АвторТема: 23andMe & I1  (Прочитано 4649 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19426
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1424/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
23andMe & I1
« : 22 Ноябрь 2009, 11:02:34 »
Вот какие мутации из ныне действующей классификации есть у меня

I1* defining mutations
N/A          
 
I1 defining mutations
i4000178 (P30)            G       A
i4000189 (P40)        C       T
rs13447354 (M307)    G       A
rs17316597 (M450)    G       A
rs9341296 (M253)    C       T
 
I defining mutations
i4000163 (P212)            T       A
rs2032597 (M170)    A       C
rs2319818 (U179)    G       A
rs9341301 (M258)    T       C
 
I/J defining mutations
rs17250163 (P126)    C       G
rs17250887 (P130)    A       T
rs17306671 (M429)    T       A
rs17306699 (P129)    A       G
rs17315772 (P124)    A       C
rs17315821 (P123)    T       C
rs7892893 (P127)    C       T
 
I/J/K defining mutations
rs9786139 (L15)       A       G
rs9786714 (L16)       G       A
 
F defining mutations
i4000053 (P14)       D       I
rs16980391 (P149)    G       A
rs16980396 (P148)    C       T
rs16980459 (P139)    G       A
rs16980478 (P138)    T       C
rs16980499 (P166)    C       T
rs16980711 (P133)    G       A
rs16981340 (P146)    C       T
rs17174528 (P187)    G       T
rs17842387 (P145)    G       A
rs2032652 (M89)     C       T
rs2032665 (M213)    T       C
rs4589047 (P163)    A       T
rs4988808 (P142)    G       A
rs7067496 (M235)    T       G
rs9306845 (P141)    G       A
rs9306848 (P160)    A       C
rs9785905 (P159)    C       A
rs9785908 (P136)    T       G
rs9785913 (P158)    C       T
rs9786095 (P157)    T       C
rs9786502 (P135)    C       T
rs9786636 (P140)    G       C
rs9786707 (P151)    T       C
rs9786877 (P134)    C       G
 
C/F defining mutations
rs4141886 (P143)    G       A
 
C/T defining mutations
i4000227 (P9.1)      C       A
rs2032595 (M168)    C       T
rs9341317 (M294)    C       T
 
B/T defining mutations
i4000077 (M139)            I       D
rs13447347 (M299)    T       G
rs2032630 (M42)     A       T
rs2032647 (M94)     C       A

Оффлайн nieswicz

  • Сообщений: 41
  • Рейтинг +7/-0
  • Fuimus
  • Y-ДНК: I1*
  • мтДНК: T2b2
Re: 23andMe & I1
« Ответ #1 : 04 Декабрь 2009, 20:01:05 »
Abbat,

smotrel na Vashi rezul'taty na papke Excel Adriano Squecco. Pri polzovanii funktsii sravnenia (Compare=F) v posledney kolonne rezultatov I1 poluchaetsya vyborka snipov v krasnom i oranzhevym tsvetakh. S ney okazyvaetsia yasno, chto imeem tot zhe sostav snipov na Y-khromosome.  Keith Stell Harris tozhe pereslal svoi utochnennye dannye kotorye sovpadayut zaodno s Vashymi i moimi. Est tam  neskol'ko identichnykh rezultatov:

Vizzaccaro, Pepples, Nieswicz (eto ya!), Fischer, Kivinen, Berry, Fleetwood, Odom, Stone, Jackson ("pervyi"), Cockerell, Van Staden, Shtrunov (eto Vy!), Eaton, Christensen, Harris. Vse oni L22- t.e. kak ponial I1*.
Ostalnye I1d, ili I1d1, a u nikh vekh snipy vse-taki otlichayutsia ot nashikh.

Ya ne umeyu pol'zovatsya vozmozhnostiami 23andMe, k sozhalenii, no poluchil neskol'ko meilov ludey, kotorye uzhe v delo voshli. Tam est Relatives Finder, global similarity i drugie ustroistva. Nado popytatsia poniat. Dumayu, uvazhaemyi Muggley sumel eto sdelat'.

