АвторТема: Компания Dante Labs  (Прочитано 189424 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн nikku

  • Сообщений: 23
  • Страна: by
  • Рейтинг +24/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1425 : 05 Март 2023, 23:35:11 »
Подскажите, пожалуйста, как сейчас ситуация с обратной отправкой из России/Беларуси обстоит?
Доходят сэмплы, не банят аккаунты?
При том, что изначально тест заказывался в страну Европы и там же оплачивался.

Успел в последний вагон заказать два теста. По идее, завтра скидки закончатся.
Перед этим написал еще одно письмо в Данте: подтвердили, что блад киты сейчас есть в наличии в Европе.

Оффлайн nikku

  • Сообщений: 23
  • Страна: by
  • Рейтинг +24/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1426 : 19 Март 2023, 03:18:29 »
Господа, а что вы писали в содержимом посылки, отправляя Tasso-киты с сухой кровью из стран СНГ?
Пока придумал только вариант "пластиковая игрушка с кнопкой". Но боюсь, что пакет из фольги может смутить работника на почте или таможне..
В целом, судя по информации из Телеграма, как таковых санкций у Данте для России/Беларуси нет. Люди отправляли наборы прямо из России после 24 февраля 2022, и они доходили.
Но там был опыт со слюной, а мне интересен с кровью.

И кстати да, ценник с 200 евро ровно на следующий день после заявленного окончания скидок вернулся к 400 евро. Так что если Данте пишет какие-то даты, то надо успевать.
Saken, спасибо еще раз за инфу о купоне. Воспользовался им, а на сдачу добавил "Alignment to GRCh38". Почитав группу на Фейсбуке, сложилось впечатление, что будет не лишним (хотя в Линуксы умею).
Правда, потом нашел пост Ренди Харра и немного расстроился :(
Цитировать
You do not want GRCh38 but either hs38 or hg38. GRCh38 is from EBI and basically the original raw reference model. Not tuned for alignment by masking out highly repetitive regions. hs38 is the best for analysis and alignment; in that regard.
Хотя ранее он писал такое, отвечая на вопрос, стоит ли оплачивать такую услугу от Данте:
Цитировать
You will get more variants by realigning to build 38 as more of the human genome is in the Build 38 reference model. Most medical sites have their references to both Build 37 and Build 38. With that said though, most of the Exome is defined in both models and that is where most of the medical relevant variants are.
But realigning the BAM is just the start. You have to (re)create the VCF file(s) as most sites work off them.
In that regard, you are best to have Dante do the realignment in their pipeline. They are using the Illumina developed / sponsored DRAGEN tool set. It and Google Life Sciences' DeepVariant are the closest to a gold standard for variant calling.
В общем, теория у меня пока хромает, надо глубже разбираться. Но заказал докучи, черт с ними с 58 евро, даже если не пригодится. Интересно будет сравнить полученный файл с тем, что сгенерирует WGS Extract.
« Последнее редактирование: 19 Март 2023, 03:31:19 от nikku »

Оффлайн Sadad113

  • Сообщений: 116
  • Страна: ru
  • Рейтинг +21/-0
  • Y-ДНК: I-Y189048
  • мтДНК: W6a2а
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1427 : 23 Март 2023, 00:07:55 »
Что-то уже дней двадцать кит доставлен в лабораторию, но до сих пор стоит статус ожидает контроля качества, это нормально вообще?

Оффлайн academicien

  • Сообщений: 19
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1428 : 11 Апрель 2023, 16:45:15 »
Что-то уже дней двадцать кит доставлен в лабораторию, но до сих пор стоит статус ожидает контроля качества, это нормально вообще?

У вас поменялся статус в итоге? У меня статус контроля качества висит неделю пока что...

Оффлайн Sadad113

  • Сообщений: 116
  • Страна: ru
  • Рейтинг +21/-0
  • Y-ДНК: I-Y189048
  • мтДНК: W6a2а
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1429 : 15 Апрель 2023, 20:57:12 »
Что-то уже дней двадцать кит доставлен в лабораторию, но до сих пор стоит статус ожидает контроля качества, это нормально вообще?

У вас поменялся статус в итоге? У меня статус контроля качества висит неделю пока что...

Нет, ничего не поменялось, всё также, написал им в поддержку, не ответили пока, но в их группе в ФБ, им много людей пишет с такими вопросами, они отвечают тип это ничего не значит, это просто статус что тест пришёл в лабораторию и ожидает постановки на секвенирование. Причём там люди ещё не получили результаты с нового года, так что не знаю сколько длится это будет.

Оффлайн academicien

  • Сообщений: 19
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1430 : 16 Апрель 2023, 03:37:06 »
Итак, 4 апреля тест поступил в лабораторию в Хьюстоне, а уже 14 апреля пришли результаты. Очень приятно удивлен такой скоростью. Пока что только разбираюсь в теме фул-генома, вот такие данные получились. WGSExtract пока осваиваю, брыкается)

Образец собирал внутри щеки (как на видео-инструкции FTDNA).




