Реликтовые M267(J1)из раскопок...

[Yaroslav]

UKR020 Mamay-Gora Zaporizhzhia UkrMA_Nogai_2 1400–1500 CE XY M7b1a1a1 J1a-Y5321

Спасибо!

Я наверное впопыхах зашёл не в ту дверь не в ту таблицу глянул.

Так он оказывается из арабской ветви J1a-Y5321.

Вспомнились Аргинский с Чанышевым. Нужно будет глянуть, в какой они ветви.

[Yaroslav]

Megan Michel et al. 2024, Ancient Plasmodium genomes shed light on the history of human malaria

У инфицированного малярией образца STR140 Нового времени из Мехелена, Бельгия, определили гаплогруппу J1a2a1a2d2b2b2c2a~

Что интересно, согласно нынешней номенклатуре ISOGG, это соответствует... коэнскому субкладу Y3088.

По аутосомам, насколько я понял, он выглядит испанцем.

Т.ж. подозревается, что данное кладбище при соборе Святого Румбольда использовалось в т.ч. и военным госпиталем:

Situated directly adjacent to the first permanent military hospital in early modern Europe, which was in use from 1567 to 1715 CE, the cemetery may have served as a burial place for soldiers in the Habsburg Army of Flanders.

[Yaroslav]

Цитаты из Peer review и Supplementary относительно данного образца:

Peer Review File

Our results combined (Supplementary Table 8: STR Ancestry Modeling and Extended Data Figure 6) do suggest that 4 individuals (STR016, STR067, STR105, STR140) have predominantly Iberian ancestry, more specifically from Mediterranean present-day Spain (modeled either with medieval or present-day groups).

**********************************************************

However, for individual STR025 we show that a two-way admixture model between Late Medieval Germany and Medieval Sardinia provides a more adequate explanation of the data compared to the simpler model of 100% Medieval Spain (e.g., STR016, STR067, STR140).

**********************************************************

We show that models for STR067 and STR140 with a medieval group from Spain during the rule of the Carolingian dynasty (‘Spain_Carolingian’) reach the p-value threshold of ? 0.05 only when ~ 10% ancestry from CanaryIslands_Guanche.SG is added. However, other medieval groups from Spain (i.e., ‘Spain_Medieval’) can work as one-way models, supporting the hypothesis that low N. African-like ancestry was already assimilated in some medieval populations from Spain outside of the Islamic contexts (Olalde et al., 2019; citation is in the main text), and therefore STR067 and STR140 could have descended from them.

[Yaroslav]

Supplementary information

1.4.1 Mechelen, St. Rombout’s cemetery
Country: Belgium
Region: Antwerp Province, Flanders
Coordinates: 51.029°, 4.4793°
Sample Dates (STR016, STR025, STR045, STR067, STR091, STR105, STR129, STR140, STR185, STR248)

Radiocarbon Date (STR140, tooth, MAMS-34260): 340±19 BP, 1479-1635 calCE (2-sigma)

**********************************************************

STR140 (3535-2)- Interred in a single-phase multiple burial which included one non-adult and four adults (based on the initial assessment), this adult male individual exhibits evidence of a P. malariae infection.

**********************************************************

From the same phase [c. 1400-1600 AD], STR025’s and STR140’s probabilities are shifted to France, but mostly to S. Spain and Sardinia.

**********************************************************

In the same way, STR016, STR067 and STR140 are cladal to modern and Medieval Spain (‘Spanish.HO’ and/or ‘Spanish_North.HO’, ‘Spain_Medieval’ and/or ‘Spain_Carolingian’), and STR091 to Aegean Byzantine.

**********************************************************

Similarly, STR140 that can be modeled as deriving 100% from ‘Spain_Medieval’ or cladal to ‘Spanish.HO’ (mostly sampled from southern Spain), requires a second source from Guanches in Canary Islands when applying Medieval ‘Spain_Carolingian’ as first source. This can be explained by low amount of N. African-related ancestry in the group of ‘Spain_Medieval’ which could date back to the Late Antique period134. Therefore, our data do not support that STR140 carries additional N. African ancestry.

