АвторТема: Предикторы мито-гаплогрупп  (Прочитано 3456 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 17848
  • Страна: az
  • Рейтинг +6424/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Предикторы мито-гаплогрупп
« : 19 Август 2017, 11:32:13 »
Мито-предиктор Джеймса Лика.

Последовательность действий при работе с предиктором (тест mtDNA plus):

1) Копируете свои HVR DIFFERENCES FROM RSRS в блокнотовский файл и удаляете первые буквы. Т. е. вместо T16093C должно быть 16093C и т. д. Если доступны rCRS Values, то просто копируете их в блокнотовский файл ничего не меняя!
2) Сохраняете как txt-файл и загружаете (выбрать файл/upload) сюда
3) Система выдаст наиболее вероятные субклады

Если есть полный мито-секвенс (MtFullSeq), то достаточно скачать из профиля FASTA-файл и так же загрузить в предиктор


Просьба к модераторам запинить тему.

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 17848
  • Страна: az
  • Рейтинг +6424/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Предикторы мито-гаплогрупп
« Ответ #1 : 31 Август 2024, 13:37:39 »
Mt Clade Finder

Определитель мито-гаплогруппы по данным FASTA-файла.

Онлайн Tora_sama

  • Сообщений: 862
  • Страна: ru
  • Рейтинг +410/-0
  • Y-ДНК: E-Y184711
  • мтДНК: H1b2g
Re: Предикторы мито-гаплогрупп
« Ответ #2 : 31 Август 2024, 14:24:49 »
Писал ещё пару лет назад, а зачем нужен мито предиктор по ФАСТА, если он у вас уже есть, значит вы либо получили всю инфу в ФТДНА либо загрузите свой файл на ифулл)

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 770
  • Страна: ru
  • Рейтинг +208/-4
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Предикторы мито-гаплогрупп
« Ответ #3 : 31 Август 2024, 23:12:51 »
Tora_sama
Предположим, результат неожиданный и клиент хочет перепроверить.

Онлайн Tora_sama

  • Сообщений: 862
  • Страна: ru
  • Рейтинг +410/-0
  • Y-ДНК: E-Y184711
  • мтДНК: H1b2g
Re: Предикторы мито-гаплогрупп
« Ответ #4 : 01 Сентябрь 2024, 00:07:44 »
Tora_sama
Предположим, результат неожиданный и клиент хочет перепроверить.
Так всё равно придёться грузиться на ифулл, иначе вообще зачем делать фулл мито)

Оффлайн FarroukhАвтор темы

  • Maternal Y-DNA: R1b-FTD83033
  • ...
  • Сообщений: 17848
  • Страна: az
  • Рейтинг +6424/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Предикторы мито-гаплогрупп
« Ответ #5 : 01 Сентябрь 2024, 05:20:26 »
Любой результат (что BigY, что MtFull) является динамическим и терминальный субклад - всегда "плавающий", всегда в состоянии углубления. Так что присутствие в базах является обязательным.

Предикторы нужны скорее для беглой оценки "где кто есть", без загрузки в базы.
Поэтому просьба делиться здесь не философскими  мыслями, а только ссылками на мито-предикторы.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.