Оффлайн academicien

  • Сообщений: 19
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4/-0
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1431 : 18 Апрель 2023, 23:05:22 »
Статистика файла в 19 референсе после загрузки в yFull. Может потом сделаю платный апгрейд у них же за €14 до 38го.


Оффлайн Sadad113

  • Сообщений: 116
  • Страна: ru
  • Рейтинг +21/-0
  • Y-ДНК: I-Y189048
  • мтДНК: W6a2а
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1432 : 09 Июнь 2023, 00:02:01 »
Подскажите, пожалуйста, как сейчас ситуация с обратной отправкой из России/Беларуси обстоит?
Доходят сэмплы, не банят аккаунты?
При том, что изначально тест заказывался в страну Европы и там же оплачивался.

Успел в последний вагон заказать два теста. По идее, завтра скидки закончатся.
Перед этим написал еще одно письмо в Данте: подтвердили, что блад киты сейчас есть в наличии в Европе.

Здравствуйте, у вас какое-то движение по вашему киту есть? У меня никакого несколько раз писал в поддержку, извиняются, гооврят что много заказов, но никаких сроков не называют, все заявленные сроки ими давно прошли.

Оффлайн Sadad113

  • Сообщений: 116
  • Страна: ru
  • Рейтинг +21/-0
  • Y-ДНК: I-Y189048
  • мтДНК: W6a2а
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1433 : 10 Июнь 2023, 01:44:12 »
В общем никому не советую заказывать здесь, лучше подумайте сто раз чем тут брать вгс, где 200 долларов там и триста, похоже проще взять биг игрек, может у небулы или yseq, но не здесь иначе будете ждать от полугода, движения по семплу нет и не предвидится в Фейсбуке полно тех кто сдал ещё в декабре, компания свои обязательства не выполняет, по крайней мере ее европейское отделение и даже если образец прошел контроль качества, то это ещё не гарантия ничего, таких людей там тоже полно. Сейчас такая жизнь, что можно умереть не дождавшись их результатов. Это жалкая макаронная контора, ноги моей там больше не будет.

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 667
  • Страна: ru
  • Рейтинг +179/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1434 : 15 Июнь 2023, 18:33:53 »
Господа, каков итог? Всё-таки существует полный геном за 199 баксов или это обман?
Вижу, что люди жалуются что "долго". Но полгода - это недолго, на мой взгляд, если в итоге сделают работу вдвое дешевле, чем конкуренты.

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1250
  • Страна: ru
  • Рейтинг +929/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1435 : 15 Июнь 2023, 21:38:40 »
Да хоть год. Главное цена\качество. Около 30 наборов со слюной заказали на днях. С опозданием, но регулярно приходят результаты. Цена\качество лучше данте. 20 тыс. +- в РФ.
Nebula мутят с подпиской, дорого выходят.
YSEQ львиную долю отдают на аутсорс с разбросом в качестве.

А недовольных хватает.

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 1456
  • Страна: hu
  • Рейтинг +269/-7
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397 -> I-FGC79161
  • мтДНК: V7a1?
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1436 : 15 Июнь 2023, 21:39:56 »
Господа, каков итог? Всё-таки существует полный геном за 199 баксов или это обман?
Вижу, что люди жалуются что "долго". Но полгода - это недолго, на мой взгляд, если в итоге сделают работу вдвое дешевле, чем конкуренты.
мне Full Genomes как раз полгода делали... ну, и норм!

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 667
  • Страна: ru
  • Рейтинг +179/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1437 : 15 Июнь 2023, 22:25:12 »
Да хоть год. Главное цена\качество. Около 30 наборов со слюной заказали на днях. С опозданием, но регулярно приходят результаты. Цена\качество лучше данте. 20 тыс. +- в РФ.
Это вы про Данте?

Оффлайн Val_Metov

  • Сообщений: 1250
  • Страна: ru
  • Рейтинг +929/-2
  • Y-ДНК: J-Y94477
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1438 : 15 Июнь 2023, 23:25:11 »
Да. Что-то я уже охладел к этим Y37 тестам. Надо сразу полный геном. Надо лишить людей шанса выбрать более дешевые варианты. Им же будет лучше. Уж 20 тыс. для такого дела это не так уж и много.

Оффлайн Древ

  • Сообщений: 667
  • Страна: ru
  • Рейтинг +179/-2
  • Y-ДНК: I-PH1410
  • мтДНК: H5a1a*
Re: Компания Dante Labs
« Ответ #1439 : 16 Июнь 2023, 00:32:58 »
А за скачивание BAM-файла Данте какие-то деньги берут?
Просто не верится в такие чудеса.
Генотек - 100 т.р. (около 840 баксов)
фтДНА - 500 баксов (BigY+mtFull+FF)
YSEQ - 699 баксов

А у Данте вдруг 199! Ну не бывает же такого!

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.