АвторТема: Компания Dante Labs  (Прочитано 169692 раз)

0 Пользователей и 2 Гостей просматривают эту тему.

Оффлайн Alex.msc

  • Сообщений: 15
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1230 : 23 Ноябрь 2020, 15:35:59 »
Цитировать
Чем объяснили это в DanteLabs?
Ответа на письма не последовало
« Последнее редактирование: 23 Ноябрь 2020, 22:41:15 от пенелопа »

Оффлайн ochkas

  • Сообщений: 594
  • Страна: af
  • Рейтинг +297/-0
  • FTDNA: 634321
    • Ochkas DNA
  • Y-ДНК: R1a-L1029-Y128293 (UKR)
  • мтДНК: U3a3a1a1 (BLR)
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1231 : 23 Ноябрь 2020, 15:42:31 »

Цитировать
Чем объяснили это в DanteLabs?
Ответа на письма не последовало
Но вы не оставляете надежду получить свои тесты или вернуть деньги?
« Последнее редактирование: 23 Ноябрь 2020, 22:41:39 от пенелопа »

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1232 : 23 Ноябрь 2020, 16:34:36 »
Если через VPN выбрать США, то цена будет 149$, а не 149€ (~177$) ;D Конвертор валют у итальянцев 1 к 1 ;D


Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17099
  • Страна: az
  • Рейтинг +5911/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1233 : 23 Ноябрь 2020, 16:42:33 »
А вот это интересно :)
Однозначный лайк!

Оффлайн Saken

  • Сообщений: 464
  • Страна: kz
  • Рейтинг +287/-0
  • YFull: YF079031
  • Y-ДНК: C3d [C-Z33001], R1a [R-Y62055], C3x*
  • мтДНК: D4g1* & F1b & M10a1
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1234 : 23 Ноябрь 2020, 16:59:54 »
Чем платить 100$ за Bam файл в ФТДНА, лучше купить этот тест и крутануть итальянскую рулетку 8)

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5994
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4192/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1235 : 23 Ноябрь 2020, 17:20:49 »
У меня три набора в обработке с начала августа. Еще не прошли QC, то есть тестирование не начиналось.
Поддержка отвечает на каждое 2-4 письмо. Задержки списывают на коронавирус. Подкупает только цена, но тут реально рулетка...
Плюс получение только через сервис пересылки.

Подумываю сейчас заказать пару китов от Небулы, тем более образцы должны быть ценные.

Оффлайн Qwerty

  • Сообщений: 14
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: I-L38
  • мтДНК: T2b
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1236 : 23 Ноябрь 2020, 20:21:21 »
А как сейчас обстоят дела с доставкой контейнеров со средой в Россию. Год назад они доставляли в DHL и видимо из-за того, что писали ДНК на упаковки их разворачивали.

Есть ли до кого доходили посылки из ДантеЛабс в последний год? Через что через Почту России или DHL?

Можно ли в России купить совместимые с ДантеЛабс контейнеры со средой? И как обойти уникальный номер kit?


Оффлайн evgivanov

  • Сообщений: 465
  • Страна: ru
  • Рейтинг +175/-0
  • Y-ДНК: R1a-Z92 (YP682+, YP1261+)
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1237 : 23 Ноябрь 2020, 20:32:53 »
Подкупает только цена, но тут реально рулетка...

Подумываю сейчас заказать пару китов от Небулы, тем более образцы должны быть ценные.

Если сравнивать результаты от Данте и Небулы, у кого лучше покрытие и прочее?

Оффлайн Alexey_V.B.

  • Сообщений: 880
  • Страна: il
  • Рейтинг +223/-0
  • Y-ДНК: R1a (R-A8995*)
  • мтДНК: K1a1b1a
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1238 : 24 Ноябрь 2020, 01:01:38 »
получил письмо с ценой на Черную пятницу: Do not miss out on the opportunity to get the Whole Genome Sequencing Test (30X Coverage) at only $149.
Discover the world's most complete DNA Test at the world's lowest price!

полагаю, надо в VPN указать США, для Европы стоимость €149

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1240
  • Страна: ru
  • Рейтинг +912/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1239 : 24 Ноябрь 2020, 09:12:02 »
получил письмо с ценой на Черную пятницу: Do not miss out on the opportunity to get the Whole Genome Sequencing Test (30X Coverage) at only $149.
Discover the world's most complete DNA Test at the world's lowest price!

