Реликтовые M267(J1)из раскопок...

[Yaroslav]

На PCA он (R128, на изображении он просто 128) оказался ближе к киприотам.

[Arame]

[Yaroslav]

Marcus et al. 2020 Genetic history from the Middle Neolithic to present on the Mediterranean island of Sardinia

Обсуждается здесь.

Сардинский образец, насколько я понял, из финикийского/карфагенского захоронения периода V-IV вв. до н.э.

Full ID   Archeological Site   Y Haplogroup (ISOGG 2018)   mtDNA Haplogroup   Archeological phase (paper)   C14 age (BP)   Date interval (cal BP)

VIL007   Villamar   J1a2a1a2d2b2   K1a3a   Punic   2400 ± 15

Согласно используемой в публикации номенклатуре ISOGG 2018, J1a2a1a2d2b2 соответствует уровню Z2331 в YFull.

В YFull, кстати, на разных ветвях субклада Z2331 находятся 12 научных образцов из Сардинии.

[Farroukh]

J1 из Монголии, 5 тыс. лет назад

I6221   3000-2500 BCE   Bayankhongor aimag, Erdenetsogt sum, Shatar chuluu kurgan 2   Mongolia   J1   U5a1+@16192

Подробнее...

[IlgarAsadov]

It should be J1 P58 right?

[Yaroslav]

Богатый улов J1 из публикации Agranat-Tamir et al. 2020 The Genomic History of the Bronze Age Southern Levant

Baqah

I6461 Baqah_family6   1550-1150 BCE J1a2a1a2d2b2b-F4843/Z2324   N1b1a

I6464 Baqah   1550-1150 BCE J1a2a1a2d2b2b2c3-FGC63758/HU80   U3b1a

I6566 Baqah   1550-1150 BCE J1a2a1a2d2b2b2c4b1-FGC8223/V7510/Y3441   U3b

I6569 Baqah   1550-1150 BCE J1a2a1a2d2b2b2c4b-FGC8182/V5320/Y2920/FGC8185/ZS219/Y5761   T2c1a

I6460 Baqah   1550-1150 BCE J1a2a1a2d2b2b2c4b-FGC8182/V5320/Y2920/FGC8185/ZS219/Y5761   U4a

I3703 Baqah   1550-1150 BCE J1a2a1a2d2b2b2c4b1c-FGC8224/Y3442   U3b3

I3705 Baqah   1492-1303 calBCE (3130±25 BP, PSUAMS-1987) J1a2a1a2d2b2b2c4b-FGC8182/V5320/Y2920/FGC8185/ZS219/Y5761   J1b2

I3987 Baqah   1428-1293 calBCE (3100±25 BP, PSUAMS-1989) J1a2a1a2d2b2b2c4b1-FGC8223/V7510/Y3441   N2a

I3706 Baqah   1424-1288 calBCE (3095±25 BP, PSUAMS-1990) J1a2a1a2d2b2b2c4b1c-FGC8224/Y3442   L0f2b

I3985 Baqah   1412-1234 calBCE (3065±30 BP, PSUAMS-1992) J1a2a1a2d2b2b2c4b-FGC8185/ZS219/Y5761   N1b1a2

I6459 Baqah   1384-1213 calBCE (3025±20 BP, PSUAMS-3719) J1a2a1a2d2b2b2c4b1c-FGC8224/Y3442 T1a1

Hazor

I3965 Hazor   1800-1700 BCE J1a2a1a2d2b2b2-F4881/YSC0000235   HV1b3

Megiddo

I8187 Megiddo_MLBA   1800-1650 BCE J1a2a1a2d2b2b2-F4881/YSC0000235   H2a2a

I8188 Megiddo_MLBA_family2   1800-1650 BCE J1a2a1a2d2b-Z1853   U2d

I10359 Megiddo_MLBA   1623-1518 calBCE (3295±20 BP, PSUAMS-4852) J1a2a1a2d2-CTS2453/PF4806/Z2319/FGC1677/Z2326   J2a

I2195 Megiddo_MLBA   1600-1278 calBCE (3160±55 BP, RTK-6766) J1a2a1a2d2-FGC1677/Z2326   U3b

