Предикторы мито-гаплогрупп

[Farroukh]

Мито-предиктор Джеймса Лика.

Последовательность действий при работе с предиктором (тест mtDNA plus):

1) Копируете свои HVR DIFFERENCES FROM RSRS в блокнотовский файл и удаляете первые буквы. Т. е. вместо T16093C должно быть 16093C и т. д. Если доступны rCRS Values, то просто копируете их в блокнотовский файл ничего не меняя!
2) Сохраняете как txt-файл и загружаете (выбрать файл/upload) сюда
3) Система выдаст наиболее вероятные субклады

Если есть полный мито-секвенс (MtFullSeq), то достаточно скачать из профиля FASTA-файл и так же загрузить в предиктор


Просьба к модераторам запинить тему.

[Farroukh]

Mt Clade Finder

Определитель мито-гаплогруппы по данным FASTA-файла.

[Tora_sama]

Писал ещё пару лет назад, а зачем нужен мито предиктор по ФАСТА, если он у вас уже есть, значит вы либо получили всю инфу в ФТДНА либо загрузите свой файл на ифулл)

[Древ]

Tora_sama
Предположим, результат неожиданный и клиент хочет перепроверить.

[Tora_sama]

Tora_sama
Предположим, результат неожиданный и клиент хочет перепроверить.

Так всё равно придёться грузиться на ифулл, иначе вообще зачем делать фулл мито)

[Farroukh]

Любой результат (что BigY, что MtFull) является динамическим и терминальный субклад - всегда "плавающий", всегда в состоянии углубления. Так что присутствие в базах является обязательным.

Предикторы нужны скорее для беглой оценки "где кто есть", без загрузки в базы.
Поэтому просьба делиться здесь не философскими  мыслями, а только ссылками на мито-предикторы.