Vsego dobrogo

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19426
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1424/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: 23andMe & I1
« Ответ #2 : 04 Декабрь 2009, 22:15:43 »
Спасибо, Лех. Я тоже обратил на это внимание.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19426
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1424/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: 23andMe & I1
« Ответ #3 : 11 Декабрь 2009, 12:57:08 »
As far as I understand, Keith's results would have not been not correctly loaded and he was requested tu reload them. I've contacted him yesterday and he was quite unaware of the need to reload his result. He promised to do it as soon as possible. Then, we will see whether the big difference remains in terms of snips between Keith Harris and the set of I1 L22- people having the same set of snips. This group at present is composed of: Vizzaccaro, Pepples, Nieswicz, Kivinen, Berry, Fleetwood, Odom, Stone, Jackson (1st in the row), Cockerell, Van Staden, Shtrunov, Eaton, Christensen. The patronymes of Pepples (Peeples), Berry, Stone, Jackson and Cockerell have numerous matches with different Harris groups, noticeably Stone, close to Harris Group 4.

There's another set, apparently L22+: Verwaerde, Lunilla, Hidds, Van der Knaap, Ritter, which apart L22 value has a set of snips identical with the previous one.

What is quite funny is what we see when looking at Nordtvedt's subdivision of I1 based on STR values. The subclade I1-T2 defined by DYS459a,b = 7,9 has only 2 members having L22-: Stone and Nieswicz. Harris belongs also to I1-T2, but we're not sure about his snips. Theorically, he should fall into the first set, characterized by L22-.

http://dna-forums.com/index.php?/topic/9751-23andme-snips-versus-str-record/

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19426
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1424/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: 23andMe & I1
« Ответ #4 : 31 Январь 2010, 11:02:03 »
Решил посмотреть результаты работы ASquecco http://slil.ru/28572970

Очень хорошо видно две группы I1 со своими снипами.

Первая группа (фамилии в файле выделены красным):
Egede-Nissen, Vizzaccaro, Pepples, Nieswicz, Verwaerde, Junnila, Fischer, Higgs, Bruggeman, Kivinen, Berry, Fleetwood, Odom, Stone, Jackson, Jackson, van der Knaap, Cockerell, Ritter, van Staden, Shtrunov, Eaton, Christensen, Davis, Berestov, Harris, Comp.

Вторая группа (фамилии в файле выделены черным):
Almack, Nevalainen, Henderson, Kraig, Emanuelson, AnI, Sandifer, Jensen, Stuvstad, MTS, Vesey, Fichtner, Marsic, Beck, Lambda, Ray, Gudehus, S?rensen, Goff.

Но обладатели снипа rs34626372, который маркирует субклад I1d (L22/S142), присутствуют в обеих группах (в файле выделены зеленым полем http://slil.ru/28572977):
Egede-Nissen, Verwaerde, Almack,   Nevalainen,   Henderson,   Kraig,   Emanuelson, Junnila, Higgs, Jensen,    Stuvstad, Jackson, van der Knaap, Ritter, Davis, Berestov, Lambda Ray, S?rensen.

Обладатели снипа  i4000146, который маркирует субклад I1d1 (P109), присутствуют также в обеих группах:
Egede-Nissen, Jackson, Ritter, Davis, Berestov, Lambda Ray

Как такое может быть?

Оффлайн Овод

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 2158
  • Рейтинг +390/-3
  • Omnia mea mecum porto
  • Y-ДНК: R1a-M198
  • мтДНК: U4a
Re: 23andMe & I1
« Ответ #5 : 31 Январь 2010, 11:20:31 »
Решил посмотреть результаты работы ASquecco http://slil.ru/28572970

Очень хорошо видно две группы I1 со своими снипами.

............

Как такое может быть?

Всё зависит от того, что понимать под словами "очень хорошо видно". Вполне возможно, что это два кластера, а не клада. Первые, в отличие от последних, не обязаны находится в разных ветвях.
 
