АвторТема: Разбор случая Legatus - N1b; первоначально предполагалась Гаплогруппа K-M9  (Прочитано 5770 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6224
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1089/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #45 : 28 Март 2017, 18:06:00 »
Если не P, и не NO....
Исключая австранезийскую и индийскую экзотику, остается LT.
О чем, собственно, и написал уважамый Фаррух.

Оффлайн LegatusАвтор темы

  • Сообщений: 27
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: N1b
  • мтДНК: U4a1
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #46 : 09 Апрель 2017, 12:11:12 »
Результаты, полученные в Тапотили:

Marker   Allele 1   Allele 2
DYS576   17   
DYS389 I   13   
DYS448   18   
DYS389 II   31   
DYS19   13   
DYS391   10   
DYS481   22   
DYS549   13   
DYS533   13   
DYS438   10   
DYS437   14   
DYS570   16   
DYS635   23   
DYS390   23   
DYS439   10   
DYS392   12   
DYS643   10   
DYS393   13   
DYS458   19   
DYS385   11   12
DYS456   15   
YGATAH4   12

DYS385 = DYS385 a, b = считаются как два разных маркера

Predicted Haplogroup, 3 different predictors:      

http://www.nevgen.org/       
N1b      

http://members.bex.net/jtcullen515/haplotest.htm       
N-E.Europe =>25%  R1a1-English =>15%  E3b-M183 =>13%  I-P37.2 =>11%  N-Germanic =>8%  E3b-V12 =>7%  R1b-S21-Scottish =>5%  R1b-S29-Frisian2 =>3%  N =>2%  R1b-IrishIII =>2%  I-S31* =>1%  Q-M242-Group2 =>1%  R1b-S21-Scottish2 =>1%  R1b-North/South 1 =>1%  E3b =>1%  J1-M267 =>1%  F =>1%

http://www.hprg.com/hapest6/
I2a

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2112
  • Рейтинг +575/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #47 : 09 Апрель 2017, 15:02:03 »
Уважаемый Legatus, Ваш гаплотип в 17-маркерном формате Yfiler (19, 389I, 389II, 390, 391, 392, 393, 385a,b, 438, 439, 437, 448, 456, 458, 635, GATAH4) выглядит следующим образом:

13-13-31-23-10-12-13-11,12-10-10-14-18-15-19-23-12.

Данные по другим локусам пока не принимаем во внимание.

В базе данных YHRD есть несколько гаплотипов, образующих некий кластер, к которому относится и Ваша игрек-хромосома:

Свердловская область, русские:
13-13-32-23-10-12-13-11,12-10-10-14-18-15-16-24-12,
13-14-31-23-10-12-13-11,12-10-10-14-18-15-16-22-12,
13-13-31-23-11-12-12-11,12-10-10-14-18-15-15-23-12,
13-13-30-23-10-12-12-11,12-10-10-14-18-14-15-23-12,
13-13-30-23-10-12-12-11,12-10-10-14-18-16-15-24-12.

Архангельская область, русские:
13-13-30-23-11-12-12-11,12-10-10-14-18-15-15-24-12.

Новгородская область, русские:
13-13-31-23-10-12-12-11,12-10-10-14-18-15-16-25-12,
13-13-31-23-10-12-12-11,12,
13-13-31-23-10-12-12-11,12.

Пензенская область, русские:
13-13-31-23-10-12-12-11,12-10-10-14-18-14-15-24-12.

Азиатская часть России, русские:
13-13-30-23-10-12-13-11,12-10-11-14-18-15-16-24-12,
13-13-32-23-10-12-12-11,12-10-10-14-18-15-16-25-12.

Пока что гаплотипы кластера проявляются только в образцах русских. Несмотря на мои упорные попытки, найти такие гаплотипы в других странах не удалось.

Оффлайн LegatusАвтор темы

  • Сообщений: 27
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: N1b
  • мтДНК: U4a1
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #48 : 09 Апрель 2017, 15:15:16 »

Пока что гаплотипы кластера проявляются только в образцах русских. Несмотря на мои упорные попытки, найти такие гаплотипы в других странах не удалось.

А можно ли по этим данным установить конкретную гаплогруппу?

Да и предки по отцовской линии, по моим данным, принадлежали к тюркским народам.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2112
  • Рейтинг +575/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #49 : 09 Апрель 2017, 15:44:36 »

Пока что гаплотипы кластера проявляются только в образцах русских. Несмотря на мои упорные попытки, найти такие гаплотипы в других странах не удалось.

А можно ли по этим данным установить конкретную гаплогруппу?

Да и предки по отцовской линии, по моим данным, принадлежали к тюркским народам.
Данные о типировании ограничиваются данными Fechner et al. (2008) + Roewer et al. (2008) по трем таким гаплотипам (Архангельская, Новгородская и Пензенская области):

M9+, M45-, Tat-.