[Yaroslav]

Eirini Skourtanioti et al. 2024 The Genetic History of the South Caucasus from the Bronze to the Early Middle Ages: 5000 years of genetic continuity despite high mobility

10 образцов J1 от раннего бронзового века до поздней античности.

Early Bronze Age            
   
TRB010   Taribana_EBA   MMVAS8, Kurgan 1   Taribana, Kakheti   J1a2b1b2~   CTS1460

TRB011   Taribana_EBA   MMVAS8, Kurgan 1   Taribana, Kakheti   J1a2b~   Z1828

TRB006   Taribana_EBA_cont   MMVAS7, Kurgan 1   Taribana, Kakheti   J1a2b~   Z1828

I1325   Samtavro_EMA   Tchkantiskedi_I11N_SM1   Samtavro, Tchkantiskedi   J1   M267

Middle Bronze Age               

AVR002   Alaverdi_MBA   941, Grave No4   Alaverdi, Telavi, Kakheti   J1a2b1b2~           CTS1460

Hellenistic               

NSK007   Nastakisi_H   MMPPH7, Grave No15   Nastakisi, Kartli   J1a2b~   Z1828

Late Antique      
         
KIM001   Khimshiant_LA   MMKPH13, Grave No37   Khimshiant   J1a2b1b2c1~   BY100

KIM003   Khimshiant_LA   MMKPH16, Grave 39   Khimshiant   J1a2b~   Z1828

KLD006   Klde_LA   2740, Grave No64   Klde   J1a2a1a2d2b~   Z1853

KLD008   Klde_LA   2732, Grave No73 (I)   Klde   J1a2b1b~   Y4423

[User]

KIM001   Khimshiant_LA   MMKPH13, Grave No37   Khimshiant   J1a2b1b2c1~   BY100

Khimshiant – а где именно в Грузии это находится? 

Кто-нибудь уже проверял снипы у KIM001?

[G-Man]

Khimshiaantmitsebi (KIM)

The site (41.7774711, 45.7671037) is located in the southwest of the homοnymous village, on the left bank of the Aragvi River. The cemetery found at this site is multi-layered and covers a wide range of time periods, from the 5th millennium BC to the 6th century AD.

[rozenblatt]

Khimshiaantmitsebi (KIM)

The site (41.7774711, 45.7671037) is located in the southwest of the homοnymous village, on the left bank of the Aragvi River. The cemetery found at this site is multi-layered and covers a wide range of time periods, from the 5th millennium BC to the 6th century AD.

Там что-то напутано с координатами. По указанным координатам нет реки Арагви. Я погуглил и нашёл:

В с. Абаносхеви продолжены исследо­вания могильника Химшиант-Мица. На площади 200 кв. м выявлено шесть погребений IV—V вв.

Координаты Абаносхеви (42.026389, 44.764722) подходят под описание лучше, там Арагви совсем рядом.

[Yaroslav]

Lehti Saag et al., 2024 North Pontic crossroads: Mobility in Ukraine from the Bronze Age to the early modern period

Средневековый образец UKR020 (~1400-1500 гг.), захоронение Мамай-Гора вблизи села Великая Знаменка Васильевского района Запорожской области.

Как указано - Nogai Culture.

UKR020 Mamay-Gora Zaporizhzhia UkrMA_Nogai_2 1400–1500 CE XY M7b1a1a1 J1a-Y5321

Согласно данным от пользователя teepean с форума GenArchivist образец UKR020 ногайской культуры оказывается из субклада... J1-Y280553 с йеменцами:

UKR020: Total SNPs: 4282
Result (71.4% 50 -0 +20): J-Y280553
J-P58 -> J-CTS9721 -> J-Z643 -> J-Z1865 -> J-Z1853 -> J-Z2331 -> J-Z2324 -> J-Z2317 -> J-Z2313 -> J-YSC0000234 -> J-Z1884 -> J-FGC11 -> J-Y3014 -> J-Y6370 -> J-Y6369 -> J-FGC40624 -> J-Z18258 -> J-Z18257 -> J-ZS2260 -> J-Y280553 (ISOGG: )
Extra: Y16678:T FGC65342:T Z13492:T FT239283:T Y382737:T Z1575/CTS3097/V2547:T Z6678/FGC714:T FGC59489:T YP886:T FT343296/Y189846:T F1992:T Y152937/BY162049:T GG285:T Z35081:T C180026/TY467674/Y460596:T Y308596:T Z24321:T V7235/FGC4316/ZS1851/Y8975:C Y238561:T FTA15178/Y237293:T

Снипы, указанные им как Extra, я ещё не смотрел.

В то время как дистанции по его аутосомам, согласно пользователю lukpl с того же форума следующие:

Distance to: UKR020
0.00292593 Kyrgyz_Bishkek
0.00311022 Kyrgyz_China
0.00355726 Kazakh_China

[Semargl]

Lehti Saag et al., 2024 North Pontic crossroads: Mobility in Ukraine from the Bronze Age to the early modern period

Средневековый образец UKR020 (~1400-1500 гг.), захоронение Мамай-Гора вблизи села Великая Знаменка Васильевского района Запорожской области.

Как указано - Nogai Culture.

UKR020 Mamay-Gora Zaporizhzhia UkrMA_Nogai_2 1400–1500 CE XY M7b1a1a1 J1a-Y5321

Согласно данным от пользователя teepean с форума GenArchivist образец UKR020 ногайской культуры оказывается из субклада... J1-Y280553 с йеменцами:

UKR020: Total SNPs: 4282
Result (71.4% 50 -0 +20): J-Y280553
J-P58 -> J-CTS9721 -> J-Z643 -> J-Z1865 -> J-Z1853 -> J-Z2331 -> J-Z2324 -> J-Z2317 -> J-Z2313 -> J-YSC0000234 -> J-Z1884 -> J-FGC11 -> J-Y3014 -> J-Y6370 -> J-Y6369 -> J-FGC40624 -> J-Z18258 -> J-Z18257 -> J-ZS2260 -> J-Y280553 (ISOGG: )
Extra: Y16678:T FGC65342:T Z13492:T FT239283:T Y382737:T Z1575/CTS3097/V2547:T Z6678/FGC714:T FGC59489:T YP886:T FT343296/Y189846:T F1992:T Y152937/BY162049:T GG285:T Z35081:T C180026/TY467674/Y460596:T Y308596:T Z24321:T V7235/FGC4316/ZS1851/Y8975:C Y238561:T FTA15178/Y237293:T

В данном случае это явная ошибка. Перепроверял результат по просьбе одного знакомого. Образец имеет множество ложных положительных значений во всех гаплогруппах, но за J-Y280553 нет даже ложных плюсов.
Наиболее вероятное положение этого образца на дереве - J-FGC4309.

Код: [Выделить]

J-Z643: Z1857/PF4802?(0(0)) Z1892/CTS12237/PF4790+(1(1)) V4841/Z2315/FGC1667?(0(0)) Z2316/PF4678?(0(0)) Y2305/FGC1689?(0(0)) PF4827?(0(0)) Z1885/CTS10882+(1(1)) Z1889/FGC1687?(0(0)) Z643?(0(0)) Z1852?(0(0))
   |

J-Z1865: Z2326/FGC1677+(1(1)) Z2330/CTS11234+(2(2)) CTS7920/PF4817?(0(0)) Z2319/CTS2453/PF4806?(0(0)) Z2320/PF4854/YSC0000183+(1(1)) Z1865/CTS5551/PF4811?(0(0))
   |