I4525 Megiddo_MLBA   1600-1500 BCE J1a2a1a2-AM01339/PF4826/Z1874   K1a18

I10361 Megiddo_MLBA_family3   1600-1500 BCE J1a2a1-AM01312/CTS4376/Z1861 J1d

I2198 Megiddo_MLBA   1509-1432 calBCE (3207±20 BP, RTK-7898) J1a2a1a2d2b2-F4849/Z1855   H5'36

I4517 Megiddo_IA   1107-923 calBCE (2845±25 BP, PSUAMS-2166) J1a2a1a2d2b2b2c2-S16807/S21060   K1a

[Yaroslav]

Marc Haber et al., 2020 A Genetic History of the Near East from an aDNA Time Course Sampling Eight Points in the Past 4,000 Years

Все образцы из Бейрута.

SFI-42   Iron Age III (540 BCE–396 BCE)   J1-M267

SFI-34   Iron Age III   J1-M267

SFI-44   Iron Age III   J1a2a1a2-P58

SFI-55   Iron Age II   J1a2b1-Z1842* (после просмотра bam файла)

[Yaroslav]

Eirini Skourtanioti et al.2020 Genomic History of Neolithic to Bronze Age Anatolia, Northern Levant, and Southern Caucasus

Tell Kurdu (см. Anthrogenica)

KRD003   J1-L620 (excl. PF4816, FGC6031, Y48949)   Tell Kurdu   6739 ± 23   cal BCE 5661-5630    cal BCE 5706-5622

L620 level: AM01309/YSC0000171/PF4809+, PF4670+, Z2353/FGC1642+, S5004/YSC0000184/Z2361/AM01316/PF4720+, Z2357/PF4693/AM01307/YSC0000168+, AM01338/YSC0000214/PF4824/L825+

L620>PF4816 level: AM01324/PF4739/CTS7260-

L620>FGC6064 level: *no calls*

L620>FGC6064>FGC6031 level: FGC6156-, FGC6070-

L620>FGC6064>Y59693 level: *no calls*

L620>FGC6064>Y59693>Y177646 level: *no calls*

L620>FGC6064>Y59693>Y48949 level: ZS7161-, ZS7145-, ZS7179-

Arslantepe

ART018   J1a2b1~   Z1842   Arslantepe   4573 ± 25    cal BCE 3368-3142    cal BCE 3491-3122

Ebla

ETM001   J1a2a1a2   P58/Page8/PF4698   Ebla   No collagen preservation      

ETM005   J1a2a1a2   P58/Page8/PF4698   Ebla   No collagen preservation      

ETM012   J1a2a1a2d2b~   CTS5266/PF4870/Z2321   Ebla   3997 ± 25   cal BCE 2565-2476    cal BCE 2572-2470

Alalakh

ALA001   J1a2a1a2d2b2b2~   CTS11741/PF4847   Alalakh   3151 ± 24   cal BCE 1486-1407    cal BCE 1496-1325

ALA002   J1a2a1a2d2b2b2~   CTS11741/PF4847   Alalakh   3158 ± 22   cal BCE 1487-1412    cal BCE 1496-1401

ALA018   J1a2a1a2d2b2b2~   CTS11741/PF4847   Alalakh   3154 ± 26   cal BCE 1490-1409    cal BCE 1497-1326

ALA026   J1a2a1a2d2b2b2~   CTS11741/PF4847   Alalakh   3390 ± 25   cal BCE 1736-1645    cal BCE 1744-1628

ALA035   J1a2a1a2d2b2b2~   CTS11741/PF4847   Alalakh   3543 ±24   cal BCE 1930-1784    cal BCE 1948-1774

[Yaroslav]

Marc Haber et al., 2020 A Genetic History of the Near East from an aDNA Time Course Sampling Eight Points in the Past 4,000 Years

После просмотра bam файла образец SFI-55 оказался J1a2b1-Z1842:

Код: [Выделить]

SFI-55 Iron Age II male J H2a

SFI-55 Iron Age II belongs to J1-Z1842* https://www.yfull.com/tree/J-Z1842/   https://anthrogenica.com/showthread.php?20466-A-Genetic-History-of-the-Near-East-from-an-aDNA-Time-Course-Sampling-2020&p=671317&viewfull=1#post671317

