингов мы оцениваем количество ДНК, которое вы разделяете с древними викингами. Мы также вычисляем ваше генетическое сходство с четырьмя популяциями викингов и сообщаем вам, к какой из этих групп популяции вы ближе всего генетически.

Вы получите:

оценка индекса ДНК

Назначение группы населения викингов

Историко-географические описания

Оффлайн Sly

  • East Slavic 74% Baltic 14% Central Europe 9% Ireland 3%
  • Сообщений: 506
  • Страна: nf
  • Рейтинг +464/-6
  • Y-ДНК: Печенкины R1a-Y2915 (Южно-русский) Мишины N-L1027 (Литва) Микуровы R-CTS4648 (Польша)
  • мтДНК: K1b2b1 Кельты
Re: LivingDNA
« Ответ #67 : 13 Октябрь 2022, 21:16:35 »
Сделал апгрейт Викинги  :)

Ваш индекс викингов 28%
Вы наиболее тесно связаны с викингами Восточной Европы.

Оффлайн Sly

  • East Slavic 74% Baltic 14% Central Europe 9% Ireland 3%
  • Сообщений: 506
  • Страна: nf
  • Рейтинг +464/-6
  • Y-ДНК: Печенкины R1a-Y2915 (Южно-русский) Мишины N-L1027 (Литва) Микуровы R-CTS4648 (Польша)
  • мтДНК: K1b2b1 Кельты
Re: LivingDNA
« Ответ #68 : 13 Октябрь 2022, 21:16:56 »
Понимание ваших результатов

Индекс викингов

Индекс викингов представляет собой количество ДНК, которое вы разделяете с древними викингами. Во-первых, вычисляется генетическое сходство между вашей ДНК и ДНК, полученной из образцов древних викингов и не викингов. Это позволяет нам оценить, сколько ДНК у вас общего с каждой группой. Чтобы затем интерпретировать и контекстуализировать этот расчет, мы сравниваем вашу ценность с ценностью всех других пользователей Living DNA. Это дает ваш индекс викингов. Оценка Viking Index позволяет вам увидеть, где ваш результат падает по сравнению со всем диапазоном индексов Viking в базе пользователей Living DNA. Например, если ваш индекс викингов равен 80%, это означает, что ваша ДНК больше похожа на ДНК викингов, чем ДНК 80% всех клиентов Living DNA.

Матч населения викингов

Совпадение популяции викингов показывает, ДНК какой популяции викингов больше всего похожа на вашу. Мы идентифицировали 4 различных популяции викингов на основе нашего анализа древней ДНК. Это норвежские викинги, шведские и датские викинги, британские и североатлантические викинги, восточноевропейские викинги. Мы сравниваем ваши данные ДНК с генетическими моделями, описывающими генетическое сходство и изменчивость этих популяций, чтобы определить наиболее близкое вам совпадение.

Древняя ДНК викингов

Всего для нашего анализа было использовано 446 образцов Viking. Останки древних людей эпохи викингов были раскопаны в 80 разнообразных археологических памятниках в пределах нынешних границ Соединенного Королевства (включая материковую часть Великобритании и Оркнейские острова), Ирландии, Исландии, Дании (материк, Фарерские острова и Гренландия). , Норвегия, Швеция, Эстония, Украина, Польша и Россия.

Образцы были раскопаны в основных районах влияния викингов и датированы концом 8-го и концом 11-го веков нашей эры. Человеческие останки были извлечены из захоронений. В большинстве регионов, которые когда-то были заселены викингами, наблюдалось постепенное увеличение использования ингумационных захоронений (в отличие от кремационных захоронений) в эпоху викингов в результате принятия христианской практики захоронения в Скандинавии и районе Балтийского моря с 10 века. . Это означает, что биоархеологические данные о человеческих останках ранней эпохи викингов ограничены, тогда как они гораздо богаче для более поздних этапов эпохи викингов. Следует принять во внимание, что записи о лицах, захороненных в археологически видимых местах, сильно перекошены в сторону социальных элит, т.е.

Древние человеческие останки (в основном зубы или каменистые кости) были обработаны, а ДНК извлечена и секвенирована, чтобы использовать ее для получения результатов нашего индекса викингов и сопоставления населения викингов. Генетические данные викингов были получены из трех научных публикаций Margaryan et al., 2020, Krzewińska et al., 2018, Ebenesersdóttir et al., 2018.

Оффлайн R1a-Stolin

  • Сообщений: 907
  • Страна: us
  • Рейтинг +505/-1
  • Y-ДНК: R1a
  • мтДНК: H
Re: LivingDNA
« Ответ #69 : 13 Октябрь 2022, 22:44:46 »
Сделал апгрейт Викинги  :)

Романтик!

Я - пасс, потому что 20 долларов и потому что у меня по их последнему апдейту 98% восточная Европа и Балканы + 2% южная Европа. Было бы хоть пару процентов Скандинавия, мне бы было интересно.

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 603
  • Страна: ru
  • Рейтинг +182/-5
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a, дети T1a1ct и H5b9
Re: LivingDNA
« Ответ #70 : 17 Июль 2023, 17:51:51 »
Почему могут быть такие разные результаты с одним и тем же матчем?
Генотек - 13 сМ
Living DNA - 64 сМ
В living DNA заливал сконвертированный из генотека файл.