То есть было показано, что Ваш гаплотип относится к парагруппе K, но не к P (R+Q) и N-Tat.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6224
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1089/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #50 : 09 Апрель 2017, 17:17:54 »
Загадки продолжаются.
Я внес гаплотип в базу Семаргла (см. http://www.semargl.me/kit/157351/) для того, чтобы поискать совпадания.
Так их особо нет. Те которые есть (желающие могут вбить в поиск по номеру Tap09042017) явно не имеют отношения к сюжету. Ну мне так кажется.
Итого: относительно P (R, Q) понятно. А вот N-Tat не исключает других субкладов N. Вот, например, параллельный ему N-L666 (https://www.yfull.com/tree/N-L666/). Я уже не говорю про LT.
Возвращаясь к N-L666 в России. Видим ветвь: https://www.yfull.com/tree/N-Y3195/
А тут русский из Свердловской области (научный образец), русский с Камчатского края (научный образец) и тд.

Если верить Nevgen, то получается N1b. Опять же не силен я в N, но это N-P43. А эта ветвь под N-L666. Так что все вроде сходится и искать нужно здесь.
Википедия повествует по этому поводу:
Цитировать
Гаплогруппа N1b определяется мутацией P43. Предполагается, что N1b возникла 4 500 — 10 000 лет назад на территории Саян или поблизости. Данная гаплогруппа характерна для самодийцев (до 92 %), а также частично для угро-финнов Урала и Западной Сибири (до 60 %). Наибольшая частота гаплогруппы N1b отмечена у северных самодийцев. У памирских киргизов - 24%.
Частота гаплогруппы N1b в русских популяциях невелика. В южных и центральных популяциях эта гаплогруппа практически отсутствует. В северных русских популяциях встречаемость этой гаплогруппы 3 — 7 %, максимальное значение выявлено в популяции деревни Нюхча Пинежского района (восток Архангельской области) (15,8 %; в источнике выборка обозначена «Пинега» по названию реки и района).
Предлагаю проверить в Тапотили P43.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2112
  • Рейтинг +575/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #51 : 10 Апрель 2017, 07:33:04 »
Загадки продолжаются.
Я внес гаплотип в базу Семаргла (см. http://www.semargl.me/kit/157351/) для того, чтобы поискать совпадания.
Так их особо нет. Те которые есть (желающие могут вбить в поиск по номеру Tap09042017) явно не имеют отношения к сюжету. Ну мне так кажется.
Итого: относительно P (R, Q) понятно. А вот N-Tat не исключает других субкладов N. Вот, например, параллельный ему N-L666 (https://www.yfull.com/tree/N-L666/). Я уже не говорю про LT.
Возвращаясь к N-L666 в России. Видим ветвь: https://www.yfull.com/tree/N-Y3195/
А тут русский из Свердловской области (научный образец), русский с Камчатского края (научный образец) и тд.

Если верить Nevgen, то получается N1b. Опять же не силен я в N, но это N-P43. А эта ветвь под N-L666. Так что все вроде сходится и искать нужно здесь.
Википедия повествует по этому поводу:
Цитировать
Гаплогруппа N1b определяется мутацией P43. Предполагается, что N1b возникла 4 500 — 10 000 лет назад на территории Саян или поблизости. Данная гаплогруппа характерна для самодийцев (до 92 %), а также частично для угро-финнов Урала и Западной Сибири (до 60 %). Наибольшая частота гаплогруппы N1b отмечена у северных самодийцев. У памирских киргизов - 24%.
Частота гаплогруппы N1b в русских популяциях невелика. В южных и центральных популяциях эта гаплогруппа практически отсутствует. В северных русских популяциях встречаемость этой гаплогруппы 3 — 7 %, максимальное значение выявлено в популяции деревни Нюхча Пинежского района (восток Архангельской области) (15,8 %; в источнике выборка обозначена «Пинега» по названию реки и района).
Предлагаю проверить в Тапотили P43.
Уважаемый Шад, Ваше мнение подтвердилось. Еще в 2007 году в работах по гаплогруппе N (Rootsi et al., 2007; Derenko et al., 2007) в гаплогруппе N-P43 (старое обозначение - N2) была обнаружена ветвь, которую авторы Rootsi et al. (2007) назвали N2-E:

Rootsi et al. (2007):
Komi 13-13-31-23-10-12-13-12,12-10-10-14-18-15-16-26-12,
Komi 13-13-31-23-10-12-12-11,12-10-10-14-18-15-16-24-12,
Tatar 13-13-30-23-10-12-13-12,12-10-10-14-18-16-20-24-12,
Vepsa 13-13-31-23-10-11-12-11,12-10-10-14-18-15-16-23-12,
Mari 13-13-31-23-10-12-13-12,13-10-10-14-18-15-18-23-12,
Russian 13-13-31-23-10-12-13-12,12-10-10-14-19-10-16-24-12,

Derenko et al. (2007), N2-E:
Russian 13-13-30-23-10-12-13-12,12-10-10-14.

