АвторТема: Оракул для Eurogenes K-36.  (Прочитано 105228 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Stanislav S

  • Сообщений: 602
  • Страна: ru
  • Рейтинг +132/-4
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a2b3
  • мтДНК: H3
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #60 : 27 Июнь 2017, 19:17:17 »
Спасибо! По этому калькулятору особенно заметно, что разница между русскими и поляками достаточно незначительна. И еще интересно, как меняется "этничность" буквально за два поколения. Отец - северный русский и финн, я - практически кругом разные вариации русского, сын - уже больше похож на поляка. Еще отмечу, что данный калькулятор в упор не видит ашкеназские 17% от FTDNA, просто относя их к полякам.

Оффлайн Serckesh

  • Тапы и Мальково Тобольской губернии. Зюбриха Липовецкого уезда Киевской губернии. Тойси Буинского уезда Симбирской губернии
  • Сообщений: 516
  • Страна: ru
  • Рейтинг +297/-0
  • FTDNA: 644559 GEDmatch: ZQ2019538 YFull: YF11431
  • Y-ДНК: R1a1a1b1a2b3a6a2b~ (R1a CTS1211 Y2613 M12335)
  • мтДНК: U4c2a
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #61 : 27 Июнь 2017, 19:45:36 »
Спасибо! По этому калькулятору особенно заметно, что разница между русскими и поляками достаточно незначительна. И еще интересно, как меняется "этничность" буквально за два поколения. Отец - северный русский и финн, я - практически кругом разные вариации русского, сын - уже больше похож на поляка. Еще отмечу, что данный калькулятор в упор не видит ашкеназские 17% от FTDNA, просто относя их к полякам.

Мне кажется, что все этнокалькуляторы более-менее точно показывают монопопуляции. А когда подставляешь значения таких жертв глобализма, как я - начинаются уже гадания на кофейной гуще. Тут уже самому приходится подбирать калькулятор, то есть искать результат под себя, а не идти от результата, как должно быть. Моя бабушка - коренная сибирячка, соответственно и картина по ней везде примерно одинакова. А у меня мешанина из русских, украинцев и чувашей - так мне ни один калькулятор ничего толкового не показал, вот только Eurogenes K36 Oracle что-то смог похожее на реальность изобразить.

Оффлайн andronn

  • 23andMe: Восточноевропейская 99,1 % финский 0,9 %. MyHeritage: Прибалт 42,1%, Восточноевропеец 36.7%,Балканец 20,3%, Финн 1,3%. Family Finder: East Slavic 45% West Slavic 28% Baltic 24% Greece & Balkan 2% Central Europe<2%
  • Сообщений: 589
  • Страна: ua
  • Рейтинг +184/-0
  • Y-ДНК: R-YP417
  • мтДНК: T2b4
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #62 : 27 Июнь 2017, 20:12:19 »
Мать получилась полячкой:




Цитировать
А когда подставляешь значения таких жертв глобализма, как я - начинаются уже гадания на кофейной гуще. Тут уже самому приходится подбирать калькулятор, то есть искать результат под себ
совершенно верно, вот этот калькулятор интересный, подошел почти идеально для отца, но у матери как то однобоко показывает. Вот К-27, отлично подошел для результатов матери, там и польши и карпатиан хватает, но там указана и русская компанента, сев-зап России, Положье там четко показано, здесь этого нет.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8576
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4919/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #63 : 28 Июнь 2017, 09:07:37 »
Спасибо! По этому калькулятору особенно заметно, что разница между русскими и поляками достаточно незначительна. И еще интересно, как меняется "этничность" буквально за два поколения. Отец - северный русский и финн, я - практически кругом разные вариации русского, сын - уже больше похож на поляка. Еще отмечу, что данный калькулятор в упор не видит ашкеназские 17% от FTDNA, просто относя их к полякам.

Мне кажется, что все этнокалькуляторы более-менее точно показывают монопопуляции. А когда подставляешь значения таких жертв глобализма, как я - начинаются уже гадания на кофейной гуще. Тут уже самому приходится подбирать калькулятор, то есть искать результат под себя, а не идти от результата, как должно быть. Моя бабушка - коренная сибирячка, соответственно и картина по ней везде примерно одинакова. А у меня мешанина из русских, украинцев и чувашей - так мне ни один калькулятор ничего толкового не показал, вот только Eurogenes K36 Oracle что-то смог похожее на реальность изобразить.
Посмотрел внутренности таблицы, здесь миксы вообще никак не обрабатываются. Берутся первые n выборок с наименьшим отклонением (в зависимости от режима среднеквадратичным, четвертой или шестой степени). Затем обратно пропорционально отклонению раскидывается процентовка "вклада" этих выборок, чтобы общая сумма составила 100%. Аналогичный механизм применен для Area Sharing (каждая выборка отнесена к определенному региону).

По сути, в режиме Conservative это то же самое, что обычный одиночный Оракул, в двух других режимах работает, как одиночный Оракул с более резкими настройками. Но для кого-то режим запуска через таблицу более удобен, да и выводится в симпатичном виде :) .