У девушки-матча направление заливки аналогичное

Оффлайн AleksG

  • Maternal Y-DNA: R-L365->YP940>R-Y110693
  • Сообщений: 845
  • Страна: 00
  • Рейтинг +370/-4
  • Y-ДНК: Q-PH2513
  • мтДНК: U5a1a1a
Re: LivingDNA
« Ответ #71 : 18 Июль 2023, 02:18:29 »
Почему могут быть такие разные результаты с одним и тем же матчем?
Генотек - 13 сМ
Living DNA - 64 сМ
В living DNA заливал сконвертированный из генотека файл.

У девушки-матча направление заливки аналогичное

У генотек учитывают фуллы, прочие - халфы. IBD, вот это все.
По-простому, Генотек занижает длину общих сМ.

Оффлайн NathanS

  • Сообщений: 1274
  • Страна: 00
  • Рейтинг +1187/-2
Re: LivingDNA
« Ответ #72 : 18 Июль 2023, 11:01:49 »
Почему могут быть такие разные результаты с одним и тем же матчем?
Генотек - 13 сМ
Living DNA - 64 сМ
В living DNA заливал сконвертированный из генотека файл.

У девушки-матча направление заливки аналогичное

LivingDNA работает с чипом Affimetrix Axiom, а все остальные, включая Генотек, с вариантами чипа GSA. https://isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart
В Affimetrix Axiom (Sirius) около 700 тыс. снипов, а в GSA - 630-640 тыс. Между ними общих около 400 тыс.
https://isogg.org/wiki/Autosomal_SNP_comparison_chart

При заливке в LivingDNA идет импутация (расчет) недостающих снипов, т.е. около 300 тыс. вписываются туда на основе общей статистики. Что-то предсказывается с 95% вероятностью, а что-то с 80%.

Не знаю какой вариант использует Генотек. По данным ISOGG MyHeritage использует неизмененный чип GSA с 576 тыс. снипов (на другой странице указано 606 тыс.). Если так и в Генотек, то им тоже надо импутировать ("дорисовать") еще 55 тыс. снипов до объема 23andme. Получается, что у вас идет двойная импутация данных, где половина этих данных основаны не на самом тесте, а на расчете. Это приводит к появлению ложных совпаденцев и завышенному совпадению.

Если конвертировали сами, то вероятно в данных есть пробелы, где недостает данных для чипа 23andme v5. Как система совпадений в LivingDNA обрабатывает такие участки я не знаю. Весьма вероятно, что при наличии совпадения около участка с недостаточными данными отсутствующие снипы признаются совпадающими, а в таком случае тоже будет завышенное совпадение.

Оффлайн Georg

  • Сообщений: 603
  • Страна: ru
  • Рейтинг +182/-5
  • Племянник vk511(Y),vk160(аДНК)
  • Y-ДНК: I1a1b1a1e2 (Y353312)
  • мтДНК: Я U5b2a, дети T1a1ct и H5b9
Re: LivingDNA
« Ответ #73 : 18 Июль 2023, 11:29:22 »
Почему могут быть такие разные результаты с одним и тем же матчем?
Генотек - 13 сМ
Living DNA - 64 сМ
В living DNA заливал сконвертированный из генотека файл.

У девушки-матча направление заливки аналогичное

LivingDNA работает с чипом Affimetrix Axiom, а все остальные, включая Генотек, с вариантами чипа GSA. https://isogg.org/wiki/Autosomal_DNA_testing_comparison_chart
В Affimetrix Axiom (Sirius) около 700 тыс. снипов, а в GSA - 630-640 тыс. Между ними общих около 400 тыс.
https://isogg.org/wiki/Autosomal_SNP_comparison_chart

При заливке в LivingDNA идет импутация (расчет) недостающих снипов, т.е. около 300 тыс. вписываются туда на основе общей статистики. Что-то предсказывается с 95% вероятностью, а что-то с 80%.

Не знаю какой вариант использует Генотек. По данным ISOGG MyHeritage использует неизмененный чип GSA с 576 тыс. снипов (на другой странице указано 606 тыс.). Если так и в Генотек, то им тоже надо импутировать ("дорисовать") еще 55 тыс. снипов до объема 23andme. Получается, что у вас идет двойная импутация данных, где половина этих данных основаны не на самом тесте, а на расчете. Это приводит к появлению ложных совпаденцев и завышенному совпадению.

Если конвертировали сами, то вероятно в данных есть пробелы, где недостает данных для чипа 23andme v5. Как система совпадений в LivingDNA обрабатывает такие участки я не знаю. Весьма вероятно, что при наличии совпадения около участка с недостаточными данными отсутствующие снипы признаются совпадающими, а в таком случае тоже будет завышенное совпадение.
Ок.
Ну будем знать, что в этом случае просто чудовищная ошибка.

Есть ещё матчи, полученные wgse из bam wgs и загруженные в living DNA и ftdna - там расхождение значительно ниже/отсутствует - 30 сМ в обеих базах

Оффлайн FELIX

  • Сообщений: 4064
  • Страна: rw
  • Рейтинг +1573/-8
  • Y-ДНК: R-YP569
  • мтДНК: U5a1a1b
Re: LivingDNA
« Ответ #74 : 18 Июль 2023, 13:08:25 »
Это не ошибки, а настройки.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.