Так что обсуждаемый образец уважаемого Legatus

13-13-31-23-10-12-13-11,12-10-10-14-18-15-19-23-12

из "европейской" ветви гаплогруппы N-P43.



Оффлайн Farroukh

  • Maternal Y-DNA: R1b-L584
  • ...
  • Сообщений: 10971
  • Страна: az
  • Рейтинг +1797/-15
  • Paternal Mt-DNA: M9a1b1
    • Azerbaijan DNA Project
  • Y-ДНК: E-Y37093
  • мтДНК: F2f
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #52 : 10 Апрель 2017, 08:09:12 »
Цитировать
из "европейской" ветви гаплогруппы N-P43.
Если так, то более чем вероятно речь об N-Y3195

Если слова самого тетсируемого о том, что:
Цитировать
предки по отцовской линии, по моим данным, принадлежали к тюркским народам.
то вероятен N-VL67

Оффлайн LegatusАвтор темы

  • Сообщений: 27
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: N1b
  • мтДНК: U4a1
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #53 : 10 Апрель 2017, 10:20:43 »
В таком случае можно ли надеяться, что тестирование P43 даст полезную информацию?

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6224
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1089/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #54 : 10 Апрель 2017, 11:33:19 »
В таком случае можно ли надеяться, что тестирование P43 даст полезную информацию?

Можно "на удачу" поставить VL67 на проверку, а при отрицательном результате идти по дереву вверх. Т.е. от VL67 к Y3195. В принципе, есть высокая вероятность, что это будет одна из этих двух ветвей.

Оффлайн Nimissin

  • Сообщений: 2112
  • Рейтинг +575/-0
  • Y-ДНК: N-M178 L839+ P298+ M2019+ M2118+ M1991+ M1988+
  • мтДНК: C4b4
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #55 : 10 Апрель 2017, 13:18:06 »
В таком случае можно ли надеяться, что тестирование P43 даст полезную информацию?
Думаю, в Вашем случае тестирование на Р43 - лишняя трата денег. С большой вероятностью мутации VL67 нет. Лучше тестировать сразу Y3195, ожидаю наличие производного аллеля (т.е. мутации). Далее, Ваш образец лучше протестировать на снипы L1419 и VL97.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6224
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1089/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #56 : 10 Апрель 2017, 17:03:05 »
По большому счету, это уже как ставки в казино.
Хотя, если бы понять - где есть гаплотипы по протестированным в этой ветви (N-P43) и сравнить их...
Но, как я уже писал - в базе Семаргла с совпадениями не густо...

А так, если предполагать V97, то должны были выйти в совпадениях гаплотипы:
YF01867 RUS [RU-PER]
YF01503 FIN [FI-LS]
YF07844 RUS [RU-PER]
Но мы то их не видим... Если бы знающие гаплогруппу N люди подсказали FTDNA ID этих людей, то предположения можно было бы строить более уверенно.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6224
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1089/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #57 : 11 Апрель 2017, 15:04:50 »
Надеюсь, что через какое-то время обсуждения случая уважаемого Legatus перейдет в раздел по гаплогруппе N.
А пока про настоящих K*

Сегодня заглянул на Minimal reference phylogeny for the human Y chromosome   от Ван Овена.
Вижу новую гаплогруппу Х:
X    F549  F650  M2308           X-F549*(xM214)

На YFull это https://www.yfull.com/tree/K-M2335/

Интересно, какое обозначение в итоге приживется? :)

Оффлайн LegatusАвтор темы

  • Сообщений: 27
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Y-ДНК: N1b
  • мтДНК: U4a1
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #58 : 11 Апрель 2017, 15:54:43 »
Надеюсь, что через какое-то время обсуждения случая уважаемого Legatus перейдет в раздел по гаплогруппе N.

Согласен. В ближайшее время собираюсь продолжить тестирование. Учитывая полученный результат, который можно назвать неоднозначным, вполне может оказаться, что дальнейшее исследование будет не менее интересными.

Оффлайн Шад

  • Главный модератор
  • *****
  • Сообщений: 6224
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1089/-4
  • Ex oriente lux
  • Y-ДНК: Q-Y2750
  • мтДНК: J1c2z
Re: Гаплогруппа K-M9
« Ответ #59 : 11 Апрель 2017, 16:45:19 »
Надеюсь, что через какое-то время обсуждения случая уважаемого Legatus перейдет в раздел по гаплогруппе N.

Согласен. В ближайшее время собираюсь продолжить тестирование. Учитывая полученный результат, который можно назвать неоднозначным, вполне может оказаться, что дальнейшее исследование будет не менее интересными.

Ну тем не менее, мы на 90% сузили область поиска. Вопрос в одном-двух снипах и все будет ясно.

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100