J-Z1853: CTS6020/PF4856?(0(0)) CTS10704?(0(0)) Z1856/PF4850+(1(1)) Y2277/FGC1681?(0(0)) Y2292/FGC7633?(0(0)) Y2344/FGC1684?(0(0)) Z1853?(0(0)) Z1854/PF4834?(0(0)) V5269/Z2318/FGC1668?(0(0)) Z2325/CTS10394?(0(0)) Z1886/CTS11050/PF4783/S2769/FGC1679?(0(0)) Z1887/PF4862?(0(0)) PF4836?(0(0)) Z2311/FGC3687?(0(0)) Z2323/PF4858/YSC0000200?(0(0)) Y2330/FGC7631/V5372?(0(0)) Z2322/CTS5269/PF4855+(1(1)) Z2321/CTS5266/PF4870?(0(0))
   |

J-Z2331: PF4799?(0(0)) KMS1557/L862/PF4853/YSC0000169+(1(1)) PF4635+(1(1)) PF4838?(0(0)) Z1881?(0(0)) Z1860/CTS2966/PF4699?(0(0)) Z2331/FGC1669?(0(0)) Z1850?(0(0)) Z1888/CTS11719/PF4863?(0(0)) Y2284?(0(0)) Z1864/CTS5130/PF4722+(1(1)) Z2314/PF4848/YSC0000071+(1(1)) Z1867/CTS6161/PF4857?(0(0)) CTS463?(0(0)) Z1855/PF4849?(0(0)) Z1871/CTS9998/PF4859+(1(1)) Z1875/PF4860?(0(0))
   |

J-Z2324: Z2324/PF4843?(0(0))
   |

J-Z2317: YSC0000235/PF4881+(3(3)) V5207/Z2317?(0(0)) CTS11741/PF4847?(0(0))
   |

J-Z2313: Z2313/PF4638+(1(1))
   |

J-YSC0000234: Z2329/PF4845/YSC0000234?(0(0))
   |

J-Z1884: YSC0000080?(0(0)) Z1884/CTS10835/PF4828+(2(2)) CTS1894-(2(2)) L858/PF4851/E388?(0(0))
   |

J-FGC11: Y3015/FGC11?(0(0))
   |

J-Y3014: Y3014/FGC7638+(1(1))
   |

J-S21237: Y5585/FGC1698?(0(0)) FGC1701/Y8768+(1(1)) V7255/S21237/FGC1722?(0(0)) Y4352/FGC1710?(0(0))
   |

J-Y4348: Y4348/FGC1720?(0(0))
   |

J-Y4349: FGC12/Y8770?(0(0)) Y4349/FGC1723?(0(0)) Y4350/FGC1731+(1(1))
   |

J-Y10887: Y10887/FGC1695?(0(0))
   |

J-Y5321: Y7684?(0(0)) V4884/Y5321/FGC1707+(1(1)) Y8769/Z28311?(0(0)) Y5326/FGC1714/AD0000002?(0(0))
   |

J-Y5324: Y5325/FGC1724/V7413?(0(0)) Y5324/FGC1705?(0(0))
   |

J-Y5322: Y5322/FGC1721?(0(0))
   |

J-Y9271: FGC23310?(0(0)) FGC1696/Y9271/AD0000003+(1(1))
   |

J-Y9272: FGC8/Y9273?(0(0)) FGC7/Y9272/AD0000005?(0(0))
   |

J-Y9274: FGC7936/Y9274?(0(0)) Y9275/FGC9?(0(0))
   |

J-Y8975: V7235/FGC4316/ZS1851/Y8975+(2(2))
   |

J-Y10966: Y10966/FGC4314/ZS1850/V6216+(1(1))
   |

J-FGC4309: FGC4309+(1(1))


[Yaroslav]

Наиболее вероятное положение этого образца на дереве - J-FGC4309.

Спасибо!

Тогда ещё интересней.

J1-Y280553 - это пальма со стволом из 27 снипов, а потом йеменскими ветками. Там были теоретические варианты ответвления предков ногайца в незапамятные времена.

А, вот чуть меньше чем полностью арабская J1-FGC4309 ответвилась и распалась на ветви где-то в пределах интервала между 200 г. до н.э. и 550 г. н.э.