АвторТема: Вопросы о выявлении mtDNK ветви  (Прочитано 2511 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Serge1Автор темы

  • Сообщений: 180
  • Страна: il
  • Рейтинг +18/-0
  • Y-ДНК: L-Y16366*
  • мтДНК: T2a2
Вопросы о выявлении mtDNK ветви
« : 02 Апрель 2017, 11:34:55 »
1) Сколько минимум образцов FMS необходимы для того что бы выявить общую ветку между ними?
2) Могут ли случатся обратные мутация подряд в промежуток 1-2 мутаций между ними, а точней какова вероятность?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17098
  • Страна: az
  • Рейтинг +5909/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Вопросы о выявлении mtDNK ветви
« Ответ #1 : 03 Апрель 2017, 12:59:37 »
Цитировать
1) Сколько минимум образцов FMS необходимы для того что бы выявить общую ветку между ними?
Как минимум два.
Цитировать
2) Могут ли случатся обратные мутация подряд в промежуток 1-2 мутаций между ними, а точней какова вероятность?
Обратные мутации митоДНК возможны, вероятность их возникновения практически не изучена. Выявлены у носителей полинезийской B4a1a1.

Оффлайн Serge1Автор темы

  • Сообщений: 180
  • Страна: il
  • Рейтинг +18/-0
  • Y-ДНК: L-Y16366*
  • мтДНК: T2a2
Re: Вопросы о выявлении mtDNK ветви
« Ответ #2 : 03 Апрель 2017, 19:52:07 »
На осеове phylotree расширил ветку T2a2 из 8 образцов участников мито T2 проекта:





Как видно от до T2a2 до T2a2(c) произошли 3 обратные мутации за 4 шага.

Можно ли считать верным то что я сделал?

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17098
  • Страна: az
  • Рейтинг +5909/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Вопросы о выявлении mtDNK ветви
« Ответ #3 : 03 Апрель 2017, 20:40:43 »
Бирор, это нисходящие мутации, а не обратные (возвратные). У T2a2 обнаружились дочки.

Оффлайн Serge1Автор темы

  • Сообщений: 180
  • Страна: il
  • Рейтинг +18/-0
  • Y-ДНК: L-Y16366*
  • мтДНК: T2a2
Re: Вопросы о выявлении mtDNK ветви
« Ответ #4 : 03 Апрель 2017, 20:48:41 »
А в чем разница? Вот до T2a2(c) быле 2 мутации C146T и C16311T, а после пропали...

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17098
  • Страна: az
  • Рейтинг +5909/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Вопросы о выявлении mtDNK ветви
« Ответ #5 : 04 Апрель 2017, 04:51:59 »
Они не пропали. Простор в проекте есть только T2a2 и T2a2a (A215G в крайне правом столбце у гаплотипов 225 и 226). 364418 - это T2a2b

Оффлайн Serge1Автор темы

  • Сообщений: 180
  • Страна: il
  • Рейтинг +18/-0
  • Y-ДНК: L-Y16366*
  • мтДНК: T2a2
Re: Вопросы о выявлении mtDNK ветви
« Ответ #6 : 04 Апрель 2017, 10:48:44 »
Бирор, я не понял что ты патаешся обьяснить. Причем здесь мутация A215G?

Я про T2a2(c), почему у них отсутствуют мутации C146T и C16311T? На ветке T2a2 эти мутации все еще есть, а на T2a2(c) уже их нету.

Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-BY124371
  • ...
  • Сообщений: 17098
  • Страна: az
  • Рейтинг +5909/-17
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37518
  • мтДНК: F2f1
Re: Вопросы о выявлении mtDNK ветви
« Ответ #7 : 04 Апрель 2017, 13:37:59 »
На стандартном древе ФилоТри есть только T2a2a (A215G)



У ФТНДА перечислены такие мутации, там тоже только  T2a2a (A215G) :

Оффлайн Serge1Автор темы

  • Сообщений: 180
  • Страна: il
  • Рейтинг +18/-0
  • Y-ДНК: L-Y16366*
  • мтДНК: T2a2
Re: Вопросы о выявлении mtDNK ветви
« Ответ #8 : 04 Апрель 2017, 15:45:59 »
Братан, мы с тобой на разных языках...

Я же писал что я сам расширил ветку, я создал T2a2a(1), T2a2(b), T2a2(b1), T2a2(c), то что в () это от меня добавлено.

Мой вопрос был о 2-ух древних мутациях C146T и C16311T которые присутствуют на всех стадиях до T2a2 и после, кроме как у 3 чел из ветки T2a2 у которых эти мутации не выявлены, я этих 3 распределил в созданую мной ветку T2a2(c).

ФТНДА базируется на ФилоТри.

Может быть причина в том что ты не видешь картинку на которым я продлил ветку, вот ниже картинку видешь??
↓↓↓

Оффлайн ankr21

  • Сообщений: 2256
  • Страна: ru
  • Рейтинг +551/-0
  • Y-ДНК: I1-L1302
  • мтДНК: U3b1b
Re: Вопросы о выявлении mtDNK ветви
« Ответ #9 : 04 Апрель 2017, 22:53:30 »
Братан, мы с тобой на разных языках...

Я же писал что я сам расширил ветку, я создал T2a2a(1), T2a2(b), T2a2(b1), T2a2(c), то что в () это от меня добавлено.

Мой вопрос был о 2-ух древних мутациях C146T и C16311T которые присутствуют на всех стадиях до T2a2 и после, кроме как у 3 чел из ветки T2a2 у которых эти мутации не выявлены, я этих 3 распределил в созданую мной ветку T2a2(c).

ФТНДА базируется на ФилоТри.

Может быть причина в том что ты не видешь картинку на которым я продлил ветку, вот ниже картинку видешь??
↓↓↓

PhiloTree рисуется на базе последовательности rCRS, а вы используете RSRS. Здесь можно посмотреть чем они отличаются
http://www.phylotree.org/resources/RSRS_vs_rCRS.htm
Позиции 146 и 16311 в этих эталонных последовательностях различаются. Но похоже 146 довольно часто крутит. 16311 особо не отслеживал. Посмотрел: 16311 тоже крутит будь здоров. Обратные мутации этой позиции наблюдаются не только в группе T.
« Последнее редактирование: 04 Апрель 2017, 23:20:32 от ankr21 »

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.