[Yaroslav]

Eirini Skourtanioti et al.2020 Genomic History of Neolithic to Bronze Age Anatolia, Northern Levant, and Southern Caucasus

ETM012; 2572-2470 BC; Ebla, Syria; Ebla_EMBA

J1-P58>Z643>Z1865>Z1853 (xZ2331, ZS3683)

==============================

Z1853 level: Z1853+  C>T (1T); PF4834/Z1854+  C>T (1T); PF4855/CTS5269/Z2322+  C>G (3G); PF4850/Z1856+  G>A (1A); Z1886/FGC1679/S2769+  G>A (2A)

Z1853>Z2331 level: PF4799-  A>G (2A); Z1881-  C>A (1C); PF4849/Z1855-  G>C (4G); PF4838-  G>A (1G); PF4857/CTS6161/Z1867-  G>A (3G); PF4863/Z1888/CTS11719-  G>A (2G);
CTS463-  G>A (2G/1A)

Z1853>ZS3683 level: ZS3707-  T>G (1T)

Z1853>ZS2652 level: *no calls*

[Yaroslav]

Обновил данные по образцам J1 средней и поздней бронзы Южного Леванта выше.

[Джим]

Has this case been discussed?


https://anthrogenica.com/showthread.php?20521-Y-Chromosome-Haplogroup-assignments-for-2500-ancient-samples

Iboussieres25-1 France_Iboussieres25_1 J1

from: Iboussieres25-1   Iboussieres25-1   M   France_Iboussieres25_1   MathiesonNature2018   11725   10090-9460 BCE (10140±50 BP, GrA-43700, layer date based on a direct date of Iboussieres39)   Aven des Iboussières à Malataverne, Rhône-Alpes   France   44.29   4.46   0.131   41121   minus   PASS (Qiaomei QC)

[Yaroslav]

Has this case been discussed?

No, it hasn't. Thanks Jim!

Iboussieres25-1 is the second eldest J1 sample (10090-9460 BCE) after Satsurblia man (13235±250 yBP).

[Yaroslav]

Iboussieres25-1 France_Iboussieres25_1 J1

from: Iboussieres25-1   Iboussieres25-1   M   France_Iboussieres25_1   MathiesonNature2018   11725   10090-9460 BCE (10140±50 BP, GrA-43700, layer date based on a direct date of Iboussieres39)   Aven des Iboussières à Malataverne, Rhône-Alpes   France   44.29   4.46   0.131   41121   minus   PASS (Qiaomei QC)

As I see from the list of his called SNPs:

He has positive calls for:

P209/PF4584 of J level

F4200/PF4726 of J1 level

At the same time he has negative calls for:

CTS8340 of J1 level

PF4764 of J1 level

PF4774/YSC0001330 of J1 level

Y2332 of J1 level

I am afraid this sample quality is not enough good.

[Yaroslav]

Вышла публикация Péter L. Nagy et al. 2020 Determination of the phylogenetic origins of the Árpád Dynasty based on Y chromosome sequencing of Béla the Third.

Обсуждается здесь.

Образец HU3G оказался J-ZS7626. Причём у него самое лучшее качество из всех образцов.

Посмотрел таблицу S4 Table.

В узле ZS7640 у венгра положительные снипы:

ZS7652, ZS7640, ZS7651, ZS7643, ZS7661, ZS7647, ZS7630, ZS7645, ZS7653, ZS7642, ZS7634 и ZS10517.

Отрицательные у венгра снипы в узле ZS7640:

ZS7662, ZS7627, ZS7663, ZS7641, Y21704, ZS7628, ZS7646, ZS7654, ZS7626, ZS7655, ZS7650, ZS7635 и ZS7632.

Из 31 снипа в этом узле есть информация о 26 снипах. Из них 12 положительных и 14 отрицательных. Учитывая, что ZS7640 выделилась ~4600 лет назад и распалась на известные сегодня чеченские ветки ~1200 лет назад, грубо и на глаз время ближайшего общего предка венгра с чеченцами может потянуть наверно где-то на ~2900 лет назад.