Оффлайн varang

  • Сообщений: 5364
  • Страна: fi
  • Рейтинг +1823/-8
    • Проект "R1a-Y417 & Subclades" (M458>L1029>YP417)
  • Y-ДНК: R1a-L1029-A14777
  • мтДНК: H2a1
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #64 : 28 Июнь 2017, 09:33:53 »
Спасибо! По этому калькулятору особенно заметно, что разница между русскими и поляками достаточно незначительна. И еще интересно, как меняется "этничность" буквально за два поколения. Отец - северный русский и финн, я - практически кругом разные вариации русского, сын - уже больше похож на поляка. Еще отмечу, что данный калькулятор в упор не видит ашкеназские 17% от FTDNA, просто относя их к полякам.

Мне кажется, что все этнокалькуляторы более-менее точно показывают монопопуляции. А когда подставляешь значения таких жертв глобализма, как я - начинаются уже гадания на кофейной гуще. Тут уже самому приходится подбирать калькулятор, то есть искать результат под себя, а не идти от результата, как должно быть. Моя бабушка - коренная сибирячка, соответственно и картина по ней везде примерно одинакова. А у меня мешанина из русских, украинцев и чувашей - так мне ни один калькулятор ничего толкового не показал, вот только Eurogenes K36 Oracle что-то смог похожее на реальность изобразить.

безусловно.
калькулятор лишь сравнивает наши значения со средними значениями используемых там выборок по популяциям (эталонные - это сельские жители "без подмесу").

картину просветляет визуализация по IBD- сегментам.

это примерно как STR и снипы в Y: т.е. в первом случае мы гадаем/занимаемся предикцией, в другом - фактическое родство.

Оффлайн MikSa

  • Сообщений: 297
  • Страна: by
  • Рейтинг +59/-2
  • Соколовские герба Холева
  • Y-ДНК: I-А2423
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #65 : 28 Июнь 2017, 12:54:21 »
Может кто-нибудь выложить таблицу в нормальном современном формате xlsx?


Оффлайн valera27

  • Сообщений: 732
  • Страна: ru
  • Рейтинг +161/-0
  • Y - R1a1a-YP682(xYP1260,YP612,YP1696); mt - H1a
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #66 : 28 Июнь 2017, 13:33:33 »
Может кто-нибудь выложить таблицу в нормальном современном формате xlsx?
ODS (OpenDocument Spreadsheet) это абсолютно нормальный и не менее современный формат, и самое главное свободный, а не проприетарный.
Excel последних версий должен его без проблем открывать. Так же вроде быстрый гуглинг показал существование онлайн-конвертеров.

У меня например Excel 2010 открывает (после ругательного сообщения)  в неинтерактивном виде (т.е. при вводе цифр ничего не меняется). Попробовал пару конверторов - файл убивается на корню(((

Оффлайн MikSa

  • Сообщений: 297
  • Страна: by
  • Рейтинг +59/-2
  • Соколовские герба Холева
  • Y-ДНК: I-А2423
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #67 : 28 Июнь 2017, 14:22:32 »
Все верно - современные эксели открыть не могут - предлагают попробовать. В результате режут формулы.
Пробовал два онлайн-конвертера - один также вырезал формулы, второй не вырезал, т.к. конвертнул в xls 97 года - но все-равно не работает.

А чем его свободность лучше свободности экселя. Или при запуске экселя очень тяжело закрыть окно о неободимой активации?

Оффлайн MikSa

  • Сообщений: 297
  • Страна: by
  • Рейтинг +59/-2
  • Соколовские герба Холева
  • Y-ДНК: I-А2423
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #68 : 28 Июнь 2017, 14:48:19 »
Можно что-то очень редкое, но бесплатное выбрать - тогда вообще никто не увидит.
И смысл такой работы?
А право выбора, само собой, не пытаюсь оспорить.

Оффлайн MikSa

  • Сообщений: 297
  • Страна: by
  • Рейтинг +59/-2
  • Соколовские герба Холева
  • Y-ДНК: I-А2423
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #69 : 28 Июнь 2017, 15:17:22 »
Почему обязательно ПК?
На смартфонах самсунг стоит в базе легально.

Но, наконец запустил после обновления офиса.
 :)

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2272
  • Страна: ru
  • Рейтинг +552/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #70 : 28 Июнь 2017, 15:22:20 »
А мне так больше Admix4 понравился. Правда, как я уже отмечал, некоторые киты долго крутит - минут 5. А некоторые за две проглатывает. результат в текстовом формате выдает.

Оффлайн RoaringАвтор темы

  • Сообщений: 652
  • Рейтинг +155/-1
  • Y-ДНК: R1b-DF99
  • мтДНК: U5b1e
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #71 : 28 Июнь 2017, 15:23:38 »
Спасибо! По этому калькулятору особенно заметно, что разница между русскими и поляками достаточно незначительна. И еще интересно, как меняется "этничность" буквально за два поколения. Отец - северный русский и финн, я - практически кругом разные вариации русского, сын - уже больше похож на поляка. Еще отмечу, что данный калькулятор в упор не видит ашкеназские 17% от FTDNA, просто относя их к полякам.