Вполне также возможно, что в "перемешивании" гаплогрупп виновата гомоплазия (хотя она очень редко наблюдается у снипов). То есть - параллельные или возвратные мутации в одной из позиций. В таком случае, снип в этой позиции просто не годится для классификации.
 
Третий вариант - плохо работает L22. Я помню, у Кена Нортведта были недоумения по поводу его уникальности.
 

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19426
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1424/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: 23andMe & I1
« Ответ #6 : 31 Январь 2010, 11:28:44 »
Решил посмотреть результаты работы ASquecco http://slil.ru/28572970

Очень хорошо видно две группы I1 со своими снипами.

............

Как такое может быть?

Всё зависит от того, что понимать под словами "очень хорошо видно". Вполне возможно, что это два кластера, а не клада. Первые, в отличие от последних, не обязаны находится в разных ветвях.
 
Вполне также возможно, что в "перемешивании" гаплогрупп виновата гомоплазия (хотя она очень редко наблюдается у снипов). То есть - параллельные или возвратные мутации в одной из позиций. В таком случае, снип в этой позиции просто не годится для классификации.
 
Третий вариант - плохо работает L22. Я помню, у Кена Нортведта были недоумения по поводу его уникальности.

Посмотрите файлы, которые я залил, Вы поймете, что я понимаю под "очень хорошо видно".  ;)

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19426
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1424/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: 23andMe & I1
« Ответ #7 : 01 Февраль 2010, 18:10:25 »
Илмари ответил:

Цитировать
The red group have updated "new" raw data that they submitted.

Those that are still in black have not ever provided the new raw data that was added to their accounts back sometime last year.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34038
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2819/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe & I1
« Ответ #8 : 05 Февраль 2010, 16:06:40 »
Кто-нибудь знаком с Vladimir Annenkov?

Получил сегодня сл. письмо от mikej2:

Hi, do you know him? I have with him the same y-haplogroup and 1.1% / 5Mb, chrs 1,2,3,4,8 at Decodeme.

best regards
Mauri Myllyl?

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19426
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1424/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: 23andMe & I1
« Ответ #9 : 05 Февраль 2010, 16:32:50 »
Кто-нибудь знаком с Vladimir Annenkov?

Получил сегодня сл. письмо от mikej2:

Hi, do you know him? I have with him the same y-haplogroup and 1.1% / 5Mb, chrs 1,2,3,4,8 at Decodeme.

best regards
Mauri Myllyl?


Есть такой, со мной законтачен.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34038
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2819/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe & I1
« Ответ #10 : 05 Февраль 2010, 16:43:24 »
Есть такой, со мной законтачен.
Законтачен то он и со мной.
Нужен контакт письменный на предмет проверки общей родни.

Оффлайн Аббат БузониАвтор темы

  • Модератор
  • *****
  • Сообщений: 19426
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1424/-56
  • Y-ДНК: I1a2a1a3a1a1a-YP1084+
  • мтДНК: H16
Re: 23andMe & I1
« Ответ #11 : 05 Февраль 2010, 16:56:50 »
Мы с ним общались. Написал ему о Mauri.

Оффлайн Mich Glitch

  • Genus regis
  • Сообщений: 34038
  • Страна: ca
  • Рейтинг +2819/-44
  • Y-ДНК: J2b1
  • мтДНК: H6a1a5a
Re: 23andMe & I1
« Ответ #12 : 05 Февраль 2010, 16:57:26 »
Мы с ним общались. Написал ему о Mauri.
Спасибо!

Оффлайн Sigfrid

  • Сообщений: 21
  • Рейтинг +1/-0
  • Y-ДНК: I1-bothnia
  • мтДНК: H39
Re: 23andMe & I1
« Ответ #13 : 06 Март 2010, 21:03:10 »
Thank you gentlemen, I am Mauri.  My result with Annenkov is now solved quite well; his mother has obviously some Finnish connections, though she is born in Uzbekistan.  She is my "RF-cousin" at 23andme. 

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100