АвторТема: MyHeritage DNA  (Прочитано 21010 раз)

0 Пользователей и 1 Гость просматривают эту тему.

Оффлайн Harmua HukkaАвтор темы

  • Сообщений: 48
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Ты никогда не будешь моложе чем сегодня
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #30 : 12 Март 2017, 15:35:36 »
И опять же повторюсь, МН и Gedmatch подкинули одну и ту же персоналию по своим различающимся базам.

Оффлайн Harmua HukkaАвтор темы

  • Сообщений: 48
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Ты никогда не будешь моложе чем сегодня
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #31 : 12 Март 2017, 15:45:54 »
И если провести анализ данных по совпаденцам из gedmath.com то основная часть самых близких персоналий сводится к гаплогруппе R1b

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4807
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1660/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #32 : 12 Март 2017, 15:46:20 »
Цитировать
Вот эти субклады вроде как определяются (исключил участок последовательности, где было много двойных значений наподобие AC - видимо, гомология с X-хромосомой). Предковые и производные значения снипов даны по ISOGG, кое-где могут отличаться.
Это все лирика. Так какая гаплогруппа, клад и субклад ?  ;D
Я определял для Aleksashka, если он захочет, то напишет :)
Ну, и эстонцы (документально) у обоих в роду есть. А что эстонцы, что финны... Одно и тоже!
Эстонцы финны примерно на 1/3, но таки да, этого достаточно для кучи финских "кузенов"
« Последнее редактирование: 12 Март 2017, 15:55:18 от Srkz »

Оффлайн Aleksashka

  • Сообщений: 8
  • Страна: ru
  • Рейтинг +0/-0
  • Getmatch - H416498
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #33 : 12 Март 2017, 18:13:06 »
Вот эти субклады вроде как определяются (исключил участок последовательности, где было много двойных значений наподобие AC - видимо, гомология с X-хромосомой). Предковые и производные значения снипов даны по ISOGG, кое-где могут отличаться.


Сказали, что так выходит, Y-гаплогруппа у вас I1, судя по файлу

Оффлайн Harmua HukkaАвтор темы

  • Сообщений: 48
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Ты никогда не будешь моложе чем сегодня
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #34 : 13 Март 2017, 11:09:45 »
Сказали, что так выходит, Y-гаплогруппа у вас I1, судя по файлу
У меня тоже I1. Не могут ли МН всем одинаковую приписку по Y лепить?

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4807
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1660/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #35 : 13 Март 2017, 11:29:39 »
Сказали, что так выходит, Y-гаплогруппа у вас I1, судя по файлу
У меня тоже I1. Не могут ли МН всем одинаковую приписку по Y лепить?
Меня тоже смутило, что оба результата совпали. Однако у Daemon2017 получилось по другому:
Перебрал. Дядька оказался R1a+, P278.2-  8)
Проверил некоторые снипы вручную, чтобы исключить программную ошибку - они совпадают. Так что можно предположить, что действительно оба протестированных случайно оказались I1, для Восточной Европы это не редкая гаплогруппа. Либо всё же всем приписывают чей-то кусок Y-хромосомы, а сами тестируют только аутосомы и X (они отличаются) ;D Но смысла в этом не вижу.

И собственно интерпретация:
CTS2514 +    I   14337364   rs7892876   T->C
L15 +    IJK   6753519   rs9786139   A->G
L16 +    IJK   7173143   rs9786714   G->A
L35 -    I2a2   22725379   rs7893064   C->A
L38 -    I2a2b   15668070   rs7892889   A->G
L39 -    I2a2b   16199051   rs7893033   T->C
L80 +    I1   14640715   rs35960273   A->G
L137 -    I2a2a1a1a1   9791250   rs34441307   G->A
M26 -    I2a1a1   21865821   rs2032629   G->A
M258 +    I   15023364   rs9341301   T->C
M522 +    IJK   7173143   rs9786714   G->A
M523 +    IJK   6753519   rs9786139   A->G
P127 +    IJ   8590752   rs7892893   C->T
P195.2 -    I2a2a1b2a2a1a1a1a2   22665262   rs2196155   A->G
P221 -    I2a2a   8353707   rs17316729   C->A
PF3492 +    IJK   6753519   rs9786139   A->G
PF3493 +    IJK   7173143   rs9786714   G->A
PF3526 +    IJ   8590752   rs7892893   C->T
PF3649 +    I   8046731   rs17250803   A->C
PF3706 +    I   14337364   rs7892876   T->C
PF3721 +    I   15023364   rs9341301   T->C
PF3858 -    I2a2a   8353707   rs17316729   C->A
PF3862 -    I2a2   22725379   rs7893064   C->A
PF4056 -    I2a1a1   21865821   rs2032629   G->A
S120 -    I2a2a   8353707   rs17316729   C->A
S137 +    IJK   6753519   rs9786139   A->G
S138 +    IJK   7173143   rs9786714   G->A
S150 -    I2a2   22725379   rs7893064   C->A
S154 -    I2a2b   15668070   rs7892889   A->G
S155 -    I2a2b   16199051   rs7893033   T->C
S166 -    I2a2a1a1a1   9791250   rs34441307   G->A