Калькулятор всё видит, просто экселевский инструмент есть оракул по одной популяции и естественно ваш сын будет ближе всего к Славянам, так как это большая часть его генома, но вот результаты по Адмикс-4:

1 GR_Istanbul+PL_Sudovia+PL_Sudovia+PL_Sudovia @ 4,808729
2 GR_Istanbul+Russian_Voronezh+PL_Sudovia+PL_Sudovia @ 4,872136
3 GR_Istanbul+Lithuanian+PL_Sudovia+PL_Sudovia @ 4,880833
4 GR_Istanbul+PL_Sudovia+PL_Sudovia+PL_Podlasie_East_Mazovia @ 4,912889
5 GR_Istanbul+PL_Sudovia+PL_Sudovia+Pl_Kashubians @ 4,92596
6 GR_Istanbul+Latvian+PL_Sudovia+PL_Sudovia @ 4,937547
7 GR_Istanbul+PL_Sudovia+PL_Sudovia+PL_Wielkopolska @ 4,937664
8 GR_Istanbul+Russian_Smolensk+PL_Sudovia+PL_Sudovia @ 4,940629
9 GR_Istanbul+PL_Sudovia+PL_Sudovia+Sorb_Lusatia @ 4,942085
10 GR_Istanbul+PL_Sudovia+PL_Sudovia+Pl_north @ 4,949531
11 GR_Istanbul+Lithuanian+Russian_Voronezh+PL_Sudovia @ 4,959926
12 GR_Istanbul+PL_Sudovia+PL_Sudovia+PL_Mazovia @ 4,961912
13 GR_Istanbul+PL_Sudovia+PL_Sudovia+PL_SE_Carpathia @ 4,987018
14 GR_Istanbul+German_East+PL_Sudovia+PL_Sudovia @ 4,989648
15 GR_Istanbul+Russian_Voronezh+PL_Sudovia+Pl_Kashubians @ 5,003546
16 GR_Istanbul+Sweden_north+PL_Sudovia+PL_Sudovia @ 5,004691
17 GR_Istanbul+PL_Sudovia+PL_Sudovia+PL_South_Poland @ 5,007488
18 Askhenazi+PL_Sudovia+PL_Sudovia+PL_Sudovia @ 5,007612
19 GR_Istanbul+Russian_Novgorod_Pskov+PL_Sudovia+PL_Sudovia @ 5,01119
20 GR_Istanbul+Russian_Oryol+PL_Sudovia+PL_Sudovia @ 5,015438


Как я понял мои инструкции оказались недостаточными, сделаю сегодня подробный гайд по Адмикс-4.

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2272
  • Страна: ru
  • Рейтинг +552/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #72 : 28 Июнь 2017, 15:28:16 »
По Адмикс-4: чем Least-squares method от Gaussian method отличается? Какому методу верить?

Оффлайн HaploAndrey

  • Сообщений: 111
  • Страна: ru
  • Рейтинг +43/-0
  • Y-ДНК: C-F4002/F1918/Z1866/F966/Y4497/F4044
  • мтДНК: J1c5a
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #73 : 28 Июнь 2017, 16:37:34 »
Добрый день,

не могли бы вы пожалуйста проанализировать вот эти данные:
Population   
Amerindian -     
Arabian -     
Armenian -     
Basque 1.01
Central_African -     
Central_Euro 7.44
East_African -     
East_Asian -     
East_Balkan 4.76
East_Central_Asian -     
East_Central_Euro 25.55
East_Med -     
Eastern_Euro 20.84
Fennoscandian 11.74
French 3.87
Iberian 4.43
Indo-Chinese -     
Italian 4.33
Malayan -     
Near_Eastern -     
North_African -     
North_Atlantic 3.52
North_Caucasian -     
North_Sea 10.45
Northeast_African -     
Oceanian -     
Omotic -     
Pygmy -     
Siberian -     
South_Asian 0.49
South_Central_Asian -     
South_Chinese -     
Volga-Ural 1.55
West_African -     
West_Caucasian -     
West_Med - 

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 8576
  • Страна: ru
  • Рейтинг +4919/-3
  • Y-ДНК: N-L1025 Y64023
  • мтДНК: U4a1-a C16134T
Re: Оракул для Eurogenes K-36.
« Ответ #74 : 28 Июнь 2017, 16:48:29 »
Открыл в LibreOffice и сохранил в .xlsx: http://rgho.st/7ByCwC7Bk
Не знаю, что из этого получилось, т.к. проверить негде, а форматы не полностью совместимы по функциональности:
Работает

Цитировать
LibreOffice/OpenOffice или Google Docs поможет, но неужели все отписавшиеся в этой теме использовали их?
Возможно )) Я открывал изначальный файл с помощью OpenOffice

По Адмикс-4: чем Least-squares method от Gaussian method отличается? Какому методу верить?
В Gaussian при сравнении с выборками разница значений по главным компонентам получает больший вес, чем разница по мелким. В Least-squares для всех компонентов имеет значение только величина самой разницы (ПМСМ более правильный подход).

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.