полагаю, надо в VPN указать США, для Европы стоимость €149
Все верно, однако я как и многие в раздумьях. С одной стороны долгое ожидание, даже если и год не смертельно. Когда мы копаем в глубь сотен и тысяч лет, даже десятки месяцев это не смертельно. Терпение хорошее разовьется. С другой стороны не факт, что они когда нибудь вообще сделают. Пожалуй стоит подождать как минимум до пятницы. Может Nebula скинет сотню баксов. Очень в этом сомневаюсь, но ждать не долго.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5994
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4192/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1240 : 24 Ноябрь 2020, 09:35:55 »
Подкупает только цена, но тут реально рулетка...

Подумываю сейчас заказать пару китов от Небулы, тем более образцы должны быть ценные.

Если сравнивать результаты от Данте и Небулы, у кого лучше покрытие и прочее?
В среднем сопоставимое. Может Небула чуть лучше. Хотя по отзывам в FB у DL сейчас покрытие стало ниже заявленного. Но сам не видел.

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5994
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4192/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1241 : 24 Ноябрь 2020, 09:39:22 »
А как сейчас обстоят дела с доставкой контейнеров со средой в Россию. Год назад они доставляли в DHL и видимо из-за того, что писали ДНК на упаковки их разворачивали.

Есть ли до кого доходили посылки из ДантеЛабс в последний год? Через что через Почту России или DHL?

Можно ли в России купить совместимые с ДантеЛабс контейнеры со средой? И как обойти уникальный номер kit?
Проблема как была, так и осталась. DHL доставляет в Россию только юрлицам. Поэтому если у вас нет юрлица, то заказ следует оформлять через посредников. Например https://www.shipito.com/
Это где-то еще +20$.

Оффлайн AlexVN

  • Сообщений: 7
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1242 : 24 Ноябрь 2020, 12:51:42 »
Всем привет, за год переписки с дантелабс мне так и не удалось получить от них обработанных данных(VCF и пр)
Поэтому придется обрабатывать самому.
Подскажите не появилось ли проверенных пайплайнов для обработки Long Reads от DanteLabs?
А наличии у меня от них только FASTQ размером в 200гб

Оффлайн Semargl

  • "El sueño de la razón produce monstruos" ©
  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 5994
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4192/-5
  • www.semargl.me
    • www.semargl.me
  • Y-ДНК: R1a [CTS3402+]
  • мтДНК: U4a2g
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1243 : 24 Ноябрь 2020, 13:15:46 »
Всем привет, за год переписки с дантелабс мне так и не удалось получить от них обработанных данных(VCF и пр)
Поэтому придется обрабатывать самому.
Подскажите не появилось ли проверенных пайплайнов для обработки Long Reads от DanteLabs?
А наличии у меня от них только FASTQ размером в 200гб
Советую обратиться в YSEQ. Томас вроде бы делал свой алгоритм для маппирования LR.
BWA точно не подойдет. Лучше наверное использовать https://github.com/lh3/minimap2

Оффлайн AlexVN

  • Сообщений: 7
  • Страна: ru
  • Рейтинг +3/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1244 : 24 Ноябрь 2020, 13:34:30 »
Всем привет, за год переписки с дантелабс мне так и не удалось получить от них обработанных данных(VCF и пр)
Поэтому придется обрабатывать самому.
Подскажите не появилось ли проверенных пайплайнов для обработки Long Reads от DanteLabs?
А наличии у меня от них только FASTQ размером в 200гб
Советую обратиться в YSEQ. Томас вроде бы делал свой алгоритм для маппирования LR.
BWA точно не подойдет. Лучше наверное использовать https://github.com/lh3/minimap2
Спасибо YSEQ посмотрю.
С помощью minimap2 удалось выровнять на hg38, вот только не могу понять качество, может есть какие-то метрики для оценки качества выравнивания да и сервенирования в целом?
А вот на следующем этапе BAM => VCF я пока завис, изучаю samtools/bcftools и в планах GATK, но встанет тот же вопрос, как оценить качество полученных результатов?

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.