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 977
  • Страна: ru
  • Рейтинг +154/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397
  • мтДНК: V7a1?
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #36 : 13 Март 2017, 11:42:55 »
Цитировать
Либо всё же всем приписывают чей-то кусок Y-хромосомы, а сами тестируют только аутосомы и X (они отличаются) ;D Но смысла в этом не вижу.
Вообще майхеритаж в этом замечен.

https://dna-explained.com/2017/02/21/myheritage-broken-promises-and-matching-issues/

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4807
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1660/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #37 : 13 Март 2017, 11:52:26 »
Цитировать
Либо всё же всем приписывают чей-то кусок Y-хромосомы, а сами тестируют только аутосомы и X (они отличаются) ;D Но смысла в этом не вижу.
Вообще майхеритаж в этом замечен.

https://dna-explained.com/2017/02/21/myheritage-broken-promises-and-matching-issues/
Я так понял, импутацию они делают при загрузке аутосом 23andMe v4, где не хватает снипов. На самом деле правильным решением здесь было бы игнорировать отсутствующие снипы, а не пытаться их импутировать - так будет меньше ошибок. Но и понять их подход тоже можно. А в чём смысл дописывать левые Y-снипы в файл raw data? Можно просто их туда не включать.

Оффлайн Harmua HukkaАвтор темы

  • Сообщений: 48
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Ты никогда не будешь моложе чем сегодня
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #38 : 13 Март 2017, 11:56:39 »
Сергей, а если сравнить наши вырезки по Y с ув. Aleksashka, они сильно отличаются?
Левые снипы можно лепить для полноты картины. Не все же будут результаты на другие сайты закидывать. Многим просто нужно проверить  ближайшие связи и всё.

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4807
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1660/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #39 : 13 Март 2017, 12:03:02 »
Сергей, а если сравнить наши вырезки по Y с ув. Aleksashka, они сильно отличаются?
Левые снипы можно лепить для полноты картины. Не все же будут результаты на другие сайты закидывать. Многим просто нужно проверить  ближайшие связи и всё.
Вообще не отличаются, кроме участка, где идут пересечения с X-хромосомой. Но если вы одногаплогруппники, то так и должно быть. Все мутации, появившиеся у I1 ниже узла (то есть не ранее 4600 лет назад), MH не проверяются и в файле не отображаются.

Оффлайн Harmua HukkaАвтор темы

  • Сообщений: 48
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Ты никогда не будешь моложе чем сегодня
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #40 : 13 Март 2017, 12:07:55 »
Ладно, двое ещё могут совпасть...
Нам нужен третий  ;D

Оффлайн Srkz

  • Сообщений: 4807
  • Страна: ru
  • Рейтинг +1660/-2
  • Y-ДНК: N1c L1025*
  • мтДНК: U4a1a
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #41 : 13 Март 2017, 12:25:43 »
Ладно, двое ещё могут совпасть...
Нам нужен третий  ;D
Ага ;D Еще интересно женский результат увидеть ;D

Оффлайн Harmua HukkaАвтор темы

  • Сообщений: 48
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Ты никогда не будешь моложе чем сегодня
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #42 : 13 Март 2017, 12:35:25 »
Может по этому результаты с МН никуда и не грузятся. Тупо багов накидали для использования только на их сайте. Ведь даже Geni выкупили и туда с МН не закинуть!

Оффлайн gecube_ru

  • Сообщений: 977
  • Страна: ru
  • Рейтинг +154/-0
  • Незнайка на Луне
  • Y-ДНК: I-A6397
  • мтДНК: V7a1?
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #43 : 13 Март 2017, 12:55:50 »
Господа!

Решение простое. Если все-таки список снипов общий, то можно просто конвертировать (преобразовать) файлы между форматами. Если список снипов разный и принципиально важно, чтобы были определенные - ну, так и быть можно взять их из референсной последовательности. Деваться некуда. Но тот же geni с ftdna данные берет напрямую. Т.е. единственный способ загнать в geni "левые" данные - сначала загнать их через бесплатный "аутосомным перенос" в FTDNA с созданием отдельного кита и отдельного личного кабинета для него. Но в моих экспериментах FTDNA не ест ничего, кроме "настоящих" "сырых" файлов от ancestry и 23andme....
Полагаю, что они смотрят не только на формат файла (заголовок, маркировку хромосом, разделитель строк и столбцов), но и на сам список SNP (вот эти самые. rsXXXXX)

Оффлайн Harmua HukkaАвтор темы

  • Сообщений: 48
  • Страна: ru
  • Рейтинг +2/-0
  • Ты никогда не будешь моложе чем сегодня
Re: MyHeritage DNA
« Ответ #44 : 13 Март 2017, 12:59:15 »
Вот и я пытался в FTNA грузануть, но не хавает МН результаты

 

© 2007 Молекулярная Генеалогия (МолГен)

Внимание! Все сообщения отражают только мнения их авторов.
Все права на материалы принадлежат их авторам (владельцам) и сетевым изданиям, с которых они взяты.


Rambler's Top100